Tan0007396 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0007396
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionReverse transcriptase
LocationLG03: 15950801 .. 16017035 (+)
RNA-Seq ExpressionTan0007396
SyntenyTan0007396
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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GAATTGAAGTACATTGACTCCATTTCAAGGTCCATGGCTTTAATCCACTCGTCCCTATCTATATCATTCATTGCTCGTTTATAGGTCAATGGATCCTCAATGCCATCATCGTATGACGACTTGGTTTCTGTCAAACCCATGTAACTGGTCGGGTTGTCTAACATCCCTCCCACTACGTCGAGGCATTCTCAACTCTTGAGAAGGACCACTTTAACAACAACTCTTGTTGATTTATCCGTAGCTTCCTGGAAATTTCACTTAAGACAATCTCGCTACGAGGGTCGATGATCTCTCATGTGGTCTTCCTCTAAGAACGTGGTGTTTGTCGACACAAGCACCTTGTCCTCTTGAGGATCATAAAGCAGACCACCTTTCGTTTCTTTGGAGTACCCTACTAATAGGCATAATTTTGAACGATGTTCCAGTTTCTTTGGATTGGACACTAGCACATGTGCCGGACATCCCCAAATCCTGAAGTGACGTAAACTACCTTTACGCCCTTTCCATAACTCATAGGGTGTTTTTGAAACACTCTTAGAGGGAACCATGTTCAAAATATATGCGCAGACTTCTCATCGCATATCCCCAAAACGAACTAGGCGGTGAGCGTAGCTCATCATGGATCGAACCATGTCTAACAGGGGTTCTATTTCTCCTCTCGGATACACCATTCTCACGAGGTGTACCAGTGTTGAGAGTTGGGATACGATTCCATATTCTATCATATAGTCTTGGAATCTCAAATCCATATACTCTCCACCTCGATCTGATCGAAGTGTTTTAATCGTTTTACCTAATGTATTCTCAACTTCTGCCTTATATTCCTTGAACTTTTCATGGGTTTCAGACTTATGATGCATTAGGTAAAGATAACCATACCTAGAATAATCATCAATAAAACCGATGAAGTATTCATATCCTCCTCGTGCCTTGACATTCATAGGACCACAAAGGTCCGAATGCACGAGTTCCAAGGGCTCTTTGGCTCTATAACCTTTTTCAGAAAAAGGTCTTTTAGTCATTTTTCCTTCGAGACAGGACTCACATGGTGGTAAAGAGTTGTCCTCTAACTGACTAAGAAGACCACTCTTGACCAATCTCCCAATCCTATTGAGATTAATGTGACCTAGTCTCAAGTGCCAAAGATAGGTACTAGGAGAAAGTTTCTGCCTTTTATTTTGAGTATCAGCTGTTTTAAACATCTCAGTGTTCAAAAGCAAACTTTCACTTCTGTTGGTCTTAACACATATATTTGTTTTCAAGTTTAGCAGAACATATTCGTACACCTCTTTTGCAAATGAACGCTTCATTATGATCAAAAGATACTTTATACATATGTTCAAGCAAACAAGAGATAGATACAAGATTTCTTTTGATTCCAGGAACCAAAAGTACATTTTCTAATAAAACAAATCTATCTCTAAACAACAGCTTCACTGCTCCCACTGCTTTGGCTGAGACAACCTCTCCCGTTCCAACCCTGAGAGATATCTCCCCATCAGCAAGCTGCTGCCAGGAACTAGTTTCCTGAAAAGAAGAACAAACATGGTTAGTGGCTCCTGAATCTAATATCCAGGCAGAATCATCATGTTCCACTAAACATGTTTCAAAAACGAGTAAATCATATTTACCTTGTTTTTCTTTCTCGCCTTTCTTTTTTCTCGCAAGGTATTTGAGTGAGTTCCTCTTCCAGCCCCAAATGCACCACAGTGGAAACATTTTCCTGTGGCTTTGGCCTTGCGTGTGGGAGCCTGTCCCTTCCCTTTGTCCTTCTTCTTCTTTTTCTGAATACCCTTATTTTTAGAAAAAGAAGGACCAGACTTGGTCCCAGAGGATGATCCTCTAAGGAACTTGTTCAAGTGACAACATTTGCCTCTTTCTCTTTTCCTTTTGATTTCATGAGGGACTCAAAAGTCCAGAGCTCGTTGAGGAGAGTAGTCGAGTTATACTCTATTTTATTCATTACCGCATTTGTGCGGAATGGCAGAAACTCTTGGAAGAGATTCCATAATAAAAGTTACCCGACTTCTCTCATCTATGATCGCCCATTTACTTGACCACGTTGAAGTGGGTCATCATGTCAAGGACATGTTCCCTATGAGAGGCTCCCTCCTTCATACGGGAGTTGTAAACGATTTGACAAAGATCATAATGGACCGATGAGGACGGTTGTCCAAACATCGCTCGTAATGATCCCATGATCTCCTTTCTTTGTGACCATGGTCTCATGTTTCTTAGACAACACATCGGATATGTTTGGCTAAGATATAGACTCGGGCCTTCTCATTAGCCCTAATCCATCTTTCATAAGCATCCCGAACCATTCGGTTTTTGCGGTTGAGTCTGGGGGGGAGGACATTCCTCCGTTAAGACGAACCTCGGATCATCAAGAACAAGAATTGTATTCAAGTTTGACTTCCGAGGTTCCATAGTTATCGCGCGCTAAGTTTATTGAAGGCGAGTAATTGGATAAAAGAGTTCGACATGTGAAAAAGAATGAATTCTATTAGTGAATTGTTTGTAACCTATCCAATTTAAGAATTTAGCAAAAGTAATAATGTACCCATAAACTCATTATTGTTTTTGCAACGATACTTCAATGAGTCAGAGCAACCACTACCGAGGGGCAGTCAATCACTCCTTCACCGAACCAAGACATTCTTGACTAAATGCTAATACCGGAATAACTCTTATTCCTATAACATTCGAGTTATCGCTACTTTGGTCAAGAACTTACTAACACTTAGCAATTCTTGTAAGTGTGACCCGCCATTTTAAGACCTCGGAGGTCGGCCCCAACAATGTTACCAAACTGGAGAGACAAAGCTGGGAATGGACCTAAGAGACCCTATCCATTTCTCGGAGTTTGAGTTGTTCTCAATCCCATGTTACATCCTCCGAATGGATGGTGCTACTTGCGGGCAACTGCAGCGCAACATGGGAATCTCACGGTCCAACCTAATGGAGGAGACCGTAGGATGTGTTGACACACTTCCTTCACTCACTTACTATAAATACTTTCTCCATTCACCTTGCTCTTGATTTATGCAAACACCATCCGAATGGGGATGCCCTATTGACATCACGAGGCCGAGCATAAATCTCACGGTGTGAACTTCGTGGAGAGCGTAAGAGGAAATTGATATATCATATATACCTTTTCATTCCCACTAAGTATTTTAAAGCAGTTTGGGTATACTTTTACTTAGGCATATTCCTACTTAAAACAATATAACCTAAGTCTACCAATATAACAATTATCTTTGGAATTACCTAAGTCTATTAACCTTTTAATAAACCTAGGTCTATGAGTTTAATTTATTAACTTTTAATAAACGCCACTCACGAAAGATAATTTATAAACCTATGGATTAAATTCACTCCCGCATCGGTTCCCGTGTAGGGGTGTTCCGCTTCGCACGACTTAAGTACCCCAACCCAGCTGTAACCTTCCTTAGTCGAGTCCTCTTTAATCAAAGTTTATAAATTATTAGTTTCCTAATTCTAATCTTATTAGAACTAGATAACCTTAGATCTAATTAATTTCAGTTCTAAAACCATTTTAAAACTAATTAATTAACCTTAGGTTACATGCATTTCTATGTTATAAAATATTTCATCATTCATCACATGAATAAACATACATTTATAACAAATTCATCACATGAATAAATGCATAGCAATTATATGTTTAATTTTTAATTAATATAACCCTTATATTAATTATAATTAAAACATATAATATTTATTTCATAAATTAATATAACTCTTATATTAATTCTCATGAAACCAATTAACATGCATACAATATATTATAACACTTATAACATACTTTCAATGCATGGAGCATGCTTCCTATGGTGGGATTTTAAAATCTATATGGCATACTTTATGCACATATAATTAGAGAATTTAATTAAAACATACATTCACAATGCATAATTAATTAAACACACTAAAGTGGACTGGTTTTGGCATCTAATGGAAGCAAACTACTAAATTATTACAATAATAATCTAGAATTGATATCAAACCACTTGAACACTTCAAATTTGGGTCGAACCAAATTTTGCAAATGTGTGAACCAGACCTTCATAAGGTTAAACCGGCTGTAAAAGGATGAACGGGCCTCCAATTGGTTAAACGGACCTCCAAAATGGAAAAACCGGCCTCGAAATAGTCGAACCGGTCTAAAACCAACCGAACCGGACCAAAATCGAGCCAAACCGGTCCAAAAACCATTGAACCGGTCAAAGTCAACTGAACCGGTCAATGGTCAACGGTCCAGTCAAAGTCAACTTCTTCTTCTTCAAATGAGAAAACACGGGCTGGAGTGAATTTGGTTACTGTAGCATAATTGCAATTTAAAAAAACAGCCTCTGTTTTGAGTTTTCTTTGACCTTTCGAGCTTCTCTCTTCAAATTGAAGGCCTTCCCGAACTCCAATCGATCCAAAATTTTTACAGCTTATTCTACACACATTAATGCTCAAACACACTTGAGCAATTTGAAAATAAAGCACAAATTGATGCTCAATTTAAATGCCAAAACCAGAAAGAACACTTTAAACGCCTGAGAAAAATGTATTTCAAAAACACCCACCACAAAACAAAATAGATCAAATTGAGTGCTCAAAATTGCTCTGATACCAATTGAAAGAGTCTAGCTTTCGAGGTATTTCTGAACCAATCTATTGGGAATCTCATTTTCATGTCTTCATAAGAGTTTTAGAGGATTCAAAAAGGAAGAGTTTGGTATAAAGTGCATTCTTTTTGGATAAGTAATGAAGAAGTTATGGCTATCTGAATACAGGGCATAAAATCTGTTAAATGCTGGAATTTTTGTTGGAATGTTTTCTTGTAGTTTTAAAGTTAAAACCATGAGCTCGAGGTTCTAAAACATAGTTTTGGTTTGTTTGACAGGCCAATAACGATTAGGTCGAGTGTACGGGTCAAGAGTTTAGTTCTAACACTGTGAGTGACAAAACGAACCTTGAAAATGGTTTATAGGCTTGTATTATGCTTATGAAATGCAAGGTTTTGCTAAAACGAAATGGTTTAGATGTTTATTGTTTTCTTGAACACTTGTTTATGAGCATTCATGATTTCTTAGAAATGTTTTAAAGTGTTCATGATGAGCCTAAAAGTCTTTATAAAGTTTATACATGAGCATATGTCCAATGGTTGCCAAAACTTATGAAAATGTGATGATTTCAAGCAAGCATGTACTAGCAAGTATGTTTTAAAGATTTCTAGTTTTATGAACAAGCTAAGTAAGCTTGAGTTTTATGAAAGAAAAGATAAGCTGGCATGTTCAAATGTTTTCATGGTGATCTTTTGAGATATTGAGCCCGAGGCTATGTAGTACCGCAGTGTGCACACAGGTCTTATTCGTTGTCGACGTTGAGTGTACTCGTGACAACAGGTACATTGTCGTGAGTCTTTGGCGGGCCCCACTACGACAAAGACGATGGGAGTCTTTGGCGGGGCCCCACTACATCATAGAATAAACGTTGGTGTACTGGGCGTGCCCTACACAACGTAGATTGTGACATGTTTTAAAAAGAGTTTATATCATTTACATGCCTTACGAGATTTTAACGGTGTCTTGCTAGTTTTCATGAAAAGCTATAATGATTACACGATTATTTTTAACGCTTGATTACAGATGCATATGCTCACAGATGGCCAGGTGATATGATTTACGAGTTAATAGCTTTCTTTTAAACTCAAGTCACTCACTGAGCTTTATAGCTCATTCTTTCAGTGTTTTTTCCACTTTTTTCGTAGAGATCGAGCTCCCTGGCTCGATAACTCGCCATAATCTGCTTTGGAAGCTTCTCATGTTTGATATGTTGTACGTGGTTGGTGTGGTTTAGCAAGTCCATATGTCTGTAAATTATTTTAAGAGAACTATGTAGTTATAGTCGTATGTGCTTTAGAGGTTGTGGTTGCTTAATTAGTGGTTTGGACTGTTTGTGGTTCTGATGTTCTAGCTCATCTTAGTTTCCAAGAGAGACTTGAGAAGAGTTTCTCCTCATGTACGCCTCTTATAGATGTCCAGATTCATTGTGTTAAGTTTAAAGTGTTCCATATGCGAACATAGTTTGTTTCGTGTAAAGTAATGTCACAGTATAGTTAAGAGGTAATAATGTCTGTTGGCTTCATGCCGTCTCCCGTGCTAAGTTAGCATGTGGTTCGGGAGGGGGTGTGACAACTTGGTATCAGAGCAGTTAG

