Tan0005863 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexonthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGCCTTCCGCTGCACCTGTAGTTGAATCCCCACTTCCATCAACAGTCGAAAACATCGAAACCAATTTCCAGGTTTGCTTGTTTTCTCTTAAATTTTCTTTCCTGTTACAGAAATTGCATGAATTTGATGAAGAAATTGTTACTGATTTTGCTTCATCTGTTGGCAGCCGTTCTATGTTCTTCATAAAGCATCGTGTCGGAAAAATTCGAGAAAATCAAATCTATGTGGCAAACCAAGGAAAAGAACTAAACTATCTCCATCCGGCCCCAATGGAATCGAGAATCCTGAGACTGAAGAACGCGACGGTTCTCCACTTGAACACCTGCGAATGGAAGCTCTGGAGCTTGTGTGGTCGAAAATCGAAACCACCATTAAGGTCAATCGTTTTGTTTTCACTTTTTTTCCCACTTACCCGATGCTAACGTTTGCTTGCAAATGCTGCTATTTGTCTTCTAACTGCTTATTCTAATAGTGTCTGAAAAAATTGTTGGGTCCTCTCTTGCAGGATGTTTTGAGGGATACTAATGTTAAAGTTTTTGATGATATATGTTGCTGGGTTTATGAGTCCTTTGCTGCTATTCGATCATCAGGGACACCTAGTTCGTCTTCAGCTACCCGGCCTTTTCCTATTTTAACTCCTGCTGATTGTAAAATATTGTTCACAGGGTTGGTTCTCACCAGTAAGTTCCTCATTCCAAAGTTCTAATTCGGTATATGGTATAGCTCCTAGAATTCTATCCATTTTGCAATTAAAGAACATTTGAGTTAGTTTGATGACCTTACTCGAACGAGATCTGTTCTATAGATTGTACCTTAGTGCCCCAAAATTAGAAGCTTCATGAGACAATATTTGGTGTGCATGTGAGACAACTGCACACCATGAATTCTCGTATAGTGATAATCTTTATGCTGTGCACACTTGATTTGGGAAAATATGGGAGAACTCTTTGTACATTTCCTTAGGTTTCTACTGTTGAATAAGGAAGCTTGATTAATTTGCAGAGAATATGGAAGTTGTGGATGATTTACTGACATTTGAAGAGCTTGGTTCTCATTTAAAATCTCATGGATGCCATGTGGCAAGTCTCTCTTCTCAAGAATTATCTGCCAAGAGTAGCATAGGTGGATGCATCAAAAGTTTATTAAGACAGTTGTTGAAGGTTACCGTTGATGTAAGTACCATGTTTTATTTGAGTGAATATAACGAATAATGTCGGATTCTTTTATTGAAGAACTTTGTGAATTTGTTCGCTTTTGTGGAATTTGAGCAGGCAGCTGACATGTTCATCCTGGCATCATGGTACATAGAACAAGGGTACTATGAAAACCCGGTAGTTGTAATTGTAGAAGACATTGAACGATGTTGTGGTTCAGTTTTATCTGATTTCATAATTATGTTGAGGTACTTCAAAGAACCACACCTCTAGCCAATTTCCATATGAGTTTTCATCATTTTCCCTTGATCCTTTTTTTCTTCATGTAGCGCATTATTTTTCCTTAATCTGTTTTTTGTATCTTCTGTTCTGTCAAAAACTTACAAATGCCACCTACCCAGTGATTCCTCACTATGTTGGTGCTCTACATATGTATTACTATGCATGTTTTATGGGATATTTTTATGTCATCTATTTTTCATCTATAAAAGAAATGTTATATATATTTGATATAGGAAAGTATGGATCTTAATTATATCTCTTAAAATCTTAAGAAAGTTAATGTGATTTACAATCAACAAAAGGACAATGATAATGAAATTTCCATATTTTCTTGAAGAATAATAAGATTTAGAAAGTAGTCAAAAGAATAAAACACTAATGCCTTGGACTAGGAGACTCATTCATGTCACCTTAGATATGCGTTTTATGCAAAAAGGTTAGCAAAGGCAACCATCATCTATTGTCCCGAGGCTTTGACTATTTGTGGCAATATGTTTAGCACTTCTAGATTTTTCTGGGTGGCGACTTGAAAGCTAAAACTCTCTTCTAAAATGACTAACTTTTAAGTTGAAAGGAAAAGCCAACAACTTGAGTGGAGGGAGATGGATCATCCCAACTCTGAGAAACTAGGAATAACCAAAAGGTCTCCAGCTTACTGATGTATTTGTTGTTTGATTTTTTGCTTCATTCTTTTGTTGAAACAAAAAGTTATTAACTTTTAATTGTGCAATATGTATATATTATTTTCAAGCTATCATTTTGTACATTCGTGATTTTTGTACATCAGTGAATGGGTTGTGAAGATTCCAATTATTTTAATTATGGGAGTTGCTACAACAATTGATGCTCCTGCAAATGTGCTTCGTTCAAATGCACTACAGCAGTTGTGCCCTAGCAAGTTTGTATTAGGATCACCGGCTGAGAGGATGGAAGCAGTTGTTGAGGCTGTTCTTCTAAGGCATTGTTGTATGTTCAGCATTGGTCACAAGGTTGCCGTCTTTCTGAGGAAGTACTTCTTAAATCAGGATGGCACTTTAACATCCTTTATAAGAGCCATGAAGGTTGGTACTTCAATTTCATTCAGAACTTAATGAGCTGGCAAAGACTTGTTATTTGTTATGTGCAGCATTTTCTCCCATGTTGTTTTGTATTATGATTAGGCTTCTCCTAATGATTAGTTTGGCAAAGAATTTTGCAGATTGCATGTGTCCAACACTTCTCTATGGAACCCTTGAGCTTTATGCTTGCAAGATTGCTTGTTGAAGAAGAGAATAAGGTAGCCTTTAGTTATTTGCTCTTTTAACTTCTAATTGTATAATATTAATAACTTTATACTAATACAATAATTAAGTTCTGGTGCTTATTTGGAAGTTACTAGAAATTTTTACTTTTTATGAAAGTGTCTTATTTACCTTTTATTTTAATGTATGTTATTGTTTTGATGCAATTGTTTGGTATTTTGACTTTTATGAAATGAGGAAATTATGATTCTTGTTAAACTATAACTGTCATAGGTGCTTTAATTATTTGCTAAGTTGAACATTGCTCTGTTACCAAGTGGTCACAAGTTCAAAGGGAAAGTACTTTTTTTTTTTGGTTGAGTTATCAAAACTATGACCTGGAGTTTGTGGCTAGAAAGAAACAGTTGAATCGTTAGTGAAAAACAAAAATATTTTTAAAATGTGATGGATCAAGTTAAGTTCATTTTTATGGTGTTCCCTTTTCTAAGGCTTTTTGTAATTATACTGCATTGTAGTTAATTCCAATTGGAAACACTTTTGTAAGGTATAAGTAGGGATGAATCTGCTGGTTGTAACTACTGACTGTAACTTTTCACTAAATGAATGAAAGGTTTGTCTCTTGTTCTAAAAAAAGAAATTGTTGGTAAATTAGGCTTTCTGTAAATATAATGGTATGTATTTCCATTAACCGTATAAAAACATCCAATAGAAAAGGAACTGGAGGTCACAGCCTACTCGAATAAAGAGAATTAAGAAAATAAAGGAAGTTCTCTAAAATCGTCAAAGAAACCTAAAGAAAGCCAGAAGCGATCTCTCCTCTATGCAAGGTCTTTATCAAAAAAATTCACACCAACCTCTATTTCTTCTATTTTGTCCTGATAGTAGTCTTACTCGAATTGTATGTATTTCGAATTAAATGCATAAACAACCCGAACTACTTTGGGAATGCACACCCTTCATGGTCTAGTGCAGTCGCAAGCACTTTTATGATGAAATATAGAAACAATAGCTGTTGCTTATGGAGAAATTGGGTCCCCAACATTGACCTATTTTTTTGCATGCTACTTAAGGTAGCATCAGTTTGTGCATTTATCAGTCATGTTTTTCTTTATTACGTATATGCAATATGATTTATTTTTACCAAAGGGTTTTCAGGATGGGAATCATGCTTTTATCCTAGAAGTTCTATCCAAGCATGCTTCAGATCTTCCGTCTGATTCAAGGTATTCATGAAAAAGCTCAGCAACTACATGTAATTTAGTGAACAATTTACTTACAGTATATTGTTGATACAACATTCTGTTAGGATTCTCCAACACGACCTAGAATCACACAACACACAAACACACTGGAAATCCAAGAAGAAACCTACTGTTGCATTGGTAGTTCTCCAATGAACATAAGGTTATTCATTCAGATTAAATCTCCTTGAAAAACACAAGAACAAAGAAGTTCCTCAAGCAAACAGGTAGGCCATTCGAGAGGGCCAAGCTCTCCTCCCTCAGAGACTTCTACTCTCTAAGATAATTCCCCAAAAAGATGCCCCTCCCCACAACAACTAACCCCTACATAAACCCTTTCACTCTTGGGACCGTACAGCCATACACGATCCCACTAACCTCTCCCACTTTCTCTAACAGAATTCCTGGCCCACACCTCTCTCTTTCTCTTTTTTACCCTTTCTCTTGTAAGTATGTATAATTTAGTGAACAATTTACTTACAGTATATTGTTGATACAACATTCTTAGGTACCCCTTGGCCGAAGGGACTGGTAATAATCTTGGTAATATATTGTCAGAATTGAAGAGATGGCGGAAGGGCTGGAGTGCTGTTGTCCTGGTACCCATAACTTCATTAGTCTTTTTTATCTGATGGAACTTTTCCCTTTTTTGGAATTTAACTCTCAATATCCATCATTTGCAGTGTCTTTATCAAGTTGGAAAGTTCGGCAAAGTTCAATTGCTTGACCTACTTTGTGAGGCACTTGATCCACAACTTTTCAAACCAATAACTTCTGAAAATTCAAGTAGACTGGAGCAAGGAAAGGTTGTATCGTTTTCAAGTAGTTGTGAGCTGCAATATCAATTTTCATCACGCCAGGATGGCTATATTTATCAAGCAATTCGAAAAGTGAGGTAGGTCATAAAGTTCACTGCAGTGTGATATATTGCAATTGTTGTTTTTTTTTTTTAATTTTTTTTATATATATAAGAAATAATTTCATTGATGTATAAAATTTAGAAAAGGAATATAAAATCCATGATCATTATATAAGGCTCTCCCAAATGGTTAAAAGGGAAACATAGCTATGT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BLAST of Tan0005863 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Tan0005863 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0IY07 (Origin of replication complex subunit 3 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=ORC3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 594.0 bits (1530), Expect = 2.4e-168 Identity = 333/748 (44.52%), Postives = 468/748 (62.57%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005863 