Tan0006668 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTTCTTCTTCCTCCATTATTCAAATTTGGTAGCTACTTCTTCCATTTAGCCAATGGAATTCCTAGCCGCCTCTCTTTGCTTATTCATTCTTCACTGCATCAGCTTCGACTCTTTTTCCCTCTCTGTTCTTCATTTCTCTTACGATCTCTCTTCTCAGATCTTTGTGATCATCTGCTATTACAGAAGATTTGTATTTTTACAATCAGGTACAAAATTTTATCTCTTAATACTTGCCTTCTTTGCATTTACTTATCCATTTCTTTTGCATATTCTTTCTCCTCTTTTCTTTATTTGGAATTATATCTACAGACTTGTCACATTTTTTTTTTTTGTTTTTGTTATTCGCAGTTGCTTGTTTCTTTGTGCGGGTTTTGTCAGCTTGAGATTTCTACCGTGGAATTGCTTCGGAGTTTTCCAGAATTTCTATTCAGGTTAATTCGTTGTGAGTTTTCAGCTTTTGAATATTTTATTAAGTCTCAGTTTCTGAAGTTCAAGTACAATAAGGGAATGGAAATCCTTTTTTCTATTGTTGGAAAAATTGCTGAATTCACTGTTGAGCCTATTGGGCATCAGTTGAGTTATCTATGTTTCATCAGAAACAACATTCAAAAACTCAAAAGTAACGTTGAAATGTTGAAGGAAACTAGAGAATCGGTGGAACGCATGGTATATAATGCAAGAAGAAATGCAGAAGACATAAAACCTGGTGTTCAGAATTGGTTAACTAAGGTTGATGCAATAATTGAAAAATCTGAATTGATCCTAAACAATGAAGATCAACAAGTTAGATTCTGTTTGAATTTGGTTCAACGACACCAATTAAGTAGAAAAGCAGTAAAGATGGCAAATGAGGTTCTTGAGATAAAGAATGAGGGGAATTTTGACAGAGTTTCTTACAATGTCGCCCTCTCAAAGTACGAGAGTTCGTTAACAAAAATTTCAGATTTTCTTCACTTCGAATCAAGAAAGTCAACGATAGAAAAAATCATGGATGCACTTGTAGACTATAATGTCAACAAAATTGGAATTTATGGGATGGGAGGTGTTGGCAAAACAATGATAGTGAAAGAAATTTCGAGAGAAGTTATTGAGAAAAAGTTATTTGATGAAGTGGTAATATCGACAATCAGCCAGACACCAGATTTGAAAAGAATTCAAGAAGAGCTAGCTGAAAAATTAGGTTTGAAATTAGAAGAAGACACACTAGAAGGAAGAGCTCTTAAGCTACACAAGAGATTGAAGATGGAAAAAACGTCTTTGGTTGTGCTTGATGATATCTGGGCACATATTGATTTGGAAACAATAGGTATTCCAAATGGTGTAGATCAAAAAGGATGCAAGATTCTATTTAGCTCTAGAGATAAACATACACTCTCTAATGATATGTGCATCGATAAAATTTTTGAAATAAAAGTTTTACAGAAAGATGAGGCGTGGAATTTATTCAAAACAATTGCTGGTGAAACAATTGAAGGATCTGATTTGAAATCTATAGTTATTGAGATAGTGAGAGAATGTGCAGATTTACCTATTGCTATTATTACGGTGGCTAAGGCATTAAGGAATAAACATACCTCTGTTTGGAAAGATGCTTTAAATCAACTAAGACATCCTGTGGCCGTGAATATTAGGGGAATGAATGAGAAAGTGTATGCTTCACTAAAATTAAGCTATGATCAACTAGAATCTGAAGAGGCTAAGAAGCTATTTTTGCTTTGTAGCATGTTTCCAGAAGATTTCGAAATTAATGTGCAACACTTGCATATATATGCTATGGCCTTGGGTTTACTTCATGGTGTTGACACTGTGGCACAAGGGCGATATAGGATAACAAAATTGGTTGATGATCTTATATCTTCTTCTTTGCTGCTAGAATATATGAATCATTATGTGAAAATGCACGATCTAGTTCGTGATGTAGCCATATTAATTGCATCTAGGGATGATCAAATTCGTACATTGAGTTATGTGAAAAACTTGAATGAATGGGAAGTAGATAAAATATCAAGTAATCACACTGCAGTGTATTTAAATGTTGGACGTTGCCAAAGCCCTCCCCAAAAGCTAATGTTGCCCAAAATTCAATTGTTAATATCAGTTGGAAGATGGCCTTTTGTTCAAGAGTTGCCGATAAGTTTTTTTGAAGGAATGAAGGAGCTCAAAGTTTTAGAACTACATTCGATGAAAATTTCACTACTGCCACCATCTCTTCACTGTTTTACAAATGTTAGATCATTGCATTTGTTTAAATCTGAATTGGGCAACATTGATATGATTGGTGAGTTAAACAAGCTTGAAATTCTTAGTTTTAAAGGATCCAATATAACTCAGATTCCTATGGCAATAAGTCAATTGACCCAGTTAAAAGTATTAGATTTGTCAAATTGTGGCAAACTAAAGGTAATTCCATCAAATGTTCTTTGCAAGTTGACAAAATTGGAAGAGTTGAACTTGGAAACTTATGAAGGATGGGAAGGAGAAGAATTATTGAACAAAGAAGACAGAAAGAATGCTGCCCTTTCTGAGCTCAATAATTTATCATGCCTTTCTGCTGTATGTTTATGCATTCAAGATGAAAAAGTTATGCCAAAACAAATGTTTTCAATGGAGTTGAATTTAGAAACATTCAACATTTCTATTGGTTTCCCAACTAAAACAATGTATTTCGATGAAGACATTAGAAAGGGGTTGTCTTTGAAGATGGAATCAGAATGTTGTATGAATGAAGGGATAAAAATGTTGTTAAAGTGGTCAGAAAAGCTACATTTAGAAGGTTCAATTAGTGCAAAGGTTTTCCTCTTCCAATTAGATGAAAATGAGTCTTCACATGTGAAATATCTCAAACTTCGTAATATTTCTGGGTTACAACACATTATCCACGAGCAGAAACAACCTTTTCGAAAAGCCTTGTCGAATTTGGTGCATCTATATATGAAAGACTTGAAGGATTTGGAGAGTATAATTCATGGATATGACAGAAGATCTCCTTTCAAAAAGTTGAAGTCCGTAGCAGTGAAACAATGCAAAAAATTGAGAAGTGTTTTTTTTAACTCTATTGTGGATGACGTTTCAAATCTTGAAACGATTAAGATTGAGGATTGTGAGATGATAGAAGTGATCATAGTGATGGTATGCGAAGAGGCAATAAAAAAATTTGAGTTTACTCATTTAAAGTCATTATTGCTTTGTGGCTTACCACAACTTACAAGTTTTTCCTCCAAAATTGAGAAATTTAAACAACTAAATCTAGAGAGTTCAGAAAAATGCAGAACAAGCAAGCCTAGCAACAACAATTCATTTTTCAGCGAAAAGGTGAGATCACTAATCCTAGACTTTTTATTTTTTTTTATTTGCTTGTAGATCTTTGTTTTTTTTTCCTTATTGTTAATGCTAAAGTATGAGAGAATCAGTAAGTTTATTACATTCACTCAAGAGATATATATATACAAGTATACAGGGTTAACCTAAATAGAAGAGCGTAAAAAGACAATAACAGACACCCTAAGAGTTATATTAACAAAATACAATTATACTAATATAAGGACTCTAACACTCCCCCTCAAGTTGGAGCATATATATCCATCATGCACAACTTGTTAGAGAGGTAATCAATTCGTGCTCCGTTCAATGCTTTGGTGAAGGTATCTCCTAATTGCTCTCCAGTCTTCACATATCCTGTCGATATCAAACATTGTTGTATCTTCTCACGTACAAAATGACAATTAACTTCAATGTGTTTAGTTCTCTCATGAAATACTGGATTAGATGCTATATGCAGAGCTGCTTGATTATCACACCACAATTTGGTCGGTGTTGTGATATCAAATCCCAATTCAATAAGAAGTTGACGTATCCAGACTAATTCACAGACAGATTGTGCCATTGCTCTATATTCTGACTCAACACTTGATCGTGAAACCACATTTTGTTTCTTACTCTTTCAAGAAACCAAATTACCACCAACGAATACACAATATCCTGACGTTGACCTTCTATCTTTCTTAGATCCTGCCCAATCAGCATCTGAGAAACATTCAATGTTCATATGCCCATAGCTCTTATATAATAAACCACCCCTAGGAGCTGCTTTCAAATAACACAAAATCTGTTTCACTGCAACCCAATGATCAACTGTAGAAGAAGACATGTACTGGCTCACAATACTCCTTTGAATAAGCTATATGCGGTCGAAGTTCTTTGTAAGATAATTGAGTTTTTCTACCAACCTCCTATATCGTTCAGGATCGTTCAATAATTCTCCCTCTTTTGTGAGTTGTACATTAGGCATCATCGGGGTACTACATGGCTTAGCCCCTAACTTCCCTGTTTCGGTCAACAAGTCAATAACATACTTTCTCTGTGATAGCATGATTCCCTTCTTGCTTCTCATTACCTCAATTCCTAGAAAGTATTTCAACATTCCCAAATCTTTCGTGTGGAATTGACTATGGAGAAAGGTCTTGAGAGATTGGATACCCAATGTATCATCTCCTGTAATCACAATATCGTCAACATACACAACCAACGGGATGACACCACTCTCAGACCGCTTGTAAAACACTGAATGATCTGATTTGCTCTTTCTCATTGCAAAGCTTTCAATCACCTGAGTGAATTTCCCAAACCATGCTCGTGGACTCTGGTTTAATCCATACAAGGATTTACGAAGGCGACATATCTTTCCCTTCTCCCCCTGAGCAACAAATCCTGGAGGATGCTCCATATACACCTATTCCCCAAGATCACCATGAAGAAAGACATTTTTAATATCAAGACAGAAGTCATTTTAGTAACAGGAGAAAAGGTGTCAGAATAGTCAATCCCATAAGTTTGTGCGTAGCCTTTAGCAACAAGGCGAGCTTTCAATCGAGCAACAAATCCATCTCGATTGACTTTAACCGCAAAGACCCACTTACAACCAATAGATTTCTTTCCTGCAGGAAGAGACACTAAATCCCAAGTACAATTGTCATCTAAGGCAGTCATCTCCTCCA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MEILFSIVGKIAEFTVEPIGHQLSYLCFIRNNIQKLKSNVEMLKETRESVERMVYNARRNAEDIKPGVQNWLTKVDAIIEKSELILNNEDQQVRFCLNLVQRHQLSRKAVKMANEVLEIKNEGNFDRVSYNVALSKYESSLTKISDFLHFESRKSTIEKIMDALVDYNVNKIGIYGMGGVGKTMIVKEISREVIEKKLFDEVVISTISQTPDLKRIQEELAEKLGLKLEEDTLEGRALKLHKRLKMEKTSLVVLDDIWAHIDLETIGIPNGVDQKGCKILFSSRDKHTLSNDMCIDKIFEIKVLQKDEAWNLFKTIAGETIEGSDLKSIVIEIVRECADLPIAIITVAKALRNKHTSVWKDALNQLRHPVAVNIRGMNEKVYASLKLSYDQLESEEAKKLFLLCSMFPEDFEINVQHLHIYAMALGLLHGVDTVAQGRYRITKLVDDLISSSLLLEYMNHYVKMHDLVRDVAILIASRDDQIRTLSYVKNLNEWEVDKISSNHTAVYLNVGRCQSPPQKLMLPKIQLLISVGRWPFVQELPISFFEGMKELKVLELHSMKISLLPPSLHCFTNVRSLHLFKSELGNIDMIGELNKLEILSFKGSNITQIPMAISQLTQLKVLDLSNCGKLKVIPSNVLCKLTKLEELNLETYEGWEGEELLNKEDRKNAALSELNNLSCLSAVCLCIQDEKVMPKQMFSMELNLETFNISIGFPTKTMYFDEDIRKGLSLKMESECCMNEGIKMLLKWSEKLHLEGSISAKVFLFQLDENESSHVKYLKLRNISGLQHIIHEQKQPFRKALSNLVHLYMKDLKDLESIIHGYDRRSPFKKLKSVAVKQCKKLRSVFFNSIVDDVSNLETIKIEDCEMIEVIIVMVCEEAIKKFEFTHLKSLLLCGLPQLTSFSSKIEKFKQLNLESSEKCRTSKPSNNNSFFSEKVSFPNLKRLRIERANNLTMICDSVLFPNSFSKLAEVYLDSCHNLKKVFSSKIMSILMSLKFISIKNCNLLEGIFEAQESNVTKESAALLPQLRNLELSNLPNLRYVWNEDACELLVFENIELLSIHQCPKLKLRKKCVIKVLPQLKHLEIDLSEMKEILEKEKSVQTLELDQFKTSEVKSIQLRDSSELFSKLTTLKLHGSVDYNLTDLPMEIVQILPHLKRFELNEAFIEEVFPNERLINNNMKEQQCARSELLQRLCLTKLPKLRHLWKEGSQKKTSLQHLNDLWISECGKLNNLVPSSSVSFRSLSELYIYKCHGLTHLLSPSVARTLVQLQVLELYQCKRMTTVIVGGDKDQGNDEIVFNKLKMLTLSNFSQLTSFHSGRCIIKFPSLSLVDIESCPEMKVFSLGIVSTPHLAHEMIKFSYNDNYFRSKDPKQIIVEDINIIIRQIWEDNFDTSIPYLFAEQNLEENQSDHSSSHVEE Homology
