Tan0004253 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTTGGATTTGGTTTGTTTGACAGGCCAAGAGGAAATAGGTCGAGTGTTCGGGCCAAGGTTCTAGTTCTAACACTATGAGTGACAAAACGAACCTCGAAAATGGTTTATAGGCTTGTATTAAGCTTATGAAAATGCAAGGTTTACTAAAACGAAATGGTTTCAATGCTTATTGTTTTCCTTTGAACACATGTTTATGAGTATTCATATTTTCTAAGAAATGATTTCAAGTGCTCGTTGTGAGCCTAAATGTCTTGATGAAATTTATATGTGAGCATATGTTCTTGATTTTCGAAATTTATGAAAATGTTATGATTTCGAGCAAGTATGTACTAGCAAGTATGATTTAAAGATTTCCAGTTTTAATGAACAAGCTGAGTAAGCTTGAGTTTTACGAAAGGAAAGATAAGCAGGCATGTTTAAATGTTTTTATGTGTTTTTCTTAGTCTTGAATGAGTAAATGACTGAGACATTGAGCCCGAGGCTATATGGTACCGTGTGCACACAGGTCATTTTCTTTTGTCGACGTTGAGTGTACTCCATGACAACAATGCTGTCGTGAGTGTTGGGCGGGCCCCACTACGACAAAGACGATGGGAGTGTTGGGCGGGCCCCACTACATCATAGAGTAAACATTGGTTGTACAGGGCGTGCCCTACACAACGTGAATTGTGACATGTTTTAAAAGGATTTCTATCATTCATATGCCTTACGAGATTTTAACGACATACTTGCTGGTTTTTCTGAAAAACTATTATGATTACACAGTTACTTTTAATGCTTGATTACAGATGCATATGCTCATAGATGGTCAGGTGATATGATTTACGAGTTAATAGTTTTCTTTTAAACTCAAGTCACTCACTGAGCTTCATAGCTCATTCTTTTAGTGGTTTCAAATTTTTCAGGTGGTGATCGAGCTCCCGGTGCCTGATAACCTGCCATAGTCTGCTGGAAGCTCCATAAGTTTGATATTTTGTACGTGGTTGGTTTTGTATAGCAAGTCCATGTGTGTTAAAGTTAATTTTGAGGGGACTATGTAGTTATAGTTGTATGTGCTTTAGAGGTTGTGTAATTAATGGTTTGGCATGTTTATGGCTCTGATGATCTTGCCCGTTTTAGTCTTCAAGGGAGTCTTAAGTAGAGTTATTCCTTAGGTAGGTTACGTAATTGTCAATATTCCGTTGTGTTATGTTTAGAGTGTTTCCTATACAAGTATAGTATGCTTATCAGGTAAAGCAGGGTCAACAGGTATCGTTAGGGAGGTGAACGATGTCTGTTGGCTTCACGCCGTCTGTCGGACTAAGTTAGCTGGTAGCTTGGGAGGGGGTGTGACAGCTTGGGTCAACTCCTCCCAAGAGGTGATATTGCCTGGTAGGAGAGACTCTAGTCATTCCTTAGCCATGCAAAGATAAAGGAAAAAGACGTAAGCGAATACTATCAGCAGCGATACCATTTAATTAAATTGTACCACAAATTTCTAGAAAATTTTGCAAATGTGAATTAAGATCTTATGTGGCTTGCCTCGAAAAGCACCTTCCCTAACCATCTGAATAAGCCCTGTTTTTAGTTCAAAATTGTTAGTATTTATGGGAGCATGGACAATTCCAGCTTGCTCAGAATTAAACACAGGTTGGAAATACTCCCTGATGGGTTTAGGGTTGTTGATTAAATCCTGATTTGCCATTATCTGAGTTTCTGTTCATCCTTGCCATAGGAGTCTCCTACATGTCCTTTCAATCTCAAGATCAAAATGGTGCAAGTCTGCAGCTCTATCCTTGGTCATACACCTGGAGGTACAAAAAAAAAAAGAATTAGGCAACAAAACTAGGAAAGGAAAGAAAACATAAAAAGAAAGAAAACACAATAAAGAAAATAAAACAGAGAACTAAAACATAAACTTGGGTTGCCTCCCAAGATGCGATTTCTTTAACGTCTTTAGCTAGACGGTGACTTATGATTGACATTAAGGCATGTAAAATTGCTCGTATTTCTTCGGGCCCTTCTTGCTTGAATCGATATAGCCTTCTAAGTCTAAAATGCTATCTTGTTTTTCCTGAGCACTTGAGAGATAATTATTTTTGGTATTTGTGTGTATTGAAATAAAAGAACAAAAATAAAAAAAAATAAAAAAGACTCGTGAGTATAGGACAAATGGTTGTCAATATTAAAGGAAATTTCTGGAGATAAAAAGGGAAAAGACTTTTCAGCCTCGAACTCTATCACCTGAATTTCCTCCGTGGAAGTGATTGCATTACCATTGTCTACCTCACTAACCTGTTTCTGGTGTGTTTCAGTCTCCTCCAACTCATCTTCACTATCATACGAATAAGTCCTCTTAGGCCAGGGGTAAGAATAAGAAACTGTTCCTGTAAGGCTTTAAGGGAATTTACCAGTTGATTGAGATAATGAGTTCTTTCATGTACTATTTTCCAAAGCTCCACCACTTTAACCTCTAACCTATCCAACCTTTCTAAATCATCATGAACCAAATTTTTAATTTTCAACTCTAATGTATATTTCATTAATACGTCCACAAGAGAGGAGTTTTCTATAGGTTGGTTAGGGTACGAGACATTTTGGTTCCAAGTGCCTATATGATTACCATCAAAAGAATTTTCATCAATCATAAATTAAGAATGGTAAGGATTAGACAAATGGTATCCATAAAAATCATGATGCACATATCTGGGGTCCTGGGATGGACAGTACATTGGTGGAGAATCAAAATCATGAAAAGTCATACTTTAAATCTCATCAATTCAACTCAAGAATTTTACACAGAAATCAACACAACCAAAACAGGAGACAAATTGTAACGCCCCTACTTATATACAATACGTTCCTAGGGACATTACTACTCATGCATGCATTTGAGGCCCTAAATAACTTTAAATATTTAAAACTTGGTAATTTAAAGCACTTCAATTTGGGATCTCGTAATAATGCAAAACATTTCAAAACATAAATAAGTTCGGCCTCTAGTTTCAAACTTTTATAATACATAAGCAGAAAATGATAATCCTTAAAAATGCTATCTAAAACGTTTGTGCGGAAAACTATGACTTGGTTCTCATGGCTTCTGTAGCATATCCCCGTCACTCGCCTGGTATGCCCTCACCTTTACCTGAAAGCATTTTAAAAACGGAGAAAACAAAACAAAGGTAAAGGGATAAATATTGTAAAATACCCAGTAAGTGGAGGTCGAAAAATGCAAATACATGCACATGACTTCCTTTTAAACCTGACTTTTAAACATGACTATTATTCGTGATTTTTTTTTAAATCATAAAGCTTTCTGTAGTGGGACCTAAAACCTTCTTTCATAAAATCATAACTTTTTCTCTTTGGCTATACGTGGTCAATTGAGTCTACCTGAGTCTTTTCATATTGAGTCTCTCACAGACCCCTATAGGTTTTGAGTCTCTCACAGACCCCTATAAGAATTGAGTCCCTCACAGACCCCTATAAGTTTTGAGTCCCTCACAGACCCCTATAAGTTTGAGTCCCTCACATACTCCTATAAGTTCGACCCATAGGGTCTCTGATGTATGTTTTACCATGCATAAATTCTCAGGAGACCAATTGCCACAACCTACATAATATATTCATATACATACAATATGCATGAGGTCCCATATGTCACTCACACGTATATAGGCAGTCATAATGATGCAAAATCACATAATCATGGCATAACTTTCATAACTTTAAAACTTGAGTCAATCAATCATAAAGCATAAATACATTTACATTTTCAAATACGTATTCATTACAATGGCATAACTGAAAAGCTCACTATATATAAATATACATAACTGTGTCAAAACTTATTTTCAAATACTTTTTGAAATCATTTCTATTCGGGTCCTCTCAAACCCTTAAATCATTTGGGATCCTCTCAAAAAAAATTTAACCGTGCATTGAGGGTCCTCTCGAACCCTTTGGAGTAATAAATCTTGAGAAATCATTCTCAAAAGAAATCCTTGAGATTTATCTTTTTCAATAACTCATAAGATTCACCCTTTTGAAATAAAATTTTCAAATGCATACATGCTTCCCATTCTCAAATTCATTTATATAAACATCCCTTACCTTAGCTTGGCTTGAAACACCTAAAATTTCGCTCCTAAATCAAGTCTCCTCTCAAACTTGCTCGGTTCTCGAATTCCTTCAATCCGATACATTTTCCTAGTTAAAACACATCATAAATAACTTATTTTTTTGAATCCAATAAAAGATAAGTCGAATTACCACTAACAGATGCTGAAACCGACTCGGGGAGGCGAAACTGATAGGATCGAACACAGTCCGGTGAGCGGCGGCGCGGCGGCACATCTCGAACTGTGGAGCATACCGTTGGAATCCTCGTGGCTCTATTTATCCAAAACCGATCCTAGAACGTCAAAAACCGATCGAAAAGCTCCCTAAAAACCTGAGCAAAATTCAAACCAGTAATTTCAAGCCCTGACGCGAACGGCTTCCCGCGGCGCAACCACTCGATTCAAAGCTTCCATCTGCGGCGGTCGTCGACGTCCAGCGGCTGATGACCAGAAGTGGGGGCTGAAGATGGCGAAACACCCCTGCGATGGAGGTGGCGTTCGGCGATCGGCGACGACAGCACACCGAGGTGGCGGCCGGCGGACACGAGGCTTGGCGTGTGGACTCGCATGGACTTCACGCTACACGGCGAGAGGTGGCTGGCTGCGCGGCTTCACAGGGCGGCGGACGACTAGCTCATCGTGTGTGGCGACCAGCAACTGCGGTGGCGGCGCAACCCTGACGAACCGATCGAAGGTCTGGTGGCAAGGCTGGCGTTGCACGGTTGGAGTGAGGAAGGGGGAAGATGGATGTGCTTCGTAACGCGTGCCTAAAAGAATAAGGAACCCTAATTCTATTTCATTTACCAAAATGCCCCTCCTTCTTCTCATAAATTACAAGTGTGTCCTTAACTCTATTTAAGTGCTTCAAAATGTCCTTAATTACCCAAAATC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BLAST of Tan0004253 vs. NCBI nr
Match: TYK11725.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold304G00370 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 9.2e-14 Identity = 55/106 (51.89%), Postives = 65/106 (61.32%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004253 vs. NCBI nr
Match: KAA0060199.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold386G00120 [Cucumis melo var. makuwa] >TYJ95571.1 uncharacterized protein E5676_scaffold767G00770 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 85.1 bits (209), Expect = 7.8e-13 Identity = 55/111 (49.55%), Postives = 66/111 (59.46%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004253 vs. NCBI nr
