Tan0006277 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTTATTGTTAATCTCTAGCAGAGCCAGAACCTCCCCAAAACCCCAACGGACAAGCAGAGCAATTTCTTCTAGTTGGCGATCGGAGATGAAGGTGGTGGCTTTGGTAAGCGGCGGCAAAGACAGTTGCTTCGCCATGATGAAGTCTATTCAATACGGCCACGAGGTTTCGTTTTCCTTTTCGATTTTCCCTTTTAATTCTTCTTCGTCTTCTTCTTTTGTCTGGCTTAGGCGAACAATGTTTACTGGCTCTTACATTTTGCTTCTTCTCTCAATTTTCGTTTGTTTGATTTTCTCTTTAATGTAAACTTATGCCCTGCTTGGTTGTGTTGTTCTATGTTTGGTCTAGATTGTAGCGTTAGCAAATTTGTTGCCGGCCGATGATTCCGTGGATGAACTTGATAGTTACATGTATCAAACTGTAAGTCTTCCGGCCCTCCATATGCAAAATATGCATGCGTTCACTTATAACTTTGTAGTAAATGGTTGATTTGGTTTTTGACAGTCAACTATCGGTCTCCTTAATCATGGAAGTTTTGTTTTTGTTTTAGGTTTTCAACTCTTCAACTACAGCCCTGTCTTACATGTTGAAAAACCCCTTGTGAAAAAACAGGCACAGTTTTTTCGTTGAAATTGGGAATAAATAAATTATGTTTCCTTCTCCATTTTCAAAACTGCAATTAAAATTAAATACCTGCATTGGTTGATGGGGTTGGCTTGGTTGATCTTCCTTTCTTTTCCCCTTCTTCTCCACCAAGAATAGTTAGTATGACTCCGAGAGTTAAGTTTCTTATAAAACCCTTGACTTGACCCTTGAGCTACCTCACTCCTTTGGTTCGCTGTTGATATTTTTGATCAACCCAACGTGTTGGGTTATAAGTTTATAACCTTCTTTGCTTTGAGATGGAATCGACTCAAATTATTATTAATTAAGAAGACATCTTTTTGTTATATTAATTTTTTCATATTTATTTTTATTTAACCCCTTATAGGAGTTTGTATCTTTCGAATGTACTTGTACGTTGTAGCACTTTACTCATCAAATGAAAAGTTTGTTTCTTATTAAAAAAATTGCTTATATATACACACACATTAATTTCATTTCATACATTTTTTTTTCTATAAATTTAGATAGGAAACAGAGAAAACCATTTCATTGATGAGTGAAATAGATACAAAAGAGGTCCTATATGTGATAGTTACAAAAAATAGATAAAAGGGTTGTTAAGCCATAATTACAAAAAAGAGGAGATAAAATACTCCACGATAAAGCATGATATGAAGTTGAGTCTATGAAGGTTTGAATGTTTATGTTGCTTATCTGTGAAAACCCATGTGAAAACCCAGACATTTCTCTCAAAGCATAAACTCCATAGAAAAGCATAAATGAAATTGATCCATAGTGTCTTATTTTCTTTTTTGAACGGGTGACCATTGATTAACACATCTAGCAATGTATAGATATCCCTAGGCCACGCTGTGGACCACCCAAACTCTTGTTGAAGGAAGGACCAAAAAGCATTGGCAAGGTTTTTTTTTTTTTTAGTATATCAACAAATTGGGGGTGGGGGGATTCGAACCCATGACCTCTTGTTCATGAGTCATACTTGATGCCAGTTGAGCTACGCTCTTGTTGGCAAAGCATTGGCAAAGTTACAGTTACTGAAAAGGTGGATTTGAGACTCATTGTTTATGTAACAAAGATGACCAGGAGATTTTTTTTTTTTTTTAATATGTCAAAAGTGTTGATACATGCATGACTAAGCTCCCAAATAAAGAACGTAACTTTTTTTGGATGGTGACCCTTCCACAATTGCTTATAAAATGATGTTTTATCGAAGTTTCCAGTAGATGCAAGCCTTTTAGTTTGTCAACTCGTGGAGAAATGCCCATCCTTTTCCAATGCCCAAACCCATCTATCCTCTTGGTCTTTGAAAATAAACGAGGACAATAACTGAGATAAGGAACCCCATTCTTCAATTTCTATTTCGTTGAGGTTTCTTCTTGAAAAGAGATTTCATGATCCAGCCAGTTGATTCCAATGATTAGCAACATGCAAGTCTTTCTTTAGAGATAAAAGGTAAAGAGATGGGAATTTTGACAGGAAAGATTGAGTTCCCAACCAAACGTCTTTCCAGAAATGGGTTTTGTCTCCTTTCCCAACAATGAATTCAATGTTGCTGGAAACCAAATTTTGCAAGTCCGGAATGGATTTCCAAGGTCCCTTAGCAATTTTCAGAGACATACTGCTGGCTTGCAATTGTAGTGGCTAGTACCATATTTTGCTGCAATCACCCTTCTCCAAAGAGCTTCTTTTTCGATGTAAAACCTCCAATTCCATTTCGCCAAAAGGGAGATGTTATGTATGTGTATATCACCTTCCTCAATAGGTCCTTGGAATGTGGACCACTTTAGGAGATGCCTTCCCTTTTTATCGATACCACCCCTCTATAGAAAATCCCTATACAACTTCTCAATAGATTTTGTGACTTTGGATGGAGCAAGAAAAATGGAGAAATAACATGTGGGTAAATTAGAGAGTGTAGCTTGGATGAGTGTGTGTCTTCCTCCTTTTGAAATATGAGAATTTCCCCAATTATGCAACCGATTCTCAATTTTCTCAATGACTGGACTCCAATAACTAGTCGTACGTGGGTTGCCTTTCAACGGTAGACATAAGTATGTAGAGGGCAGTTGCCCACCCTACATACAAAGATAGAGGCACAACCAACTTTCTGGGCAGCGATATCGATCCCAAAAATTATGATTTCTGACCATTTATGTTTAGCCCAGATGCTTCCTCAAAATCATGAATGACTTGAAAAAGATTCTGAAGCATTGCTTCATTGCGTGATGAGAAAAGGATGCCCTGCAAAATCATTAACGACCTGCAGATTGGAGGTGAGTGATTGAAACTGTGTATGGAGCTTTACCAACATTAAACCCCTCAATCAATCCTTTTTGTTCTGCCAGTAATAGCATCCTACTAAGTTAGTTGACCACAAGAATGAATACGAAAGGAGAAAGGGGATCTCCTTGACGAAGGTCTCTAGTTGCTTTAAATTTACCCCTACACATTAATAATAATGGAGAAGTTTGTTAAAGAGATGCATCCTCTAATCCATATGCGCCATGTTCGTCCGAAGCCTTTGGCTCGAAGAATATTCTTGAGAAAATCCCAATCCACCATATTTTTTAGACAAAGTGACAATGGAATTTCATTGAGATAATGAAAGAGACTAATGCTCCAGTTACAACTTCAACCATTAATCAAAAGAACCTATAAAAGACATTTGCGCCAAAAGCAAAAACTGAAAAATAAAGGTCCCAACCCAACATATTCGGTCCCATAGAATGCCCAAGAGAACCACCCTCAAAGCACCAAACTAAGGCGTAAAATAGCTATCCGTGGCCAAGGAACTGTGGCAAAACAGAAAACAACAACCCTATTCAAACCTCTGCCCTAGTCCAAACAAACGAAACTACATATTAAGTAAGAAGGGCTGCCAAGAAAAAGTCAAGTCTGAAGAAAAAGTCAAGAAAAAGTCAAGAAGGGCTCTCTAAATCCCAATCCACCATATCAAACGCCTTTTCAATGTCAAGTTTAATGACCACTCCACTATTCTTCTTTCGGTTCCATTCATCGATGATCTCATTGGCTTTAAGGGAGGCATCAAGGATTTGGCGATTGGCTATGAAAGCAAATTGATGGTCTGTAATTGAGTATGGGAGGACACATTTCAATCTTTCTGAGAGCACTCTAGCAATAATCTAGTGGAGACAAGTTGTGAGACTAATTGGCCTGTAATCACTCACTTTTTTGGCACCAATCTTTTTTGGGATGAGGCAAACGTATGTTTCATTTATGTTTGCATTGATGATCCCATTCTTAAAAAAATCATGGAACACCCCAATAATATCTTCCTTAAGGATGTTCCATGATTTTTTAAAGAATTCTGCCGTGAATCCATCTGATCCCTAGAGTCTTGTTACTGCCCATATCAGTGATTGCTTTGTAAATCTCAGCTTTTGTAAAAGGTATTTCCCGTGGGTCCTTTTGCTCAGAAGAAATGGGACTCCAATCATCAATCTCAAGTAGTGTTTTAATATACCTCTTCTTTTAGTAAACGGATTAGGGTAGAAATTCAAGAATTCCCCCTCAATATCTTCATCATTCACCAAACGGTCCCCATCTGCAGGAAGGACTTCCATAGTTGTACTTTTCCTTCTGTTTGCTGCCACAATCCTATGGAAGAAAGCAGTATTTCCTCGACAAGCCATTTAGTTTTGCAGCTTTGTCCCCACATGGCTTCTTCATTAGCTGAGATAGTAAGCAATTCCCATTTTATGGTGAGTCTTCGCTCTAAGTCATCATTAGATAAAAGGGTGGATTCCTCTTTTTCATCAATGACCATAAGCCCATGGTGGAGTTTGGCTTTAAGCTCCTTCTGATGGCCAAAAATATTATGATTCCACAACCTCACCTCCTTCTTTAAGCCTTTGAGTTTTTGGATGAAATCATGTCCTAGCCAGCCTTGTATAGGATTTTTCAACCACCAAGAATCAATCATTCTATCAAAGGTGTGATGGTTTAGCCAAGCATTAAAAAACCTAAAGGGAGTAGGACCCCAGGATTCCTTTCCTAGAGTGAGACAAATGGGGTAATGGTCAGAAGTAATTCTCTCAAGTCTACGAGCAGAGACACTAACAAATTTTTTAATGATCCCATCCCGTAGCAAAAATCTGTCTATAGGACTCATCGTAGCTTCAATGCGCATATTGGACCTAGTGAATTTTCCATTTGTGAGGGGGATGTCTGTAAGTTCAAAAGAGCTAACGAAATGGTTGAATTTCTTCATTCCTCGTGTAGTGACAACACTAGAAGATTTCTCCCAAGACCACCTAGTAATATTAAATTCTCCACCCAAAATCCAATTAGGTTGACAAAGGCTCGATAAATCTTTTAATTCAGTCCATAAGAATTTCCGCTCAGTAGA