
Tan0010888 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAGAATTTAAAAACTTTACTTTTAAAAAGAAAAAGACTCCATAGAGGCAAAGTCAAGCTTGGTTTCTAATCTAGATCATCTTTTCTTCTTTCTCATTTTAGAATCCAATTTCCAATCCGATTGAGAAGGTAAGGACGATGAGAACATTGAGAAGAGTACTTCTGGGAAGAAATTTCAGAAGTCTCGTCCAATCCGCTTTCAGCCGCCTCGAAACACTGAAGAACCATCGCCATGGCAGATACACCCAAGATCGCAACGAAGTCCTTCGCCTCCTTCATGAAGGCCTTCCCAAACTAGCTCTCTCTCGCGTACGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTCAATTCTTATATTGTTTTCAAGTTCTGGCTTTTTCTCTATTAGATTTCACTTTTAGATCATTCGTGTATGACTTTTTTTTCCTCTTCTTAAAAAAAAAGTAATTTATATTTTAACGTTGAAGTTCTATCACTTAAAACCTCAAACCAATAATTATATTAATTTAAGTCATATTTATTTAGAACTTCGGTTAGAATTTCATTTCAAAACATTAGATGTGTGTATAAAACTTCTTTAAAGTAGGGATTAACTATATTAGAGAGAAATGTTGAAATCAAATACATAGTAGCCGTTTTTCATCTTCTCATTTTTCCTTATTTTTCTTCATCTTCTCACTTTCCTTTATTTTTCTCTATTTATTGAGAGGGATAATCGTGATGATTTTCTTGCTACTTAATGATTTTGTTTAGGTGATTTTGAGTTGATTTTAAATGGAATCAAGTGAAAATATATCTATAAATCACTAATTAAATGTCTAAATTGATTCACTTATAAAAATTTAGTTTAATTGATATCAATATTAGTTTGAGACTTTAATTGATCCAACCCCCAAAGTTTAAGGACATAAATTGATTTTTTTTTCTTTTTTTTGTTACTTGTAATTTGCATGTATAAGATTAAAAGAACAAATTTAAATACTATATTGACTTGAACTTTATTCTATTTTGGCCTTTAAAACTTCTATAATGTTTATTTGAGTTTCTGTTTGGTATGCAATTTTAAAACAAAAATTTGAAAACAAGGGATTTAATGAAAGCAGAGTTGTATTTTATGTTTTCAGATATGTGTTTGGTAGCAGATTTTGAATTGGATTCCAATTTAAACAATTATTCAAAATGTGTTTTATAATATATTTATAGACTATGAAACTAGTTGTAGTTGTAAAACTAATATTAGGTTGAATCTAAACCATTATTAATTAATTTATGAACATATTTTTTGTTGTACATTTTATATAATTATTATTTTACAATATCATATAAATTATAGTATATTATATTATACATAATTTAATTTAACACAAATAAATTGAGTTTATAACATGAAATACTATTTATATTAAAGAATTTATCTTTTTTAGTAGAATTCTGCATTTTAAATGTTCAAATTCAGAACCTGGATTTAATGAAAATATAAAAATATTGTTTTCAGAATTTATATTATTTAGATCACAACATTCAGAAAAATAGTTTTGAAAACATATTTGTCAAACATATATTCACTGAATTCTGTAAATCTAAAAACATAAAACAGAATCCAAATTCTATACTAAACAAGCCCTAAATTTTCAAAAGTGACCATTTTTTTAGTCAACTAAGGATCATATCCCAGACAGGGATCATTTAAAAATGATTTTTCAAACTTCAAAATTTAGATGAAATAGACGGTCACTTCAATCTCAACGACCAAAAATATATTTTACTTTTTTTAAGACTAAAAATAAAGTCATTAACATACTTTTTTTTTTTTTAATTTTACATATGTACTTACCTCATAGGACCAACATCATTATCACGATTTCATTTTTAAGAAATTCAAACTTTTGTTTTCGTAGGAATTTTATTTTCACATTTTTATGATCTATTCTTTGCAGTGCGAACAAATGATTAAACATCAAAATCTTTTGGATTCTTATGATATGATTGAAGGCTATCTCAATCTCTTGACGGAAAGAATCTACCTCCTTCGACGTGGAAGGTTTACTTTGCATTATTTTACAATAGTTTATAGAATAATAAAATTCTCATTTTCAATACAATTCTAAGAAAATTACACAGTTGAAAGGAGTAATTTAATTCCTAAATTTTAATTTGCAATAATTTAGTTGCAATTTAACTCAAAATTAATTTTGTCCATATAATTTGTAACTTATAACAATTTAATCTCTACCATAAAAAAATCATTAAAATTAAGAGTCAATTTTTATTATATAATGTTAAACCTTTCTAGTTTATAAGCACATTTATTCCCTTATTAGTTTATCGATCTACCTATTATATAAAAAATTCCATCATGTCGTACTAATGATTTTTATTTGACTAAATTGTTAAAAAAAAAATTATAATATAGAGACTAAATTATTAAATATCAAAATTTACCGACTAGTTACTACAAAATTAAAAGTACAGACTAAATATTTTAAATTAAAGTATAGAGAGAGAATTGTTACTTAAAAGTTAGAAGGAACGGTGTTTTTTTTTTTCAGCAAAAAGGTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTGAAATCAGGTTTTTCTTTTTCCTTCGGGGACATGTTTTGTGAATAATGATTTTCATTTGCAGAATATTAAAACCAATTTGGAAACAAAGAGAAAACTACTGTTAAAACAAATTTCCAACTGGTTTAAAAGAATCACATCCATTTGAATTCCAACCCCTTGCATGGTTAGCAAAGACTCTATTCGATAACTATTTTAACCGTTTTTTTTAATAAATAAAGTAGATAACTATTTAGGCCCGTTTGATAACTATTTTGTTTTTTGTTTTTGAAAGTTAAGCTTATTTTCACATAATTTCTCTATAATAGAGATCATCCCCTTAAGTTAACATTTGAACTCTTAACCAAATTCTAAAAACAAAGTTAAGTTTTTGAAAACTACTTTTTTTAGTTTTCATAGTTTTCAAAAGTTGACTTGGTTTTTAAAAACATAGGTACAAAATAGATAAGAAGACATATAAACTCATTGGTAAAAATAGTATTTTTAGGTTTAAATTTCAAAAACTAAAAACCAAAAACAAAAGCCCCGTTTGATAACCATTTTATTTTTGGTTTTTGGTTTTTGAAATTTAAACCTAAAAGTACTACTTCTACCAATGAGTTTATATGTCTTATTATCTACTTTGTACCTATGTTTTTAAAAACCAAGCCAACTTTTGAAAACTAAAAAAAGTAGTTTTCAAAAACTTGAATTTGTTTTTAGAATTTGACTAAGAGTTCAAATGCTTACTTAAGGGAGATAATCTCTATTATAGAGAAATTAGGTGAAAATAAGCTTAACTTTCAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAATGGTTATCAAACGGGACCAAAATGGTTATCAAACGGGGTCTTAGTTTTGAATTTTTTGTTTTTGAAACTTAAGCCTATAAATACTCAATTCTATTGTTTTCTTATTCTCTTATTTATTTTTTATCTACGTTTTTAAAAACTAAGTCAAATTCTTAAAACTAAAATACTTAATTTTCAATTTTTTTTTTTTTGAATTTTAATTAGGATCTCAAATGTATTTTAAGAAAGATATTACAATTATAGAAAAATAAATAAATAAATGTTAGATGATGTTGATATAATTAAATTTACTCCAAACTTTCGGTTTAAGCTTTTAGTTTGATTAGCGATTTAAGAATAAATAAACAAACACGATTTTTAAAAATAAAAAATCAATAATATAGTAGATATGAAACCGACTTAAAAAAAAAAAAGTAATTTTATGGTTTTCTTACCTTTTTATTTTGACAATGGTTTCTTTATCTTTTTTTATAAAGAGAATGCCCTGAAGAATTGAAGGAGGCAGTGTCAAGTGTGTTATTTGCAGCTTCAAGATATAAGGACTTTCCTGAACTTGAAGAGATTAAATCAGTATTGACTTCTCGTTTTGGCAAAGAGTTCACTGGTCGTGCTGTTGAATTGCGCAACAATAATGTTGTAAATCACTTGGTACGACTCATTTGGTAACATTTCATTTTTCCTCTTTTTACTTTTTTATTTCTTATTTCTTATTTTTTCATTTTTCAAAATAAAAGATAAGATATAAATATATTTGATAATTGTTTCATATATTTTGTTCTTTCTTTTATATTGAAAAAAATTTCCATTAATAGCAACGGTTTGTTGTCAAAATTTAGAAAGAATAAAACATCTAACTATCATGTGACAACAACTATAAAATCTGTATTGAAGGGAAGAACGTGGGCTATAAAACAAGTGAAAACTTGAATATCTGCGATATAGGCTCAAATGCTTAAATTAGCTAGAAGTCTTTTGAGTGTAGCAAGAAGTGGTCACATAAACTCATAGTCGGTAGTATGGATTATGTTGAATATAGAAATATGCTTGAAGAAAACATAGATAGCATTTGTGTCACCTCGTGGGCTCAACTGGAGTGTTTGCCTAAGTTTTAAGCCTTTAGTTTTATCCTTTGTCGCATTTTTGCATGGAGATAATTGGTTTGTTTTTAACTACGAGTGGGTTATCCCAGCCCCCAGTTCTCCTTCAAACTTTTCTTGATTTGAACTTAATCAGGAAGATAACCTGGTTTATTTTGGTCTTACTTCACTTATCCGATCTCGAGGTGAGAAACTCACTCAATGTTTGACTCACCCCTAGGGTCAACCTCTCATAGGCTCGGGATGATCCTAATGTTATTGATTCAAATTGTTCTGGTGTGGGCCAATCCAGCATAGGGTGACAAAGGTGATTATAACCACATGGAGATTGATCAAAGATTCAAGTGTGTGATGTACCAACTTAAAGGAAATTGGGGCACCTCGGCCTCGACCATCTTAGGCTCAGTTAAGATGCTCATTATGAGTATTTGTCCTTTGATTCATCCTTTTAAGACTCTTTGGAACCCTTAAGTTGAACAAACTTGAGTTTTAACGAAGAGTAGATTAGCCCAACCTCCAAT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BLAST of Tan0010888 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54I39 (IST1-like protein OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=DDB_G0289029 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 70.1 bits (170), Expect = 3.5e-11 Identity = 47/155 (30.32%), Postives = 81/155 (52.26%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3ZBV1 (IST1 homolog OS=Bos taurus OX=9913 GN=IST1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 57.8 bits (138), Expect = 1.8e-07 Identity = 39/139 (28.06%), Postives = 75/139 (53.96%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P53990 (IST1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IST1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 57.8 bits (138), Expect = 1.8e-07 Identity = 43/158 (27.22%), Postives = 82/158 (51.90%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CX00 (IST1 homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ist1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 57.8 bits (138), Expect = 1.8e-07 Identity = 43/158 (27.22%), Postives = 82/158 (51.90%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q568Z6 (IST1 homolog OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Ist1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 57.8 bits (138), Expect = 1.8e-07 Identity = 43/158 (27.22%), Postives = 82/158 (51.90%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. NCBI nr
Match: XP_022963468.1 (uncharacterized protein LOC111463790 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 293.1 bits (749), Expect = 2.0e-75 Identity = 157/221 (71.04%), Postives = 179/221 (81.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. NCBI nr
Match: XP_023538969.1 (uncharacterized protein LOC111799739 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 290.8 bits (743), Expect = 9.7e-75 Identity = 157/221 (71.04%), Postives = 178/221 (80.54%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. NCBI nr
