
Tan0008838 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAATCTATGGAAAAGCACTTTTCGATTTTCATGATTGTTTTGTCGTTGGCAATGCTTGAGTCAGCAAGGGCTGCCGAGCTGAAAAAATGGCACATCCACGTTATGAATGGGCTAAGCAATAGCCAAATGTTGTTGGTGCACTGCAAGTCTAAGGACGATGATCTAGGCGAACACAATATCAGCGTTGGAACTGAATTCGATTGGACTTTTAGAGTAAACTTTTGGAACACAACATTGTTTTGGTGTTACTTGAAAAAGCCGAATGCTCAATTTGTTTCATTTGAAGCATTTTGGATCGAGAGCAGATCTGTTTGGCTTTTTCATAAATGTTTTGATTCTAATTGCATTTGGACAGCAAAAGACGATGGAATCTATTTGAAAGACAACATGACTCAAGTAGATGTTTTGATTCATCAATGGAAATAACATGCACCAAAACATACCAGAGTTTATTTTATATGGATTATTTGACTTAATATCTTCCTACACCACATCCATTTTATATATTTTGTTATATTTTTTTTTTCCTTTGTTTCAATAAGCAATATCCATTTGTATGGATGTTCTATTTCTTAATGAAGTTGATTAAGATTTGGTTTGGAATTGATTTTGCAAGGATTGAAAGTTGTTATACAAATTGAAGTTTTCATGATATTAAAACAAATAAGAGGAAAGGGAGAAAAAAAATATCATAAATAGTTTGAGACACGTTTTAACAGAAAAAAAAAAAATAGAGATTTTATATTTTTAAAAATTTATTACATTTTTTCAAAGTCATAAATTTATGATTTTGATTAATTTTCATTAATTAAAAATAATATATCAGACAATTTAAATTTGAGAAGAATATAGGAAAAATAATAAAAGAAAGTTTCATCTTCCTTTCCACTTTCCCTCATTCTAACATATCCAACAAGTCATCCTTCTCCAACCAGCCATATCCAGCAATGACGAAAGACTTCAGCGGTGTTTTGTTATTATGTATTAAGTCAAAGACAGAATCGATGTCAAAGTTGTGTTCTGTGCTTGTTGCTTTGTACAACATGAGACTGCCTGGAGAGGGATAAATAAATCAAAGAGAGTAAAGACCAAATAATTTCACATAAGGTAAAAGGAAAAAATGTTGAGAGAAGAAGATATTTCTGTTAACGATCATTAAAAAAAATTATTTTAATGTTTGGTTTTGCTTTTTCAATATTGATTTTTCATACAATTAGAAGTAATTTTTTTTAAAAAAAAAATATATTTGGAAATAATTTTAAAATAAGTATTTTAAGTTAAGTTATTTTATTATAATTAATTATTTTAAAAAGTATTTAGTTTAAAACTTTCAAAAATATGGATTATTTGCTGATTTGCTGGCTCCTATTATTACCATTCAGCTGCTCATTTGTTTATGATTTTTGTGGTGGCTGCTCCTCCCTTTTGAATAATGTTGTTTATATTCCTAAGTCATAGTAAGTTTAATGATTTGTCTTGTTTTTTATGAGTGTAATTGCTGTAGTTATGACATTTTCCATAAAGTTTATACTTTATTCATTTGTTTATTTTTTTTTCTGAGAATTGTTATCTTACTACATTTTGGTTTTAATAAATGTTTGATTTATAATTGTATACTAGTAAATTATTTTTTGTCACATTACACCATGTTATGCGTACTTTTACGTTTTTGTAAGCGCACATGCCATATGATATAAAAAGAGATTTGATACTCAATTTTTAATTCAATTAAACACAATGAATAATTTCACTTAGTTTTATTTAGATAAGAGAAGTGAAAAGAAGATAAGCAAAACTAATAATTAAAAATAAAGTACATAAAATAAATTAGAGACACAAACACGAACAATAGCTTGGGAAAGGATCCATCATTAAGATGGCACACAATTATAACCCAATAAACATTGAACTCAAAAGTCTAGAAGCTCAAAAGACGTGAAATCTCTTGTCACTAAGGTAAATAAACACTAGTTGTGCAATTGGGTTATTGTCTTAGCTTTTCTCATTCGAGTTTCCATTTAAAAAACTAGTCAATTAATCAATGTCCAACTAATTAACCTTCATCACAAACTACTATTAATTAACTATTCATCACATGTGTACATTTGAGGCCATAAATAACATTAAATAAGTCAAACTTGATAATTAAAAATCACTTAAATTTGAGATCCCTATTAAAACAAAACATTTAAAACATAAATGAGTTTAGCCTCAATTCAAAAATCTCTAAGCTACTGGGAAAAAAACTTAAAAATACTTTCTAAAATATGTATGCGGAAATCATAACTTGGTTCTCATGCCTTTTCTAGCGCGTCCCCGTCATTCGCCTTGTATACCCTTGCTTTAACCTGAAAACATTTTAAAAAGGAAGAAAGAAAACAAAGATAAAGGGGTGAGAATTATAAATAATACCTAGTAAGTAGGGGGTCGAGAGATACAAACACATGCAACATGACTTTTAAAATCATACAACTTTCTTTAGTGGGACCTAAAACTTTCTTTCATAAAATCATGACTTTTCTTTTCGGCTTTAAGTTGCCAATTGAATCAACCTGAGTCCTTTAATGTTGAGTCCCTCACAGACCTCTATAGGTTTGAGTCCTTCACAGACCTCTATAAGTTTGAGTCCCTCACAAACTCATATAAATTTTGAGTCCATCACAAATCCCTATAAGTTGACCCATAGGATCTCTAATGCATGTTTGACCATGCATAAATCCTCAGGAGATCAATTGTCACAACCTTCATAAAACATGTTCATATACATAGAATATGGCATGAGGTCTCATTCTTCAATCACATGTACATATATATTCATAATGTTAGCAACAATACATGACAATTGTATAATCATAAATACATTCATAATTAAAACACATATACATCACAATATCATAAGTGAAAATCTCGATGTATGTAAATATAAATAACTGTGTCAAAACTCTTTTTCAATTACTTAAAATCATTTCTGTTCGGGTACTCTCAAACCCTTAGATCACCTGGAATCCTCTCAAATTCCAAAATGAAATTCTTTTCTAAATCTTTTTGAAACTCGTTTTACTCAGGGTCCTCTCAAACCCTTAGATCATCTAGAATCCTCTCAAATTCCAAGATGAAATTATTTTCTAAATCTTTTAAAAATCATTCTGCTCAGGGTCCTCTCAAATCCTTAGATCACATGGAATCCTCTCAAATTCCAAGATGAAATTCTTTTTCTAATTCTTCTTAAAATTAAATCATCTAGGGCCCTCTCAAACCCTTAAAATGATTCATTTCTAAAATCAAGTCCTTCAGGGAAAATCTTTGAATATCATTTATTTAAATAAGTCCCTTACATTCACCTTTTTGGGTAATCCTTAAAAATATCTTTTAAATAAATCGTTCAAAGCATATATGTTTTCCCTTTCAAAATAATTTGTAGAAAATTTCTTACCTTAGCTCAGCTTGGAACTCCTCAAGCTCCGTTCCTAACTAAAGGTTTCTCTCAATCGTGTTTGATAGTTGAATCCCCTAAATCTAATACATTTTCCTAATTAAAACACATATAAATGAACTTATTTTCGAATCCAACAATAGTTAGGCTAAATTACAACAAACGGAGGGTCAAAACATGCTCGGAAGGTTGAAACTAACCAACTAGATAAACTGGCATTAACCGTTGACCAACACGTTGACCATTGACCGATGAGCGACAACATACCGCGCAAATAGCGTGGAGCTCGGGATCCGGATGCCCACTTGTTGATCTACTCGAATCGGTGGTTAAACTTCAAAACCAATTGAAAAAGTGTTGAATCGCTTGAACCAAAAGTGTGGCGGTTGGAATCGGCGTCCGGTGACTAGTCGATCGTCGACTTAGGCGCCGTTACACCGAGACAATGGCTCGAACGACGTGTGACGTTTTTCGACAAAACCCGGGGCGATGAAGGCTCGACAAAACCACCACCGTCGAGTAGTGAAGGTCGTGGTGATTCCGACGAAGAGCTTACTTTCGAATCTAGCATCAACGAGAGGAGGTTGTAGATTTGCGAACATTGGCGTGTGCCCGATCCGTTGTTCGACGCAGCGAGGAATGGCAAAGCGATGTCCGATCGAGAAATGAGAGCTTACCTAAAACTCAAAAAGAGAAGAGAATTGCAGGTTGATGGTCGTTTTTGTCGAGAAGAAGAGGGTGGAGAGGAAGAACAAAGGCTTTGGAGTCAGGAACAACTCCGATATCCAAGGCCCCGTACAGAATGGCACCGGCAGAGTTGAAAGAGCTTAAAATACAGTTACAGGATTTACTGGATAAGGGATTTATACGCCCTAGCATTTCACCTTGGGGAGCCCCTGTGCTGTTTGTGAAAAAGAAAGACGGAACTATGCGCCTGTGCATAGATTACCGAGAGCTGAACAAGGTTACGATCAAGAATAAGTACCCTCTTCCTAGAATCAATGATTTGTTCGATCAGTTGCAGGGAGCAGCGGTATTTTCGAAAATTGACCTGAGGTCAGGCTATCACCAGTTAAGAATCAGTGAGGAAGACATTCCCAAGACGGCGTTCAGATCGCGTTATGGACATTACGAGTGCACAGTGATGCCATTTGGTTTGACCAACGCCCCTGCCGCTTTCATGGACTTGATGAACCGATTATTCAAGGAGTTTTTAGATACGTTCGTAATTGTGTTTATTGATGACATTGTGATATACTCCAAATGTGATGAAGAACATGAAAGGCACCTGAGGAAAGTTTTACTCACGCTGAGAGAGAATAAGTTGTATACAAAATTTTCCAAGTGCGAATTCTGGCTCAGGCAGGTATCCTTTTTGGGACATGTGGTGTCCAAGGCAGGAGTCTCTATTGATCCTGCGAAAGTGAAAGCAGTCACACAGTGGCCTCGTCCGACCACCGTTACGGAGGTACGCAGATTTCTTGGTCTTGCCGGATACTATAGATGTTTCGTGCAGGACTTCGCCAAGATAGCCATGCCTATGACTCAGCTGACGCGC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MKSMEKHFSIFMIVLSLAMLESARAAELKKWHIHVMNGLSNSQMLLVHCKSKDDDLGEHNISVGTEFDWTFRVNFWNTTLFWCYLKKPNAQFVSFEAFWIESRSVWLFHKCFDSNCIWTAKDDGIYLKDNMTQVDISCEDMTVICMRIFHGFLQNTISQTMEMKSMKKHFSVFLIVLSLAILEPARAAELKKWHIHVMNGLSNDQMLLVHCKSKDDDLGEHNISVGAEFDWTFRVNFWNTTLFWCYLKKPNAQFVSFEAFWIESRSIWLFHKCFDSNCIWTAKDDEIYLKDNLTQVDVLIHQWK Homology
BLAST of Tan0008838 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JLS0 (S-protein homolog 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 111.3 bits (277), Expect = 1.9e-23 Identity = 48/116 (41.38%), Postives = 72/116 (62.07%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2HQ46 (S-protein homolog 74 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH74 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 2.1e-22 Identity = 46/116 (39.66%), Postives = 73/116 (62.93%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LW22 (S-protein homolog 21 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH21 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 2.0e-12 Identity = 49/131 (37.40%), Postives = 73/131 (55.73%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FI84 (S-protein homolog 27 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH27 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 2.0e-12 Identity = 39/102 (38.24%), Postives = 53/102 (51.96%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DN92 (S-protein homolog 24 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SPH24 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 72.8 bits (177), Expect = 7.6e-12 Identity = 45/123 (36.59%), Postives = 67/123 (54.47%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. NCBI nr
Match: XP_022143772.1 (S-protein homolog 74-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 231.5 bits (589), Expect = 9.7e-57 Identity = 101/149 (67.79%), Postives = 123/149 (82.55%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. NCBI nr
