Tan0004011 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCAGTATCAGAGGCTTAGACAGCAGGCAATGATGCAGCAGTCTTTGTATCCCCACCCTGGCCTCCTGGCTGCTCCTCAGGTTTCTACCTCTCATATATTTTAATTTTTTATTGTTCGATTTGGTTGCAAGATATGTATCCTCTTCTGATCGATCCTTTATTCCTCAGTTTTAGATTACTCGAGCTTGGATCGTTCTCTCCCCAGCTATTTTCTTGAAATCTGAGTTCGTTTCATCAACAAGATATAATATATTTTTTTTTCAAAATTTTTAAAGTGGAAACAGGAAAGGTTTCAGTAGAGAAGTAAAGGTTCAGTAGGTGATAAGATATCAATGTTAGAAAGGAGCCCCAGGGATTCAAAAGCAATCCTCCAATTGTTATCGATAAATTATAATCATGCCGACGAAAACATTTTCGCGAGGAGCTTTACCAAGAAGTCTTGTACTGAATAGTATCCCAAATGACCACTTCCCAAGTGTTCCGAAAAAGTGTGAGATTTCTTTTCAACCACAACTTCCCAGCCACAGCTTTGATGTCTAGAAACATGGTCACTGAGAAGCTGTTCTACACTTCCGACCGAGGTCAAACGCCTGTAATAAGAAAAGTAAAAGCTCCCGAGTAGTTGGACAATGAAGAAACAGGCGGCTTTGGGTCTTACAGTTCTCTTGGCATAAAAGACAACATTTAGGATTGGGGTTAAAAAATCATACGTGATGTCCAGAGACTATATTCCTACCTAAATGAAAGAAGCACATCCTAAAGTGCGTCCCCTTTTATCAAATCTAAAAACCATGTACTGGTTCCATGTTTTTCTATGAGTTCGTCTTTTGTTTTTTCCCCTCCTATTTCATTTTGATTGGCCCATTTGTGCGCACGTACATACATGATGGAATTTGCATGCTAGTGAGTAAATGACAATCAATTAACTAGTTTTCAAATACTCCTCCTTTCTATTCTTCTTGCACAAACTGTTGCCATCGTTATGCGAGTCTTAGGAGCCATCCAGATATTCTTTAGCTGTTGCCTTTGGTAACCTGAGTAACAGAAGTCACCCAGATATTCGTTCAGAAATATGATCGTTAATTGATCAATATCAGTATCATATTCTTCTTTACATGGGCTTCCATGACTAGTCCTTAGAGATTTCTTGCTGAAGAACACGAGTCAATTGGAGTCTCTTTCATCCCTGGATTTAAAACATTACCCATTGTTTGTGAGTTTGAGCTGTCGGTGACACTGTCTACGTAACCTTTTTCCACATTTGGCTGGAATTTGGGTGAGGAGTGCAGACATGTTTTTCTAGGAAGATTCTGCTTTCCTTTTCTCCTTTCTTGGTTTTTACTTTTTTATTTTGCAGATAGAGCCTATCTTGAGTGGAAACCTGCCTCCTGGCTTTGATTCAAGTACATGCCGCAGTGTGTGAGTGTTAAATAGATATTTTCTTTTCCTTTTTCGATTTTGTCATTTAGTTCATTTTAACTTTTACATAGTAAGATGGAGTCTTGATTTGGATTAACTCATACCTTTCTTGCCTTAGATATAGGGTTCCTCATTGGGTTTGGCATTTGTCGATTGATTTCCATTGACACCATATCATGTTCATTATTTGCTAAAATTGATACCATTTCAATTCGTATGTGGAATGAATGAATTCAAGTACACTGACTGCTATTACATTATTTGTTCTTAATTGGCCATCAATCTGAACTAATGGAAAAATATAGGTATGTTGGGAACATTCACCCCCAAGTCACCGAGCCTCTTCTTCAAGAAGTTTTCTCAAGTATTGGACCCATTGAAGGATGTAAGCTCATTAGGAAGGAGAAGGTGCGGTTCCATTTAGACTGTCATTTGTTGGTATATGACCTCTTTCCATCATGATAATAAGTACCATCGATTAATAACTATTAGATTTTGATGGACTATTTCTTCCTTAAGTAACCAGTTAGTGGAATTATTTCAAAGAATCCAGTGTTATCTCACTGATCAACATCTTCTTTGAACGTGTTTTTGGTTAAATAAATTGGTGCTGATCTTCTGTCTTAAGTTTTGTTTCTATTTATGCAGTCATCCTATGGTTTTGTGGACTACTTTGATCGCAGATCGGCTGCAGTTGCTATTATTTCTCTCAATGGAAGAAACTTGTAAGTGAAATTCTTTATTGCATTTTTATTGACATTAACCAAATCATATATTTCAATATAATTTCACACAGGTTTGGACAACCTATAAAAGTTAATTGGGCATATGCAAGTAGTCAGAGGGAAGACACATCTGGTTGTATGCTTAGATTGTTTCTTTTTCCTTTTACTTTGTTTCCAATGACGAGGAGTTTGTAGTATGCGGCTGCTGATATTTTTATATGGTGTTTTTATCCAGGTCATTTTAATATATTTGTTGGTGATCTTAGCCCTGAGGTTACTGATGCTACATTGTTTGCATGCTTTTCTGTTTACCCCAGTTGTTCGTAAGTTTGTTCTCCAAATTTTTGTTATGAGTCCGTCTGCTTGGCTTATGTTCAAATGTTTGAGATGTGACAGAGCTTAACTTAATACTATTCAACTGGGAGTGTCTTGTTCTAGCACCTCTAATTTTAATTTCCTTAAATACTTCAGGGATGCAAGGGTTATGTGGGACCAGAAAACTGGACGCTCGAGGGGTTATGGTTTTGTTGCTTTTCGGAATGAGCAGGTTTTGGAATTGTTTCAATATTATGTTTTTACCCCTTCCTGGATCCCACCCTTTTGCTACCAATATAGGAAGTATTATATTTGCTTTCTTCAGATTATGGTCATAATTGTACTTCGGTTGATAATTATTTATTCTGCTCTCAGGACGCTCAAAATGCAATTAATGACATAAATGGTATACCTACTCTCTCTCGTTTGGAAATCTTATGTTGTGTATTTATCTATTTATTGACCTGGCTAACCATATCTTGTCCTGAACCATGCATGAGGAGTATGGAAACTTGATATGAAAATCCAAGGGAACTGATATGAGATCTCTTCCATTTAAGGAGGACCCCAAAGAACTGTCCTTGAATCCTGAAACAATTTGGATCAAGTCAAAAGGCAAAATTAGATTTGGATCAGTGTTTTCAAAGCGCAAGGCGCACCTCAAGGCGACAAGCCCTGTGATAGCCCGAAGGCAAGAGGCGACCAAAAGGCGTGGCCCGAGTGATGCGAGGCGCAATAATTAAATATATAAATAAATAATATATAGAGCATAAATTGTATAGTAAATATTATATAAAATGTAAAAACCTTAAAAGCTTAATACATCAATCAAATGTCACAAGTCATTAAGAATGAAATAATGAATCACTGAACCAAAAATAATAAAGGTAAATGTTAAAACTAGTCTAAATTTAAAAGACTACAACATTAATCAACTGTCATAATCATAATTTTCCTCCCCATCTACAGCTCCTCCTTGATTTTTTAGTGTTTCTTGAATTTTAAGTTAAGTAGTTAAGATTCATTAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGCCTGCGGAAAGTCGCAGGCGATCGCCTGCGCCAGAGGCAAGGCGGCTGCAAGGCGCGGCAAGGCGAAGCCGGGCGTGCGCCCCGTTGAAGGGGCTCGCCTTGCCTTGATGCGAGGCGCAAGACCTCAAGGTCGCCTCGCCTGTCGCCTAAGGCGAGCGCCCGGCTGCGCCTCAACAACACTGATTTGGATTATACATTATGGTCAGTGTTTTAAAAAGCCCTCCGGGGCGCGCGCCTAGGCGCGAGGCGCATGTAAGAAGGCGCGCGCCTTCCATGAAGCCCTTGAGGTGCGCAAGGCGTGCCTCTGGGGCTTCTTCAGTTTATTTATTTTTTTTCTTTCATTAAATGTATTTTAAATATATATTTAAAGAAAAAAACACAAAACACAATAAACCCATTTCATTTAGGGTTTAACATCATTAAAATCAGTGGAGGAGAGATTGATATTTAAGGCTTTTGATCTTGTAGTGTTTATAATTTATTAGTGTTGTATTGTTTCATGTTTTTTAATAGAGTATCTATTGTCTCTATGTTCAAACATTAATACTTGAAAGTTGAACCTTATTTCTTTTACTTATTTTCCTTGGTTAAAACTTAATTTCATCCCATGAAGAGTTTTTCTTATTGTGTATATATATATATATATTTTTATTTTTTTATATATAGTGCACCTTAGATAAAAAAGCCCGCACCTTTTGGTGCGCCTTGCGCCTAGGCTCCAGAGGGCTAGTGCGCCTTGAGCCTTTAAAAACACTGATTCTGGTCAATGATCAAGAAGCAAGAAAGCTTGTTTTTTTTATTCAAGGTTGTAAGACTCCACAAGATTAGTGATCAATCAAACTTGAACTTATAGGGACATGCTAACACATAGAATTGCAATGGGAAAGAGGGAAAAATTCTCGACTCTTTAGAGTTGGTCAAACGCTGAATTTATTTCATCGTCTTAACTACAATGACCTGAATAAGGCATATATAGTCTTAAGGGAGGTGACAACAAAGGAAGTAAAATGCTAAAAAATCTCGACAAACAAGGTAAAAATCCTATTAATCCAATAAGGCAAGAATCTAAACAAATCAATGTGTAATTTTAGACAATAATCCCCCTAATAAAATCCTAAATAAATGTCAATACAAGGCCTAGATGGCAAGCTAAAAAATAGTCTTAAACTAGGATGTATTTATAGGCCTCCCTAAGCTCTTCGTCTCTTCCTCTTGGATTGTGTGAGTAGCATGGATTCTTGGAAAAGATTTCTTTGATGCAATGATAAGCTTTTGGAGCCTTTGAAAGGGAACTTGAATTGACAATATGGGCTTGGATCTTATTTGGTTAGTGGGCTAGGATCTTATTTGGGTATTGGGCTTGAACTTGCAGATTGAACCTTGGATAGAGATTTTGAAGTCTAAGCTTGGTTCCTTGCCCTTGGTTCATATCGAAACTATTTTAAATTAACAGAGAAAATGTTCAGTGATTGGTATTAATTGCAA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BLAST of Tan0004011 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M427 (Oligouridylate-binding protein 1 OS=Nicotiana plumbaginifolia OX=4092 GN=UBP1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 585.9 bits (1509), Expect = 3.5e-166 Identity = 