Match: XP_022971780.1 (uncharacterized protein LOC111470458 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 283.5 bits (724), Expect = 1.5e-72 Identity = 155/222 (69.82%), Postives = 178/222 (80.18%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. NCBI nr
Match: XP_038884436.1 (uncharacterized protein LOC120075284 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 276.9 bits (707), Expect = 1.5e-70 Identity = 152/227 (66.96%), Postives = 182/227 (80.18%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. NCBI nr
Match: XP_008445649.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103488605 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 260.8 bits (665), Expect = 1.1e-65 Identity = 143/227 (63.00%), Postives = 178/227 (78.41%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HHW4 (uncharacterized protein LOC111463790 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463790 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 293.1 bits (749), Expect = 9.5e-76 Identity = 157/221 (71.04%), Postives = 179/221 (81.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I6P0 (uncharacterized protein LOC111470458 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470458 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 283.5 bits (724), Expect = 7.5e-73 Identity = 155/222 (69.82%), Postives = 178/222 (80.18%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BD77 (uncharacterized protein LOC103488605 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488605 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 260.8 bits (665), Expect = 5.2e-66 Identity = 143/227 (63.00%), Postives = 178/227 (78.41%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K949 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G031970 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 247.7 bits (631), Expect = 4.6e-62 Identity = 136/227 (59.91%), Postives = 177/227 (77.97%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CEI4 (uncharacterized protein LOC111010490 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010490 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 240.0 bits (611), Expect = 9.5e-60 Identity = 142/244 (58.20%), Postives = 172/244 (70.49%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. TAIR 10
Match: AT1G13340.1 (Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein ) HSP 1 Score: 149.4 bits (376), Expect = 3.3e-36 Identity = 84/181 (46.41%), Postives = 116/181 (64.09%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. TAIR 10
Match: AT2G19710.1 (Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein ) HSP 1 Score: 110.2 bits (274), Expect = 2.2e-24 Identity = 71/211 (33.65%), Postives = 119/211 (56.40%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. TAIR 10
Match: AT1G34220.2 (Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein ) HSP 1 Score: 109.4 bits (272), Expect = 3.7e-24 Identity = 54/162 (33.33%), Postives = 100/162 (61.73%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. TAIR 10
Match: AT1G25420.1 (Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein ) HSP 1 Score: 103.2 bits (256), Expect = 2.7e-22 Identity = 54/169 (31.95%), Postives = 99/169 (58.58%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0010888 vs. TAIR 10
Match: AT4G35730.1 (Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein ) HSP 1 Score: 99.4 bits (246), Expect = 3.9e-21 Identity = 50/170 (29.41%), Postives = 98/170 (57.65%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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