mRNA sequence

ATGAGAGATTACTTGAATTCCTTATTGCAAGAAGGGATTGTATCGTGGAATAATCATGGACACAGGATGCCCCCACTCGCATGTCAACCACATGAACGAGTCAGATCACCTCGTTTGTATCTAATACAAATATGCGATGTAGGGTCGATGACTATAATAGAATATGAGAAGAAGTTCACAAAGTTGTCAAAGTATGCTAGCACTATTGTTGCAAGCGAGATAGATCGATGTCTTATTCTTTTGTCGACATTGAGTGTACTCCGTGACAACAGCGCTGTCATCGAGCTCCCTGGCTCGATAACTCGCCATAATCTGCTTTGGAAGCTTCTCATGTTTGATATGTTGTACGTGGTTGGTGTGTTAAGAGGTAATAATGTCTGTTGGCTTCATGCCGTCTCCCGTGCTAAGTTAGCATGTGGTTCGGGAGGGGGTGTGACAACTTGGTATCAGAGCAGTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGAGAGATTACTTGAATTCCTTATTGCAAGAAGGGATTGTATCGTGGAATAATCATGGACACAGGATGCCCCCACTCGCATGTCAACCACATGAACGAGTCAGATCACCTCGTTTGTATCTAATACAAATATGCGATGTAGGGTCGATGACTATAATAGAATATGAGAAGAAGTTCACAAAGTTGTCAAAGTATGCTAGCACTATTGTTGCAAGCGAGATAGATCGATGTCTTATTCTTTTGTCGACATTGAGTGTACTCCGTGACAACAGCGCTGTCATCGAGCTCCCTGGCTCGATAACTCGCCATAATCTGCTTTGGAAGCTTCTCATGTTTGATATGTTGTACGTGGTTGGTGTGTTAAGAGGTAATAATGTCTGTTGGCTTCATGCCGTCTCCCGTGCTAAGTTAGCATGTGGTTCGGGAGGGGGTGTGACAACTTGGTATCAGAGCAGTTAG

Protein sequence

MRDYLNSLLQEGIVSWNNHGHRMPPLACQPHERVRSPRLYLIQICDVGSMTIIEYEKKFTKLSKYASTIVASEIDRCLILLSTLSVLRDNSAVIELPGSITRHNLLWKLLMFDMLYVVGVLRGNNVCWLHAVSRAKLACGSGGGVTTWYQSS
Homology
BLAST of Tan0007396 vs. NCBI nr
Match: KAA0054351.1 (reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] >TYK12388.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 71.6 bits (174), Expect = 6.5e-09
Identity = 46/120 (38.33%), Postives = 63/120 (52.50%), Query Frame = 0

Query: 68  TIVASEIDRCLIL-LSTLSVLRDNSAVIELPGSIT-----------RHNLLWKLLMFDML 127
           ++   E+D+ +I  LSTLSVLRDN AV+E+  S+             ++  W  L F+ +
Sbjct: 23  SLQTEELDKTVIFPLSTLSVLRDNDAVVEIQLSVPDTLATSAESSGSNSSTWLELYFESV 82

Query: 128 YV------------------------VGVLRGNNVCWLHAVSRAKLACGSGGGVTTWYQS 152
           +V                         G++RG+NVCWLHAV RA+ A G GGGVTTWYQS
Sbjct: 83  HVEMFCYFTNQVISGLHLVFNVLVRSTGIVRGDNVCWLHAVFRARTAGGLGGGVTTWYQS 142

BLAST of Tan0007396 vs. NCBI nr
Match: TYK11835.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold152G00520 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 68.6 bits (166), Expect = 5.5e-08
Identity = 46/119 (38.66%), Postives = 62/119 (52.10%), Query Frame = 0

Query: 68  TIVASEIDRCLIL-LSTLSVLRDNSAVIELP---------GSITRHNLLWKLLMFDMLYV 127
           ++   E+D+ +I  LSTLSVLRDN+AVIELP          S   ++  W  L F+ ++V
Sbjct: 69  SLQTGELDKTVIFSLSTLSVLRDNNAVIELPVPDTLPTSAESSGSNSSTWLELYFESVHV 128

