Tan0012564 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0012564
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG11: 11855338 .. 11859012 (+)
RNA-Seq ExpressionTan0012564
SyntenyTan0012564
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TTTTACTTTACTCTTTCCATTTCACTTTTATCGACAAAACCCTAGACTTATGTCAACCTTCTTCTTCTTTCACTCTTATCATATATTCACAGTTGTTCATCAAATTTCTTCTCTCATTCTTCGTTGTTTGTTATATTCGTGTGGTTATTTTGTTCACCGTTGCTAGCTAGTCTAGATTTTTTCGTTGTCATGAGTTTTCGTTAACCTCCGTGCCTTAGATCTTGGGTTTTGCTGCTGGATTTTGCCGCCATGAGTTCGAGTTTTTTTCTTCGTGAGTTTGCATCGTGGGTATCGACAACCATTCATAAAATTTCTTCACGGTGAGTTTTTGAATCCATGAGTTTTAGTTTCACTTGATATGGTTTATTCGTTAGTTTCAGACTTATCGGAAGTCGGCCTCGCCCCGACGTTCAATTTCGATTCAGAAGAAGGATTGTGAAAACAATACGAATGTGGTATCGACGAACAAGAAGAAAGTGTGTATGTGTTCTCCAACGACACATCCAGGTTCCTTTCGGTGTTCTCTCCACAAGAATTCGAGTTCGAGGTATTCTATTAATGGCGCGAATCACATCCAACCATAAACTTGCAAAAGATTTAGTACATAAATGGGTAATGTTGCCCCTTTCCTTTTCCTCTGCGCTTGTATTACACTCTATTTATGGGGTACTTTTGTTTTCTTTTCATACCATTTTATATATAACAGTAGTGTATATCTGTTTATTTACTTTTAGTCTGAGAAGAACCTTATGAGAGAGTTATCATGCCACTGAACTAATTATGTTGGTTTAAAGATTTTAATTTGATTTTTTTTCTCATACACATACAACAAGGGATGAGACAACTAATTTGAGCGGTAAGTTAGATGTGTTAATGAGCTAAATCTTAGCTCTTTTTTTATGATTCATAATTTATAATTCTCATTTTTCCTTTAGACATGTTATTTCCCTTTTGTTTAGGTTTTTTTTAAGTATTTATAAAACAAAACTCTCAAAAACCAAATGGTTATCAAACAAAGGGTATGTTACTAATTTCTCTTGTATTATTTTTTTTTGTAAATTTTTAATATATATGCTCATGATAGACCTGTGGAGCATACAAACCATGTTATAGTGATTAAGGGTGTTTATTTTGCCTCTGTTTATTATGATAGACATGTGGATTTAACCTTTGAAAGTTAATTAGTTTAAAGTTTTGATTGTTTTGTTAAGTTTGGATGGGTTTAGGTGTGAATATGAAAGTTTAAGGTTGAACATGAAAATGTGGTCGGTATCACTCTGGCTCTTGCTCGAGATGATAAAAGGATCATCTGGTATCTGCTATTCAACTCTGTACTTGCGTATTTTGTAAACCTGACCAATTTTTTGGTTTCTAAAACACACTAGTGCATTGACACTTCAGGTATGCCCACTTTGTTTATTGATGCTTATGTTTTTCTTATCCATCCTTCTTTGTGTTCTCTTTTTATAACTTGTGTTGCTTTCTGTTCTCTTTTGAAAGTCCCCAACAAATCTCATTTCAATGATGCATCCTTGAAGAGTCTTCTTTTTCATCTTTGTGACCCATTCAAATGATGACTCCTATTATTATTTGTCCTTTTTTTTTAAACTAAGTTCTGTTTTTTGTTTTCCTTTGAAAGTCCCCAACAATTACACCATTAAAATGATTACACCTTCTGAAGAGTTATGATCTGTGTTTTCTTCCTATTACTCGAGTTTGGTTTTATCTTTTCTTTTGAAGCTCCCCAACAAGTATGAAAGTTTAACCTTTGTCTATTAACTCATTTTCAATCTTTGAACTTTTTTGTTGAGCAACATGACTACTACTACTCTTCTTAAATCTTCTTCTTCTTCTCTTTTTTCGCCTTTGTTTTGCCATGCATTTTGTTTCAAATCTCAACCTTGTGAGACACCTCCTAAAGATATTTTGGTAATTGAATGTTTTGGGTTTTAGTTTTCATGTAGTTCGAGCTCTTACATCATATGATCAATGTTGTAGAAGTAGCTAGTAATGCATATGATATGACTCTAGATTAGGATGTTTCATCACCAATCTTTACATTTGTGCATTATGTTGTCAGGTTAGTTAATTTAGTTTTATTTTGAAGGCATTTTATGTTTTATGTTGTGTTCTAATTACTTTGCATTTTTACCAACATTTGATGATTGATAACGTTACATAATGCCTCATTCTCTTGTTAATTTAAGGGTGTTTATTATAGCGTTGATTTAGTTGTCGGACTCTTCGAGAGTTTCTAAAGCTTGAATTCTGACATTCTATCTAATGTTTACAGACAAAAACGCTTCACACAACATGATTCTTCATTCTTTCTCGGGTGCGTACCTTTCTCAATCTGCACTTTTGTAGTTTAAATTATGTTTTATTTTTTGAATATTTCGATTGTTTGTGTAATGATGAAGTGATTTGCTTCTATTTTTGTTGTGTTTCGATTGAATTTTTTAAGTTTTAATCATGATTAATGATGGAGGCCTTTGTTATTACTCTCGGTTGCTCTAGAATGTTGTGAATGAATATTTTTGCAAAATAATTAATTGTTAGAGTTATGTAGAATTTGTGCTCTCCCACAACAGTTTCAACACAAAGTCACGTTCAACATGTTTGTTGCATAGAGTGTTAGTATTCAGTTCGTTTGAGTTTATGTTCATGATTGTTGAGCTTTAGATTTATGTTCAGAAAGGTGAGAAAGTGGGGGAAGTTCATTGCCATTAAAGACATAGACACACACATGGTGTTTCCTTGCAGATTCTCATAGGTTCTTACTGTTTCTTTATCTCTTTTTGTAGTGGAAAAGTCATCCGTCGATTTGTGCCAGTTGATAAAATTTTAAAGCTGGTTCTCCTTGAATGTTATGTCACTTGCTCAGGTTAGTGTTTCATTTCAATTACTTGTTTTTTTTATTTGTTATGGTGACAGGGAGTTTCAAAGTGTGGAAAAAAGGTATATATTTGTTTCTCAATGCTAGCATCGTGTTAATGGAGATGGACATCTTTTTATATGGTCTTTAACGGAAATGTATTTAGCAAAGTTATTAAAAAATAATTTTTTGGAAACTTTATTCTCCTTAAAAATGGATATATAGTTCTTTCTATATTAAATAATCTTTGGATAATACATCCTTTTCTTTGACTTATTTTCCTTGTGAGCATTAGCAAACCCTTAAGCTGGAATATATTAGCTATATTGTTTGGGTATATTACCAACTGTTTGCTCTTTTTGTGGTTCATTTGGAGTCTAGGGGTTTGAAAGATTCATGATCACTGTTCTTTAGTCTTTTGTTACTGAACTGTACCAAAAGGTTAGATTGTGGAAGAACTTTGTTGCAAATTAATTTTATTTGAAAGTCCTGGGGGAAAAAATTAAAAACTAGTTTACATTTTTGCTATTTACAAACTTCTACCATTTAAGGTTAATGGTGACAATCTTAATTGATTTTTATGTCAATATCGTAGCTATTGCGATATGGAAAGTTTCAGGCATGAAGATCAATCGGTTGATGATAAGAGGAAGAAGAGCATGAATGGGTTCTTTATTTTGTTTAGCAATTTTTCTTATCTTTGTAAAGTAAATGTAGTTTTTATATATATTTTCTGATATGTAATACACTTCTTTTAATATATATTTTATATTTTATTAATTAAAGTTAAGTTGGTAAGA

