Tan0005999 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACTGAGACATTGAGCCCGAGGCTATATGGTACTGTGTGCACACATGTCATTTTCTGTTGTCGACGTTGAGTGTACTCCGTGACAACAATGCTGTCGTGAGTGCTGGGCGGGCCCCACTACATCGTAGAGTAAATGTTGGTTGTACTAAGCGTGTCCTGTGCAACGTAGAATGTCATACGTTTTTAAATGATTAGTAGTATCGATATGCCTTACGAAATTTTAACGATATACTTGCTAGTTTTCATGAAAAGCTATTATGATTACACAGTTACTTTTAACATTTGATTACAGATGCATATGCTCATAGATGGCCAGGTGATATGATTTACGAGTTAATAGTTTTTTTTTAAACTCAAGTCACTCACTGAGCTTCATAGCTCATCCTTTCAGTATTTTCCCACTTTTCAGGTAGAGATCGAGCTCCCGGTGCCTGATAACCTGCCATAGTCTGCTGGAAGCTCCAAGAGTTTGATACTTTGTACGTGGGTGGAGATGTATAGGAAGTCTATATGTATTGTAGAAGGACTATAAGGTTATGTTTATGTGTACATTTTAGGTTGTCGTTGTGTGATCCATGGTTGGGTATGTTTTTGGTTGTGATGTTCATATCTCTTTCAGTTTTCCAGAGAGTCATAAGTAGGGTTACCCCTTTACGTAGGTTACGTAATTGTCAATATTCCGCTGTGTTATGTTTAAGTGTTTCTTATACAAGTCTAGTATGCTTATTAGGTAAAACAGGGTCAACAGGTATCGTTAGAGAGGTGAACGATGTCTGTTGGCTTCACGCCATCTACCGGGCTAAGTTAGCAGGTAGTTCGGGAGGGGGTGTGACAAGTGCTGTCTCTAAGGCTTGAACAACGGGGCCCCACTCTCTCATTGGCCTGAGAGGGTTGTTCTTTATGGTTGGACCATGCAACGTAGTTGTTCATTAGAGGAGCAGTGGGACTTAAGGAGCAAGAGGTAGACACAGTGGTAAAACGGTAATTTGACCTACCAGTGTCTACGAACAACCAGTGAAGGGTCGACTCATGGGTATTGGTTATATCGATGGACACAACTTGTCCTACAGTGATGAGAGTGCAGCTACGGGCTTTAGTGGAGTGTTACCGTAGCTAATGAATGTTGAATAACCGGGTCAAAGAGTTTGACAGGTTAGTCTCGGATCATTGAAGCTCGTTACGTGTAGGTCCATTAGGTCCCTCGGTTGGCTCAAATTGGACAAATTGAGGGTTTAAAGTTTGGTGTGAATTTGAAGTGTTCAAATTCATTATTTGGGTATTTATGTTGTTTATATGAGATATAGATGACATAAAATATAGTTTGATGTGAATGAGATTCATAATAAACTGTAGTATAGCCTAATTGATTAATTAGTGCTATTTGGAGAAATTCAATTGAGAGAAATTAAATTGAATGTGATTCAATTTAAAATTCCACATTTATGCAAATGAGATTTGTATAATAAGGTATGATATACCTTATATTATGTGATATGCAAATATGATTTGTATATCATATACTTGTGGTAAAATGGTGAATTGGTGGAGGTTTTAACTCCACCACACACCATTATAAAAGGATGCATTCAAAGGCATCTCATAAGCCTTTTTGCCATTTTTTGGATTTTGATCCAAAGAGAGCAAGACAATTCTCTCTAGAACTCTCTAAATTCTCTCTAAGATTTCTCCTCACTCAAAACCAAAGGGAGTCCCACCTACTCTCCCTCAACCTCCCGAGAACAATCGAGAAGACCCTGTGGAGGTGTCTTGCTGTTCGGATCGAGGTTCGTCGTCGAGGAGATCGTCCGTTCGAGAAAGATTGTGACCGGAGGAGGAAAGTATTGAAGAAGAGTTCTTCAACAAGTAAGTAGCATATACCTTACTGTTTTCTTCTCCTTTTTATGCATGTTTAGCCTAGGATCTATGAGATAGATTCAATTTTAAGATAGGAATTACACAACGAAACAACGACGTTTCATAACGTCTTCCGCTGCGGAAATTCCAAATCCCTTCATCATCTTCGTCGATATGTGAAGACGAAGCTCTCGCTGCCGTCTGACTCACCTGAAGTCGGAGCTCTCGCCGCCGTTTGAGTCGCCTGAAGTTGCTGAAGCTCCTCGTCGACGACCGAAAAAAAGCAAATCGCCTTCGTCTCCATCGACTGACCGAAGCCAAGCTCTCGCCGCATCTTAGTCACCAAGTCGATCTCACCGCCGTCGATTTATCAAAAAGCAACTTAGTCAGATCTCACAGCTGGATCTCGCAGCCCCTCGTCGACAATCTCACCGTCGTCTGAGTCGAATCTTACATTCGGAGATCTCACCGCCGTCTGAAGCAACTGAGTCGGATCTCACAGCCGGATTTCGCTGCCCCTCGTCGACGATCTCACCGCCGTCTGAGTCGGATCTCACAGTCGGAGATCTCACCGGCGTCTGAAGCAACTGAACTGGATCTCACAACCGAATCTCGCAACCCCTCGTCGACGATCGAAAAAGCAACTGAGTCACTTGAAGTTGTCGACCTGAAGCTGGAGCTGTTGTCGTTGTCTAAGTCGCCTGAAGTGGTCAGAAATCATTCTCTGCCACCGTCTGCAAGCCATCGACGATTGGATAAGCAACCTCCACCATTTTCAAGCCGTCTGTATTCGGGTAAATATGCATGCCTCTAATTTATGAAGATTTTTTTAGGATTTGAGACACTGTTTAGAATATTTGAGAATAAAAAGTTCCAAATTCCAACATATATTTCTCGATTTTCCTTGTGACTCTGTTTAAAATTTTATGAATTTTGGTATTGTGTGTTTGCCCAAGGGTTGATACAAGCATGTTGCCCTCAAGTGTTGTCAATTAGTTCTCGATAATTAGAAGAATTTTCAGAACATTTACCTTTAAGTTTAATTCTTAGCACACACTTTATAAGTGATATTATTTGAGAGTTTTGTTTTGCTATGCTATTTTTGTGAGAAACTTCAATATCTAAGTTAATTTTAGTAGTAAAAGGTTGTTGGGTGTTGTCAGTAAAGTTAAATAGGACTACATAATTTCGAGAAAGACGTGGACTTTAGAGTTAGCATGCATTTGATAGTTTAATCCAAAAGGTTCATCACGTTAACGTATTGCATTCTGACCTTTCCTCTACCCTAGAACACTGGTTCTTTGGAGACTTCCTTTGAGGCTTTCAAGAGTCGTTTGATCTTAACCATGTATTAACTTACAATTTTGAGTAGTTATATGACGAGCACTGTCTTCAGATATGTGGCTTTTGGTTATTTTTCTTTTCTTTGGTTTATATGTTTGATTGATCCATCTCTTCGTTGACTTAGGAAGCTTTCGAATTTGGAAGAATCATTCGAAGTCGTTCGATCTCCAGGTTGGTCCAACTGTTGGAGTTATTCTCACGCCGAAATCTTCCCTCACCTCTCGTTGGAACATCACATCGGTAAGTAAAGTACAATGACTATAAGTTGAATTTGAACAATTACTATTAGTTGGGTTTCTTGATATAGAACTATGATTATGATTTTCTTATATTTGATTGCATGATTACAATTTATGTTCCATTTTAGGGTGGATTATTTTGTATGGTAGTGGACCACTTTTTAGTTTTACCCAACTTCTTAATGAATTATATGAACTATTTATCTAAATTAGAAGAGCATTAATGAATGTGATACTGATAATTTCAGTACACCGTTCCATTCTCAGACAGATGGTCAATCAGAGAGGACCATCCAGACCTTAGAGGACATGTTAAGAGCATGTGTCCTTCAGTTTAAGGGAAGTAGGGATACCCACTTATGAATTATGGAGTTCGCTTATAATAACAACTATCAGTCTAGTATCGCATGACACCGTTTGAGGCTCTATATGGAAGACCATGTAGAAGGCCCGTGTGTTGGACGAGGTGGGGGAGTGGAAGCAAATCGTTCCTGAGTTGGTACAAGTTATGACGGATAATATTAAAGTGATTAGAGAGAATCTGAAAGTGGCCCAAGATTATTAGAAGAGCTACGCAGACAAGCGACGAAGAGACTTAGAATTCCAGGTCGGAGATCAAGTTTCCTTGAAGTTATTTCCATGGAGAGGTGTCATTCCGCTTTGGCAGGAAAGGTAAGCTGAGTCCTAGATATATTGGTCCTTATCAGATAACAAAACGAGTTGGGCCAACAACCTACAAACTTGAGTTGCCAACAGAACTGTCTCGAGTACATGATGTTTTTCATGTGTCCATGTTGAGGAAGTATATTCCAGACTCGAAATATGTGTTGCAATTACATAGACGATGCAGTTCAAATCTTTGATAGGAAAGAACAAGTTTTGAGAAACGAGACGATCCCACTCGTGAAGGTTCTTTGGAGACAACACGGAGTGTAAACCCGAGATCTCTCCTTGAAATTTCCTTAAAAAAAGAAGAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAGCTATGTTTGATATGTAATGTTTTGTTTTAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGACAAAAGGAAAAGTTAAAATGGGTATAAGACAAAAGAAAAAACAAACTCAACTGTCTATCTTTTTAAGTAACTCATTTCTCTCCATTTCCTTCTCATTTTAACAAAAAAAAGCTGAGGGTTTCGTGGGAGAAGGACGAAGGAAGAGGAAGGATGGGTTTTCTAGAGTTGAAGTTGCAAAAGAAAGGAGGAGAACTCAATGTATGTTGGTATAGCAACAATGTAATCAATTCTGCCAAGTTCTGTTATTTGAATCACTTAGAGCTCCACAAGAAGAGATAAGAGGTGAGGTTTGATTTTCTTGAAATTTAATTCATGTTGGAACAAAATTTGTGAAGGAAGCTCGAGCAAATTCCGATCTTAAGTTACTGATTTGTGAAGAGAAAGGCAGAGGAGAGAATTTGCTGTCAAATCTGAGAAACCTTTGTTTTTTGGGTCGTGCTGATCAGTAGGATTTGAATCAGAAGGTCTAATAGGTATGATTGGAAAGCTTATTTCATTTCCTACAAC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ATGACTGAGACATTGAGCCCGAGGCTATATGGTACTGTGTGCACACATGTAGAGATCGAGCTCCCGGTGCCTGATAACCTGCCATACTACGCAGACAAGCGACGAAGAGACTTAGAATTCCAGGTCGGAGATCAAGAGTCATGCCACCACATACTAGTAGACGACGTAGGCAGGATCAGGGCGGGACGCAGGATCCTTCCCAAGGCCAATTTGAGAGGGGATCTAGTGCCCTGA ATGACTGAGACATTGAGCCCGAGGCTATATGGTACTGTGTGCACACATGTAGAGATCGAGCTCCCGGTGCCTGATAACCTGCCATACTACGCAGACAAGCGACGAAGAGACTTAGAATTCCAGGTCGGAGATCAAGAGTCATGCCACCACATACTAGTAGACGACGTAGGCAGGATCAGGGCGGGACGCAGGATCCTTCCCAAGGCCAATTTGAGAGGGGATCTAGTGCCCTGA MTETLSPRLYGTVCTHVEIELPVPDNLPYYADKRRRDLEFQVGDQESCHHILVDDVGRIRAGRRILPKANLRGDLVP Homology
BLAST of Tan0005999 vs. NCBI nr
Match: KAA0062409.1 (reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 7.5e-06 Identity = 25/32 (78.12%), Postives = 27/32 (84.38%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005999 vs. NCBI nr
Match: TYK26572.1 (putative Retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 7.5e-06 Identity = 25/32 (78.12%), Postives = 27/32 (84.38%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005999 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V9N3 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold154G002110 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 3.6e-06 Identity = 25/32 (78.12%), Postives = 27/32 (84.38%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005999 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DSY7 (Putative Retrotransposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold313G001810 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 3.6e-06 Identity = 25/32 (78.12%), Postives = 27/32 (84.38%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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