Tan0012261 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0012261
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG10: 67476061 .. 67493842 (+)
RNA-Seq ExpressionTan0012261
SyntenyTan0012261
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptide
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mRNA sequence

ATCAGGGAGAAGGTATTAGGGATTTCAACAATTTACTCTACAAATGAAGAATTTCGTCACTTGCTCAATGAACAAGAACAGTGGTAAAATGATAATATTGCTCGACTGTTTTTGCATGGATGAGTTCATTTGTATTTGGAGGCTGATAAGAGGCTCCTCTGCATTCCAACGGTCTCCATTCTTCATTATTGCACTTCTCAAGAATTTCTGAAGCATTTGGAGGTCACTATTTATTACTTTCACTATTGGAAATTCCTTTTCGATTTATGAAAAGAAGTGTGGGATTTTTGTTTATGATGCAAGTACCAAATGGAAAACACAACTCTCAAGCTTCTCAAATGCACGTTCCTTCAGTTCTCTTAGCCTTCGGAAAGCGCTCAATGTATGGGCATACGAGACCGTTTCCTCATTGAGTGGGCGTGTTGTTAATCGGTTAAATTACACGACTATTCCACGCATTTGTAAATGGGTCGCGCGCGCACTCTCCTTCTTACTTACAACTTACCAGCGAGATCTTCGCATCTAGAGTGGCAACTATTCAATTGGAGCTTATCCCATTTGAGGGAGAGGTTCGATACATTAATCGAAAGATCGAGCCCCCACGTGCACCACTTGAAGCTCTTGCCACTTCAACTCCTACTCCTACTTCTACCCTATTGCATGAGTCGTCACACGGGTCGATAGATAAAGGAAAGAAGAAAGAGCAAGTGCAAGAGATTGAGAAATAGGAGCATGAACACGATGAAAGGGAAGGAAAAGGATAAACGAAAGATTTCGAGAAAGAGGAGGAAGATAATGTAATGGTTAAGAATAATAATAAGAAGATCAAGTGAAAATGCAGAAAGTGGATGAAGAGTATGGACAGTTGCATGGTTAATATGGAGTCCGACCTGAAGGACATCAAGAGGTTGTTGCGACGGCTTGCTAAGACGAAAGATGTGGACCCATCTAAGTATATTGGACCAAATGACGGTGAAAACGATGATGGTGGTCCATCTAAAGGTCCAGACGGTGGTACTTCTAAAGATGACAATAGTGTCTCTAAAGGGCCTAAGGATGGTGGTCTTTTTAAATATGGCGTTGTTGGAGAAGGGTCTAAGGGGCACGATAGTGGGGCAGAGTTGGTTATGGACTTTGTCGAAAAGACAAGTGAGTCGGTGGATGAACCCCGATTATTACACGTAGATGTTGACGAGGACTCATATGTAGATCCTTACTCGGTAAACTTAAGGTCTAGTTTTGAGCTCTCAATCAACAATGGATACTACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGAAGAGTATGGACAGTTGCATGGTTAATATGGAGTCCGACCTGAAGGACATCAAGAGGTTGTTGCGACGGCTTGCTAAGACGAAAGATGTGGACCCATCTAAGTATATTGGACCAAATGACGGTGAAAACGATGATGGTGGTCCATCTAAAGGTCCAGACGGTGGTACTTCTAAAGATGACAATAGTGTCTCTAAAGGGCCTAAGGATGGTGGTCTTTTTAAATATGGCGTTGTTGGAGAAGGGTCTAAGGGGCACGATAGTGGGGCAGAGTTGGTTATGGACTTTGTCGAAAAGACAAGTGAGTCGGTGGATGAACCCCGATTATTACACGTAGATGTTGACGAGGACTCATATGTAGATCCTTACTCGGTAAACTTAAGGTCTAGTTTTGAGCTCTCAATCAACAATGGATACTACTAG

Protein sequence

MKSMDSCMVNMESDLKDIKRLLRRLAKTKDVDPSKYIGPNDGENDDGGPSKGPDGGTSKDDNSVSKGPKDGGLFKYGVVGEGSKGHDSGAELVMDFVEKTSESVDEPRLLHVDVDEDSYVDPYSVNLRSSFELSINNGYY
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 8..28
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 29..85

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0012261.1Tan0012261.1mRNA