302/424 (71.23%), Postives = 345/424 (81.37%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LQI9 (Oligouridylate-binding protein 1B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=UBP1B PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 571.2 bits (1471), Expect = 8.9e-162 Identity = 293/420 (69.76%), Postives = 329/420 (78.33%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LJH8 (Oligouridylate-binding protein 1C OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=UBP1C PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 565.5 bits (1456), Expect = 4.9e-160 Identity = 289/420 (68.81%), Postives = 331/420 (78.81%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SYG4 (Oligouridylate-binding protein 1A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=UBP1A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 524.2 bits (1349), Expect = 1.2e-147 Identity = 274/421 (65.08%), Postives = 325/421 (77.20%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6YZW2 (RNA-binding protein 208 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=RBP-208 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 465.7 bits (1197), Expect = 5.3e-130 Identity = 255/438 (58.22%), Postives = 308/438 (70.32%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. NCBI nr
Match: XP_022154627.1 (oligouridylate-binding protein 1-like isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 764.6 bits (1973), Expect = 4.2e-217 Identity = 386/420 (91.90%), Postives = 392/420 (93.33%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. NCBI nr
Match: XP_038889890.1 (oligouridylate-binding protein 1-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 760.8 bits (1963), Expect = 6.0e-216 Identity = 384/420 (91.43%), Postives = 392/420 (93.33%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. NCBI nr
Match: XP_008460071.1 (PREDICTED: oligouridylate-binding protein 1-like [Cucumis melo] >TYK10832.1 oligouridylate-binding protein 1-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 759.6 bits (1960), Expect = 1.3e-215 Identity = 383/420 (91.19%), Postives = 391/420 (93.10%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. NCBI nr
Match: KAA0061449.1 (oligouridylate-binding protein 1-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 758.8 bits (1958), Expect = 2.3e-215 Identity = 382/414 (92.27%), Postives = 389/414 (93.96%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. NCBI nr
