
Tan0013537 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACTCAGAACCAGCTTATGGACTCCCTCACCTCCCATATCTCCCTCTACCATTCTACATCCGTTCCTTTCAACCGTGATTCTAATCCCAATCCCAGGGCCTTGATCCTTAAATGGTTCTCCTCTCTCAGCGTCCACCAACGCCAAGCTCATCTCACGGTCCTTGATTTCAAATTCGTCCAAATCCTCATCCAAATGGTGGCAGAAGTTCGCAGACGAGGACACGGTTTCTTTATCCTCCTGCCAGACGTTCCCTCCTGCGACCCTCTGCACCTACCCAGCTTATGCTTTAAGAAGTCCCGCGGGCTTTTGTCTCGCGTCTCCGAGTCCAGCGAGTCCGAGAGGATGATTTTTGAGTCCAGTCGATTATTCGGTTCCAGGGAAGGCGATAAGCTCGAGGAATGTTCTTGCTCGTTAAAGAACATCGATTCTTTAACTGTAAGCGAGGAATTCGTCGCAAATGTGGATAAATTTGTCGAGGCAATGGATGGAGTTTCAAATGGGGGGTTTTTGAGAGGTGAAGGGGGTGACCTGGCGTCCGATTGGGCTGAATTAAATTGGTTAAAAGCGAAAGGGTATTACAGTATTGAGGCGTTTGTCGCAAATAAGTTGGAGGTGGCTTTGAGATTGTCATGGATGAACTTGAATAATGGAAGAAAAAGATCGGTGAAGTTCAAAGAGAAGGCTAGCGCAATTGGCATGGCGACAAACGTGTTTTGGAGGAAGAAAGGATGTGTGGACTGGTGGAATAAATTGGATGCTTCGTCAAGGGAAAAAATTTTGATTGCAATTCTGGGAAAATCATCAAAACAATTGGTAATGCTGGGAACATTAACATGCTGTCCATTTTGTGTGCTTGTTTAGTTGAAGTCGTTACAAATTATTTCTGAATACTCGGGTTGCTGATGCTTAATCCTTTCTTCTCCATACTTAATTTCGCTCAAGTCTTTGTACCTTATTTCTATATATTTTTTAATCCATACTCCAAACATTTAAGTCGATTGTGTGGATTGAGATTTTTTGGATAAAGTTATGGTGAAGTAAGGCTTTGGGTATAAAAAGAGATCTTGGATCTGGAGTAGTCTTTTTTAGACAAGGCGACCCCTTTTCCCCAACGTCTCCTTGTCGGTTATGGTGGAGGGTAACGTTCTTGAGGGGTTTTAGGTAGGGAGGGGTATTTTTTTTTTTGTCTCGTATCTAGTTGGCTGACGATACTATCTTCTTTTGCTTGGGTGGCTTGTGAGGTAGGTTCCTTTTCCTTCCTTCCACTTGAGCCTCCCTTTTGATCATAATCCTAGAAGCCTGCCTTTTTAGGATTCAGTTGTGAACAAGTTTCATAAACGTTTGTCCTCTCTTAAGAGAAGCTATTTCTCCAAGGGAGGTAGGTAGACTCACTTTGATACAGTTTGTTTTGAGTGAGATCCCAACTTATTTCATCCCTTTGTTTAGGGTTACTGTGTCGCGAGTAAGTATTTGGAGAAGCATATGAGAGACTTCTTATGGGAAAGGTTTGATGAAGGGAAGAGCTCTACTTTAGTCTAGTGAGATGTGCTGACCAAGTTGTTGGACCTTGGGGGTCTAGGTATAGGTAATTGAAGACTGCAAAGTGAGGCGTTGTTGGCTAAAAAGTAACGATGATTTCCTCTGGTATATAACACCTTATGACATAAGGTCATTATAAGTAAATATGGCTCCAACCATTTTGACCGGATCTTAGGCGAGGTCTTGAAAGGTGCCACTAGAAATTAGTGGGAAGCTGTTTCTAATGGGTTTCCCTTCTCTCTCTTTTTGTCTAGTGTTAAGTTGGTGATGGGTTGGATACTTATTTCTGGAAGGATAAATGGTTGGGGATAGACCCCTTTGCTCTTCATTTCCTCATTTATACTATTTGTCTTTTATAAGAAATCATTCGGTGGCTTTTATCCTCCTCACTTCTGGACTTATGTGATCTCATCCTTCCTCGCTCTCTGTACCGTACCCATCGTCCTTTGCCTGTTAGGGAAACAACAAATATGTGACCCTTTTATCACTACTGGGGGGTTTTCCATTGCTGCGGGGATACAGGATTTTGGGGCCCAATTCTTTTGAAGGGTTCTCTTGTAGTTCTTTTTTTGTTGTATGGTGAATCTCTCTCCCTCCAACCTCTCCATCCTTTCCTCATTGCGGAAGGTTAAAATTCCCATAGAGGTCAAATTCTTTGTGCTGCAGATCCTTCTTAGTAATTTTTTTTTGATGAGAAACGTGAAATCATTTCATTGATAGTATGAAATGTACAAAAAAAAGGGGAGGAAAGACCCCATTACAAAAGAGAGTCCCAACTTGTAATAAGAGAGGTGAGACTGTGATTACAAAATAGAGGAGATAATTTACACCAAGAGAGAGCTAAGAAAACAATATGATCGTAGACTTGTTGGATCTCTCTTTCCTTGTCTTGGAAGATACGACCATTACGTTCAAGCCAAATAGTCCATAGAAGAGACTTGACAAGATTGTTCCAAATGCATGCATTGATGTTGGAGAAGGGGTTGGAGAGGGGTGTCCCAAAAAGGAGGTTTTCCAGAGATTGGAATGATCTTGCTTTGGATGAACCCAATTTAGATTGAAAGCTTTGCAAGATCTTGTTCCAAATGATAGTAGTGTAAGAACAAGAAGAGAAGAGATGGGTCGTTGTCTCACAAGCAATCCTGGAAAGAACACACCAGTTTGGGGAGGAGACAATCCATGGTGCCTTTCTCTGAATAGTGTCATCTGTACTAATCCCATCATGACTTAGCTCCCAAATGAAGAAACGAACCTTCTTAGGGATGGTTCTCTTCCATAAACTCACATAAAGGTGTTTCTGTGGGTGGTTATTAAGAGATGTCAACTTACTAGAAAGAGATTTTGCTGTGTAGCTACCAGAATTGTCTAGAGTCCATTTCCAAGTATCATTGAGGGGACTAACCGGAGGAATAGGGAGCATAGCTGACAACCTGCACACTCATCAACCTCACTGGCCTTGAAATTTCGCCGAAAGCCAAGGTCCCAAGAACCCCCATCAACACTTTTCATTTCCGCAATGAAACCATGTTGCTTTCTAGAAATAGCGTAGAGAAGGGGAAAGGCACGCTGTAGCACTAGGCCACCTAGCCAATTGTCATTCCAGAAAGATGTGTGTTCCCCATTTCCTACTAAAGAGATAGTATTGCTGTAGATGTAGATGTATCCTTCATAGTAAATTTAATGCCTTGGATCGGGATATGAGGAATTCATCTTGCCTAACAAGGTGATTGTGCTGTATCTTTTGTAGTGTAGCTGAGGATCTTGATCATCTCTTGTGGGCTATGATTAGGCTTGCTCGGTTTGGAGTTGTTTTTTTAGTCATTAGACTTTAGCTTGGCCCGAGCGGGAGGGTGTTGTTCTATGGTGGAGGAGCTTCTTCTACTCCACCCTTTTGTGATAAGGGTCGTGTTCTATGGCTTACTAGCTTTTGTGCTATTTTATGGAATCTTTGAGTTAAGAGGAACAATAGAATCTTTAGATGAGTTGAGAGACCTTTGGAGGAGGTTTAATCCCTAGTTAGGTTTCAAGTCTCCCCATGGACTTCGATGTGTAAAGTTTTTTGTAATTGTCCTCAAGTCTTATTTTGCATGATTGGAGTCTCTTGATGCTTTAGTTTGACTCCTTTTGGCATTGGGTTTTTATTTTTATAATTTTATTTATACAAACACCCCTTGTATTAATTTTTTCTTAATAAAAGCCTGTTTTTTCATTAAAAAACATCTAGGTCGAGAGATGGATTGTCTCAGAAAAATTGTGAACTTCCTTTCAAATTATCTTCCTTGGGTAAATTATCAACTAAAATGATCAAAATAGGTTTAATAAAAGGCCAAAATAGATTAACTAGAACACGATTTTGGCATTTTAAATACTTACCTTGCCTCCGGCTGTTAGGCACATGCTTAAATTATGGGGTTCATTACTATTTTTGTAGTTATTTCTTGAGGGAGAGTTAATATGTGGATTCGGACGGGATGGGATCACTATAGAGAATTGCCCGCCTGAAGCTTGAAATCTGGAGCCAAAACATTCATTGAAAATTATCTGCTATTCCCACTTATCGGAGTGAATTAAAGTCAGGAATCTTCCACTTAATGAGTGGAATTAGGACTCCTTTATAGCTATTTGAGAAGCTTGTGGTGGATTCTTGATGTTGCTCAAAGAACATTAACTTGATTAGGCATTTGTTGAGTGAGGTTTTGTTTTATTTCTTATCTCATTCCAAAATTCTACAGTATGTGAGGTAGAGTTCAACCAGGATTGTGAGGAATTGTTTTGCAGGAAATGGTTAGAAATATTATTAGGATATTAAGGGCCTACTAGTCATTAGTTGGTTGCTTGTGTATCGGTTATAAAGAGTAGGTTGGGGATTGAGATGGGTAGAATTTAGAAAATTGTTTTGGGTGAGCACCAACATGCTCTGGCATTGTATTTTTCTTGCCTTTATCAATTATTTGTTCATATTAATTTCTCCTTCAATGTCTACTTCTACTTCCTATTGAATTGGTATTAGAGCAGTTGGATCTTGAGTATGCATTCGGAGTCTACAAGAATATTGCTGGAAATCTGAAATATTTTGGAGGAAATGATGAATGAATTTGCAAGAAGGAAAACAAAACCAACTAAGGATATGAAATTGGTCCCTAAACTTGTGGGGGAGGGGCTTTTATTTAGAGGTGCTAATTGAAAACATCAATACTAACTCAAAGAAGGGATGCCACTGTAGCTCACATCCCAAACATGTGTATATTAGGCTTGCTCGGTTTTTGTTCCTCGAGAACTTCGTTTAAAGAACACCGTAACAACCTAAGGGGGCAGGAGGACCCCGCCCAAGAAATAGACAATGAGAGCCTTCCAGTCGTTGATTATCATCAAAAGCCTGTCATTTATTCCTCCACTATGATTAAGCTTTCGAGTTTTGGAGTATGCCCTTCTCCTGATTTGGATGGTCATTC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MTQNQLMDSLTSHISLYHSTSVPFNRDSNPNPRALILKWFSSLSVHQRQAHLTVLDFKFVQILIQMVAEVRRRGHGFFILLPDVPSCDPLHLPSLCFKKSRGLLSRVSESSESERMIFESSRLFGSREGDKLEECSCSLKNIDSLTVSEEFVANVDKFVEAMDGVSNGGFLRGEGGDLASDWAELNWLKAKGYYSIEAFVANKLEVALRLSWMNLNNGRKRSVKFKEKASAIGMATNVFWRKKGCVDWWNKLDASSREKILIAILGKSSKQLIHEILRWTSGLAEHEMGLFSAEWNRPFRYNCTISPPRNVLTSQADLHIDFNIIPATHSGKPYSLSNIFRNLLVLQDIVTMVSSCLHDEYYKSNLFYSTLGSICAIPDCILRKLREFLMFISLDCTKLELLGEGNSKSLPSKSRENLGASSRRKKGKSRKSQNPVLRACVGDLSCNKFLKPQEFDKECAHKGREDMTESTTMSIMPKGNEACREMPANVHDHIMSVGKDQGTTRKKKKHKSKNSGGNNRLVEIRPSEGPAVKFSSPSFSSQDQVAELDNIFRKPSISNIKNESSNNYDSSTLNTSPPVFSNESNREYDSSQNIEVHEISGLMKSDGQIGPGESQFPKGIIENQCLSSTLENSTSFMDCSAVPSHLPSLELNNIVKSDVNGKGSVRTCELGDKSSLLDKLPRTFDVKERSCLSRDQFSGDTCNTRTLNSLEHSPYEWHGVASLYIPPFNSHLPPATDRLHLDVGHNWHNHFRRSFTPAMHQSRNSSVKGGCNPLLTRPLLMSLDWPPVLRSASGLASTMTSNHDTGFLSRRQSTFRQGFPTNSNQISTEDEKYSGNLTDLPDLSNNQDLADECDGNWISEEELEMHAVSGIDYNQYFGGGVMYWNPSDHHGTGFSRPPSLSSDDSSWAWREADMNRTVDDMVAFSSSYSNGLTSPTATSFCSPFDPLGSGKQALGYVVQGADLPNNMLHSSPTMKDTVTEEDAPISLANLPSDVEGKTGDLHPFPMLRPIVIPNMSRERSRSEFCHGYDHKSPCIPPTRREQSRVKRPPSPVVLCVPRAPIPPPPSPVNDSRKHRGFPTVRSGSSSPRHWGVKGWYPDGTNLEEACLRIDGAEVVWPNWRNKSNSNCSTVQPLSLIAMSQIALDQEHPDVAFPLFPPTMSCPVKKESLSLMHSRLHDEIDSFCKHVAAENMAKKPYITWAVKRVTRSLQVLWPRSRTNIFGSNATGLSLPTSDVDLVVGLPPVRNLEPIKEAGILEGRNGIKETCLQHAARYLSNQEWVKSDSLKTVENTAIPIIMLVVEVPHDLITSSTSNMQSPKEESSAVSGEQDVNILNDMASLEDSALPKCLEVNYGSSISTKSVRIDISFKTPSHTGLQTSELVKELTEQFPATIPLALVLKKFLADRSLDQSYSGGLSSYCLVLLIIRFLQHEHHLGRPINQVNSCYLFVRVGLRSGLALQIYMDDLRETRSSLL Homology
