Tan0003675 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGCTTTCACGTTCTCAGAGCCCCTCCTTTCTCCTCCACAATCATAATCTTCAAACCCACTTCTTCCGCTTCGTTTCTCTTCAAATTTGGCTATGCTTTCTACTCTTCACCCTTCTCCAAATCTCCTTCTTCCACCAGAACCTATTTCCGAGCTTCTTCCCTCAAATATGTTGCCTCCCCTGCAACTGCAATTCCGCTTTCTGGGTCTCTTTCTCGGAGAGCTCGTAATTTTCGTGGTGGGTTTATTGCAGCTACAGCTGCACCTGGGTCAGTCCACAAATCTGAGGAATTGAGGCCTTCCATTTTGCCAGAGCAATCTTGGGTACAGAGGCAAAATGGATCTGAGTAAGACTGTTAACTTTCTTGCAAATGTTTACTCGCGTTTTCTTTTATTCTTTTATCTTATTTTCCCTTTGCAATTGTTAAGTGATGTAGATATATGTTTTTCTGTGTATTGTAATTGGAAGGCCTAGAGGTTTTGTGTCAGAAGCATTATGTTGTTCGAGGATGAAATTTGGAGTTCGACAAGGCACTTAAGTGTAAATCGAACTGTTGGATCATTATTTCTAAGTCTATGCCTTTTAACTTTAAGGGTGTTACCGTGTTACTATATAATTTGGTTTAATTCTTATTTACAAATTTAGACTCCTTTAGGCACTAAGTTCTATTAGCTTGTTATGGTATCCTTATTTTATCCTGATAGCTGGTAGTTCAGGGTTATGTCTAGACTAATTTATGGCTGTTGTTAGTAAGGACCTATTCTTTATTTTTTTTAAACCAGAAACAGACTCTTCATTGATAGATGAAAAAAAATATAAAAGTTCAAGGATAGAAAGTAGGAACGGAAAAAAGAGAAAGTAATATAACCAACCAAACAGAGCAAAACAAGCTCTCCAAACCTAACCGAAAATCAACCAAGCCTAACGCACCAACCACTCATTCATGAACAAAACCAGCAAAAAGAAAAAGAAAAAGAGAAAAAATACCGAGCCTGCAAACTCTGCAAAAATCAGCCTAAAACATGATCCCAATGGAAAAGCCGACCTCCAAACACCACCAACGCAAAAGTAGAGTAACTCGAGAATCCACGAAGAAAGCTCCTCAATAACATTATCCTCTTGGAGAATCTCTTCAGCATCTTTCTCCATAGGTTTTTGAATGGAGTTATCATTTGTAGAGTGGATTATACCACGAGAAAGAGGGGGATTAATATTTAAAATAGGAAGCTTCCCTCTTAAAAAACTTGCATGCACATGGCCATTTGAATTTAAAGGCTTTATCTGAGCTTTTTTCTTGAAGCTTTGGCTTGAGAGGAACAATTGCAGCTTCAATGGCTCCATGGATTCCTTTGATACAATCTTAAATTCTTTTTATGGTTTTATATTGGTGTGAATGCATTTATCTTTTTTCATATTGTAATCTTAATATTCTTTTAGCCAAGTGATAAAGCCTTTTGTAATCCATCTCTTGGCATTGGGGGACTCTGCCCCACCCCAATTTTATTTTCTATAATATTTTATTTTATCAATGAAGTATAAGTTTCCTTTAGAAAAACCACAACATTACCTTCTCAGAAAATTCCTCATCTCTCTTTTTAGAATAGTTATCACTTTCTTGGAATAGGAAAAATGGATATAAAATGACTCCAGTTCCTACAACTTTGGCCTCATCTTCCTTTTGCTTTCAACATAATAGTCTTTCAATATTTGGTCTTTATAAATTGGTATGAGAGCACATTTATCCATAAAATGGATGCAAATTCAGGAAAACTTTGTTGGAATTTGGAAATGCACCATATACTTGACTTGAGGTTGAGGCGATCATGGACATTTTTGAAAATAAGACAAGAGGTGAAATCGAGACAAAAAAATTCTATGCAAAATGAAGTTACAAGAGGAAGCAAAAATGTTTTCAACCAATAATGTTGGAATAGAACCAGTTAGTAAGAAGGAGCACAATGTTCATTGTAGGAACTGTGTGGCTCTAAAACTAAGAAAAAACTATAATGGACCGATTTGGGTGGATGGGGCAAACCAAAGCGAGTCAAAGCAAAAATAGACCATGTTCTATAGATAGCAATTTAGGTTAGGAATTAGGATGGGAGAATTTGGAGATGGAGTCCAAATCAAAGGTTCGTGAGATAGGGAGAATTAAAATTGACAAGGTTGGGAGGCACCAACCAAGAAAGATGAGCTTAATAGTTACTCAAATATATAATAAGGTCGACTATTAACTTATTAGAAGTGGTTGGTGCTCATTGACTTGATCATAGTAGATCACAATTCACCCAACTTGTTCATGGGGTAAGGTTTGGGGATTGGATGTGATCGCCCTCGATGTGAACAATCTCTTCCAATTAAGTAGTGTCATATTTCCCATTCTTGTTTAGGACCTTCTAGAACTGCAAGGGGTCAGACAAACAAATTAATAAAAGGCTCTCGTTTAATAGAAGGCTCTCGTTGAAGATAATATTGTTGAAGATTTTAATGTTGTTCACTCTTTGAATAGTACACGAGCTCTTCTTCCTTTGGTAGCAGTAGATGCCTTTGGCTTTTCAAAGAAATATGGGAAGGTGTGATGATTTAGTCCCATTATATCAGTGTCAGTAATATTTCCAAATATCTATATTATTTATTTTGATAGGAAACAATAACCATTCACTGATATGATGAAATGAGATACAAAAGAAAGTCCTATCGATAAGAAGTTACAAAAAACACCTCCATTGATTATTGAGGGCAGATAAACTATAATTACAGAGAGGAGGAGACAACCTGCTCCAAGTGATAGCTAAGATAGAAGTTGATTCAATGAAGTAACCAATATCCTAGACTGTATCCATAAGGACGCGAGAATTACGTTCCAACTACATATCCCATAAAAGAGCATGAACATTACAAGAATCTCTTTTTCCTTTTTGAAAGGATGTCCTAAGAACAAAAGTGAGATAAGAGAAAGTGTATCACCTGGTCTAGGGAAAGTCCATCCGAAAGTGTCTTTTAAGGAGTTCGAGAAAGTAGAAGCAAAGATGCAAGTTGCTGAATAAACGAATCGATGTTTCATCCACAGAAAAACACATGGGACAACAAGGAGAAAGATAGATCCATGGAGACTTCTGTAACTTGTCAAAGGTGTTGATGCAAGAGGGGCTAAGTTCCCAAATAAAGAATTTCACTTTTTTAGGGAAACAACCTGACCATATTTGTTGATAGATAGGTGAATGCTCATTTAGAACATTGAATGGATTTTGTGGAACCTTGACATGGATTTTGTGCAAACTATGTTGTCTTTTTCTCAGGACCAACACCATAAATCTGCTTGGTTGGAAAGATAAATTGGTTGTTAATAGGTGGATAACATAACCCATTCTTCAATCTCAACTTTTGTGAGGTTTCTCCTCTGGTGAAGCATCCATGCTTCATTCTAGAGATGTTCATTTCTTGTCCCTACAGGACCTGCTTCACCTGTTTAGGTGGGGAATTTGGGGGTGGATTTTCCCCATTAGCTGAATGGGACGATGATGGGGAATGTATTTCCCGTCCCCATCTAGATTAATTTATATATATAAAATAAATCCTAAATTTAAACTTCTATGATACATTATTTTATTTTTCTAAAGAAATTTTAAAAAAATTCTATTCAACTAGAAATTTATCCTAAAGAATTAACAATTTAAATAAAATTTCTAAAAATAATTTTATTTAATCAAAATAAAAAAACCATAAATGTAGAATACTTTCCTGTGGGGAACTTGATCCCTACAAAATTAAATGGAGAATGTCATGGAAATGGGGGCTGGGAAGCCATCCCCAACCTTGCCCTACCGTGTGGACATCTCTACTTCGTTCTATGTGCACCAAAAGTCAACAACACTGACCGTTTTCTTGAGGGATAAATTGTAAAGCTATGGGAATTGGTGTTGAAGACTGAAGTTCCCTATCCACATGTCCTTCCAAAAAGAGGTATTAATACCACCATTGCCCACTTGTAATATGAGCATATACCATGTCTTAGTAGGACAATGGCTTTCCAAGGCCCTCTAGATGAGTGTAATGATTTGGTATTCGATTTGAGATCAAAGTGGGTGGATCCAAATTTGGATGCAATAATCCTACGCCACAATGCACTCTTTTCAAGGTGAAACCTCCCGATCCATTTTTCAAAAGAGAAATGTTTCTCTGTTGTAAGCCCAAAATCCAAGGCCCCCTTCAATAAGGGCCTTAACATATTCCCATTTAAGAAGATGATGACCCTTTTCTTCCTTGCAACCTTTCTAGAGGAAATTTTGAAGAGTTTCTCTAGCCTAACGGGCACTTTATTAGGCACCCTAAAAAGCGTTAGGTAATAAATGGAAGATTGGTAAGAGTTGCTTGAATGAGGGTAAGCCTACCGCCTTTAGATAAATGAGTTGAGCACCTTGTCATAAACTTCCTTTCTACTTTCTCAATAATCGTTTCCCATAAAGATGAAGATTTTGGTTTTCCATTTAAAGGTAAGCCAAGATAGGTGTTCGACCAATATCCTAACTTACACCCAAACCGATCAGCAAGGTAGGATAGAATAATCGGATTAATGCCAATGCCCTAAATTCAGATTCATGACAGCTTACATTAAGTCCAGAAGTTTCCCAAAGTGATTAATTGTACAAAAGAGAGATTGCCAAGGTGTTCCTTGTTCGGAGAGGAGAATAGTGTCGTCTGCAAATTGGAGGTGGGTGATGGAAATACCATGGGAATTGTTGCCCACTCTAAAACCTTTAATCAATCCCTTTTGATCTTCAAGAGAAAGCATCCTACTCAAGCAAATGACCACCAAAACGAAAAGAAAAGGAGATAAGGGGTCTCCTTGTCGCAAACCTCTAGTGGCCCAAAACATCCCTCTAGGCTTTCCATTGATGATGATGGAAAAATTGGCCGCCTAAATGAATCCCTTAATCCATCGGGGCCAATTGACTTCAAAACCTTTGACACGAAGAATATCATCTAAGAAGTC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ATGGGCTTTCACGTTCTCAGAGCCCCTCCTTTCTCCTCCACAATCATAATCTTCAAACCCACTTCTTCCGCTTCGTTTCTCTTCAAATTTGGCTATGCTTTCTACTCTTCACCCTTCTCCAAATCTCCTTCTTCCACCAGAACCTATTTCCGAGCTTCTTCCCTCAAATATGTTGCCTCCCCTGCAACTGCAATTCCGCTTTCTGGGTCTCTTTCTCGGAGAGCTCGTAATTTTCGTGGTGGGTTTATTGCAGCTACAGCTGCACCTGGGTCAGTCCACAAATCTGAGGAATTGAGGCCTTCCATTTTGCCAGAGCAATCTTGGGCTCTCGTTGAAGATAATATTGTTGAAGATTTTAATGTTGTTCACTCTTTGAATAGTACACGAGCTCTTCTTCCTTTGGTAGCAGTAGATGCCTTTGGCTTTTCAAAGAAATATGGGAAGGTAAAAACACATGGGACAACAAGGAGAAAGATAGATCCATGGAGACTTCTGGCAAACGAGGATTTGGATCACATGCTTTGGAGTTGTGACTTTGCTCGAGCTATTTGGAATTGCTTCTTTCGGCAATTCAACTTCGGTTTTGTTGGCCACTTCGATTGTAGAGCGACATTCATGGAGCTTCTTCTCAATTCGCCTTTCCATGAGAAAGTATTGTTTTTATCCTTACCAGCTTCTGAAGTGCCTTTAAGAGGTCGTATTTATCATGAAACTTATGGGTGTCAAATGAATATTAATGATATGGAGGTTGTTCTATCAGTCATGAAAAATGCTGGATACGGTGAAACCGTCGACATTCCTGAGACTGCAGAGATCATTTTTATCAACACTTGTGCAATCAGGGACAATGCCGAACAGAAGGTGTGGCAGAGACTTAATTACTTTTGGTTTCTGAAGAGGCATTGGAAAAGTAATGTTGCTATTGGAAGGTCACAGTCTCGGCACCCTCCAAAAGTAGTTGTTTTGGGGTGCATGGCTGAGAGGTTGAAAGATAAGATACTAGATGCAGACAAGATGGTTGATGTGGTTTGTGGACCTGATGCTTACAGAGATCTACCAAGATTATTGGATGAAGTAGATTATGGTCAAAAGGGAATAAACACACTTCTTTCCCTTGAAGAAACTTATGCCGACATAAGTCCAGTACGAATATCTAAAAATTCAGTCACTGCGTTTGTATCTGTGATGAGAGGGTGCAACAATATGTGCTCATTCTGCATTGTTCCTTTCACTCGGGGCAGAGAGCGGTCACGTCCAGTTGAATCAATTGTGTGTGAGGTCGGAGAACTTTATAGAGAAGGTGTGAAAGAGGTTACCCTTCTCGGTCAGAATGTTAACAGCTATAATGATACCACTGGGAATGCAGACGTAGAGCCAGGAACTAATTGGAAACTCAGTGATGGGTTTTCCACCATAGCCAAGGTAAAGAAAATGGGTTTGCGTTTCTCTGATCTCTTAGATCGTCTTTCCACAGAATTTCCTGAGATGAGGTTTAGATACACATCTCCACATCCTAAAGACTTTCCCGATGAATTCCTTTATTTAATGCGAGACAGACACAACATTTGCAAAAGCATCCATTTACCTGCTCAGAGTGGGAATAGCACAGTTCTTGAAAGAATGCGTAGGGGATATACCCGAGAGGCCTACTTGGATCTTGTGCACAAGATTCGATCAATTATTCCGGATGTGGGAATAACTAGTGATTTCATTTGTGGTTTCTGTGGTGAGACAGAAGAGGAACATGCAGACACTCTAAGTCTAATTAAGGAAGTCAGATACGATATGGCTTACATGTTTGCATATAGCATGAGGGAAAAGACTCATGCCCATCGGAACTATGTCGATGATGTTCCAGAGGAAGTGAAGCAGAGAAGACTAACCAAACTAATTGAAACTTTTCGAAATAGTACAGGACAGTGTTATGACTCGCAAATTGGTAGTGTCCAATTGGTCCTTGTGGAAGGACCAAACAAGAGAGCCCCAGAGACGGAGATGATCGGCAAGAGTGACAGAGGTCATAGAGTTTCGTTCGTTAATGTAGCAGTTCCACATCGAGATGGTGATTACGATGGACAACGAAAAGCAACGATTGGCGACTTTGTTGAAGTCCATATATCGAAATCGACACGAGCATCATTGTTTGGAGAGGCACTTGCCATTACAAAACTTAGCTCATTTTATGACAGTACAGATGAATCAATTGCTTGCGTGAGCTGA 