Query: 128 ------------------------VGVLRGNNVCWLHAVSRAKLACGSGGGVTTWYQSS 153
                                    G++RG++VCWLHAV RAK   G GGGVTTW  S+
Sbjct: 129 EMFCSFTNQVMSELHLVFNVSVGSTGIVRGDDVCWLHAVFRAKTVGGPGGGVTTWESST 187

BLAST of Tan0007396 vs. NCBI nr
Match: KAA0058280.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold274G006090 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 2.1e-07
Identity = 45/114 (39.47%), Postives = 59/114 (51.75%), Query Frame = 0

Query: 73  EIDRCLIL-LSTLSVLRDNSAVIELP---------GSITRHNLLWKLLMFDMLYV----- 132
           E+D+ +I  LSTLSVLRDN+ VIELP          S   ++  W  L F+ ++V     
Sbjct: 89  ELDKTVIFPLSTLSVLRDNNVVIELPVPDILPTSAESSGSNSSTWLELYFESVHVEMFCS 148

Query: 133 -------------------VGVLRGNNVCWLHAVSRAKLACGSGGGVTTWYQSS 153
                               G++RG++VCWLHAV RAK   G GGGVTTW  S+
Sbjct: 149 FTNQVMSELHLVFNVSVGSTGIVRGDDVCWLHAVFRAKTVGGPGGGVTTWGSST 202

BLAST of Tan0007396 vs. NCBI nr
Match: KAA0066738.1 (DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK27886.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 1.0e-06
Identity = 44/101 (43.56%), Postives = 57/101 (56.44%), Query Frame = 0

Query: 68  TIVASEIDRCLIL-LSTLSVLRDNSAV-------------IELPGSITRHNLLWKLL-MF 127
           ++   E+D+ +I  LSTLS+LRDN  +             IELPG  T   L +K   + 
Sbjct: 40  SLQTGELDKTIIFPLSTLSILRDNDVIVYHMNMFPTFHVEIELPGPDTLPTLFYKPSDVR 99

Query: 128 DMLYV-----VGVLRGNNVCWLHAVSRAKLACGSGGGVTTW 149
              YV      G++RG++VCWLHAV RAK A G GGGVTTW
Sbjct: 100 AASYVCWEGSAGIVRGDDVCWLHAVFRAKPAGGLGGGVTTW 140

BLAST of Tan0007396 vs. NCBI nr
Match: TYK14494.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold15G00050 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 62.8 bits (151), Expect = 3.0e-06
Identity = 34/70 (48.57%), Postives = 42/70 (60.00%), Query Frame = 0

Query: 82  STLSVLRDNSAVIELPGSITRHNLLWKLLMFDMLYVVGVLRGNNVCWLHAVSRAKLACGS 141
           STLSVL DN AV+E+   +                  G++R ++VCWLH+V RAK A G 
Sbjct: 22  STLSVLHDNDAVVEIELPVADTLPTSAESSESNSRSAGIVRRDDVCWLHSVFRAKTASGP 81

Query: 142 GGGVTTWYQS 152
           GGGVTTWYQS
Sbjct: 82  GGGVTTWYQS 91

BLAST of Tan0007396 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CMM1 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold302G001700 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 71.6 bits (174), Expect = 3.1e-09
Identity = 46/120 (38.33%), Postives = 63/120 (52.50%), Query Frame = 0

Query: 68  TIVASEIDRCLIL-LSTLSVLRDNSAVIELPGSIT-----------RHNLLWKLLMFDML 127
           ++   E+D+ +I  LSTLSVLRDN AV+E+  S+             ++  W  L F+ +
Sbjct: 23  SLQTEELDKTVIFPLSTLSVLRDNDAVVEIQLSVPDTLATSAESSGSNSSTWLELYFESV 82

Query: 128 YV------------------------VGVLRGNNVCWLHAVSRAKLACGSGGGVTTWYQS 152
           +V                         G++RG+NVCWLHAV RA+ A G GGGVTTWYQS
Sbjct: 83  HVEMFCYFTNQVISGLHLVFNVLVRSTGIVRGDNVCWLHAVFRARTAGGLGGGVTTWYQS 142

BLAST of Tan0007396 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CJX3 (CCHC-type domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold152G00520 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 68.6 bits (166), Expect = 2.6e-08
Identity = 46/119 (38.66%), Postives = 62/119 (52.10%), Query Frame = 0

