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Tan0006725 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAAAAAAAAAAATCAGAAGAAAAAAGGAGAAGAAGAAATTCAATATACCTTCAATGGCTCTTTTTCAGCTCCCTCTTCCTTCAATGTTGCGTGTTTTCTCTCCAAGGGCCAATGAAGTTACTGTGGTCGAAAAAGTCTTTGACTACTGTGTTGTACAACAATCTGCTAACTATCAACCTTCTTCTATAAGGGTAATATATTTGAGGCGTTTTGCAGAGTGATATTTTTTAGAATGAATTTTATACCGTCAAGTGGTCGAGAAACTTAAAATCAAAATAGGTTGATTGACATAAAGTATAAATTTATGATTAAAACGTCATAGATTTAGAATTAATGGAATGTTTGGATTGGAGAGTCAGGAGAAGTTAATAACTCTTTTCAACTCCTTGTTTGATCCAAGGGGTTTTTCAACCTTTTGTGAGCCTTACATGCATATTAACAAATTTATTAACTACTTCCCAACTCTCCATGTAGATCCTACAATTTTTCTATCTCATTTTTTTTTAAACTCACATCACTCCTACTTCTCTTTTCTCTTCTCTCCATTTTCTCTCTATTTTATTTACATAATTTTCTTTATTTCTTAATTTAAAAAATTTGTTCTTTATTTTTTATATAATTTTTCTTTATTATTACTACTAATTACTAATTAAATATAAATATTTATTAATTTTTTTAGTATTATCCTATAATTTTATATCTTTTTAACATAAATATTGTTTCTTTTCTTATTTTTTTTCTTTTTTTAAATATAAATTATATAAAAATGTTTTTCATTACGATGCTATTATTTAAATTAAAATTCTTAATATAAATTAGAGTACTACATTAAAAAAAATATTAATTGATAAGAATCTTCATGTCTCACTTTCTCCCGCTTGTCATCTACAATTTTTAAAAGTCTAAATAAAAATTACTTATAGCAAATAACAATCTTATCTTTTTTTCTGTATTCTTTTATTAATCGCCAAAATATATAATTTGAAGATAAGAAAAACATATTTTAAACTCTTCCGTATTACAATTTAAGAAATTAGTATTTAAAAATGTTAGTATATTAAAAACAATTTGATATTCAAATTAATCCTATTCAAAGTAAAAAGATAAATGATTTATCTTTTTCAATAAGAAGATTTTCATTTCAAACTTAATAAAATAAAATTGTACCATAAATAATATAAATACATAATAATCTAAACAAAAGTATATATAATATTCATTTTGAGTGGTATTAGAAAATATATATTGATTTTGAACATAATTTTAAAAAAAATAACATAAATATTTTATTTTTTATTTTTTACTTAGTTATTTCAAACTTTAAATAGTCTCTGGTTTTTAAATTAATCAAACTCTAAATAATTCATTACATTCATTAGTTAGAAAAATAAAATCTTAAATTATACCGAAAAATTATTTTATTAAGTTTGAAAAACACATTTCAAATTAAAATTGTAAAATCGATAAAAACACGCATTTAAAAAATTATAAAATATTCATAAAATAATATAATTTCAAATTTCAAATTTAAGATTGATGGAAACAAATTTCTCTTATTTCTAGAATTTAGAGAATAAAGACATAAACCTTAAAGTTTATTTGAATGCTTTTAAATTAGTGAATTAAAATCTTTTCGAATCCCAAGTAATATTTAATAAAGTATGATATGACTTTTTTTTTTTATTAAAAAACTATCCAAGAAAAATGAATAATTAATGTGAGAGATTGAAAAAAGAATGTGAGGTTTTTTTTATAAAATTCTTTTTTAAAAAAAAAAATTGTAAAATGTACCGAAATTAATAAAGACAAAAAATATGTATCTTACAATTCATAGAAACAAATTCTTAATAATGAAATTTTGAGAAAGGGTAGAAAAACTATAATAAATAAAAACTAAAATCAACTATAACTTTAGAAATCCAAATTTAACAAAAATATGTATTTCAAACACAAATTTTAGAACTCCTACTTCCTGTATCTCGTTGCCTTAAACACAAACTTTCTAATTCCAAACTAAACAAATTTACACTTCAAATACAAACTTTCTAACTCTTACACCTCCTAACCCTCCAAATTTACTAACTCTTACCCCTATAATTTGTTGCCCCAAGTGACCCTAAAAATTTAGAAAGAAATGATCATACTTTGGTAGTCACATTTTCCAACCATTCTCATTTTTCCTTCTCCTTTTCTCTTCTCTCTAATATAAGAATCTCACATATTCCCTCTCTTTCTTTTCTCTCTCTTACATATCGACCTCCATCTCTGTAACGTGCCACCATCCAAACCAGTCGTTAATTTTTTTTTTTTCCTCTCATTTTCCTTCCTTAATTTCCAATTTAAGTCTTAATTTGTGATTGATGTAGCTGTTAAAATAGGGGAATTATAGTGGATAGCAAAAACTATTAAGATAACTACAACTTTAGTTAGTTTTCGGAGATTTGTAAATATAGCAAAAATTTTAAAATTAATTTTTCGTTTTCTTATTATTCCAGTTTTACCCTCATTAGTGTATTGGTAGATATATCAAGAGTATATCTAATATACTTTATATTTGGTATATCAGTAGTAAATTAATAATATATCTAATATACTTTACTTTTGATTTACAAATCAACTTATATTTAGATAGTTTGCATGGTTTGTATATCACTAAAATAGTAATATATCTAACACTGAGTATATTAGTAGTATATCGGTAATATACTCCATTTAGTGATATGGTTCATTACTTTTTTTTTTTTTTGTCAATAATGGTTCGTTATTTTAAGTGGTGAATATTATATCATTCATTTACTATTGATACAATGTATAAAAAAAACAGTGACAAAAAATTATTAATAAAGTAAAAAACTAAAATATGGTATATTAGTGGTATATCACTAATATACCTATCACTGATATACTTTATATTACGTATATCTCATCTTACTGATATATTTAAGTAAAATATATATGTAGTTTATCGATAATATACTTCATATTAAATATATTATTATACTGAATATAAATTGTTGTCATGCTCTTGATATATTTTATTTTAATTATTTTTTATATACTATTGATAAATTGAGTATTTGGAAATTCAACTTCATTGTTATATTTAAATAATATACTTAAATAATATACGTCAATAGTATATAACTGATATGTTTCATATTAAGTATATCAAAGATATATCAACAGTTTATCACTGATGATATACTCCTGGTAGATTATTGATAGACGTCATATTGCAAACACGAGAATTAAAGGTAAAAGTTATTTTGGATATTTTGCAAAAAAGTTGACACGTCCGCAATTTAAAAAAAACAGATGAAATGCATACAATTAGGCTTTTTTGTTTTGCTAATCATGCAACTCACCTTTTAAAATAAGTGTAGGCAACTATGCTTTTAGAAAAAATCAACTGTGATGAAGTAAAATAGTGTTTGGTAAATTTCAATTAGGTACAATAATTTTTTGTGATTTAGTTATAATGGCGAAAGTATATTTATTATTTCAATTATTTTTATATTCATATTTAATTTAGAAAAAAAAATACACAGCCTTGGATTAAGTTGGATTTGGTTCCTCGATTTTTCTAGCTTTTCTCCTTCTCTAATTTCTTGTTTGTTAGGAAGTGAATAAGACGAAATACAATCAATCTAAATTCTACCAGATTCAGACAATATGTATTTTATCCCAAATCCCAGATCAGGTTATAATTCCAAATATTTTGCGGAATAATCAATTTGGAATTAGCAAGCCTAAAATAGTAGATAAACCAACCTAAACCTTTAAGCTACAAGAACGATAAATAAAAAGAAGTTTAAGGGATAGAGAAATTGACACTAAAATTATACTGGTTCACCCAATGATGGCTACGTCCAGTTCTCTGCTACCGATGCAGGTTCCACTATAATCGTCAGGGAGGAAGTTACAAGAGTTTACAACGCTCAATAGTGTTTTATCTCACTATGTGTGCATCTACACAAAACAACTCTCAAAAACAAAAGAGAAGGTCGCAATTTTTTTTTCTCTCGGTACAAATCCTTTGCCGCAACTCTCGATGTGTGCATCTACACAAAACTGCCGCAAACACATGATATATATATATTTAGGTTAATTAGACTGAAGTTGAGTCGTGGGCTTTTTGCTCCACAATTTCTAACAATCTCCCACTTGGAGACAAAAACCAATCAACATGTCTCCCCTGCAACGGTAGCGACTCCTCTCTACTCGTGGAGAAGTCCAACTGAAGTTGCACACAACTTCAGTTTGTCAACAGAACGGTCTTGGTAAACATATCCATTTGGATTCTCGACTTCCAAATCTTTTCAAGTACCAGCGCTCCATCTTCCAAAACTGATCTGATAAAATGATACCTCACCTGTATGTGTTTCGTTCTCGAATGAAACACTGGATTCTTTGCTAAATGAATAGCACTCTGACTGTCACAATGCAAGGTCCCCTTTCCAAATTTCAAGCCAAGTTCTTCTAAAAAAGACTGAAGTCATATCATCTCTTTACTTGCCTCAAGAATAAGAACATACTCAACCTCTAGTAGTAGAAGAGCTACTATCTTCTTCAGTCTAGAAACCCAGCTAATAGCAGTATCACCCAAAGTAAAAACATACCCGGTAGTACTTTTTCTGCCATCTGTATCACCTGCCATATCTGCATCTACATAACCCTGCAGTTTAAAATCTGACTTCTTAAAATGCAGAGCATAATCAGTTGTCCCTCTCAGATATCTGAAAATCCACTTCACAGCCTCCTAGTGCTGCTTCCCTGGATTAGTCATGTACCTACTAACAACTCCTACTGCATGTGCAATGTCTGCTCTTGTGCAAACCATGGCGTACATTAGGCTTCCTATAGCTGAAACATATGACACTCTAGCCATGTGATCTCTTTCCTGCTCAGTAGTGGGTGAGTGATCCTTAGATAATTTAAAATGACAAGCTAAAGGAGTACTCACAGGTTTTGCATCTTCCATGTGAAACCTG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ATGGCTCTTTTTCAGCTCCCTCTTCCTTCAATGTTGCGTGTTTTCTCTCCAAGGGCCAATGAAGTTACTGTGGTCGAAAAAGTCTTTGACTACTGTGTTGTACAACAATCTGCTAACTATCAACCTTCTTCTATAAGGTTGAAATCTATTGAGCTTAAAAGTCGGAGGTGCATAAAATCATCAGCACAAGCAGATGATGTTATCGTGAGCCCAAGGCCGTGTGCAAATTACCATCCACCTAAATGGAATGATGAATTTATTCAATCATTAGATAATCAATTCCAGGGAGAACCATATCGAAGACGATTCAATCAACTCAAAGGACGAATTAAGAATTTGCTTGGTGAAAGAAGAAACTCTTTGAAACAACTCGAACTAATTGATGTTTTACAAAGACTCGGAATATCATACCACTTTGAGGTTGAAATTAAAGATATATTAGAAAGAATATACAATGCCATCTATGAAGACAACGAGAAGAAGAATAATCTCTATGCAACATCTCTTGAATTTAGACTTCTAAGACAACATCAATTTGATGTTTCTGAAGAGGTTTTCAATGTCTTCAAAGATGAGGCGGGAAATTTCAAAACATGCTTTTATGAAGATACAAATGGGATATTATCTTTATATGAAGCTTCATTTTTATCAACCGAAGATGAAAATATTTTAGAAGCGGCAAAATTATTTGCAGTTGCCTATCTAAAGGAATATATCAAATCAAGCAAAGATAAATTCAAAGTAGAGATGGTAAGACATGCCTTGAAGCTTCCCTTACATTGGAGGATACCAAAATTAGAGGCAAGGTGGTCTATTGATATATATGAGAGAGAAGCAACAATAAATCCTAATCTCCTTGAAATTGCTAAGCTTGATTTCAACATGGTGCAATCTATCTACCACGAAGATCTCAAGTATGCATCAAGTTGGTGGAGAAACACAAAGCTCGGAGAAAAGTTAAGCTTTGCAAGAGACCAATTGATAGAAAACTTCATTTGGACAATAGGCATTGGATCTGAACCCGAGCTTGAATATTTTAGAAGAATGAGCACAAAGTTTGTGGCATTGATAACAGTGATAGATGATATTTATGATGTCTATGGCACATTGGATGAACTTGAACTCTTTACCAATACTATAGAGAGATGGGATATTGGTGCAATGGACCAACTTCCAGAGTACATGAAGGAGTGTTATTTTACTCTCTACAATTTAGTAAATGAGATAGCTTCTGAAGCACTAAGCAACCATGAAATTGATGTCATGCCATACCTTAAGAAAGTGTGGGTAGATTTGTGCAAATCTTATCTTCTAGAGGCAAATTGGTATCATAGTGGTTATAAACCAACATTGCAAGAATATATGAACAATGCATGGATTTCAGTAGGAGGACCAATTATGCTAGTCCATTCATATGTTTTTGTGTCATTTCAAATTATAAAGGAGGAATTAGAGACATTGACAGAATATGCTGATACAATTCGTTGGACATCAACCATTATGCGACTTGCAAATGATCTACTGACACCATCGGATGAACAAAATATTGGTGATATTCCAAAATCAATTCAATGCTACATGAATGAGACTGGTGCCTCAGAGAGTGATGCTCGTGAATATATAAAACATTTGATAGATGAGTTATGGAAGAAATTAAATGAATGTAAAGATGAAAAACTAGTATCCTCTCAAGCATTCACCAAGATGCCTAAGAATCTTGCTCGAATAGCACAATACATATATCAGTACAGAGATGGATATACTATAGATCAAAACAAAACAAAAGAACAAGTAGCTTCACTTCTTGTTTTGCCAATTATCATCCATAAGTATAACAAATAA MALFQLPLPSMLRVFSPRANEVTVVEKVFDYCVVQQSANYQPSSIRLKSIELKSRRCIKSSAQADDVIVSPRPCANYHPPKWNDEFIQSLDNQFQGEPYRRRFNQLKGRIKNLLGERRNSLKQLELIDVLQRLGISYHFEVEIKDILERIYNAIYEDNEKKNNLYATSLEFRLLRQHQFDVSEEVFNVFKDEAGNFKTCFYEDTNGILSLYEASFLSTEDENILEAAKLFAVAYLKEYIKSSKDKFKVEMVRHALKLPLHWRIPKLEARWSIDIYEREATINPNLLEIAKLDFNMVQSIYHEDLKYASSWWRNTKLGEKLSFARDQLIENFIWTIGIGSEPELEYFRRMSTKFVALITVIDDIYDVYGTLDELELFTNTIERWDIGAMDQLPEYMKECYFTLYNLVNEIASEALSNHEIDVMPYLKKVWVDLCKSYLLEANWYHSGYKPTLQEYMNNAWISVGGPIMLVHSYVFVSFQIIKEELETLTEYADTIRWTSTIMRLANDLLTPSDEQNIGDIPKSIQCYMNETGASESDAREYIKHLIDELWKKLNECKDEKLVSSQAFTKMPKNLARIAQYIYQYRDGYTIDQNKTKEQVASLLVLPIIIHKYNK Homology