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BLAST of Tan0003675 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8H0V1 (CDK5RAP1-like protein OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g36390 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 832.0 bits (2148), Expect = 5.2e-240 Identity = 404/508 (79.53%), Postives = 450/508 (88.58%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2R1U4 (CDK5RAP1-like protein OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os11g0592800 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 827.0 bits (2135), Expect = 1.7e-238 Identity = 394/498 (79.12%), Postives = 446/498 (89.56%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9JLH6 (Mitochondrial tRNA methylthiotransferase CDK5RAP1 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Cdk5rap1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 511.9 bits (1317), Expect = 1.2e-143 Identity = 270/509 (53.05%), Postives = 361/509 (70.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9VGZ1 (CDK5RAP1-like protein OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=CG6345 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 510.8 bits (1314), Expect = 2.7e-143 Identity = 257/497 (51.71%), Postives = 343/497 (69.01%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8BTW8 (Mitochondrial tRNA methylthiotransferase CDK5RAP1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Cdk5rap1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 508.4 bits (1308), Expect = 1.3e-142 Identity = 263/493 (53.35%), Postives = 351/493 (71.20%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. NCBI nr
Match: XP_038887765.1 (CDK5RAP1-like protein isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1147.5 bits (2967), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/742 (80.19%), Postives = 616/742 (83.02%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. NCBI nr
Match: XP_038887766.1 (CDK5RAP1-like protein isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1139.8 bits (2947), Expect = 0.0e+00 Identity = 593/742 (79.92%), Postives = 608/742 (81.94%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. NCBI nr
Match: XP_022989605.1 (CDK5RAP1-like protein [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1114.4 bits (2881), Expect = 0.0e+00 Identity = 578/740 (78.11%), Postives = 593/740 (80.14%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. NCBI nr