mRNA sequence

TTTTACTTTACTCTTTCCATTTCACTTTTATCGACAAAACCCTAGACTTATGTCAACCTTCTTCTTCTTTCACTCTTATCATATATTCACAGTTGTTCATCAAATTTCTTCTCTCATTCTTCGTTGTTTGTTATATTCGTGTGGTTATTTTGTTCACCGTTGCTAGCTAGTCTAGATTTTTTCGTTGTCATGAGTTTTCGTTAACCTCCGTGCCTTAGATCTTGGGTTTTGCTGCTGGATTTTGCCGCCATGAGTTCGAGTTTTTTTCTTCGTGAGTTTGCATCGTGGGTATCGACAACCATTCATAAAATTTCTTCACGAAGAAGGATTGTGAAAACAATACGAATGTGGTATCGACGAACAAGAAGAAAGTGTGTATGTGTTCTCCAACGACACATCCAGGTTCCTTTCGGTGTTCTCTCCACAAGAATTCGAGTTCGAGGTATTCTATTAATGGCGCGAATCACATCCAACCATAAACTTGCAAAAGATTTAGTACATAAATGGGTAATGTTGCCCCTTTCCTTTTCCTCTGCGCTTGTATTACACTCTATTTATGGGGTACTTTTGTTTTCTTTTCATACCATTTTATATATAACAGTAGTGTATATCTGTTTATTTACTTTTAGTCTGAGAAGAACCTTATGAGAGAGTTATCATGCCACTGAACTAATTATGTTGGTTTAAAGATTTTAATTTGATTTTTTTTCTCATACACATACAACAAGGGATGAGACAACTAATTTGAGCGGTAAGTTAGATGTGTTAATGAGCTAAATCTTAGCTCTTTTTTTATGATTCATAATTTATAATTCTCATTTTTCCTTTAGACATGTTATTTCCCTTTTGTTTAGGTTTTTTTTAAGTATTTATAAAACAAAACTCTCAAAAACCAAATGGTTATCAAACAAAGGGTATGTTACTAATTTCTCTTGTATTATTTTTTTTTGTAAATTTTTAATATATATGCTCATGATAGACCTGTGGAGCATACAAACCATGTTATAGTGATTAAGGGTGTTTATTTTGCCTCTGTTTATTATGATAGACATGTGGATTTAACCTTTGAAAGTTAATTAGTTTAAAGTTTTGATTGTTTTGTTAAGTTTGGATGGGTTTAGGTGTGAATATGAAAGTTTAAGGTTGAACATGAAAATGTGGTCGGTATCACTCTGGCTCTTGCTCGAGATGATAAAAGGATCATCTGGTATCTGCTATTCAACTCTGTACTTGCGTATTTTGTAAACCTGACCAATTTTTTGGTTTCTAAAACACACTAGTGCATTGACACTTCAGGTATGCCCACTTTGTTTATTGATGCTTATGTTTTTCTTATCCATCCTTCTTTGTGTTCTCTTTTTATAACTTGTGTTGCTTTCTGTTCTCTTTTGAAAGTCCCCAACAAATCTCATTTCAATGATGCATCCTTGAAGAGTCTTCTTTTTCATCTTTGTGACCCATTCAAATGATGACTCCTATTATTATTTGTCCTTTTTTTTTAAACTAAGTTCTGTTTTTTGTTTTCCTTTGAAAGTCCCCAACAATTACACCATTAAAATGATTACACCTTCTGAAGAGTTATGATCTGTGTTTTCTTCCTATTACTCGAGTTTGGTTTTATCTTTTCTTTTGAAGCTCCCCAACAAGTATGAAAGTTTAACCTTTGTCTATTAACTCATTTTCAATCTTTGAACTTTTTTGTTGAGCAACATGACTACTACTACTCTTCTTAAATCTTCTTCTTCTTCTCTTTTTTCGCCTTTGTTTTGCCATGCATTTTGTTTCAAATCTCAACCTTGTGAGACACCTCCTAAAGATATTTTGGTAATTGAATGTTTTGGGTTTTAGTTTTCATGTAGTTCGAGCTCTTACATCATATGATCAATGTTGTAGAAGTAGCTAGTAATGCATATGATATGACTCTAGATTAGGATGTTTCATCACCAATCTTTACATTTGTGCATTATGTTGTCAGGTTAGTTAATTTAGTTTTATTTTGAAGGCATTTTATGTTTTATGTTGTGTTCTAATTACTTTGCATTTTTACCAACATTTGATGATTGATAACGTTACATAATGCCTCATTCTCTTGTTAATTTAAGGGTGTTTATTATAGCGTTGATTTAGTTGTCGGACTCTTCGAGAGTTTCTAAAGCTTGAATTCTGACATTCTATCTAATGTTTACAGACAAAAACGCTTCACACAACATGATTCTTCATTCTTTCTCGGTGGAAAAGTCATCCGTCGATTTGTGCCAGTTGATAAAATTTTAAAGCTGGTTCTCCTTGAATGTTATGTCACTTGCTCAGCTATTGCGATATGGAAAGTTTCAGGCATGAAGATCAATCGGTTGATGATAAGAGGAAGAAGAGCATGAATGGGTTCTTTATTTTGTTTAGCAATTTTTCTTATCTTTGTAAAGTAAATGTAGTTTTTATATATATTTTCTGATATGTAATACACTTCTTTTAATATATATTTTATATTTTATTAATTAAAGTTAAGTTGGTAAGA

Coding sequence (CDS)

ATGAGTTCGAGTTTTTTTCTTCGTGAGTTTGCATCGTGGGTATCGACAACCATTCATAAAATTTCTTCACGAAGAAGGATTGTGAAAACAATACGAATGTGGTATCGACGAACAAGAAGAAAGTGTGTATGTGTTCTCCAACGACACATCCAGGTTCCTTTCGGTGTTCTCTCCACAAGAATTCGAGTTCGAGGTATTCTATTAATGGCGCGAATCACATCCAACCATAAACTTGCAAAAGATTTAGTACATAAATGGGTAATGTTGCCCCTTTCCTTTTCCTCTGCGCTTGTATTACACTCTATTTATGGGGTACTTTTGTTTTCTTTTCATACCATTTTATATATAACAGTAGTGTATATCTGTTTATTTACTTTTAGTCTGAGAAGAACCTTATGA

Protein sequence

MSSSFFLREFASWVSTTIHKISSRRRIVKTIRMWYRRTRRKCVCVLQRHIQVPFGVLSTRIRVRGILLMARITSNHKLAKDLVHKWVMLPLSFSSALVLHSIYGVLLFSFHTILYITVVYICLFTFSLRRTL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0012564.1Tan0012564.1mRNA
Tan0012564.2Tan0012564.2mRNA
Tan0012564.3Tan0012564.3mRNA
Tan0012564.4Tan0012564.4mRNA
Tan0012564.5Tan0012564.5mRNA