Tan0007932 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0007932
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG01: 47691103 .. 47695165 (+)
RNA-Seq ExpressionTan0007932
SyntenyTan0007932
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGATATCAGTTTCACCACGCCGACGGTTTTTGTTGGCTCATTGATGGAGCATTCACTAGTCATTATGGCCATTAATGGAGAAGGCGAAGATTCCGGAGGGGCGATTAACACGAAGAAGGCCAGTTGTGCAAAAAGGTTAGATCTTGATTCCTCACATTCTCTTTTTCCATTTAAACTGTCTGGGTCAGATCTGCTTGATGCTTGTTCTCTGGAGGTGGGCCAAACGGTTGGCCATAAGGCCCAAGGGTCTGGGGTGGTACATGCTGCATGTGTTGGGTCGCCTATCATACCAGAGCCAAGATGTGGAATTAAAAGTGTGGAGCCTGGACCGATATTTATTGGACCCGACTTAGAGGATGGGTTGGATTTCAAAATGGGTCTGAATAATAAAAATCGCAAATCTGGTCCTTGGAAAAAGAAGGTTTGGGTCATCACATATGGGACTACTTCTGTGGTGAGTAAAGGAGGTTTCTGCAACAATGGTGATTCAGCTGAGATTACTAAGAAGTTAAAATTAGACTTTGTTTCTGTGGGGGAAATGACTTAATGAATGCGGAGGTTGCGCGACACCCCGCCAAGACAAATGAGAATCTTGTGTTGGAATGTTCGCGGATCGGGGAATCCACGGGCATTCTGTAATTTATGCGATGAACTAAGCCGCATTAATCCTCATTTATGTTTTTTTTTTTCAGAAACAAAGTGTAATGCTTCTCAATTGAATAAATTAAAGTTGTGTTTGAATTATTATGGATGCTTTACTATAGACAGGGTTGGGTTGAGCGGGAGGTTATGCCTTTTATGGAAAAATGATATAGATGTGCCCATTAGAAATTTCTCTATCCACCACATTGATGCTACCATAACATGGAATAATTTTTCTTGGAGATTCTCTGGTATTTATGGCCATCCAAATCAATTTCTTCGTTACCAAACTTGGGAACTGTTAAACCGACTACATAACTCGGATGATATATCTTGGTTAATTGGTGGCGACCTGAATGAAATCTTGTGGGTTTATGACAAATTTGGTGGTGGCCTGCGAGATTTGTTCTTTGATGACAAATTTTAGAAAAGCGTTGGATGACTGTAATTTACAGGATCTGGGTTATGAGGGTGATATTTTTACTTGGTGCAATAGGCGGGACTCAAGAGCTCAAGTAAGTCTTCGGTTAGACAGATTTCTGGCAAATGAAAATTTTGGAAAAAAATTTTCAAACCATAGAGTTAAACATTTGGGTTGGGCAAAATCAGATCATAGACCAATTGAGCTTTGTATAAATCCTAGTCAAGGTCAATTATAGGGAAGGGATAAGAAGAAATACTTTAGGTTTGAAGAATTCTGGACTCTGAATGCTGAGTCCAGAGCTCAAATTGTACTTGTGGGAAGATGGGAGCCATCTCAAGTGGGATCAAAATCGATAAATATCTAATTAGAGGAATGTGCCTCTGCCTTGAAGGGGTGGGGTTCATCACAAAGTGCTAGTCTTGCTTCAAGCATCAGAAAATTGAAAGACAAGCTTAAAGTGGCTTATGAGCAACTCGCTCCTTGGAATTTTCAGCAGATTAAAGTGTGAGAGGATGAACTAGATACACTGTTACAGAAGGAGGAGATTTATTGAAGGCAACGTTCTTGAGAGGACTAGCTCAAATGGGAGGAAAGGAATATAAAATGGTTCCATCAGAAGGCTTCTAAAAGAAGGAAAGGTAATGTGATAAGAGGGGGTTTGGATGATTCAGGTGGTTGGCAGGAAGATCCCTTAATTATAGCGAAATTATTTAGCAGTATTTAAGGGTATTTTTACTTCGCAACAACCATTGGGCAAAGATATTGATCTGATAGCCAATCCATGGAAAGTTACAGATGAGATGAACAGTTCACTACAAGCAGATTTTACAAAGGAGGAGATTGAGGTGGCATTGAAACAATTTAAACCAACAAAGACCCCTAGACCGAATGGTTTTCCAGCTCTTTTTTTTCAAAAATGTTGGGACATTGTGGGTCCATTAACCATCCGGAGTTGTTTAGATGTGCTAAATGGGAGGGTTTCTCTGAAGGATTGGAATAAAACACACATTGTTTTAATTTCTAAAATAAAAAATTCGAGGGTGGTGACAGATTATTGGCCTATCAGCTTATGTAATGTGATTTACAAACTTGTCATAAAAGTTCTAGCTAAGAGGATGAAGGGTTTTCTTCATGAGATTAATGATGAGGCACAGTCAGCATTTATTCCTGGCAGGGCAATATCTGATAATATAATTATTGGCCATGAAGTTTTGCATTTCTTGAAAAAACAGAAGACAATTGAACCAGGTCGTGCAACTCTAAAATTAGATATGAGTAAGATCTATGACAGGGTGGAGTGGACCTTTGTGGAAAGAATCATGTTAGCAATGGGTTTTAATGATGCTTGGGTTAGACTAATCTTGGAATGCATTTCATCAGTGACTCTCTCTATTATCTTGAATGGTCGTTCGACGGGAGAATTTATACCTACAAAAGGACTACGTCAAGGGGATCCTTTATCTCCGTATTTATTCTTAATTTGTATGGAGGGTTTATTAGCTTTGTTGAATAATGCTGTTTCGCAAGGGTTGATCACAGAAACGAGAATTTCTCTCTCCGGTCCTAAGGTTTCACACTTACTTGTTGCAAATGATAGTTTGTTCTTTATTAAGGCAAATGCCTGGAGTTTGGAAATTTGAGACAGGTTCTGTGGATTTATGAACGTGCTTCTGGACAGAGTGTGAACTTTGACAAATCTACCTTGTATTTCTCACCTAATGTTCGTCAGGAAACAAAAAAATACCTTAAGAAGATCTTTCCATTACGCGTTGTCGACGAGTTAGGGTTATATCTTGGTTTACCTTCATCTTTTACCAGATGTAGATCATCTGATTTTTTGTTTCTGAAAGACAGAATATGGAAAGTTTTACAAGGCTAGAAGGGTCAGTTTTTTTCGATGGGCGGCAAAGAAGTTATGATAAAGAGTATTGTGCAAGTCATTCCGACCTACACGATGGGTTGTTTTCGAATTCCGAAGAAGGTGTGCACCTAGATAGAGTCCATGATTGCTAACTTCTGGTGGGGTTTTTCTAAGGAGAAGAGGATAATTCATTGGATCAAGTGGTCGGACCTCAGTCAGCCAAAGGAGTGTGGGGGTTTGAGCTTTCAAAGCATGGAGAGTTTCAATCAAGCTTTACTAGCAAAGCAGGCGTGGAGAATCCTTACGTGTCTTGGGTCGACAGTTACTAAGCTTTTTCGAGGAGAATATTTTCCAAATACTAATCTCATTGATGTTTCTATGGAGGGGACTCATTTGGGAGCTTCCTCTTTTTGGAAGAGCTTTCTATGCGGGGTTTCAGCTTCTGAAAAAAGGTTTGAGGTAGAATTTGGGGAATGGGAACCTGATTCGGATGTTTAAAGATCCTTGGATTCCAAGGGATTCGTCTTACCGGATTATAACGCATGCCCCACATCTGAATGAGGTAAAGGTAGCGGAGTTCGTCAATGATTCTGGACAATGGGATGTTAGCAAATTAGAACAGTCCCTTTCTCTCCAAGATGTGGAAGATATTTTGAAGGTACCCATTTCACAAACTAATGCTCAGGATAGTTGGGTTTGGCATTATGATAAGTGTGGCAGTTATTCAGTTAAGAGTAGGTATAAGGCAGTTATGCTTTCTAAGCAAAACAAGGTCTCTTGTAGCGAAAATAATTTACGTGGTTGGTGGAAGAATGTTTGGACTGCAAGGATTCCAACAAGAATTAAACTGTTTGTTTGGAGGTCATTTCATAATGGCCTCCCAACATCCCAGACAGGCAATTGAATGCCTCTCCATATTTCCCTGTTTGCAGGAAGAGGCCTGAGACAACGGGCCATGCCTTATTCACGTGTAATTTTGCAACAAAGTTCTGGAAGGATATGTTGCTCGAAATGATGGGTGTCACCTCCCGGACTTTTTCTATTCAGGACACTTGGCTTGATGTTATAAAGACACTGACAATCGAGAAGCTTGAAATGGCATTTGTGGGGGCATGGCCTATTTGGAACGATTGA

mRNA sequence

ATGGATATCAGTTTCACCACGCCGACGGTTTTTGTTGGCTCATTGATGGAGCATTCACTAGTCATTATGGCCATTAATGGAGAAGGCGAAGATTCCGGAGGGGCGATTAACACGAAGAAGGCCAGTTGTGCAAAAAGGTTAGATCTTGATTCCTCACATTCTCTTTTTCCATTTAAACTGTCTGGGTCAGATCTGCTTGATGCTTGTTCTCTGGAGGTGGGCCAAACGGTTGGCCATAAGGCCCAAGGGTCTGGGGTGGTACATGCTGCATGTGTTGGGTCGCCTATCATACCAGAGCCAAGATGTGGAATTAAAAGTGTGGAGCCTGGACCGATATTTATTGGACCCGACTTAGAGGATGGGTTGGATTTCAAAATGGGTCTGAATAATAAAAATCGCAAATCTGGTCCTTGGAAAAAGAAGGTTTGGGTCATCACATATGGGACTACTTCTGTGGTGAGTAAAGGAGGTTTCTGCAACAATGGTGATTCAGCTGAGATTACTAAGAAGAAGAGGCCTGAGACAACGGGCCATGCCTTATTCACGTGTAATTTTGCAACAAAGTTCTGGAAGGATATGTTGCTCGAAATGATGGGTGTCACCTCCCGGACTTTTTCTATTCAGGACACTTGGCTTGATGTTATAAAGACACTGACAATCGAGAAGCTTGAAATGGCATTTGTGGGGGCATGGCCTATTTGGAACGATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGATATCAGTTTCACCACGCCGACGGTTTTTGTTGGCTCATTGATGGAGCATTCACTAGTCATTATGGCCATTAATGGAGAAGGCGAAGATTCCGGAGGGGCGATTAACACGAAGAAGGCCAGTTGTGCAAAAAGGTTAGATCTTGATTCCTCACATTCTCTTTTTCCATTTAAACTGTCTGGGTCAGATCTGCTTGATGCTTGTTCTCTGGAGGTGGGCCAAACGGTTGGCCATAAGGCCCAAGGGTCTGGGGTGGTACATGCTGCATGTGTTGGGTCGCCTATCATACCAGAGCCAAGATGTGGAATTAAAAGTGTGGAGCCTGGACCGATATTTATTGGACCCGACTTAGAGGATGGGTTGGATTTCAAAATGGGTCTGAATAATAAAAATCGCAAATCTGGTCCTTGGAAAAAGAAGGTTTGGGTCATCACATATGGGACTACTTCTGTGGTGAGTAAAGGAGGTTTCTGCAACAATGGTGATTCAGCTGAGATTACTAAGAAGAAGAGGCCTGAGACAACGGGCCATGCCTTATTCACGTGTAATTTTGCAACAAAGTTCTGGAAGGATATGTTGCTCGAAATGATGGGTGTCACCTCCCGGACTTTTTCTATTCAGGACACTTGGCTTGATGTTATAAAGACACTGACAATCGAGAAGCTTGAAATGGCATTTGTGGGGGCATGGCCTATTTGGAACGATTGA

Protein sequence

MDISFTTPTVFVGSLMEHSLVIMAINGEGEDSGGAINTKKASCAKRLDLDSSHSLFPFKLSGSDLLDACSLEVGQTVGHKAQGSGVVHAACVGSPIIPEPRCGIKSVEPGPIFIGPDLEDGLDFKMGLNNKNRKSGPWKKKVWVITYGTTSVVSKGGFCNNGDSAEITKKKRPETTGHALFTCNFATKFWKDMLLEMMGVTSRTFSIQDTWLDVIKTLTIEKLEMAFVGAWPIWND
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0007932.1Tan0007932.1mRNA