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ATGAAGGTGGTGGCTTTGGTAAGCGGCGGCAAAGACAGTTGCTTCGCCATGATGAAGTCTATTCAATACGGCCACGAGATTGTAGCGTTAGCAAATTTGTTGCCGGCCGATGATTCCGTGGATGAACTTGATAGTTACATGTATCAAACTGTTGGACATCAAATTATTGTTAGCTACGCAGAATGCATGGGGATTCCATTGTTTAGAAGGCGAATTCAAGGATCCACAAGGCATCAGAAGCTTAACTATAGAATAACTCCAGGTGATGAAGTGGAAGATATGTATATTTTGTTAAAGGAAGTGAAGAGGAAATTACCTAGTGTCACCGCAGTATGCTCTGGTGCCATTGCATCTGATTATCAAAGATTGCGGGTAGAGAGTGTTTGTTCAAGGCTAGGACTTGTTTCCCTAGCATATTTGTGGAAACAAGATCAATCATTGCTTCTACATGAAATGATAAACAATGGAATTTTGGCCATCACGGTGAAGGTTGCAGCAATGGGATTGGATCCTGTGAAGCACTTGGGCAAAGAATTAACATTTTTGGATTCAGATCTACATAAGTTGAACAAATTATATGGGATCAATGTATGTGGTGAAGGTGGGGAATATGAAACGTTGACCCTTGATTGCCCTCTTTTTAAGAGTGCTAGGATTGTGCTCGACGAATTCAAAACTGTGATGCACTCATCGGATTCCATAGCACCAGTGGGGATCCTCCATCCTGTTTCCTTCCATTTGGAGTATAAGACCTCTTCTCTTGGTATCTGTGACAACAACAATTCAGTTGACCATGAGAAAGTGGGTCTTCTTTTCGAAATTCAAGGAGATTGCTTTCACAGCAGCGACACATTACAGTCCATAGCTGACGCCTCTAGTGCCAGTCATATACTTGATGATGCTCCAGTTGATAGAATTCATATTTCATGTTCAAGGATGCGGAATACATTTGCAATTTGTGGCTGGTTGCAAGATTCATGCTATACATCTCCAGGTCTGCAGGATGATCTAAAGACTATTCTCAGGAAAATAGAATCAGAACTTCTAGGTCATGGTTGTGGATGGAAAAATGTGCTCTATATTCATCTTTACCTTGCTGATATGGATGAGTTTGCTTTGGCTAATGAAACATATGTCAGTTTTATAACTCAGGAGAAGTGCCCTTTTGGTGTCCCATCACGCAGTACAATTGAATTGCCTCTACTCCATGTGAGATTAGGAAATGCATATATTGAAGTTCTGGTGGCAAATGACCAAACGAAAAGAGTTCTTCATGTTCAGAGTATATCGTCTTGGGCGCCTAGTTGCATTGGACCATATAGCCAGGCAACTCTGCACAACGAAATCCTTTACATGGCCGGACAATTGGGGCTTAACCCTCCCACTATGACACTTTGTAGTGGAGATGCTACAGATGAGCTGGAACAAGCATTAAAAAATTGTGAAGCAGTGTCAGAATGTTTTAACTCTTCAATATCTACTACTTCTGTTATATTTGTCACGTACTGTTCTACTCGTATTCAACCAGAGGAGAGAAGGAGAATAGAGGACAGGTTGCATGGTGTACTTGAGGAAATGAGGCATTCCGATAAAGATAGTTTGTCAAAAGTTCTTGATACCATTTTTCTGTATATTCATGTACCCAATCTTCCTAAAGGAGCACTTGTTGAAGTAAAGCCTATTCTTTATGTTCAAGAGAATTTAGATACAGTGGTAGAAAGTGTTCAAGACTCACCGAAGTTACATACCCCTACATATTGGGGTTTCCATCATGAACACTGGCACAAGTCTTGCATTCAGAAATGCGTTGTTAATGGAAAGATATGTGCGGTAGTGTTGTCTGTGACAAATGAACTTGCTCGGAATATTTGTTCTTGCTTACTTGGAAATCAGATTACCGAGGAGCACTTCGGATTGGTTTCTAAATTTTGCATTTATGTTCTCAATGAAGTTCTCTTGGATAGCGCTTTCTGTTGGGAAGATATAAAGAATTTAAGGTTCTACTTTCCAACTAGCCTTAATATTACTCTGGAGGCTGCGTCAATCGTATTCTCTCGTGCTTTCGATGAACTTGCGGAGTCGAATCCAACAGCTCATGTTGATCGGTTCTTCAACCTCATCCCAGTCTTAGGTGCTGGACGGACACCAACATCCATGGATGATATATTGACTTGCGAATTATTTGCTCAAAAATCCTGA