Query: 68  TIVASEIDRCLIL-LSTLSVLRDNSAVIELP---------GSITRHNLLWKLLMFDMLYV 127
           ++   E+D+ +I  LSTLSVLRDN+AVIELP          S   ++  W  L F+ ++V
Sbjct: 69  SLQTGELDKTVIFSLSTLSVLRDNNAVIELPVPDTLPTSAESSGSNSSTWLELYFESVHV 128

Query: 128 ------------------------VGVLRGNNVCWLHAVSRAKLACGSGGGVTTWYQSS 153
                                    G++RG++VCWLHAV RAK   G GGGVTTW  S+
Sbjct: 129 EMFCSFTNQVMSELHLVFNVSVGSTGIVRGDDVCWLHAVFRAKTVGGPGGGVTTWESST 187

BLAST of Tan0007396 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UT17 (CCHC-type domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold274G006090 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 1.0e-07
Identity = 45/114 (39.47%), Postives = 59/114 (51.75%), Query Frame = 0

Query: 73  EIDRCLIL-LSTLSVLRDNSAVIELP---------GSITRHNLLWKLLMFDMLYV----- 132
           E+D+ +I  LSTLSVLRDN+ VIELP          S   ++  W  L F+ ++V     
Sbjct: 89  ELDKTVIFPLSTLSVLRDNNVVIELPVPDILPTSAESSGSNSSTWLELYFESVHVEMFCS 148

Query: 133 -------------------VGVLRGNNVCWLHAVSRAKLACGSGGGVTTWYQSS 153
                               G++RG++VCWLHAV RAK   G GGGVTTW  S+
Sbjct: 149 FTNQVMSELHLVFNVSVGSTGIVRGDDVCWLHAVFRAKTVGGPGGGVTTWGSST 202

BLAST of Tan0007396 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DVW9 (DNA/RNA polymerases superfamily protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold384G00700 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 5.0e-07
Identity = 44/101 (43.56%), Postives = 57/101 (56.44%), Query Frame = 0

Query: 68  TIVASEIDRCLIL-LSTLSVLRDNSAV-------------IELPGSITRHNLLWKLL-MF 127
           ++   E+D+ +I  LSTLS+LRDN  +             IELPG  T   L +K   + 
Sbjct: 40  SLQTGELDKTIIFPLSTLSILRDNDVIVYHMNMFPTFHVEIELPGPDTLPTLFYKPSDVR 99

Query: 128 DMLYV-----VGVLRGNNVCWLHAVSRAKLACGSGGGVTTW 149
              YV      G++RG++VCWLHAV RAK A G GGGVTTW
Sbjct: 100 AASYVCWEGSAGIVRGDDVCWLHAVFRAKPAGGLGGGVTTW 140

BLAST of Tan0007396 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CU23 (Retrotrans_gag domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold15G00050 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 62.8 bits (151), Expect = 1.5e-06
Identity = 34/70 (48.57%), Postives = 42/70 (60.00%), Query Frame = 0

Query: 82  STLSVLRDNSAVIELPGSITRHNLLWKLLMFDMLYVVGVLRGNNVCWLHAVSRAKLACGS 141
           STLSVL DN AV+E+   +                  G++R ++VCWLH+V RAK A G 
Sbjct: 22  STLSVLHDNDAVVEIELPVADTLPTSAESSESNSRSAGIVRRDDVCWLHSVFRAKTASGP 81

Query: 142 GGGVTTWYQS 152
           GGGVTTWYQS
Sbjct: 82  GGGVTTWYQS 91

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
KAA0054351.16.5e-0938.33reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] >TYK12388.1 reverse transcripta... [more]
TYK11835.15.5e-0838.66uncharacterized protein E5676_scaffold152G00520 [Cucumis melo var. makuwa][more]
KAA0058280.12.1e-0739.47uncharacterized protein E6C27_scaffold274G006090 [Cucumis melo var. makuwa][more]
KAA0066738.11.0e-0643.56DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK27886.1 D... [more]
TYK14494.13.0e-0648.57uncharacterized protein E5676_scaffold15G00050 [Cucumis melo var. makuwa][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5D3CMM13.1e-0938.33Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold30... [more]
A0A5D3CJX32.6e-0838.66CCHC-type domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5... [more]
A0A5A7UT171.0e-0739.47CCHC-type domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6... [more]
A0A5D3DVW95.0e-0743.56DNA/RNA polymerases superfamily protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 G... [more]
A0A5D3CU231.5e-0648.57Retrotrans_gag domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 ... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0007396.1Tan0007396.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0003824 catalytic activity