Match: XP_022965399.1 (oligouridylate-binding protein 1-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 758.4 bits (1957), Expect = 3.0e-215 Identity = 382/420 (90.95%), Postives = 391/420 (93.10%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DM61 (oligouridylate-binding protein 1-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021846 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 764.6 bits (1973), Expect = 2.0e-217 Identity = 386/420 (91.90%), Postives = 392/420 (93.33%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CHT1 (Oligouridylate-binding protein 1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold332G001510 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 759.6 bits (1960), Expect = 6.5e-216 Identity = 383/420 (91.19%), Postives = 391/420 (93.10%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CBS9 (oligouridylate-binding protein 1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498989 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 759.6 bits (1960), Expect = 6.5e-216 Identity = 383/420 (91.19%), Postives = 391/420 (93.10%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V704 (Oligouridylate-binding protein 1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold41G00040 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 758.8 bits (1958), Expect = 1.1e-215 Identity = 382/414 (92.27%), Postives = 389/414 (93.96%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HQW3 (oligouridylate-binding protein 1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465315 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 758.4 bits (1957), Expect = 1.4e-215 Identity = 382/420 (90.95%), Postives = 391/420 (93.10%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. TAIR 10
Match: AT1G17370.2 (oligouridylate binding protein 1B ) HSP 1 Score: 572.4 bits (1474), Expect = 2.8e-163 Identity = 293/417 (70.26%), Postives = 329/417 (78.90%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. TAIR 10
Match: AT1G17370.1 (oligouridylate binding protein 1B ) HSP 1 Score: 571.2 bits (1471), Expect = 6.3e-163 Identity = 293/420 (69.76%), Postives = 329/420 (78.33%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. TAIR 10
Match: AT3G14100.1 (RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein ) HSP 1 Score: 565.5 bits (1456), Expect = 3.5e-161 Identity = 289/420 (68.81%), Postives = 331/420 (78.81%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. TAIR 10
Match: AT1G54080.1 (oligouridylate-binding protein 1A ) HSP 1 Score: 524.2 bits (1349), Expect = 8.8e-149 Identity = 274/421 (65.08%), Postives = 325/421 (77.20%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0004011 vs. TAIR 10
Match: AT1G54080.2 (oligouridylate-binding protein 1A ) HSP 1 Score: 518.5 bits (1334), Expect = 4.9e-147 Identity = 274/425 (64.47%), Postives = 325/425 (76.47%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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