Match: KAA0037515.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold277G001260 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK01990.1 uncharacterized protein E5676_scaffold808G001020 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 1.6e-10 Identity = 48/95 (50.53%), Postives = 59/95 (62.11%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004253 vs. NCBI nr
Match: KAA0067117.1 (hypothetical protein E6C27_scaffold38G001760 [Cucumis melo var. makuwa] >TYJ97479.1 hypothetical protein E5676_scaffold598G00400 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 76.6 bits (187), Expect = 2.8e-10 Identity = 54/127 (42.52%), Postives = 65/127 (51.18%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004253 vs. NCBI nr
Match: KAA0042035.1 (DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 72.8 bits (177), Expect = 4.0e-09 Identity = 48/111 (43.24%), Postives = 58/111 (52.25%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004253 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CJL4 (Retrotrans_gag domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold304G00370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 4.5e-14 Identity = 55/106 (51.89%), Postives = 65/106 (61.32%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004253 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BAD1 (Retrotrans_gag domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold767G00770 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 85.1 bits (209), Expect = 3.8e-13 Identity = 55/111 (49.55%), Postives = 66/111 (59.46%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004253 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BSA6 (Retrotrans_gag domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold808G001020 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 77.4 bits (189), Expect = 7.9e-11 Identity = 48/95 (50.53%), Postives = 59/95 (62.11%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004253 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VIY9 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold598G00400 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 76.6 bits (187), Expect = 1.3e-10 Identity = 54/127 (42.52%), Postives = 65/127 (51.18%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004253 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TKT0 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold67G004880 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 72.8 bits (177), Expect = 1.9e-09 Identity = 48/111 (43.24%), Postives = 58/111 (52.25%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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