BLAST of Tan0006668 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T048 (Disease resistance protein At4g27190 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g27190 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 263.1 bits (671), Expect = 1.8e-68 Identity = 244/933 (26.15%), Postives = 445/933 (47.70%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O81825 (Probable disease resistance protein At4g27220 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g27220 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 261.2 bits (666), Expect = 7.0e-68 Identity = 269/953 (28.23%), Postives = 458/953 (48.06%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q42484 (Disease resistance protein RPS2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RPS2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 227.3 bits (578), Expect = 1.1e-57 Identity = 242/906 (26.71%), Postives = 420/906 (46.36%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RXS5 (Probable disease resistance protein At5g63020 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g63020 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 220.3 bits (560), Expect = 1.4e-55 Identity = 224/818 (27.38%), Postives = 395/818 (48.29%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P60838 (Disease resistance protein SUMM2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SUMM2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 214.9 bits (546), Expect = 5.8e-54 Identity = 235/900 (26.11%), Postives = 418/900 (46.44%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. NCBI nr
Match: XP_038890456.1 (probable disease resistance protein At4g27220 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1465.3 bits (3792), Expect = 0.0e+00 Identity = 819/1424 (57.51%), Postives = 1045/1424 (73.38%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. NCBI nr
Match: XP_008441731.1 (PREDICTED: probable disease resistance protein At4g27220 [Cucumis melo] >XP_008441732.1 PREDICTED: probable disease resistance protein At4g27220 [Cucumis melo] >XP_008441734.1 PREDICTED: probable disease resistance protein At4g27220 [Cucumis melo] >XP_016899499.1 PREDICTED: probable disease resistance protein At4g27220 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1421.4 bits (3678), Expect = 0.0e+00 Identity = 818/1434 (57.04%), Postives = 1042/1434 (72.66%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. NCBI nr
Match: XP_038890457.1 (probable disease resistance protein At4g27220 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1407.9 bits (3643), Expect = 0.0e+00 Identity = 783/1356 (57.74%), Postives = 1002/1356 (73.89%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. NCBI nr
Match: XP_016901814.1 (PREDICTED: probable disease resistance protein At1g63360 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1348.2 bits (3488), Expect = 0.0e+00 Identity = 791/1451 (54.51%), Postives = 1024/1451 (70.57%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. NCBI nr
