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Tan0009952 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTGGATAAAAGAAAAAAAAAAAAATTAAAGAACAACGTCATTCGCGTGTTGCTACAGAAAAAAAAAACAGATAAAATAAAAGCGCGTGGTAGTGGTGAAAGATATACAATACAAACCCACCGATTCGGCTCCTTTGAAGTTCGAACCGCCATTGATTCCCTTACACGATCACTCAACTCAAACATTCCTTTTTCTCATTCTCAATCTCAACGTCTCTGCTACAGAAATTTCATCATCTATTTCCCTTTCAATTCGAAGATAGAGAAATGTCGTCGGTGGTGGAGTTCGGGTCGTCGCAAGATCAGGAGCGAGAAGGAGGAGGAGGAGAAACGACCGAACAGCTCGATTTGGTTCCGGCCAAGAGGATTCTGCTTCCTCGTGAGTCGTTTCTCTCTGCGGCCGTCTCTTTGAAGAATCAGGTCGGTTCCTTCTTTTACCTCCTTCTTTTGTTCTACTCTACTGGAGCTCCTCGTCGTCGTCGTCGTTTGTGAAAACGGTGTAGATTAGAACACTTCCCCCCTAACGGTGCTTGAATTTGTTAGGTTGTGGAGGTCACTTGGAAACGACGACGTTACGATAACATCGGCGTTGATCCGACGGCGTACGGCGGCCTCCTTGGAACGGCGTTAACGTGCCTGAGATCGTACGAGGCCACCGGTAACCTTCAGGACTTGCGCTTGTGCTCCGATATCGTCGACACCTGTACTGTTGCAGCACGTGACTCTCACAGGTGATCACGTGACCTTGCTTCCCCTTTCTCTATCTATTTCTATATGATGATTATCAGTAGGTTGGTTGTTTTGTCTACGGGAGCTATCACTTTTACAATGATAATAACAAAAGGGAAACTAAACGTGAAGATAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAGTTAAGGTGGATATGTTGTTTTTTGTTTTTGAAATTTAAACTTAAGAATACTACTTCATTGGTGATGGATCCAGAATTTATATTGAGGGGCTTAAATATGACATGAAAAAAATATTTAAAGTTTACAAACCAGAGTTTGAAAGCTTTTTTGTGATTTGATCTTATCTTTCCTATATATATTATAGAAAGTTTTGTGTGATTTGTTCTGATCTTTCCTATATATATTATAGAAAGTAAAAATGGGCTCGAACCCCTTGGGCCTATGGTAAATCCGCCAATGTCTACCAATGAGTTTATATGTTTTCTTATTATTTATGTTTTAAAAAACCAACCTAACTTTTGAAAACTAAAAAAAATAGTTTTTAAAAAAACTTGATTTTGTATCTTAGAATCTAGCTAAGACTTTAAATGCTTACTTAAGGAAGATGATCTCTATTGTAAGAGAAATTAGGTGAAAATAAGCTTAATTTTAAAAAACTAAAAATAAAAAATAAAATGGTTATTGAACGAGGCCTAAAATATCATTTTAGTTACTTAATTTGTATTTTGTTCTATTTCCGTTTCTTTATTTTTAAATGTTTAATTTTAGTTTAAATATTCTCAATAAAATTTAAAATTGATCTCTAGAATATTACCCTGAGTTAAATAATAATATTAACAATAACCTTTAGTATTCAACTATACACTTATATTTTTGAGAGAAAAATCAATAGATGCTAAAGGTCTCTATTTGGTATGCAATCTGGATTATGTTTTATGTTTTTCAAATACACTATAATATGTGTTTGACAAATGTGTTTTTGAAAATTGTTTTTGGATTTTGTGATCCAAATAGTAGAAATTCTAAAAACAAATTTTTATGTTTTTATTGTATTCATATTCTAAATTTAAAAGTTTAAAATGTAGAATTATATTAAACAAAGGTAAAAATCTCAATAAATATAATATTTTATGTTATAAACTCAATTTCTTTTGTTAAATTAAAATGTGTATAATATAATATATTATAAATTATATAATATTTTATTATAAAATGATAATTCTATAAAATCTATAAAATTCATGTTCATAAATTAATAGATTAAGTAATGACTTATATTTAATCTATTAATTAGTTTTGCAATTACAACTAATTTCATGATCTATAAATATGTTATAAGTCACATTTTCTAAACAACTATTTAGAATGAAATCAAATTTCTAAATCTGCTACTAAACACATATTTAAAAACATGAAATACAACTCTGTTTTCATTGAATCGTTTGTTTTTAAATTTCTATTTTCAATTTACCAAAGATGTTCTAATTTTTTTAAAAGAAAATTCAACTATACTTCTAATTTACAGAGAAAAATAGAGAAAAATTAATAGATACTAAATTTTTTTTAGAGAAAAATCAATACTAAATTAATACTATAGACTAATTTTAAATTTTATTGAAAATATAGTTATTAAAAATAGATTTTTAATTTATAAAAAATTAGACGTTTAAAAGTAGGTAGATCAAATAGAATAAAATGTAAAGGGGAGAGATAAAGATAATATTTTAACTTAAAAAGAAAAGTAAAAAATGAAAAAAGAGTAGAAGACAAAAATAGAGGTTTCAGCTGAAAGTTTGTGGATTAAATTAAATTTTTAAACAACTTAGAAACCAAAACGATAAAAAATCATGGGAATGATTTTTTTGTCAATAAATGATTTAGAGGATTTTTTTTTCTTTCTCCTGAAAAGTGCTCATTCGTCGAAATATTTTATTAAAAAAACTTTCATCTGTTATTCTGAATAAACTATAATCATTTTCCGATATTCTCTCAATTTGTAATAGAAAAACCAGTTATTCTCTCCCAAAGATCAAATCAACGGAATATTGTGATTTAATATTATAGACAAAGGTGTAAAATATGATTTTTGTCTTTTTTTTTAGTACAACAATATTTGGAGTGAGAGATTTGAACTCATGACCTTTATGTTATAAGTTTTACTCGATACCAACGCTTTTGCTGACAATATGATTTTTGTCTTTGATATTGGAACTTGTTCTAATTTAGCTGACTTACTTTCTAATGCCAATGTCCCGTTTGAGTTTGAGTTTTGAGTTGAAAGTATATGCTAACTACTATTGAGCTAGGTTTATTTTGGCTATAAAAATTTGTAGGTAATATTAATACAAATTCATGCTTAATGAAATAAATGTTTATTTTGGTCATTATAGCTATTTCGTACTAATTTATCAAACCAAGTAACTTAAGCGCCGTTTAATAACTATTTGATTTTTTGTTTTTGGTTTTTTAAAATTACGCTTGTTTTTCACATTTTCTCTTCATTTTTTTTATAATGATTTTCATATTTCTTGAGGTAACATTTAAGTTTCTAGCCAAATTTCAAAACAAAATCAAGTTTGTGAAAACTTTTTTTTTTTTTTTTCAAAAATTAGCTTGGTTTTAAAACATAGGTACAAAGTACTAAGATATAGAAACTCATTAGTAGAAGTAGTATTTTTAAGCTTAATTTTTAAAAATAAAAAAACAAAAAATTAATGTTTCGTTTGATTACCATTTGATTTTTGAAAATTAAGCTTAAAAATACTATTTCTATCAATGGACTTTTATGTTTTCTTATTTAGTTTATACCTATGTTTTCTTATCTAGCTCATACCTATGTTTTTACAATTTTTCAAAATTTCATTATTAAGGATTTGTTTCCTTTAATTTTAAGTTTGAGACTTTTTGTTTTTATTAATTTATGTATATTTTACAAGCTTCTTTTGAAGAAAAAATTTTTTGAACTGAGTACTCCATATTCTTTTTTCAATATCTCTCACATTAATTATTCATTTGCTTTGGATAGTTTTTAAATAAAAGAAAGTCTTACAATAATTTAAATAGATGCAAATGAACTTCAAAGTTTTTATGTTTTTAATTCTCAATTATAAATTTTCGTCAATCCTAAAATTGATATATTATATTATTTTATTAATATCTTACCATTTGTTAAATCATTTTTTTCAAGCTTAATAAAGGTTATAATATTTATTGTCTAAAAAAAAAGGTTATAATATTTATTTTTTTCATAATTTAAGATTTTCTTAAAAAAAATAATTTAACATTTTATTTTACTAACTATGTAATGAATTAATTCAAGTTTGACTAATTTAAAAATAATATATTGTTTTTGAAGTTTTAAAATAACGAAGTTAATAAAATATCAAATATTTATATTATCTTAAAAATAATCAAGTTTATGAATATATATTTTATAACACCATTGAAAATGAATATCATGCACACTTTTGTTCAAAATACTATATATTTATGTTATTGTAATAATTTTATTTTATTATGTTTTGAATTTGAAATCATTTATCTATTTACTTTGAATATAATTAAATTGACTATCAAAATTTTTAATACATTAATCTTTTTAAATATTAATTTCTTAAATTTTAATACGAGTCGGTCTAAAATATGTTTTTTCTTATTTTCACATAATAAAATTATATATGTTTTTGAATTATTAATAAAAAAAAGAAAGAGAGCTAAGATTGTTATTTGTTATAAGTACTTTTAATTTAAACTAAAAAAAAAAAGACATGTGAAAGAAGTGAGATAAAGAGATTTTTATCAATTAAAAAATTGTTACGTAGTATTTTAATTTATATTAAAATTTCAATTGAAATAATAGTATCATAGGTAAAACATTCTTATATAAGTATATTTAAAAAATAAAATTATAGAATAAAAGGAAAGATATTTTTGTTAAAGATTTATTAAAATGATAAAATAAAAATAAATGATAAATAATTATTTAAATTTAATTAATAATTAGTAATGATGAATGAAGAAATAAATATGGTAAAAAAAAAACAAAGAGAAAAAAGAGAAGTGGGAAGGGAGAGAGGTAGGAGTGAGGTGAGATGAAGAAAAATAAATATGGTTGTATTTACTCTTTATACAATTTGCAAAAATAGCAAAACAAAAGATCAAACTTAAATAGATTATGCAAAGAGTAAAAAATTTCCTTATATTTCTCGTAAGTATATTGATAATCTATCAGTGATATATTATTGATTTATCTAATAATGATACACTTATGATATATTTATATGAAGTT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ATGTCGTCGGTGGTGGAGTTCGGGTCGTCGCAAGATCAGGAGCGAGAAGGAGGAGGAGGAGAAACGACCGAACAGCTCGATTTGGTTCCGGCCAAGAGGATTCTGCTTCCTCGTGAGTCGTTTCTCTCTGCGGCCGTCTCTTTGAAGAATCAGGTTGTGGAGGTCACTTGGAAACGACGACGTTACGATAACATCGGCGTTGATCCGACGGCGTACGGCGGCCTCCTTGGAACGGCGTTAACGTGCCTGAGATCGTACGAGGCCACCGGTAACCTTCAGGACTTGCGCTTGTGCTCCGATATCGTCGACACCTGTACTGTTGCAGCACGTGACTCTCACAGGCACTTGACGTTTTTGTGTGGTAGAGGAGGAGTCTATGCTCTTGGCGCCGTGGTGTCTTATTACATGGGGGACCGCCAAAGGCTTGCATTGTTCTTCAATCTTTTCCTGCAGGCGGCACAAGAGAAAGCCCTGCCTATTGGACCTGAGGAAGGAGGGTTTGGAATGTCATATGATCTCCTTTATGGGCGAGCTGGGTTCTTATGGGCTGCCTTGTTCATAAATAAGCATCTTGGAGAGCAGAGGTTACCCCATGATCTTCTCATGTCTGTAGTTGATGCTGTATTAGCAGGTGGCAGGGCAGGCGCATCCGATAATCCAGATTGCCCTCTGATGTACCGATGGCATGGGACGAGATATTACGGTGCAGCCAGCGGCCTCGCTGGTATCTTGCTAGTACTTCTCTATTTCCCACTTTCAAAAGAGGATACTGATGATGTTAAGGGGACGTTGAGATATCTGATGAGCAAAAGGTTTCCGCATAGTGGCAACTACCCCTCAAGTGAAGGAAACCCCAGGGACAAATTAGTGCAATGGTCTCATGGGGCAACGGGCATGGGCATTACCCTTTGCAAGGCTTCACAGGTTTTCCATGAAGACAGGGAGTTCAGGGATGCTGCAATTGAAGCAGGGGAAGTAGTATGGAACAATGGATTGGTCAAGGAAGTTGGTCTTGCAGACGGTGTCGCCGGGAATGCGTATGCCTTTCTTTCCCTTTATCGCCTTACCGGAGAGAGTGTCTACGAAGAAAGAGCCAGAGCATTTGGAACTTACCTGTATCATAATGCTAGCAAGCTTATTGCCACCCAAAACCACGTCGGAGGTGACCGTCTTTACTCCCTTTTTCATGGTCTAGCTGGAACTGCTTGCCTTTGGTTCGATCTGCTTGAACCCGAGAAGTCGAGGTTCCCAGGTTATGAACTATAG