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Tan0005863 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5DJU3 (Origin recognition complex subunit 3 OS=Spermophilus citellus OX=9997 GN=ORC3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 130.2 bits (326), Expect = 9.7e-29 Identity = 174/748 (23.26%), Postives = 306/748 (40.91%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005863 vs. ExPASy Swiss-Prot
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Match: XP_023534346.1 (origin of replication complex subunit 3 isoform X3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1319.3 bits (3413), Expect = 0.0e+00 Identity = 665/737 (90.23%), Postives = 694/737 (94.17%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005863 vs. NCBI nr
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BLAST of Tan0005863 vs. NCBI nr
Match: XP_022957914.1 (origin of replication complex subunit 3 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022957915.1 origin of replication complex subunit 3 isoform X1 [Cucurbita moschata] >KAG6605650.1 Origin of replication complex subunit 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1315.4 bits (3403), Expect = 0.0e+00 Identity = 666/740 (90.00%), Postives = 695/740 (93.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005863 vs. NCBI nr
Match: XP_023534343.1 (origin of replication complex subunit 3 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1313.9 bits (3399), Expect = 0.0e+00 Identity = 665/740 (89.86%), Postives = 694/740 (93.78%), Query Frame = 0
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BLAST of Tan0005863 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Tan0005863 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Tan0005863 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K3I8 (origin of replication complex subunit 3 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491354 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1310.4 bits (3390), Expect = 0.0e+00 Identity = 665/740 (89.86%), Postives = 692/740 (93.51%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005863 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H0J7 (origin of replication complex subunit 3 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459306 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1308.9 bits (3386), Expect = 0.0e+00 Identity = 665/740 (89.86%), Postives = 694/740 (93.78%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0005863 vs. TAIR 10
Match: AT5G16690.1 (origin recognition complex subunit 3 ) HSP 1 Score: 662.5 bits (1708), Expect = 3.9e-190 Identity = 363/749 (48.46%), Postives = 481/749 (64.22%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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