MKVVALVSGGKDSCFAMMKSIQYGHEIVALANLLPADDSVDELDSYMYQTVGHQIIVSYAECMGIPLFRRRIQGSTRHQKLNYRITPGDEVEDMYILLKEVKRKLPSVTAVCSGAIASDYQRLRVESVCSRLGLVSLAYLWKQDQSLLLHEMINNGILAITVKVAAMGLDPVKHLGKELTFLDSDLHKLNKLYGINVCGEGGEYETLTLDCPLFKSARIVLDEFKTVMHSSDSIAPVGILHPVSFHLEYKTSSLGICDNNNSVDHEKVGLLFEIQGDCFHSSDTLQSIADASSASHILDDAPVDRIHISCSRMRNTFAICGWLQDSCYTSPGLQDDLKTILRKIESELLGHGCGWKNVLYIHLYLADMDEFALANETYVSFITQEKCPFGVPSRSTIELPLLHVRLGNAYIEVLVANDQTKRVLHVQSISSWAPSCIGPYSQATLHNEILYMAGQLGLNPPTMTLCSGDATDELEQALKNCEAVSECFNSSISTTSVIFVTYCSTRIQPEERRRIEDRLHGVLEEMRHSDKDSLSKVLDTIFLYIHVPNLPKGALVEVKPILYVQENLDTVVESVQDSPKLHTPTYWGFHHEHWHKSCIQKCVVNGKICAVVLSVTNELARNICSCLLGNQITEEHFGLVSKFCIYVLNEVLLDSAFCWEDIKNLRFYFPTSLNITLEAASIVFSRAFDELAESNPTAHVDRFFNLIPVLGAGRTPTSMDDILTCELFAQKS Homology
BLAST of Tan0006277 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9USQ7 (Diphthine--ammonia ligase OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=mug71 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 319.7 bits (818), Expect = 8.6e-86 Identity = 198/508 (38.98%), Postives = 290/508 (57.09%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2RV01 (Diphthine--ammonia ligase OS=Danio rerio OX=7955 GN=dph6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 295.8 bits (756), Expect = 1.3e-78 Identity = 149/252 (59.13%), Postives = 187/252 (74.21%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7L8W6 (Diphthine--ammonia ligase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DPH6 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 283.5 bits (724), Expect = 6.8e-75 Identity = 147/256 (57.42%), Postives = 186/256 (72.66%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5M9F5 (Diphthine--ammonia ligase OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Dph6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 282.3 bits (721), Expect = 1.5e-74 Identity = 152/267 (56.93%), Postives = 185/267 (69.29%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CQ28 (Diphthine--ammonia ligase OS=Mus musculus OX=10090 GN=Dph6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 280.0 bits (715), Expect = 7.5e-74 Identity = 151/267 (56.55%), Postives = 184/267 (68.91%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. NCBI nr
Match: XP_038889528.1 (diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1345.5 bits (3481), Expect = 0.0e+00 Identity = 657/734 (89.51%), Postives = 694/734 (94.55%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. NCBI nr
Match: XP_022149926.1 (diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1328.9 bits (3438), Expect = 0.0e+00 Identity = 652/734 (88.83%), Postives = 687/734 (93.60%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. NCBI nr
Match: XP_004152819.2 (diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1320.8 bits (3417), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/735 (87.76%), Postives = 688/735 (93.61%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. NCBI nr