MSSVVEFGSSQDQEREGGGGETTEQLDLVPAKRILLPRESFLSAAVSLKNQVVEVTWKRRRYDNIGVDPTAYGGLLGTALTCLRSYEATGNLQDLRLCSDIVDTCTVAARDSHRHLTFLCGRGGVYALGAVVSYYMGDRQRLALFFNLFLQAAQEKALPIGPEEGGFGMSYDLLYGRAGFLWAALFINKHLGEQRLPHDLLMSVVDAVLAGGRAGASDNPDCPLMYRWHGTRYYGAASGLAGILLVLLYFPLSKEDTDDVKGTLRYLMSKRFPHSGNYPSSEGNPRDKLVQWSHGATGMGITLCKASQVFHEDREFRDAAIEAGEVVWNNGLVKEVGLADGVAGNAYAFLSLYRLTGESVYEERARAFGTYLYHNASKLIATQNHVGGDRLYSLFHGLAGTACLWFDLLEPEKSRFPGYEL Homology
BLAST of Tan0009952 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FJN7 (LanC-like protein GCL1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GCL1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 541.6 bits (1394), Expect = 8.0e-153 Identity = 273/435 (62.76%), Postives = 327/435 (75.17%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4IEM5 (LanC-like protein GCR2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GCR2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 347.1 bits (889), Expect = 2.9e-94 Identity = 186/408 (45.59%), Postives = 257/408 (62.99%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VZQ6 (LanC-like protein GCL2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GCL2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 327.0 bits (837), Expect = 3.1e-88 Identity = 180/411 (43.80%), Postives = 242/411 (58.88%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9JJK2 (LanC-like protein 2 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Lancl2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 213.4 bits (542), Expect = 5.0e-54 Identity = 136/367 (37.06%), Postives = 192/367 (52.32%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9NS86 (LanC-like protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LANCL2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 207.2 bits (526), Expect = 3.6e-52 Identity = 135/367 (36.78%), Postives = 190/367 (51.77%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. NCBI nr
Match: XP_023514026.1 (lanC-like protein GCL1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023514036.1 lanC-like protein GCL1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023514045.1 lanC-like protein GCL1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 760.8 bits (1963), Expect = 6.4e-216 Identity = 367/421 (87.17%), Postives = 390/421 (92.64%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. NCBI nr
Match: KAG6600644.1 (LanC-like protein GCL1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7031282.1 LanC-like protein GCL1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 760.0 bits (1961), Expect = 1.1e-215 Identity = 367/421 (87.17%), Postives = 389/421 (92.40%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. NCBI nr
