Tan0006094 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGGTCGCAGCCTCAAGAGTCAACGGCCTCAACCTCACTCCGGTGTCCAAAGCTGACGAAAAATACCACAGACCCACCGAGCTCAAAGCTTTCGATGACACCAAAGCCGGGGTTAAAGGCTTATTCGACTCCGGTATTACTGAAATTCCTCGAATCTTTTACCGTCCACCAGAGGATTCTGTTTCCGGCGATACCCAAATCCATATTCCAGTGATAGACCTTGAAAGCGTCGGCAAAGATTCACTCAAACGCAAACACACTATCGACAAAATCCGAGAAGCTTCAGAGAAATTGGGATTTTTCCAACTGATTAACCATGGGATTCCGGTGAACGTTCTTGAAGAGATGAAAGATGGGGTTCGGAGATTTCACGAACAGGACACAGAATTGAAGAAACAACACTATACTCGCGACCTGACGAAGCCTTTGATTTACAACAGTAATTTCGATCTCTATTCTGCAGCGACCACCAATTGGAGGGATTCGTTTGGGTATGTAAGTGCCCCAAATTCCCACAATCCCCAAGACCTACCGGAAATTTGCAGGTAAATGTGCTGATTTTGGACCCCAAGAAAAGACCCTTTTTAAACAGAGATTCCTGTTTAAACTAACCTCTGTTTGTGCAGGGATATTCTGGTGGATTACTCAAAACGGGTGATGGAGATTGGGAAATTACTGTTTGAATTGCTATCGGAGGCTCTAGGCCTGAATCCAAATTACTTGAACGAAATAGATTGCAGCGAGGGGCTTGCACTTGTGTGCCACTATTACCCACCATGCCCACAACCAAATTTGGCGATTGGCACATCGGAGCACACTGACAATGGCTTTATCACTGTGCTGTTGCAAAACCACGTCGGCGGCCTGCAGATTCGCCATCAGAACGACTGGGTGGACATTCCCCCAGTCGCCGGAGCTTTGGTCGTCAACATCGGAGATCTTATGCAGGCAAGTTTCTTGCTAAATCTCTTTCTCTAGCAACAAATTTACAGCCTCTAATTCGATTGGGTTTTGGTTTTGGATGCAGCTAATAACGAATGACAGATTCAAAAGCGTTAAGCACAGGGTTCTGGCAAACAAGGAGGGTCCTAGAGTATCAGTGGCGGGCTTTTTTTCGACGCTAGCTTTTCCAACCTTCAAATTGTATGGACCCATCAAGGAGTTGCTATCAGAAGAAAACCCAGCAATATACAGAGAAACCACTGTCAGAGACTTCAATATCCAGTTCCGTTCAGACGGCCTTGGAACTTCCACTTTGCACCATTTCAAGCTGAGTTAATCAGATGCTTGATTAATTGTTAACAAAGGGGGAAGAAAAAAAAAAAAGAAAACAGAGTGATTGATTCTGGGTGTTCTCTGTCTGATTGAACTTGTAAGTGAATCTGTGCAATTTATAGCTGAAAAACTAAACCGAAGCTCGTTCCACGAATACGATGATGTTGTCAATGTAAGATTGCAAGATGAATATGAACAATAAAATTGTCTTAGAAATTCAATGAAATTCTTAACTTATTCATGATAGTTTTGCTTTGTTTTAGGAGGTTAGTCATTTGCTAATAATCAAAATATCTAACATCAATCCACATGCCAAAATAGATTAAGTTGAGTTAGGGGTGAAGTTGGATCCAATCAAATACTTTGAGATTAAAGGAGAGAGAAAATGATGCTAATTGTTACTATTTTGATTATGGTTTTGTTCCCTGTCCTATGACCTTATTTTCTAGTACGAGAAATTGCCAGAAAGTATGAAGAAAAAAAAAATAGAATGCAAAGGTTGTAAACTTTTTTAGTTGGTAATGCTTCAAAATGAAATTTAGAAATGAAGGTCATACCCTATAAGTAGTGACAAGATGGATACCGAAAAAAGAAAATCTCACTATTTGGTAAAACTCCCACATTGCATAAATGTGAAAGATGTGACAAAGAAAATCATAATAGATTAACCTTTCTTAATCCTATTGCATAAACTAAGAAGTTAACTATGCGAGATTAATGGAAAAGACTCAATGTTTGTTATATTGAATGTTTTAGTTTTTTTTAATAGTAGTTTGAGATGCTAAATGTTATTTTAGTTATAGTAGTCTATTATGATTGAATCCCTTGAATATGGTATTTCAAGTCATATTTTTCAAATTTCAGCCCCATAAAAATTAGTGGCGGTGATATTTCTCGCACTTTCTCCTAGCGAGAAGGTGCCAAATCAATTATGGCCTTCATGTTCTATTCTTAGCTGTACTATATATCAGTAGTACTTGGAAGAAATTAGAGCAAAACTTTCTTTAATTCTCTATTCACTTATGAAAGGATGGACTTTGTATAAATAGATATAAATAGTCTAACCCACCGTTATGATTTTTTTCCGGTAATTAAGTAACCAATATAACAAACTAGGAAACTATGAGTACAACCTAGTAAATCAGGGAGACCTTATACTCGGTCATTCCACATTGAGTTGAATTCTCTCACAGATAACAAATGTATTAGATGCAACACCGAAGTTAAGGTGAACATGGATCGATCGGAGTCAGTTTTTCAACCCAACCGATGCCAAACCGACCATTTTTTTGTATAAGACTTAAACCAATTAAACCGAGTAGGTCGATTCCAACGAAAAAAATTTATTTATTTGAACTTATATATATATATATATATATATAAATATTTATTTATTTATTATTTATAGAATTTTACATTTTATGATTATTTATATTATATAAAATAACAATAATTTAGTGATGTCGGTTCGGTTTGTTGTATCAATTTTCGAGCTTCTTTTGCTCACCCCTATCAAAAGTTACCAGTGTACCCCAACTTTCTCTCTTGCCTCGTAGAGTCCTAAAAAAGGACAACTAAATGATAAAAAATTTAGCAAGTTTAATAATGATTGAACTTGGCATACTGAACAAACTTGATGAACATATTAGTAGGATTATCAACAATACCAACTAGGAGTGTGTAGGAACCGATGAAAACCGAAGAACCGAGCCGAACCGACTTCTTTAGATCGATTTTTTTTTTTTAAATTTTGGAATTTTCGATTTGATCATTTGAACAACCATCAGATTCGATTCAATCTTCGATTTAACACTTGAAAAATCGAAAAAAACTAAACCGAACTATATATGAAAGAAAAAAATAAAAAGTTTGTATAAGCCCAACTCATTACCCTTTTTATCCCTTCATTCATGAAGCCCAACCCATTTTTTCTTATACTTCTTACAAAGCATAACCCTAATTCTCTCTCATATTCCAGCAACCATACATCTACCATTCTCTCTCACTTTTCAAACCGATCGCCCCATCGTTTTCTTCTCTCCTTCCCCATCGTTTTCTTCTTTCCCTCCTCCTCTTAGTTTTTTCATCATTTTTTCTCTTCCCCTTCGCCACTAGATCTATACCTCATTTTTTTACTGTTGAATTTAATTATGCCTCACTCTTTCGCCGCCAGAGCTACGCTTCTCTTCATCACTAGATCTTAATCTGCAAAAATGAGCGTCGTTCTTCCACGTTATAGATCTTGATCATCTATAGTTTTTCTCTAGACGGCTACTCCACAATCTCTCCCTCATCGCCTTCTTAAAAGGCCCGATCTGTTTCAGTTTCAATCGAAATTGAAAAAACCTCTGATTTTGTCGGTTCTTCGTCCTCTTCTCACTTCTTGGGAAATGATTCTTCACATCAATGTGCTTAGTCCTCTCACGATGGATTTGACCTCTCATGATGGATTTGATCATTGTCTAGACATATTGCACTCAAACTATCATAATATATAATAGCCTGATCATGTTGTAAACCTATATCTCCAATTAACCCTTTAATCATATTCCCTCTTTAGCAACTTATGTCAATGCATGTATTCTGCTTCAGTAGTAGACAAAGTGACTATTGAAAAGTTGCATTCAACTAAAAATAAAACCACAGAGTAAATACATAACCAACTACTGTCCACATCTCCAACATAATCCAAATCACACACTAAGCAGTGTGTTCTATTCTCATAAGTCAGACCAACATCAAACATACCTTCAAGGTACGTAGCAAAAATTCTCTTTACAATTTGTCAATTTTCCTTTCGAATTAAACCTACAACGAAAGCGTTGGAATCAACTTTTATTTTATTTTAAAATTAAATTAAAATGATTTAGGCTAAGCAAAGTTCACCTTAAAAATAATATATATGGAAAATATTTTTGGATGGTCTTTTTCTCCTCGTACTCCAACTCCAATGAGATTGAATTCTAAGAATTTCACAAAATCTTATTTGTTATGATTCAAACATAGAACCAAAGAAGTTTGTGAGAATCTTCTTGAAAATAAAGGGAGAGAATGAGAGGATAATTCTACTTTCTATTATTTGGGATGCACACATATAACTCACCCTTAGAGAAATAATTAAATGTATTAAAATATATTTATACAGTTTGAATCTAATTTAAACCTTTCCAAAGTCTCCAGTGATATCTATTTCCTTATTTGAATCTAATTCAAAATTTAATAAATATTTTTCTTCGATATATCTTAATACATAATGATTTCTTTGATATTTAAGATATAATATACAATAAATATAGTTTCCTTTAATATATCAAAATATATTACAATTTAATATGTACATATGAAAATTTTTTCTCAACGAAATTTATCCATATTTGTTCATATGAACTAACAAGATCAGGACTTTATTGACCTGCTGATTATGTTTCCAGCTCCTTATTTGAACAAGTTCCAAAATGGTAGACATATTGAATCGACTAAAAAACCACTTTGATAATTTTCATTTATGAGAATTATTTGCTCTTTGTGATCTTATTAGTATTATTGGATAAAAAGTAGAAAAAAAAGTAGAAAAGAGTTGGATTTAATCACATTATTATTGGGAGGTCCCTAAATTAAGTAAGTTGAGAAAAGAGAATAAAAGAATAAGAAAATCCGTACTCCATGTTTTAGTGTAGGTTTTTGTGGAATGCAAGAGAATTGCAATTGTTCTGATT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ATGGCGGTCGCAGCCTCAAGAGTCAACGGCCTCAACCTCACTCCGGTGTCCAAAGCTGACGAAAAATACCACAGACCCACCGAGCTCAAAGCTTTCGATGACACCAAAGCCGGGGTTAAAGGCTTATTCGACTCCGGTATTACTGAAATTCCTCGAATCTTTTACCGTCCACCAGAGGATTCTGTTTCCGGCGATACCCAAATCCATATTCCAGTGATAGACCTTGAAAGCGTCGGCAAAGATTCACTCAAACGCAAACACACTATCGACAAAATCCGAGAAGCTTCAGAGAAATTGGGATTTTTCCAACTGATTAACCATGGGATTCCGGTGAACGTTCTTGAAGAGATGAAAGATGGGGTTCGGAGATTTCACGAACAGGACACAGAATTGAAGAAACAACACTATACTCGCGACCTGACGAAGCCTTTGATTTACAACAGTAATTTCGATCTCTATTCTGCAGCGACCACCAATTGGAGGGATTCGTTTGGGTATGTAAGTGCCCCAAATTCCCACAATCCCCAAGACCTACCGGAAATTTGCAGGGATATTCTGGTGGATTACTCGAAACGAGTGATGGAGATTGGTAAATTACTGTTTGAATTGCTGTCGGAAGCTCTGGGCCTGAATCTAAATTACTTGAACGAAATAGATTGCAGCGAGGGGCTTGTAATTGTGTGCCACTATTACCCACCATGCCCACAGCCGAACTTGGCAATTGGCACATCAGAGCACACCGACAAAGACTTTATCACTGTACTGTTGCAAGACCACATCGGCGGCCTACAGATTCTCCATGAGAACAGCTGGGTGGACATTCCCCCGGTCGCCGGAGCTTTAGTCGTCAACATTGGAGATCTTATGCAGCTAATAACGAATGACAAATTCAAAAGCGTTAAACATAGGGTACTGGCAAACAAGGAGGGTCCGAGAGTATCAGTGGCGGGTGCTTTTACGACGCTAGCTTTTCCAACCTTCAAATTGTATGGACCCATCAAGGAGTTGTTATCAGAAGAAAATCCTGCAATATACAGAGAAACCACGATCGGAGACTACAATATCCAGTTCCAATCAGACGGCGTTGGAACCTCCACTTTGCACCATTTCAAGCTGAGTCGAGCAGATGCTTGA