Tan0009540 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0009540
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG02: 50421564 .. 50425888 (-)
RNA-Seq ExpressionTan0009540
SyntenyTan0009540
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GGCAGTCTGTCTTCGCTCTTCCCCTCGACTTCATCTCTTTTCCTTCTCTCCCTCGTCAATACGATAAGAAAATGAAATAAATCTCTCTGTGCAATACCCTGAAAGCTCTCTCTCTTATTGACCTTTTTCTTCGTGTCGTCGTTCGTTGTTCAGGCCACCGTGGTTCCTCGTGCAACATCAAAATCAGGAAAGTGTTAGCCGATTCGAAGGAAGCGTTGTTCTGGAGATAGTGAAGAGTCTAGATTGGGAGTGCTTGGAAGTGTTGTTGAATAGGAAGCGATGAAGAAAGATTCTTTCTGGGAAGATACTATTTCTGTGTTCCAATATATTGATTAAGAAAGAATCTTTTGGTTTTAGGCTTATGGAGGTTATGGAGTCGAAGAAGAATCGAAGCACCGGAGCGTTGCCTGGAGGAAAGAATCGACAACCATGTCGGAACTAGAAGACGACACTTCAAGAACAGATGCTCTTTCCAAACCAACAAAATGTAGAGTGAGCCAAAATTCTTAACTTCCTCAACTTTTTTATTTCCAAATTCTTACTTCTTAGTTGAATTTCAGTTAATTGTTCGTCAATTCTATACCCAGTCCGACTGAATTTTTCTGGGATTAGGTTAGAACGAGTAGGTTTTAAATGTAATATTAACAAAATCCGGAGACAAATTACCTGAAGGCACCAGACATATCTCTTCGTATATCCCAACTTATTCTAAAATTAGTATAAGATCTAACAAAAAGCAAAAACTTGCACCAATTTAAGTTAATTGTGAAAGGTGTAATTACAAAGTTCTTTTTCTATTGAGCATCATTCAACTACATTGAATCTAACTTTTTCAACCACTACCCAATTTCTAGATTTTTTCCCAACAACTCCTATATAATAACTTTAACCAGATCATGCCATAACTTTTGCTTTCTAAACAGCAGGATGACCTTAATTTCACTTCTGATACTCCACAGTAATTCTCCATTTTTAACACAAGCCAAAGAGATTACAAGAAAGCCTCACAATGTTAATACATCCGACTATGACATTCACACACAAGAAATAAATAGCAACTTACTAAAATACACAAATTATACACGCAATTTATCTTACCTTACAACCTAGAAATTCAACATCAGTTTAAGTAAGTCTGGCAATGATCTCTAATTTAGGATGAAATTTGGGGTGGTTACACCATGTTTATTTTATTTGTTTGTGATTAACTAATACACAACTTTATGATTCGATTATTTAATACATTCTTCTAGGGAGAAATTTGAATGCAAGAATTCTTTTGAGAGGAAACTGGCATTAATATTTTCTTTTTTGCTTATGCCACTACCTTCCCTTTCTCTTTGTAGAAGCAAATACAACCACAATTCTTCTCTTTTACTTGGTTAAATTTGTTCAAACTAAGGTTTACATAAAAGTTATTAATACTTTCATCTATGGGTCATAACACGAATAGGTTCATTTTGGTTAACCATAAGCCATGGAAGTCGATTTAGCAAAAGGAAGTTGATCCAAACATCAACTAGCGAGGCTTTGAGCCATTTTGGTAAGTCTAAGTACATTTTAATCTTTTTCGAACCCCTGTAAGTGTTGTAAGTATGTTAATCGTCTTAATCCTCCTTGGTCGATGTTTATGACATTAGACTAGACCTCACAAACATGGAAACAGACTGTAAGTGTTGTAAGTATGTTAATCGTCTTAATCCTCCTTGGTCGATGTTTTTGATGTTTTTTGCTGTTGTTTTGTTAAAGCTAAAATTTCACAAACATGGAAACAGACTGTTCTATAAAGTTCACAAGTTTCATTTGTTTTTTCTTCATCTCTGTTCGTTGTATTCCTTCACTCATCGAAGCCCATTCCCATGGTATTCTCTCTTTGGCTCTGTACTTAATGCTAACCCTAGATTTGATCTTGCAAAACTCAATGTTGGAATTTCTAGTACTATTTTGCTAACTGATACCTTTTGGAGTTTATCTATAATGTCAATTAATGTTAAATTCTTATTTGTTCGGTTAACTTTTCTGAATTTATCGCAACTCTTGACAAACCATTCGAGAACGCATAAATTGGATAAGGAATATTAATTCTTAGAACGCATAAAAGTTCTTTTATAGCCTTTGAATATAGCTTGTTTTTTAATACAAGGTTTTGTTGTGTTATTTTCTTTTGTGTTTTTTTATATAAAGTCTTCTTTTTATGTAGTATTGAGATTAACAGATTGGGTTCTTTATACAGTTTGAGATTGGCTAAAGATTGGGTGTTTTTGGTTGGTATCTCATCCCATTCTTATTTTCTTGATTATTATATTTGGATTAAATTTGATGATTAAAAAAATACTCTGATGGTTTACATATGTAATTATATCTATGTAGTTATGAATTTGACTTACCATTGACGACATACCAAATAGATAGTATACATATGGAAGGAAGTGAAAGAGAGAAGTCAATGCACATGGTGAGTGGGATTAAGATGCCATTGTCGGATTGATGAGTTTGTTGAATTTGAAAGAATGTAGCATAAGTGTTTGATCATATTCTAATCAAAATAGAGAATAAATTTTTACTAAACAACCAGAACCACAAGTTCTAATAAACCTTACCTTGTTTCTTTCTTTTTCTCTCACCTTGGATTGCAGGTGTCTCCAACTGTTATGATTGCAATTGACAATCATGTAGAAAACATTTCAACAACGGTGAAGGTTGAAAGCTAGTTTAACTATTTGTATTATCTTATTCAACTTTTTAAATGATGCAATCTCTTCATTCCCTCTTCATTCCCTGTCATGTGCCATTTCAAACTAATGCCTTTTTAACACTCTAAATATTTTCTTATATAGGTCAACATGATTGATGCAAGAAGAAACTAGAAAAGAGAAAGGGGAAGAAAAGGGAAAAAAATGCAAGTTGTTGGAGGTGTACTTGCCTTGAGATGTTAATTACTAGAGATGTTAATATTAATGTTATATCAATTTAGGTGATGATTATATTTCTTTCTTTGTACATTTCTTTGGTTTTTCAACTTTATGCTTTCTGTTTTTTGACATTAATATGATCTTATTTATATTTGAGTTAGATGATTGTTGGGTTGAACCGAATAGAAAAGTTAAGGTAAATTTTAATGGCCAATTTTTTTTCTCAGATGTGAATGAAAATCTCTATGTTTGCATTAGATGAGAAATTTTTTACCACTTTTAGGTTTCATAAGCACTTTTAGATCGTTTTGAGTTGTTTTGCTATCGTTCAGTTCATTTTCCTACCGTTGACCCCTGATCTGCTGATCACATATGTCTGCTTGTTTGTGATTTATACTTGGACCCCTCCACACACACACAAAGAGAAAAGAACTTGAAAATTACAGTATCAGGAAAGGATAATTGAGCGCTTTCTCACTGCAGTTATATTTGTTGTCTAGCTAGTTAGTTCTGACAATCTCTTTTTTGCAGCTTAAAGATGCGGGATCTGAAAAGTTGTTATAAATTATAATGAGAAAACACCACTAATTGAGGACCTTAGATCGTGCCTTTCACAAATTTGAACAATTGCTCTAGTAAGTGTTTCTCTAATTTGAATCCTATCCTTAGGAATATGAGGCTTAGGATTGCTTGTTCTGCTGAACTTTCTTGGCATGTTTGAAGTCATAAGTCGTGTTTTGAGCATTTATTAAATTAGTCTTGTTATGCTGAGAAATATCTGATTGTTGAACCCCAACCTTTGTGTATTTGAAGTTAGTGGGTGGCTGGGAAGAATGGTTTTGTTTTTGAAGTGTTTCTGATGTTAAAATAGGTTATTGAAATTTTGGAAAAGTCCTAGTAGCGTCGTTATGCTGCCAAAATTTCTGAGTGAACGACGTGTCTTGAGTAACGCTTAAGTTAGGTTTAGCGTGAGGGTTGCATGATTGAGTAAATTCACTCGTTGCATGTTTTAGAGTTCTGAATTATTAGAGGTATGTTGCTTACTTAGTATGTTTATGCTCACCATTGTTACTTAATGTTGTGTTTTGCAGGTAATACTCAACTACTTGGCAGGTGACAAAGGTGTTGCAGAATTATGGTGACATTTTCAAAGTTTTGGTCATACGGTTGCCAATAAGTTTCATGTTTAAACCTTTTTACAGTGTGTTAGGCTAGCGAATGTAAAGTTCTCTTATTTTGTAAACCTTCTTGAATGTTTGTTGAGTTTATGGCTTAGGATCGTTACAATAGTTCTTGTAATTTTTGAATTGTTGACATGAGCTTTGATAAGTTCTTGTAATTTTAGAATTGTTCATGAACTTAATAGTTTGTTATGGTTAAAGATACGAATTTTGTTAAAGTGTGGAAGATTGG

mRNA sequence

GGCAGTCTGTCTTCGCTCTTCCCCTCGACTTCATCTCTTTTCCTTCTCTCCCTCGTCAATACGATAAGAAAATGAAATAAATCTCTCTGTGCAATACCCTGAAAGCTCTCTCTCTTATTGACCTTTTTCTTCGTGTCGTCGTTCGTTGTTCAGGCCACCGTGGTTCCTCGTGCAACATCAAAATCAGGAAAGTGTTAGCCGATTCGAAGGAAGCGTTGTTCTGGAGATAGTGAAGAGTCTAGATTGGGAGTGCTTGGAAGTGTTGTTGAATAGGAAGCGATGAAGAAAGATTCTTTCTGGGAAGATACTATTTCTGTGTTCCAATATATTGATTAAGAAAGAATCTTTTGGTTTTAGGCTTATGGAGGTTATGGAGTCGAAGAAGAATCGAAGCACCGGAGCGTTGCCTGGAGGAAAGAATCGACAACCATGTCGGAACTAGAAGACGACACTTCAAGAACAGATGCTCTTTCCAAACCAACAAAATGTTCATTTTGGTTAACCATAAGCCATGGAAGTCGATTTAGCAAAAGGAAGTTGATCCAAACATCAACTAGCGAGGCTTTGAGCCATTTTGGTAAGTCTAAGTACATTTTAATCTTTTTCGAACCCCTGTAAGTGTTGTAAGTATGTTAATCGTCTTAATCCTCCTTGGTCGATGTTTATGACATTAGACTAGACCTCACAAACATGGAAACAGACTGTAAGTGTTGTAAGTATGTTAATCGTCTTAATCCTCCTTGGTCGATGTTTTTGATGTTTTTTGCTGTTGTTTTGTTAAAGCTAAAATTTCACAAACATGGAAACAGACTGTTCTATAAAGTTCACAAGTTTCATTTGTTTTTTCTTCATCTCTGTTCGTTGTATTCCTTCACTCATCGAAGCCCATTCCCATGGTATTCTCTCTTTGGCTCTGTACTTAATGCTAACCCTAGATTTGATCTTGCAAAACTCAATGTTGGAATTTCTAGTACTATTTTGCTAACTGATACCTTTTGGAGTTTATCTATAATGTCAATTAATGTTAAATTCTTATTTGTTCGGTTAACTTTTCTGAATTTATCGCAACTCTTGACAAACCATTCGAGAACGCATAAATTGGATAAGGAATATTAATTCTTAGAACGCATAAAAGTTCTTTTATAGCCTTTGAATATAGCTTGTTTTTTAATACAAGGTTTTGTTGTGTTATTTTCTTTTGTGTTTTTTTATATAAAGTCTTCTTTTTATGTAGTATTGAGATTAACAGATTGGGTTCTTTATACAGTTTGAGATTGGCTAAAGATTGGGTGTTTTTGTTATGAATTTGACTTACCATTGACGACATACCAAATAGATAGTATACATATGGAAGGAAGTGAAAGAGAGAAGTCAATGCACATGGTGTCTCCAACTGTTATGATTGCAATTGACAATCATGTAGAAAACATTTCAACAACGGTGAAGGTCAACATGATTGATGCAAGAAGAAACTAGAAAAGAGAAAGGGGAAGAAAAGGGAAAAAAATGCAAGTTGTTGGAGGTGTACTTGCCTTGAGATGTTAATTACTAGAGATGTTAATATTAATGTTATATCAATTTAGCTTAAAGATGCGGGATCTGAAAAGTTGTTATAAATTATAATGAGAAAACACCACTAATTGAGGACCTTAGATCGTGCCTTTCACAAATTTGAACAATTGCTCTAGTAATACTCAACTACTTGGCAGGTGACAAAGGTGTTGCAGAATTATGGTGACATTTTCAAAGTTTTGGTCATACGGTTGCCAATAAGTTTCATGTTTAAACCTTTTTACAGTGTGTTAGGCTAGCGAATGTAAAGTTCTCTTATTTTGTAAACCTTCTTGAATGTTTGTTGAGTTTATGGCTTAGGATCGTTACAATAGTTCTTGTAATTTTTGAATTGTTGACATGAGCTTTGATAAGTTCTTGTAATTTTAGAATTGTTCATGAACTTAATAGTTTGTTATGGTTAAAGATACGAATTTTGTTAAAGTGTGGAAGATTGG

Coding sequence (CDS)

ATGGAAACAGACTGTAAGTGTTGTAAGTATGTTAATCGTCTTAATCCTCCTTGGTCGATGTTTTTGATGTTTTTTGCTGTTGTTTTGTTAAAGCTAAAATTTCACAAACATGGAAACAGACTGTTCTATAAAGTTCACAAGTTTCATTTGTTTTTTCTTCATCTCTGTTCGTTGTATTCCTTCACTCATCGAAGCCCATTCCCATGGTATTCTCTCTTTGGCTCTGTACTTAATGCTAACCCTAGATTTGATCTTGCAAAACTCAATGTTGGAATTTCTAGTACTATTTTGCTAACTGATACCTTTTGGAGTTTATCTATAATGTCAATTAATGTTAAATTCTTATTTGTTCGGTTAACTTTTCTGAATTTATCGCAACTCTTGACAAACCATTCGAGAACGCATAAATTGGATAAGGAATATTAA

Protein sequence

METDCKCCKYVNRLNPPWSMFLMFFAVVLLKLKFHKHGNRLFYKVHKFHLFFLHLCSLYSFTHRSPFPWYSLFGSVLNANPRFDLAKLNVGISSTILLTDTFWSLSIMSINVKFLFVRLTFLNLSQLLTNHSRTHKLDKEY
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Tan0009540 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Tan0009540 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Tan0009540 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Tan0009540 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0009540.1Tan0009540.1mRNA
Tan0009540.2Tan0009540.2mRNA
Tan0009540.3Tan0009540.3mRNA
Tan0009540.4Tan0009540.4mRNA
Tan0009540.5Tan0009540.5mRNA