Match: XP_038877665.1 (lanC-like protein GCL1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 759.6 bits (1960), Expect = 1.4e-215 Identity = 367/420 (87.38%), Postives = 385/420 (91.67%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. NCBI nr
Match: XP_022942969.1 (lanC-like protein GCL1 [Cucurbita moschata] >XP_022942970.1 lanC-like protein GCL1 [Cucurbita moschata] >XP_022942971.1 lanC-like protein GCL1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 758.4 bits (1957), Expect = 3.2e-215 Identity = 366/421 (86.94%), Postives = 388/421 (92.16%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. NCBI nr
Match: XP_022981096.1 (lanC-like protein GCL1 [Cucurbita maxima] >XP_022981105.1 lanC-like protein GCL1 [Cucurbita maxima] >XP_022981113.1 lanC-like protein GCL1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 756.1 bits (1951), Expect = 1.6e-214 Identity = 364/421 (86.46%), Postives = 388/421 (92.16%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FQF3 (lanC-like protein GCL1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447845 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 758.4 bits (1957), Expect = 1.5e-215 Identity = 366/421 (86.94%), Postives = 388/421 (92.16%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IVI5 (lanC-like protein GCL1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111480349 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 756.1 bits (1951), Expect = 7.6e-215 Identity = 364/421 (86.46%), Postives = 388/421 (92.16%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KZA8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G026880 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 755.0 bits (1948), Expect = 1.7e-214 Identity = 363/421 (86.22%), Postives = 387/421 (91.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D0W0 (LanC-like protein GCL1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold130G00050 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 748.4 bits (1931), Expect = 1.6e-212 Identity = 364/421 (86.46%), Postives = 386/421 (91.69%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BWM3 (lanC-like protein GCL1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494424 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 748.4 bits (1931), Expect = 1.6e-212 Identity = 364/421 (86.46%), Postives = 386/421 (91.69%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. TAIR 10
Match: AT5G65280.1 (GCR2-like 1 ) HSP 1 Score: 541.6 bits (1394), Expect = 5.7e-154 Identity = 273/435 (62.76%), Postives = 327/435 (75.17%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. TAIR 10
Match: AT1G52920.1 (G protein coupled receptor ) HSP 1 Score: 347.1 bits (889), Expect = 2.1e-95 Identity = 186/408 (45.59%), Postives = 257/408 (62.99%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009952 vs. TAIR 10
Match: AT2G20770.1 (GCR2-like 2 ) HSP 1 Score: 327.0 bits (837), Expect = 2.2e-89 Identity = 180/411 (43.80%), Postives = 242/411 (58.88%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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