Match: XP_016902699.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC107991826 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 227.6 bits (579), Expect = 1.4e-55 Identity = 100/151 (66.23%), Postives = 123/151 (81.46%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. NCBI nr
Match: XP_038896594.1 (S-protein homolog 1-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 222.2 bits (565), Expect = 5.9e-54 Identity = 98/144 (68.06%), Postives = 116/144 (80.56%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. NCBI nr
Match: XP_031745090.1 (S-protein homolog 1-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 219.2 bits (557), Expect = 5.0e-53 Identity = 98/149 (65.77%), Postives = 118/149 (79.19%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. NCBI nr
Match: XP_022143829.1 (S-protein homolog 74-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 214.5 bits (545), Expect = 1.2e-51 Identity = 92/144 (63.89%), Postives = 119/144 (82.64%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CRU0 (S-protein homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013603 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 231.5 bits (589), Expect = 4.7e-57 Identity = 101/149 (67.79%), Postives = 123/149 (82.55%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E390 (S-protein homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC107991826 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 227.6 bits (579), Expect = 6.8e-56 Identity = 100/151 (66.23%), Postives = 123/151 (81.46%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CQH6 (S-protein homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013643 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 214.5 bits (545), Expect = 6.0e-52 Identity = 92/144 (63.89%), Postives = 119/144 (82.64%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CPR8 (S-protein homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013612 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 206.1 bits (523), Expect = 2.1e-49 Identity = 90/136 (66.18%), Postives = 106/136 (77.94%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5N5I9W3 (S-protein homolog OS=Pyrus ussuriensis x Pyrus communis OX=2448454 GN=D8674_027023 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 192.2 bits (487), Expect = 3.2e-45 Identity = 100/264 (37.88%), Postives = 148/264 (56.06%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. TAIR 10
Match: AT4G16295.1 (S-protein homologue 1 ) HSP 1 Score: 111.3 bits (277), Expect = 1.4e-24 Identity = 48/116 (41.38%), Postives = 72/116 (62.07%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. TAIR 10
Match: AT4G29035.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family ) HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 1.5e-23 Identity = 46/116 (39.66%), Postives = 73/116 (62.93%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. TAIR 10
Match: AT5G04350.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family ) HSP 1 Score: 85.5 bits (210), Expect = 8.0e-17 Identity = 44/126 (34.92%), Postives = 70/126 (55.56%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. TAIR 10
Match: AT3G26880.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family ) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 1.4e-13 Identity = 49/131 (37.40%), Postives = 73/131 (55.73%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0008838 vs. TAIR 10
Match: AT5G06020.1 (Plant self-incompatibility protein S1 family ) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 1.4e-13 Identity = 39/102 (38.24%), Postives = 53/102 (51.96%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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