BLAST of Tan0006725 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9T536 (Terpene synthase 10 OS=Ricinus communis OX=3988 GN=TPS10 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 627.5 bits (1617), Expect = 1.6e-178 Identity = 304/539 (56.40%), Postives = 402/539 (74.58%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93X23 (Myrcene synthase, chloroplastic OS=Quercus ilex OX=58334 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 617.5 bits (1591), Expect = 1.7e-175 Identity = 302/551 (54.81%), Postives = 400/551 (72.60%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6PWU2 ((-)-alpha-terpineol synthase OS=Vitis vinifera OX=29760 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 613.6 bits (1581), Expect = 2.4e-174 Identity = 307/567 (54.14%), Postives = 414/567 (73.02%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B6SCF4 (Myrcene synthase, chloroplastic OS=Humulus lupulus OX=3486 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 570.1 bits (1468), Expect = 3.1e-161 Identity = 289/576 (50.17%), Postives = 393/576 (68.23%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q1XBU5 ((R)-linalool synthase TPS5, chloroplastic OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=TPS5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 542.7 bits (1397), Expect = 5.2e-153 Identity = 276/571 (48.34%), Postives = 372/571 (65.15%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. NCBI nr
Match: XP_038900957.1 (terpene synthase 10-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 890.2 bits (2299), Expect = 1.0e-254 Identity = 443/611 (72.50%), Postives = 508/611 (83.14%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. NCBI nr
Match: XP_038901091.1 (terpene synthase 10-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 887.5 bits (2292), Expect = 6.6e-254 Identity = 442/610 (72.46%), Postives = 506/610 (82.95%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. NCBI nr
Match: XP_023513202.1 (terpene synthase 10-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 875.2 bits (2260), Expect = 3.4e-250 Identity = 427/584 (73.12%), Postives = 500/584 (85.62%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. NCBI nr
Match: XP_004148472.3 (terpene synthase 10 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8651964.1 hypothetical protein Csa_006262 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 870.2 bits (2247), Expect = 1.1e-248 Identity = 426/574 (74.22%), Postives = 487/574 (84.84%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. NCBI nr