Match: XP_011650138.2 (probable disease resistance protein At4g27220 [Cucumis sativus] >XP_031736521.1 probable disease resistance protein At4g27220 [Cucumis sativus] >KAE8651742.1 hypothetical protein Csa_006538 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1330.1 bits (3441), Expect = 0.0e+00 Identity = 785/1435 (54.70%), Postives = 1003/1435 (69.90%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B439 (probable disease resistance protein At4g27220 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485808 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1421.4 bits (3678), Expect = 0.0e+00 Identity = 818/1434 (57.04%), Postives = 1042/1434 (72.66%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E0R8 (probable disease resistance protein At1g63360 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495494 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1348.2 bits (3488), Expect = 0.0e+00 Identity = 791/1451 (54.51%), Postives = 1024/1451 (70.57%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LLJ0 (NB-ARC domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G014830 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1268.1 bits (3280), Expect = 0.0e+00 Identity = 748/1345 (55.61%), Postives = 957/1345 (71.15%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LLJ0 (NB-ARC domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G014830 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 2.2e-08 Identity = 60/201 (29.85%), Postives = 92/201 (45.77%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 1217.6 bits (3149), Expect = 0.0e+00 Identity = 745/1488 (50.07%), Postives = 988/1488 (66.40%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A097NYW9 (Vat-like protein OS=Cucumis melo OX=3656 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1217.2 bits (3148), Expect = 0.0e+00 Identity = 744/1460 (50.96%), Postives = 976/1460 (66.85%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. TAIR 10
Match: AT4G27190.1 (NB-ARC domain-containing disease resistance protein ) HSP 1 Score: 263.1 bits (671), Expect = 1.3e-69 Identity = 244/933 (26.15%), Postives = 445/933 (47.70%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. TAIR 10
Match: AT4G27220.1 (NB-ARC domain-containing disease resistance protein ) HSP 1 Score: 261.2 bits (666), Expect = 5.0e-69 Identity = 269/953 (28.23%), Postives = 458/953 (48.06%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. TAIR 10
Match: AT4G26090.1 (NB-ARC domain-containing disease resistance protein ) HSP 1 Score: 227.3 bits (578), Expect = 8.0e-59 Identity = 242/906 (26.71%), Postives = 420/906 (46.36%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. TAIR 10
Match: AT5G63020.1 (Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family ) HSP 1 Score: 220.3 bits (560), Expect = 9.8e-57 Identity = 224/818 (27.38%), Postives = 395/818 (48.29%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006668 vs. TAIR 10
Match: AT1G12280.1 (LRR and NB-ARC domains-containing disease resistance protein ) HSP 1 Score: 214.9 bits (546), Expect = 4.1e-55 Identity = 235/900 (26.11%), Postives = 418/900 (46.44%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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