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Tan0007396 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGAGATTACTTGAATTCCTTATTGCAAGAAGGGATTGTATCGTGGAATAATCATGGAGTTAATTCTCCACATTATTACCACATTACCACAACCATAGGTTATGCAAATCTCATTTGCATAACCACATAATATAAGATATCTCATATCTGATATTGCAAATCACATTTGCAATAATTGTGGATTAATTAAATTGAATCGCATCCAATTTAATTTTCGTCAATTAATTTCTCCAATTAGCCCTAATACAACAATTAGGCTAACCTATAGTTTATTATGAATCTCATTCACATTAAACTATATATTATATCATTCATATCTCATATAAATGACATAAATGCCCTTAAAGTGAAATTGAACACTTCAATTTCATACCAAAACATTAACCCTTCTTTTAAACCAGATTGAGCCAATCGAGGGACCTACACTGACGGGCTCCAATGATCCGAGATTAACCTATCAAACTCTTTGACCCGGTTAATCAACATTTATTAGCTACTGTAACACTCCACTATAGCCCGTAGCTGCACTCCCGTCAGTGCAGAATATTACGTGTCCATTGATATAACCAATGCCCATTAGTTGACCCTTCACAGGTTGTTCGTAGACACGACTTGGTCAAATTACCGTTTTACCCCTGTGTCTACCTCTTATTCCTTAAGTCCCCACTTCTCCTCTAATGAACAACATATTGTTATGGTCCAACCATACACAACACCCTTATCGGGCCAGTGAGAAGGTGGCCACCCGTTGTCCAAGCTCTGGGGATAGCACTTAAGGGAACAACCCCTCTAGTTTCCCTAAAGGCGGGAACGAGCGAATTCCATCTCGCGTAGTTAAGTTCCCAGCTCCCTACTTGGTCGTGTCCCTCACCCGTACTAGTCAAAGGACAGACCCCCGCAGACAAGAGTTCGTAACACGCTCAGGATTCAGGTCGAGTCACTAATGGTCATCTACGAAATTATTAGTCCATACTGTCAACGGCGTTACATCAGTAGTTCTAATAACTCACTGTCCGGTCTTATACAATCTCATAGCACAGGATGCCCCCACTCGCATGTCAACCACATGAACGAGTCAGATCACCTCGTTTGTATCTAATACAAAGCGGGCCACATCCACAATGTATCCAGGATTAGTTCTTCAACCCTATCCATATACTGTAGACCGTTCGGGTCATTAACTCGAATGTGATCCTCCCTGTGTGTCCACTACACACCGTTCAAGTTCTAGTTCTCTTAAAATTCAATGACCGTGGAGCTTAGTTTATTGGATAAGTTTATAAATATTGCGAGACACAAAATGATGAAATCAATAACTCTTATTAATTTCAAACCGTAATTTACAAACACGAGATTAGGACAAAAATCCCAACAAACTCCCACTTTGGACTAAGCTAGTGGAGAAAATACATTTATGAAATGTACATAAATTACAACGAAGTAATACAATAAACTAGGGCATTGAATACCCGTTTACACCTTAGCCGTGAGGGGCTTTGTAAATGGATCAGCTACGTTCTGCTCTGACGCTATCTGCGTGATCGTCACGTCTCCGCGGTGCACAAACTCCCGTATCCGATGATACTTGCGCTCAATTTGTTTGCCTCTCTTATGGCTCCGAGGCTCACGTGAGTTGGCTACTACACCGCTGTTATCACAGAACAGTGTGATCGACAAGTTCATATTTGGAACAACTTCCAAATCCGTCATGAACTTCCTAAGCCAAACAGCTTGCTTTGTAGCTTCACAAGCCGCACATACTCCGCTTCCATAGTGGAATCAGCGATGCATCCTTGCTTGATGCTTCGCCATACTACAGCTCCTCCATTCAGAATGAAGGCTGACCCCGAAGTGGATTTCCTAAAATCCTTATCGGTCTGAAAGTCAGAATACGTGTATCCCGTAAGGATCAAATCCCCACTACCATTCACTAAGATGTAGTTCCTCGTTCTCCTAAGATACTTGAGGATTGCCTTTACGGTTGTCCATTGATCTAATCTTGGATTGGACTGATATCTACTGACAATTCCTACTGCATAACAGATGTCGGGCCTAGTACACAACATGTCATACATCAGGCTCCCTACAGCCGAAGCATTGGAATCCGTCTCATATCCTCAACATCTTGAAGAGTCTTAGGACATTGATCCTTAGACAAGTGAACCCCATGCCTGAAAGGCAGTAAGCCCTTCTTGGAGTTCTGCATCTTATATCTAGACAACATCTTGTCAATATAAGACGCTTGAGACAATGCTAGCGTTCTGTTCTTCCAGTTCCGGACAATCTGGATACCTAGAACATACTGAGCTTCTCCCAAATCTTTCATTTTGAATTGTGAAGCTAGCCACTTCTTAACGTCAGTAAGAAATTCTACCTCATTCTCAATGAGAAGAATATCGTCCACATAGAACACCAAAAATACTACAGTTTTGTTAACGATTTTCTTGTACACACAAGGCTCGTCAATGTTTTGATCAAAGCCATAAGATTTGATCGCCTCATCAAACCTTATATTCCATGACCTCGAAGCTTGTTTCAGCCCATAAATGGAACTATGAAGCCGACAAATCTTTTGCTCTTGGCCTTGGTCAATGAACCCTTTGGGCTGGTCCATGTAGATGGTCTCATCAAGTTTGCCATTCAGAAAGGCTGTCTTGACATACATCTGCCATACCTCGTAGTCATAATACGTGGCAATGGCCAGAAGGATCCTGATCGACTTTACCATGGCAACAAGTGAAAAGGTCTCCTCATAGTCAACCCCTTCAACCTGGGTAAAACCCTTTGCCACTAGTCGGGCTTTGAAGGTCTGCACCTTCCCATCTACGCCATGTTTACACTTGTAGATCCATTTGCAACCAATAGGTTTTACCCCATCCGGTTGATCTACAAGCTCCCATACAGAATTGAAGCACATAGACTCCATTTCCTGGTCCATAGCTTTAATCCATTCGTCTTTGTCAACATCAACCATTGCCTGATCATAGGAAAATGGATCCTCACAGTCATCATCAGGGTGATAACTGAGGTTTGAGCTAAACCCATGTAGCGATCAGGTTGTCTCACAGTCCTTCCACTACGTGGAGGCATTCCCAACTCTTGGGAACGAATTTGACTAGACGTGCTAGGATCAACAACACTTGTTGACGTACTAGCCCCATCATCAACTCTTGCTGATGTACTGTCAATTTCATTTAAAACATTTTTACTTCTTTGTAAATGATCCCTGACGTGATCTTCCTCTAGGAAAGTGGCGTTTGTTGACACAAGCACCATATTTTCCTTAGGATCGAAAAACATACCACCCCTAGTCCCTTTAGGGTAACCTACGAATAGGCACAATTTCGAACGGGGTTCCAACTTTTTTGGGTTTGCACCCACACGTGGGTTGGGCATCCCTAAATTTTGAAGTGATGTAAACTGCCTTTACGTCCACTCCAGAGCTCGAAAGATGTTTCACAAACACTCTTCGACGGAACGTTGTTCAAAATATAGATCGCAGTCTCCACTACGTAACCCCAAAAGGAATTACGGAGACGAGCATAGCTCATCATCGACCGATCCATGTCCAACAAGGTTCTGTTTCTCCTCTCTGATACACCATTCTGCTGTGGCATACCAGGTGCTGAGAGTTGGGACGTAATTTTGTGTTCTATCATATACTCCGGGAATTCAGTGTCCATGTACAATCCACCTCGATTCGATTGAAGTGTTTTAAGCGATTTACCTAAGAGGTTCTCAACCTCAGTCTTGTACTCCTTGAAATTTTCAAGTGTTTCAGACTTTCTGTGCATTGGGTAAATATACCCATACCTCGAGTAATCGTCTATGAAAGACACGAAGTACTCATAACCGCCCCGAGCTTTAACGACATTCATCGGACCACAGAGGTCAGAAAGTATTAACTCAAGAGGCTCTTTTGCTATATATCCTTTTCCACTAAAAGGACGTCTGGTCATCTTGCCCTCAAGGCATGACTCACACACAGTCAAAGAGTTTTCTTCAAAGTCGTTTAGAAGTCCACTCTTCACTAGTTTCTCAATCGTATTGAGATTAATGTGGCCTAATCGTAGATGTCAAAGATGGGCATTTTCTTTAGGAGAAACTTTCGCTTTCTTAGTTCGTATTTCTGTAGTTTTAAACAATTAAGTATTCAAAACACTTTTGACCCAATTAGGTTTCAAAACATACAGATTATGCTCAAGTGAAGCAGAACAAATAAGATTATCTTTTATGGAAATAAACGTTTTATTACCATAAAAAGAAACGGAAATACGTTGTTCTAAAAGGCAGGAAATAGAAACTAGGTTTCTAGTAAACACTGGAACTATATACAAATTGTCCAACTAAATGTAGTTCCTGCCAAAATGTAGCATCACCTTGTCGATCGTTGGAGCAGAGACAAGCTCCCCGGATCCAACCCGTAGAGTCACCTTACCCTCTCGCAGCGGTTTCCAGGAATCAATCCCCTGAAAAGAAGAACAAACATGGTTAGTAGCGCCCGAATCCAATATCCGGGCAGAGTCACTAGTATCCACTAAACAAGTTTTTGTCACAAGTAAATCATATTTAACTTGATTCTTCCTCTCGGCCAGGAATTTGGGACAGTTCCTCGTCCAGTGTCCGCCCCCATTGTAGTGGAAACACTTTCCTTTCTCTGCAACGTCCTTGACCTTCTTGCCCTTGTGGGCGGAAGCCTGATCAGTTTTACCCCTCTTCACCCTCTTCTTCCCTTTCGGGCGTGAAGGAGAGACAGGTTTCGTCCAAGAGGTCGAACCCCTGTGAAAAGTCCTGTAGGCAACATCTGCCTCAGATTCCTTGACCCTGTTTAAGGACTGGAAAATCTATAGTTCATTGAGGAGTGTAGTCAGAGTGCAACTAATTTTGTTCGTAACAGCATTGCTACGAAACTGAAGGAAAGTCTTCGGAAGAGTCTCTAGAATAAAACTGACTTGGCTCGACTCGTCGATCGAAGCCCCGTTCATCTTAGAC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Match: KAA0058280.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold274G006090 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 2.1e-07 Identity = 45/114 (39.47%), Postives = 59/114 (51.75%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007396 vs. NCBI nr
