Tan0007314 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTTTTTACTTGTCCTATTAGAACTCCGGCGCTTTCGATTGCATTTGCGCGAAGAATTACATGCAACGGCATGTCGAAAGGATGTTTATCTTCCTTCTCAACTAGCTCAAACAAAGTCCCTCCAGAATCAGGTCCCTAGAAACTGCTACTTGATCTTGTTTCAGTCTCCGTTAAGTTCTTTCTTCATCGTTAGTCTTTGGGGCATTTCTTAACTGGGTCTTCACTGTTTTACGAATTTCAGGTGTCAAGTCTTCCAATGGCGTTTCTGAGTCTGAAACTCGTGTATTCGTGAGGAGAAGAGTGAAAAAGAAGGCAGAAGTTCAAGATAGCGGGCTTGAAGTTGACCCTAATGTCGACGCTAAAGTAAGAGCTTCACCATCTTCTTTTCCGTCTTCCAAACATATCTTTCATTCTGGAAAATGGGTTATTTTAGCTTCAGAAAGTCGTTTTTCTGGTGATTAGCTTGATGAAGTCTATCATCTATGCAGTCATTTTACTTCATTTTATTATTTTTTTTTTCTGTCCATATACCTGATGTTTGGGTTTTGGGTTTTTAACTCCCTGTGCACTTTCTGTTTCACTCACAATTCATTGATGCATTCAGTTAATGCTAAATTAGTTCATAAACGTTCAGAGTAAATTCATACATTAGCATGATATTCTAGCAACTTATTATTTGATAAGATTATGAACCCTCGTAGATAAAGGTCTTACATGGTGGATTCTGGATTCTGTAGCGGAGAGAAACAATAGAATCTTTAGGGGAAAAGAGAGTTATCCTTTGGAAGTGTGGTCCCTCGTTAGATTCTATGTTCCTCTTTGGGTCTCGGTGACGGGGTTCTTTTGTAATTATTCTTAAATATTATTTTGCTTGATTGGAGCCCCTTTTTATAGTTGACTTTTTTTTTGTGGGCTTGTTTTTTTGTACGCCCGTGTATTCTTTCATTTTTATCTCAATGAAAGTTCGATTTTTCATAAAAAAAAAATAAAAATAGAATAAAGGTCTTACATGGTGAAGGTTAATAATTTAAACTTCTAATCTTTTTCCTGTACAGCGCTGCTGTCCTCCTAATATTGAAGATTTTGCATTCAAAAGAACAAAGGATTCCCCTGGATCAAGTAATTTCTTACCTTAATGGCACTTTAGCTTGTCTGAATTTAGCCATTGCTACTGGATGATCTATATACCCCATTTATGTATGAGAACACTCCCATGTAAATTTTTAATCTTCTTGTAAGAAAAATGAAATGAGAAAAATTTATACAAAATAATTATTTCTTAAAATTTGTTTTGAAGGACTATGTAATGTGGATATTGCACAAACTTCTCCTTGATTTTCATTTTAGTTTCTCAAGTGCAATCAATGGTGATTAACTTTTGGTTCAGTTTTACCTAGGTCTCCCTCTTGGGCACAATCCTAAATCTATTTCGTTTTAGGTTTCTGTTGTGGAGAAGGTTTGTAAGAGGCTTTCATCTTGGAAAATGACTTACTCTTATTCAATCAGTTTAGAATGGGATCCCCACTTATTTCCTCTCTCTCGTCATAGTCCCTGCGTCAGTGAGTAAGGATCTCGAAGAAGCTTACGAGAGATTTCCTTTGGAAGGGTGTTGAGGAGAGGAAAGGGGCTCATCTTGTTAATTGGGAGGAGGTGACTAAGCTCGTTGATTTTGGGGGGTTAGGTATAGGTAACTTGAGATCAAGTAAAAAGGCCCTCTTGGCAAGGTGATTGAGGCATTTTCACCTTGATTCCTTTTCTCATTGGCATAAGCTTATTGTGAGCAAGTACGGGCTGCCCCCTTTTGAGTGGACTTCGTATGGAGGTCGAGGCACGTCTAGGAACCCTTGGAAAGGCATCTCCGAGGAATATCCCTTCTTTTCTACCTTTGCCCATTGTTTCGTGGGGGATGGGAGAGATACTTTTTTATAGGAATATAAGTGGTTGGGGGATAAACCCATTTGCTCCATGTTTCCTCGCCTTTATGATTTATCTTCTATGAAAAGTCATTTGGTGGCTGATGTTCTGTCTCATCCTAGGCCTTGTCCCTCGCCTTCGTTGGGTTTCCACCGCCTTTTGTCTGGGTAGATGTCATTGACCTCCTTTCTTTGTTGGGAGAGTTTCATTGTGTTTCGAGCAGGAGGGTTTTTTGCTATTGGAGCCCTAGTTTGTCTACTGGTTTTTCGTGTAAATTCTTTTTTCTGTGCCTTGTTCATCCCTCTTCTCCCTCTTCCCTAGGAGATTCTATCTTTGCCTCTTTATGGAAGGTCAAAATCCCAAAGAAGATTAAGGTTTTTGTTTGGCAGGTTTTACCCGGAAGAATTAATACCTTAGATAGGGTGGTGAGAAAGGTGCCTTCCTTAGTGGGGTCGTCGTCTTGCATTCTTTGTAGGAGAGCTATCGAGGATATTGATCATGTGATTTGGAGCTATGAGTTGGCTTATGATGCGTGGAGTCGTTTCTTGGCAGAGTTTGGCTTTGTTACTGCTAGACAGAAGATTGTCGTGAGATGATAGAGGAGTTCATCCATTTTTCTCCCTTTTGGGAGAGAGGAAAGTTCTTGGGGCAGGCTGGGGTGTGTGCTATTTTGTGGAGGTTTTGGGGTGGGAGAAACAATAGAATCTTTCGTGGGCTTGAGAGATCTCCTAGTGATGTGTGATCCCTTATTTGGTTCTATGTTTCTCTTTGGGTTTCGGTGACTAAGCCTTACTGTAATTATGCAGTAGGTCTTATTTTGCTTGACTGTAGGCCTTTCATGTAGGGTGCCTCCCCTTTTTTTGTGTGCCATCTTTTTGTATGCCCCTGTATTCTTTCATTTTTTCTCAATGAAAGCTCAGTTAATTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAACTTTTGGTTCAGTTTGATGTGAGAAGCACACAAAAGATGTTGCCTGGATGTGCATTTTCAAAAAAATAGGAAAATATAATTAGACATCTCAAATATAAGATTAAATGTATCATAACATAACAAGATAACAAAGAATGCATGATTGGATTTAAATATATCTTTTTCTTTTATGCTAATATAGCAGTAGAGGTGGAAATGTTTTAATGTTCACTAATAAAATATATGACCGGCATTAATGTACTTTTAGTTTACACATCGAAGTTTAATGCCCTTATTTACAAGAGATCATAATTGAAAGAAGTAAATCTAGTAAAATGTTCAAAAATCAACCATAAGGTTGCTTTGGTTCACCAAGACCAGAAAGTGGCAAAAAAGTAATCAAAAGGTAACCTAGGCTAGTGCGTGTTTTAAGGTGTGCTATGAGCCTGCGTCTGCTTGGCAGGTGGGGGTTGCTCAACTCACATCGCCTATTGCCATTGGCAGACTCAAGGTGTCACCTCAAAAACACCGATCCATCTTGAATTTGGATAATTTTTTTCATCAAAATGGCTTAGGCCTACTTGCGAAGGGCTGGCCTGACCTGTAAAGAAAAGGCCTAGATGAAGCCAATCTTGAAGGTCTTCTACCGCTGGCAAGGCACAGATTGGCAGCCAACCGGTGGAGAGGTTTGCAGGTCCTTTTGGTCTGCCGACTGCCTGGGGAAGCAATTTTATATTCATGTATGGAAGTTTGCAACAATTGCTTCCCCAGGTTTCGTATACATACTAGATGAGTGTATTGAACCGGAGGATGTACAATGAAGAACAAGTGTGTCAAGCCAACCTAGGAATTAGGGAGGTTTTAAAGCTTTCCAATTAGTCAATATCACAACCTTGGGTGATTATAATAAGCACTTTTCATTAATATTTGATGATTTTCTGAGAGGACAAGATATCTTGTTTGAAAGACGCTTCGCTCACAAAACTAATAATAGTTTGTTTTACCGAATTACTTTTGAGTATGTTTGGAAATGTTAATCGAGTTTCACATTTAAGTTTTCAACTTGTTCTCACACATGCAAGAATGTGTGCATGCTGCCTACACTCGGACGTGCGAAGATACAAAGAGTGGACATGCTTTTACATATATAATATGAAATTATTGACTCCCCGACTCCCTACCTTCTCATCCATCATTGTTTTTTATAAATAGGTACTACAGGGAAGTCAAAGCCTCCACTAGATCCTCTTCTCACAGGAATTGAAGATTCCTATCCAACTAGACAAAAAGGCATTGCAGAAGGAGGTGAGTGATACTTTTTTATTATTTACTTTTTCCTCGGTGGGATTTATGCTGCGTATTTAGCAGAGAGTTGATGTGGTAAGTCAGTGAATAAGAAACAGACTGAATAAGAAAAAGTACATTTCGTTTAATACTTTTTTTAGGAGTTTTCCCCCCTTTATGGATTGGATTATATTATTGGGAGAATTGTGTTAGTGTTTTTACTAGGTTGTGGTAGATACTTTTTTAAAGTAATTATTTAAATTATATTCCTCTCATATCTAAGTACTGCTCTTGTAAATACACATATTCTAGATATAAGAAGGTCAACAATTCACATTATTATTAGTTTTAATAAGCAATGATTTCGTTGAAGTAAATGAAACTCAATAAGAGAGAGACATGTAGGAGTTATAGAAAATATCTCCAATTGATCAATAAAGAAGATAAAGGGTAATTACTGATGAGCCCAGACGTAAGATACCGAGAAGAGTGAAATAAAATAATATTCCAAAACTGGTCCAGACTTTTCGTCATTGATTTTTTTTTTCCATTTCATCCAAGTAAAACATCTAATGCTGCTATTTGATTTCCTTAGATCCTTGGCCATACAAGCCTTGAACCGCAAACTCCTTGGCCATACAAGCCTTGAACCGCAAACTCCTTGGCCAGTAGTATGGGGAGAGGCAAGGCCAAACCAAAATTTCCGGGCAGCAAGAAGAGTTTCTTCTCTTAATTTTTTCATTTGTATTGAGGTCATCTAACAATGAAGACCACATAATAAACTTGCATTTGGTAGGAAAGTTTGGACTTCAAGAACAAATGAGATAAACAAAGCTAGTCACGAATCTTTGACCATTTAGGGGGTTTCT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BLAST of Tan0007314 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9DFZ0 (Endonuclease III homolog 2, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NTH2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 270.4 bits (690), Expect = 2.6e-71 Identity = 168/384 (43.75%), Postives = 215/384 (55.99%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SIC4 (Endonuclease III homolog 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NTH1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 261.9 bits (668), Expect = 9.3e-69 Identity = 167/373 (44.77%), Postives = 211/373 (56.57%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A7M7B9 (Endonuclease III-like protein 1 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=NTHL1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 147.9 bits (372), Expect = 2.0e-34 Identity = 89/238 (37.39%), Postives = 120/238 (50.42%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P78549 (Endonuclease III-like protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NTHL1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 139.8 bits (351), Expect = 5.3e-32 Identity = 86/234 (36.75%), Postives = 117/234 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O35980 (Endonuclease III-like protein 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Nthl1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 134.0 bits (336), Expect = 2.9e-30 Identity = 81/222 (36.49%), Postives = 110/222 (49.55%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. NCBI nr
Match: XP_038878189.1 (endonuclease III homolog 2, chloroplastic-like isoform X4 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 549.7 bits (1415), Expect = 1.7e-152 Identity = 293/383 (76.50%), Postives = 301/383 (78.59%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. NCBI nr