MAVAASRVNGLNLTPVSKADEKYHRPTELKAFDDTKAGVKGLFDSGITEIPRIFYRPPEDSVSGDTQIHIPVIDLESVGKDSLKRKHTIDKIREASEKLGFFQLINHGIPVNVLEEMKDGVRRFHEQDTELKKQHYTRDLTKPLIYNSNFDLYSAATTNWRDSFGYVSAPNSHNPQDLPEICRDILVDYSKRVMEIGKLLFELLSEALGLNLNYLNEIDCSEGLVIVCHYYPPCPQPNLAIGTSEHTDKDFITVLLQDHIGGLQILHENSWVDIPPVAGALVVNIGDLMQLITNDKFKSVKHRVLANKEGPRVSVAGAFTTLAFPTFKLYGPIKELLSEENPAIYRETTIGDYNIQFQSDGVGTSTLHHFKLSRADA Homology
BLAST of Tan0006094 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84MB3 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g06620 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 433.3 bits (1113), Expect = 2.7e-120 Identity = 203/353 (57.51%), Postives = 268/353 (75.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8H1S4 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g06650 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 417.5 bits (1072), Expect = 1.6e-115 Identity = 204/368 (55.43%), Postives = 272/368 (73.91%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LTH7 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 12 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g59540 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 406.4 bits (1043), Expect = 3.6e-112 Identity = 197/356 (55.34%), Postives = 263/356 (73.88%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LTH8 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g59530 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 406.0 bits (1042), Expect = 4.7e-112 Identity = 197/364 (54.12%), Postives = 266/364 (73.08%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O04847 (Deacetoxyvindoline 4-hydroxylase OS=Catharanthus roseus OX=4058 GN=D4H PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 402.5 bits (1033), Expect = 5.2e-111 Identity = 201/378 (53.17%), Postives = 273/378 (72.22%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. NCBI nr
Match: XP_038877346.1 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 674.9 bits (1740), Expect = 4.1e-190 Identity = 322/381 (84.51%), Postives = 355/381 (93.18%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. NCBI nr
Match: KAG6582374.1 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase-like 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 653.3 bits (1684), Expect = 1.3e-183 Identity = 316/381 (82.94%), Postives = 344/381 (90.29%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. NCBI nr
Match: XP_008438548.1 (PREDICTED: 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 652.5 bits (1682), Expect = 2.2e-183 Identity = 313/382 (81.94%), Postives = 347/382 (90.84%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. NCBI nr
Match: KAA0049270.1 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase-like protein 1-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK17287.1 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase-like protein 1-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 651.7 bits (1680), Expect = 3.7e-183 Identity = 313/382 (81.94%), Postives = 347/382 (90.84%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. NCBI nr
Match: KAG7018783.1 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase-like 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 651.7 bits (1680), Expect = 3.7e-183 Identity = 315/381 (82.68%), Postives = 343/381 (90.03%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AWR9 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103483614 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 652.5 bits (1682), Expect = 1.1e-183 Identity = 313/382 (81.94%), Postives = 347/382 (90.84%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U1Q1 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase-like protein 1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold434G001410 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 651.7 bits (1680), Expect = 1.8e-183 Identity = 313/382 (81.94%), Postives = 347/382 (90.84%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ISK5 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1-like isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479007 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 650.2 bits (1676), Expect = 5.3e-183 Identity = 314/381 (82.41%), Postives = 344/381 (90.29%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D215 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016571 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 648.7 bits (1672), Expect = 1.5e-182 Identity = 310/380 (81.58%), Postives = 341/380 (89.74%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E8C0 (1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431758 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 647.1 bits (1668), Expect = 4.5e-182 Identity = 313/380 (82.37%), Postives = 341/380 (89.74%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. TAIR 10
Match: AT1G06620.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 433.3 bits (1113), Expect = 2.0e-121 Identity = 203/353 (57.51%), Postives = 268/353 (75.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. TAIR 10
Match: AT1G06650.2 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 417.5 bits (1072), Expect = 1.1e-116 Identity = 204/368 (55.43%), Postives = 272/368 (73.91%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. TAIR 10
Match: AT5G59540.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 406.4 bits (1043), Expect = 2.6e-113 Identity = 197/356 (55.34%), Postives = 263/356 (73.88%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. TAIR 10
Match: AT2G30840.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 406.0 bits (1042), Expect = 3.3e-113 Identity = 194/359 (54.04%), Postives = 270/359 (75.21%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006094 vs. TAIR 10
Match: AT5G59530.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 406.0 bits (1042), Expect = 3.3e-113 Identity = 197/364 (54.12%), Postives = 266/364 (73.08%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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