Match: KAA0066738.1 (DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK27886.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 1.0e-06 Identity = 44/101 (43.56%), Postives = 57/101 (56.44%), Query Frame = 0
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Match: TYK14494.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold15G00050 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 62.8 bits (151), Expect = 3.0e-06 Identity = 34/70 (48.57%), Postives = 42/70 (60.00%), Query Frame = 0
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Match: A0A5D3CMM1 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold302G001700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 71.6 bits (174), Expect = 3.1e-09 Identity = 46/120 (38.33%), Postives = 63/120 (52.50%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007396 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CJX3 (CCHC-type domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold152G00520 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 68.6 bits (166), Expect = 2.6e-08 Identity = 46/119 (38.66%), Postives = 62/119 (52.10%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007396 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UT17 (CCHC-type domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold274G006090 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 1.0e-07 Identity = 45/114 (39.47%), Postives = 59/114 (51.75%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007396 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DVW9 (DNA/RNA polymerases superfamily protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold384G00700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 64.3 bits (155), Expect = 5.0e-07 Identity = 44/101 (43.56%), Postives = 57/101 (56.44%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007396 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CU23 (Retrotrans_gag domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold15G00050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 62.8 bits (151), Expect = 1.5e-06 Identity = 34/70 (48.57%), Postives = 42/70 (60.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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