BLAST of Tan0013537 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8NDF8 (Terminal nucleotidyltransferase 4B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TENT4B PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 81.3 bits (199), Expect = 1.0e-13 Identity = 68/255 (26.67%), Postives = 107/255 (41.96%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q68ED3 (Terminal nucleotidyltransferase 4B OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tent4b PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 81.3 bits (199), Expect = 1.0e-13 Identity = 68/255 (26.67%), Postives = 107/255 (41.96%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7KVS9 (Non-canonical poly(A) RNA polymerase protein Trf4-1 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Trf4-1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 81.3 bits (199), Expect = 1.0e-13 Identity = 73/258 (28.29%), Postives = 109/258 (42.25%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5XG87 (Terminal nucleotidyltransferase 4A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TENT4A PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 80.1 bits (196), Expect = 2.3e-13 Identity = 75/278 (26.98%), Postives = 115/278 (41.37%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6PB75 (Terminal nucleotidyltransferase 4A OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tent4a PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 76.3 bits (186), Expect = 3.3e-12 Identity = 64/232 (27.59%), Postives = 98/232 (42.24%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. NCBI nr
Match: XP_038884690.1 (uncharacterized protein LOC120075313 isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2667.5 bits (6913), Expect = 0.0e+00 Identity = 1326/1443 (91.89%), Postives = 1375/1443 (95.29%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. NCBI nr
Match: XP_038884514.1 (uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884524.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884533.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884543.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884548.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884555.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884562.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884570.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884577.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884585.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884591.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884597.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884606.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884612.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884620.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884629.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884638.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884646.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884654.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884661.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884672.1 uncharacterized protein LOC120075313 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2667.5 bits (6913), Expect = 0.0e+00 Identity = 1326/1443 (91.89%), Postives = 1375/1443 (95.29%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. NCBI nr