Match: XP_022965506.1 (diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1318.5 bits (3411), Expect = 0.0e+00 Identity = 651/732 (88.93%), Postives = 683/732 (93.31%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. NCBI nr
Match: XP_023538215.1 (diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1317.4 bits (3408), Expect = 0.0e+00 Identity = 650/732 (88.80%), Postives = 683/732 (93.31%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D9W6 (Diphthamide synthase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018223 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1328.9 bits (3438), Expect = 0.0e+00 Identity = 652/734 (88.83%), Postives = 687/734 (93.60%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LKJ7 (Diphthamide synthase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G075360 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1320.8 bits (3417), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/735 (87.76%), Postives = 688/735 (93.61%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HLV6 (Diphthamide synthase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465391 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1318.5 bits (3411), Expect = 0.0e+00 Identity = 651/732 (88.93%), Postives = 683/732 (93.31%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FIH5 (Diphthamide synthase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444237 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1317.4 bits (3408), Expect = 0.0e+00 Identity = 649/732 (88.66%), Postives = 681/732 (93.03%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4Z6 (Diphthamide synthase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485878 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1316.2 bits (3405), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/734 (87.87%), Postives = 683/734 (93.05%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. TAIR 10
Match: AT3G04480.1 (endoribonucleases ) HSP 1 Score: 875.2 bits (2260), Expect = 3.8e-254 Identity = 442/736 (60.05%), Postives = 560/736 (76.09%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006277 vs. TAIR 10
Match: AT3G20390.1 (endoribonuclease L-PSP family protein ) HSP 1 Score: 48.5 bits (114), Expect = 2.6e-05 Identity = 26/70 (37.14%), Postives = 40/70 (57.14%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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