
Tan0009498 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AATATTTTCATCCGGACAAAATCGCCGGAGCTAAAGAGTTGCAGCCTAATCGTCGGGGGATGGCGGCGCCGTCATCGTCCTCAGCATCTTCAGTAAGGTCATGGAGGACGGTGTTTCTGACTTTGAGGGACGAATCGATCTCTTCTTCAACCTCAATTTCCCAACTTCTCTACGACACCATCTTCTCCCACTCCGACACCTTAATCGCCGCCGCGCACTACCTTCCTCCACCCGAAGTACGATTTCTCCCCCTTTTCTATGCATCTTACTCGAGTTTCTCCAAAAATGTATGATTATCGTTTTTTTTTTTGTTTCTTCTTTCCGTGCATAGGTTTCATCAGATCTGCTGTTTCTCCTAGAAGTGGCTACTCCTGCTTCCGACTCCGTGCAAGACAATGCCCTTATCTTGGCGGACATCATACATCTGGTGAAATTGCCATTTTCGATTTTCATTTTCGATTTTTTTCTTCTTTTGGGCCAATTTCCTCGAGCCTGAATGATGAAATTGGGAAGTTTGTTCTGTTAGTCCATTTTCGTGCTTCTGTTAAGAATATCGCCAACAATTTGACCATTATCTATTTTGCGTATGAAAATTGGTTCTTTGCGATGTTTACTAGGAGAAATTCCTTCCCATTAAAATTATGAGAAATGAAAGCTACCGTTTCAAGTTGTGAGGTCACTTTATATTCTTCCAACGTGAGATCCTCAACATGCCCCTCAAGATGGTGTTTTTTTGGGTTCACCATTCTTGGATCGTATCCCAATTTCAAATTTTGAAATGAATACTCGTTTAGATTTTATGGGCTCTGATAACACATTCATTACACGTAGTTCCATCTCAAAACCAATTGGTAAAGAGAGGAGTAGCCATGTATCTCATAAATTGTGACGTCACTCTACATTTTTTCAATGTGGGATCCTCAACACACCAAAGGTATGAGAGAGACTTAACGTTTCAGCCTTCGGGAATTATCTATCATATTACAATATTTACTGATATAAAATTCCTTCCATTATAAAGAAACTGGAGTTGTAAGATCCTGAATACTATTTGGTCATGTGATTTGAAAACTTTAGAGAATGTAAAAGATTAAGCAAATACTATTTGGTTATGTGATTTGAAAACTTCAAGCTTATTGGTGAATGTTCTCAATAATTGACAGCCTCTACTTGATGTGATGCAAGTTCATCATCAAATGCCGAAATACTATTGAAGATGCAAAATTCATATTGTCGATCTAGTTTCATTTTTCATCATAATAACTATGAATGTGAAAGTTGAATATTTGGTGGGGAAGATATATTGCCTGACTTACAAATAGGTTGAGTATAGCAGAAAATTTCATTGTATATGGAAGATAATTTGCATTTAAAGTCACTGAGAAAATGTGTGCAACACACATTGATTCATTGAACATATTTCATAGACATGCAGCCTGCTAGATCAATGCCATTAAGGTTTAAATTACTATAATCACGTACAATGTAGTAATTATTAAAGAAGATATATTTCTATATGACAAGTAATTCGAGTAGTGCATATTTTTTATATATAAATGTTTCCTGGGATATTTTTACTGTCTTAACATGGTTCTGTCCCTGCTCATACTCTTCTGAATTCTCAGTTTTCTCTAATTATTAACATTCTTGCACCCAATGCAGAGCCACGGTATTTCTTATGAAGTTGCTCTTGAATTTAGTTCTTCCTCTTGGAACCTGCTTCTTCAATATTTTGGAGATGTGATCCAATTCCTACTTGGAAAGCTTCATATTTCAGGAAATTATGCTCAAATCAGGCCTGTCTTGGAAGTTTTGGAGATTGTAAGGTTAGCTTCCCTTTTCTCTCCTGTTAGCTTGGGGAAATACTACACTTTCTTGCTGCTTCAACTTCTGTACACTAGACCAGCATTTTGTCATTCGGGCCAAAAGTGATGTCTGCTCATCTGAGTGATTTATTTTGTGATCTATATAGTGGGAAAGAAAAAATTTTGCATGCTCTGTCATTTGTCGAGAATGAAGCAAACTTTAAACTCTTTGACCTAAATACTGCAGAAAGTATAGTCTATTCATTACCCTGAGGGTATTTAATTTTATTTTTTATGTTCTGGATGCACTGAACGGTCAGTTATTGTTGATAGTCTCTCTCTCTCTTAAGGATCCCTAGATCTTGCTTGTTAATTTGGATATGTTGTTCGTGTGACAAAGGTGAGAGGAATGTGGTTTCTTCTAATTGTCTTCATTTGCCAACTCTTCGTGTATAAGCTCAGGATTTAGAGTAAGCTAAGTTGGTTACTCCTCAAAGTATCGATAAGTTTCATTTTCGAGAGAGAGAGAGTTCATAAAGCTGAATAAAGGGGAGAAATAATTTTCATTGTGATTATTTAATAATCTTTTTGGTGCATATGGAAAGAGAAACAACGTAATTTTTGAATATATATGGGGTGCTTTAGCTGCTATTTGGTTGAATTCACTTCGTAGCTTCTCTTGGGATTTCCTTGACTAAAGAATTTGAAAGTTGTTGTTTGCTTATGATTTGGTGTCTTGTATTTTGTAGTTTTTCCCCCCTGTATGGACTTTTTATCAATTGTGCACATTCTTTTTTTCCCTTAGTATTAAATATTTTTCTGCTTTAAGTTAATTTCTTTGTCCTGTTTCCATTGAAAATTGTCGATCTTTTTTGCAGACACGTTGTCAGCTCGCAACAGCGCAAGTTTTTACCAGCAGAAGATATCCAGCTTTCAAAGTTCTTGCTTTCTGTGATTGCTAGCTCTCAATCGGCAATATTTCCCTCGTCAAACTCAATCATTAGACATGGCCATTCTGCTGAAATTGTGAAAAGTGTAACCAAATGCAATAGTTTATGGGATGTTCAGGCTGAAGCGTTTGATCTACTTAGTCAGGCCATCACAAGTCTGGGGTCATATTTTCCGGTTGATGTTTGGAAGTCAACAATTCAGGTAGAAACAATTCTCTTACATTTGTGGTTTGTCATATATGTAATTGTAGAATAGAAAAAGTGGGATATATTCAATCTGAATGATTTGCGAGCAATATATAGGCAGTCAGCCAATAAGGAAATAGTGTATAGTTTCTACACTAGGAACAGTGAAGAAGCTAACTATGAAAATGAACCAATACAGGAATGGGAAGAACAAATCAGTTTTTGGTGATGATTAATGGAATCCTTGATGCCTTTATTAGTCTGAATAATTTGACAGTAAATATATGATGTTTCCAAGTCTAATAGGATGAGGAAGTGATCAAATGTAAGCCTTTCTAATCTCCTTAGATTAGCATTCCTGAATCTGGGAAGGTAAGTGTGGGGGATAGAGAATCTATCAAGAAAAGAGAGTGAGGGTGTTAAATCACCAAAAGGTTAAGCTGATGGGTTATGGTAAATTTTATTATCTCATAAAAAAATACTCCAACAGTTTCTCTCACTCGTGGGCTTGGAAATTTGTAAGAAGCCCAACGAGTGCAAATCAATATTAATTAGGGAGAAAATGATATCACAAAGGTTCAAACTCATGACCTCCTGCTTTGATACCATGTTAAATCACCAATCAATCCAAAAGCTTAAGTTGATGGGTTATGATAAATTTAATTATATCAACACTTCAATGGAGGATTGTGAGCTTGTTAACAGCAACAAGGTGACAAAATCAGAAAAGCAATTGACAAAACCACATCTCAAAGACCAACTAAAATTCATCATCACTTATAAAGTTTTCACCCCACTTACCCTTCATCGGACCTTTTCTTTTTAGGATAACATATTGAACTTTCAGTATTAAAAAAGAGGAGTACGAAAGGTAATGATGTTAAGGAAGGCATCAACTCAATGCAAGGGCAATGGACTGAATAGAAAAATGCTTCTGATTAACATCAACGAGAAAGTAAAAAATACAACTTTTGAAGATAAAAGGGAAGCCTTGAGAGAAATCAGAGAGTTTTTGAAGACAAGTTTCTTCCTTGGGCAGATCGTTTTAAATCAGCTTGTTTAAAAGTCTCTTTCTGGTGTTCTCTTTTCTAAGTCTTTGATTGATTTTTTGTTCCATGATATTTACTTTAATTGGCATGCTTTTATTGTTCCTTTATCATTGTTGTTATGTTCTTATTTTCTCACTCCTTTATGAAGTTTGTATCTTTTGGGCATTAGTCTCTTTTCATTATATCAATGAAAAGTTTCGTTTCCAATTACAAAAATGGGAGGCCTTGAATTGTTAGGAATTCCAAACCTCACTCCCTTCTGAGCTAACCCTCACCACCCATCCCACAACACTTAAATCTTTTGTCTAAAAAGATGGCTGTAATTTTCTGTTGGTTTCCTGTTAGTGTGATTGGTTTGAGTTTGTAAGTTCTTTTGCATGTTTGGGTTTTAGGGCCTGTAGAGTTCTTTTCTTCAGAAAGATGTTTGTTTCCCTTGCTTGTATCTTTGTTCATCATCTTGTGTTCTTCTAAAAGGAGTGGAGTACCATACTTTGTAGCTTTTCACTACTTTAATGAAGGCTGCAATTAGATTAGCTAAGTGCTCAAAGTTGAATTCTGGAAATACCAAGAGATATTGACTAGTGGGATGTGTGCGGTTGGTAATGTTTATAGGAATGCTTTCATCAAACAAACAAACAAAAAAAAGGTTTGGGGGAATGCTTGCTGTCATAGTTGTCCGAACAATTTTGCTATAAATGTAAAATATTTCCAGCTGGCACAGTAACCTCCAACACTGCATATAACATGTTGAGCTTGATTCTTTTGTTTATAGGTTATTAGAAAATTGATGGATTTCTTGGCATCTAATAGCCTACTTGTTGAAGACAAGGTGATGTCCAGGTATACAGCTTCAGCAATGTTGTAATATCGTTCAGTTTTCATCATTTTCAGAGAGATTTGTTACTTTTGATTTACCTGTGAATTGTTATGCCAGCTGAATCCTTTGGCTTTAGTATTGTTGCTGTAATTTGCCTACTTTTTTTCTTTTGATTGTTACTAGTCTT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MAAPSSSSASSVRSWRTVFLTLRDESISSSTSISQLLYDTIFSHSDTLIAAAHYLPPPEVSSDLLFLLEVATPASDSVQDNALILADIIHLSHGISYEVALEFSSSSWNLLLQYFGDVIQFLLGKLHISGNYAQIRPVLEVLEIVRHVVSSQQRKFLPAEDIQLSKFLLSVIASSQSAIFPSSNSIIRHGHSAEIVKSVTKCNSLWDVQAEAFDLLSQAITSLGSYFPVDVWKSTIQVIRKLMDFLASNSLLVEDKVMSRYYLSLLRCLHLVIAEPKCSLSDHVSAFVAVLRMYFAYGFSNRPLLTCSVGNQGKEPSLTSTKSSLEDPKKTNHSAYRPPHLRRRENLNKQANAQNSPSSMSGESLNCDLISSDSDHDSDGQVRDTDIIQNGKVRVAAIICIQDLCQADPKAFTSQWTLLLPTRDVLLPRKLDATLMTCLLFDPSLKAQIASAAALVVMLDRTTSISLQIAEYKDPTKCGSFMPLSISLGQILMQLHIGVLYLIQRSTHGRLLTILFKILLHLISSTPYPRMPEELLPNIVKALQATIEEGFPFKNDQTDLLVAAISCLNAALSISQSSPHVKEMLSKQISTAQKGNSVLITLLQYSEQVTNPTICIEALQALKAVSHNYPHIMFALWEQVSSVVSNFLHEAAPEVSTGQWRVHSRNSVGIIGEKVITAAVKVLDECLRAISGFKGTEDLLDDNLLDSPFTSDCIRMKKVSSAPSHELKDLNETVDSPEEVCAGMKQWCEVIEKHLPRSLLHTSAMVRAASITCFAGITSPVFSSLSKRKEDYILSSVVNAAVYDEVPSVRSAACRAIGVISCFPQVSQSAEILDKFIHAVEINTRDSLVSVRVTSSWALANICESIRRFFDDFPSRQPTDSIESSHILTLLIECNLRLANDGDKIKSNAVRALGNLSRLIKFSCLTSPCEMPVTNSGLYPVANNTEDLLLKSDSKVHPGCTLKHLYDMPSFYNSSFLERIVQAFISGITTGNVKVQWNVCHALSNLFLNETLRLQDMDRVSSLFNILLLLLRDSSNFKVRIQAAAALSVPPSVYGYGKSFPDVVQGLEHTIENLESNHILPPSFKYKVALEKQLTSTMLHVLSLAASTDYQPLKDFLVKKATFLEEWFKALCPSLGEGSNWRDGEDNSTNHQKREMISKALRSLIEVYASSNHSTISQRFEDLENRFTR Homology
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BLAST of Tan0009498 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5R5R2 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=HEATR6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 149.1 bits (375), Expect = 3.3e-34 Identity = 214/968 (22.11%), Postives = 397/968 (41.01%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009498 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6AI08 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HEATR6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 148.7 bits (374), Expect = 4.3e-34 Identity = 217/975 (22.26%), Postives = 402/975 (41.23%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009498 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6P1G0 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Heatr6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 144.1 bits (362), Expect = 1.0e-32 Identity = 197/830 (23.73%), Postives = 352/830 (42.41%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009498 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7ZY56 (HEAT repeat-containing protein 6 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=heatr6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 142.9 bits (359), Expect = 2.3e-32 Identity = 194/868 (22.35%), Postives = 363/868 (41.82%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009498 vs. NCBI nr
Match: XP_023534365.1 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 2036.5 bits (5275), Expect = 0.0e+00 Identity = 1073/1185 (90.55%), Postives = 1104/1185 (93.16%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009498 vs. NCBI nr
Match: XP_022957979.1 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2030.0 bits (5258), Expect = 0.0e+00 Identity = 1069/1185 (90.21%), Postives = 1102/1185 (93.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009498 vs. NCBI nr
Match: XP_038875588.1 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2023.1 bits (5240), Expect = 0.0e+00 Identity = 1064/1186 (89.71%), Postives = 1108/1186 (93.42%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009498 vs. NCBI nr