Match: XP_038878188.1 (endonuclease III homolog 2, chloroplastic-like isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 546.2 bits (1406), Expect = 1.9e-151 Identity = 294/386 (76.17%), Postives = 302/386 (78.24%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. NCBI nr
Match: XP_038878187.1 (endonuclease III homolog 2, chloroplastic-like isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 533.9 bits (1374), Expect = 9.7e-148 Identity = 293/413 (70.94%), Postives = 301/413 (72.88%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. NCBI nr
Match: XP_038878185.1 (endonuclease III homolog 2, chloroplastic-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 530.4 bits (1365), Expect = 1.1e-146 Identity = 294/416 (70.67%), Postives = 302/416 (72.60%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. NCBI nr
Match: XP_022145216.1 (endonuclease III homolog 1, chloroplastic-like isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 522.7 bits (1345), Expect = 2.2e-144 Identity = 283/385 (73.51%), Postives = 296/385 (76.88%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KU72 (ENDO3c domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G015140 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 527.3 bits (1357), Expect = 4.4e-146 Identity = 280/358 (78.21%), Postives = 289/358 (80.73%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CVP5 (Endonuclease III homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014717 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 522.7 bits (1345), Expect = 1.1e-144 Identity = 283/385 (73.51%), Postives = 296/385 (76.88%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CTU5 (Endonuclease III homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014717 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 521.5 bits (1342), Expect = 2.4e-144 Identity = 283/388 (72.94%), Postives = 296/388 (76.29%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BX24 (Endonuclease III homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494544 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 510.0 bits (1312), Expect = 7.2e-141 Identity = 278/386 (72.02%), Postives = 287/386 (74.35%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GW15 (Endonuclease III homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457673 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 501.9 bits (1291), Expect = 2.0e-138 Identity = 273/382 (71.47%), Postives = 288/382 (75.39%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. TAIR 10
Match: AT1G05900.2 (endonuclease III 2 ) HSP 1 Score: 270.4 bits (690), Expect = 1.9e-72 Identity = 168/384 (43.75%), Postives = 215/384 (55.99%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. TAIR 10
Match: AT2G31450.2 (DNA glycosylase superfamily protein ) HSP 1 Score: 265.4 bits (677), Expect = 6.0e-71 Identity = 169/371 (45.55%), Postives = 211/371 (56.87%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. TAIR 10
Match: AT2G31450.1 (DNA glycosylase superfamily protein ) HSP 1 Score: 261.9 bits (668), Expect = 6.6e-70 Identity = 167/373 (44.77%), Postives = 211/373 (56.57%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0007314 vs. TAIR 10
Match: AT1G05900.1 (endonuclease III 2 ) HSP 1 Score: 234.2 bits (596), Expect = 1.5e-61 Identity = 137/275 (49.82%), Postives = 177/275 (64.36%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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