Match: XP_038884681.1 (uncharacterized protein LOC120075313 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2660.9 bits (6896), Expect = 0.0e+00 Identity = 1325/1443 (91.82%), Postives = 1374/1443 (95.22%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. NCBI nr
Match: XP_022924482.1 (uncharacterized protein LOC111431966 isoform X3 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2607.8 bits (6758), Expect = 0.0e+00 Identity = 1301/1439 (90.41%), Postives = 1359/1439 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. NCBI nr
Match: XP_016899000.1 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC103483113 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2607.8 bits (6758), Expect = 0.0e+00 Identity = 1308/1474 (88.74%), Postives = 1360/1474 (92.27%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E927 (uncharacterized protein LOC111431966 isoform X3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431966 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2607.8 bits (6758), Expect = 0.0e+00 Identity = 1301/1439 (90.41%), Postives = 1359/1439 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DTH3 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC103483113 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103483113 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2607.8 bits (6758), Expect = 0.0e+00 Identity = 1308/1474 (88.74%), Postives = 1360/1474 (92.27%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L8A8 (NTP_transf_2 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G116880 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2607.4 bits (6757), Expect = 0.0e+00 Identity = 1304/1443 (90.37%), Postives = 1354/1443 (93.83%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EF53 (uncharacterized protein LOC111431966 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431966 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2602.0 bits (6743), Expect = 0.0e+00 Identity = 1301/1443 (90.16%), Postives = 1359/1443 (94.18%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E9B4 (uncharacterized protein LOC111431966 isoform X5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431966 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2602.0 bits (6743), Expect = 0.0e+00 Identity = 1301/1443 (90.16%), Postives = 1359/1443 (94.18%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. TAIR 10
Match: AT4G00060.1 (Nucleotidyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 1324.7 bits (3427), Expect = 0.0e+00 Identity = 752/1457 (51.61%), Postives = 964/1457 (66.16%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013537 vs. TAIR 10
Match: AT5G53770.1 (Nucleotidyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 77.8 bits (190), Expect = 8.1e-14 Identity = 71/269 (26.39%), Postives = 112/269 (41.64%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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