Match: XP_022927671.1 (CDK5RAP1-like protein [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1110.1 bits (2870), Expect = 0.0e+00 Identity = 576/740 (77.84%), Postives = 592/740 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. NCBI nr
Match: XP_023529365.1 (CDK5RAP1-like protein [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1107.4 bits (2863), Expect = 0.0e+00 Identity = 574/740 (77.57%), Postives = 590/740 (79.73%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JMU5 (CDK5RAP1-like protein OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486642 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1114.4 bits (2881), Expect = 0.0e+00 Identity = 578/740 (78.11%), Postives = 593/740 (80.14%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EIA8 (CDK5RAP1-like protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434491 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1110.1 bits (2870), Expect = 0.0e+00 Identity = 576/740 (77.84%), Postives = 592/740 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CNB2 (CDK5RAP1-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold496G00300 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1105.1 bits (2857), Expect = 0.0e+00 Identity = 575/740 (77.70%), Postives = 591/740 (79.86%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BLE1 (CDK5RAP1-like protein OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491318 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1105.1 bits (2857), Expect = 0.0e+00 Identity = 575/740 (77.70%), Postives = 591/740 (79.86%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KDY2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G411190 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1097.0 bits (2836), Expect = 0.0e+00 Identity = 569/740 (76.89%), Postives = 588/740 (79.46%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. TAIR 10
Match: AT4G36390.1 (Methylthiotransferase ) HSP 1 Score: 832.0 bits (2148), Expect = 3.7e-241 Identity = 404/508 (79.53%), Postives = 450/508 (88.58%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0003675 vs. TAIR 10
Match: AT1G72090.1 (Methylthiotransferase ) HSP 1 Score: 143.7 bits (361), Expect = 6.1e-34 Identity = 110/440 (25.00%), Postives = 197/440 (44.77%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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