Match: XP_022996268.1 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2022.7 bits (5239), Expect = 0.0e+00 Identity = 1068/1185 (90.13%), Postives = 1100/1185 (92.83%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009498 vs. NCBI nr
Match: XP_004145966.1 (uncharacterized protein LOC101212003 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN49951.1 hypothetical protein Csa_000577 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2008.8 bits (5203), Expect = 0.0e+00 Identity = 1054/1185 (88.95%), Postives = 1107/1185 (93.42%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009498 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H3P0 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459349 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2030.0 bits (5258), Expect = 0.0e+00 Identity = 1069/1185 (90.21%), Postives = 1102/1185 (93.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009498 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KAB7 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491546 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2022.7 bits (5239), Expect = 0.0e+00 Identity = 1068/1185 (90.13%), Postives = 1100/1185 (92.83%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009498 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KQH7 (DUF4042 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G146250 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2008.8 bits (5203), Expect = 0.0e+00 Identity = 1054/1185 (88.95%), Postives = 1107/1185 (93.42%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009498 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AUR0 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103482890 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1992.2 bits (5160), Expect = 0.0e+00 Identity = 1051/1185 (88.69%), Postives = 1099/1185 (92.74%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009498 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E0A2 (HEAT repeat-containing protein 6 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025972 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1983.4 bits (5137), Expect = 0.0e+00 Identity = 1037/1184 (87.58%), Postives = 1101/1184 (92.99%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009498 vs. TAIR 10
Match: AT4G38120.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 971.1 bits (2509), Expect = 8.2e-283 Identity = 577/1204 (47.92%), Postives = 783/1204 (65.03%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009498 vs. TAIR 10
Match: AT4G38120.2 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 282.3 bits (721), Expect = 1.8e-75 Identity = 186/459 (40.52%), Postives = 271/459 (59.04%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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