Match: XP_031736541.1 (terpene synthase 10 [Cucumis sativus] >KAE8651963.1 hypothetical protein Csa_006072 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 866.3 bits (2237), Expect = 1.6e-247 Identity = 434/613 (70.80%), Postives = 502/613 (81.89%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BVK8 (Terpene synthase 10-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold680G001090 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 865.5 bits (2235), Expect = 1.3e-247 Identity = 419/556 (75.36%), Postives = 474/556 (85.25%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EIN2 (terpene synthase 10-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434884 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 859.0 bits (2218), Expect = 1.2e-245 Identity = 421/584 (72.09%), Postives = 489/584 (83.73%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EJ00 (terpene synthase 10-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434883 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 859.0 bits (2218), Expect = 1.2e-245 Identity = 418/584 (71.58%), Postives = 495/584 (84.76%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I7V4 (terpene synthase 10-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470416 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 849.7 bits (2194), Expect = 7.4e-243 Identity = 414/562 (73.67%), Postives = 482/562 (85.77%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E012 (terpene synthase 10-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025107 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 799.3 bits (2063), Expect = 1.1e-227 Identity = 382/538 (71.00%), Postives = 456/538 (84.76%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. TAIR 10
Match: AT3G25820.1 (terpene synthase-like sequence-1,8-cineole ) HSP 1 Score: 492.3 bits (1266), Expect = 5.8e-139 Identity = 253/551 (45.92%), Postives = 372/551 (67.51%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. TAIR 10
Match: AT3G25830.1 (terpene synthase-like sequence-1,8-cineole ) HSP 1 Score: 492.3 bits (1266), Expect = 5.8e-139 Identity = 253/551 (45.92%), Postives = 372/551 (67.51%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. TAIR 10
Match: AT3G25810.1 (Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 478.0 bits (1229), Expect = 1.1e-134 Identity = 245/553 (44.30%), Postives = 363/553 (65.64%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. TAIR 10
Match: AT2G24210.1 (terpene synthase 10 ) HSP 1 Score: 470.3 bits (1209), Expect = 2.3e-132 Identity = 252/550 (45.82%), Postives = 369/550 (67.09%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006725 vs. TAIR 10
Match: AT4G16740.1 (terpene synthase 03 ) HSP 1 Score: 449.9 bits (1156), Expect = 3.3e-126 Identity = 247/551 (44.83%), Postives = 343/551 (62.25%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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