Tan0002976 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTGACAACTGGTGGTTTAGAAGGGATTGAATACGTAGATGTTGAGGAAATGGTTGCAATGTTCTTACACATCCTAGCTCATGACGTCAAGAATCGAATAATTCGTACACAATTTGCAAGGTCTGGTGAGACAGTATCTAGGCACAATTCTGTACTTAGCGCAGTATTGCAACTCCATGAAATTCTACTGAAGACTCCAGAGCCAATCACAAATTCTTGTACTGATTCTAAGTGGAAATGGTTTGAGGTATTCATATTTTTAATGTCCCTCAATTACATGATGTAGTTAGATTTAAAATGATATACGTAACTCTTGTTCGCCCTGTCTTTCCCAAAACAGAATTGCTTGGGTGCATTGGATGGCACATACATTCAAGTCAATGTAAGTGTCGTCGATCGCCCGAGATATAGGATGAGGAAGGGTGAAATTCCAACGAATGTCCTTGTTGTTTGTTCACCAAGTGGAGAGTTCATATTCGTTCTACCAGGATGGGAGGGGTCTGCGGCTGATTCACGTGTGCTTAGGGATGCAATATCAAGACCTAATGGGTTGAAAGTCCCCAAGGGTAATAAAATCAAAAATTAAACCTTATTGCATTTGATTCTTTGAAATCAACCACTAATAGGGTCATGTGTGCAATGGTTCACATCAACAGAGTATTATTACCTATGTGATGTTGGGTACCCTAATGTAGAGGGATTCTTGGCGCCGTATAGGGGAGAGCGCTACCATCTCACTGACTGGCGTGGGGCAAGGAATGCACCAACTACTCTGAGAGAGTTCTTTAACATGAAACATTCATCTGCGAGGAACATAATCGAGAGAGCATTTGGTGTGTTGAAAGGAAAATGGGGCATTTTGTTGAGAAAATCATTCTACTCTGTTTGCACACAATGTCGAACCATTACAGCATGTTGCCTCCTCCATAATCTTATCAATCGAGAGATGGGTTCAGTGGTAGGGTGTTGGGATGTATGTTCTAATCTCGTTTTGTTTGTAATATTACCATTGGGAATACATAAGAGTTATTTCTTTCATCACTTTGTGTCTCACAATTTTACAAACTTTGTCCAATAAACTAAGCTCCAGGGTCATTAAATTTATGAGAGAACTAGAACTTGAACGGTGTGTAGTGGACACAGAGGGAGAATCACGTTCGAGTTAATGACTGAACGGTCTACAGTATATGGATATGGTTGGAGACCTAATCCTGGATATGTTGTGGATGCGGCCCGCTTTGTATTAGATACAAACGAGTTGATCCGACTCGTTCATGTGGCTGACATGCGAGTGAGGACATCCTGTGCCATGAGATTGTACAAGACCGGATCGTGAATTATTAGACCTACTGATGTAACACCGTTAACAGTATTGGACTAGTAACTTCGTAGATGACCAATAGTGACTTGACCATAATCCTAAGTGTTGGGTTTTAATGTCCTAAAACTCGTGATTTTGTAAACTGAATGTATATTCTATTTCACAATAAAGTTGTTATTGAAATTTATTCAGTAAAGGTGTTATTGACTATTGTGTATTGTGTAACCTTAATCCAATAAAGAACTTTATGTGTGACATAAAAGTGGATCAAGTTCAAGTTATAGCCAGAACAGTCTATAGTATAAGGATAGGGTTGGGCACCTTATCCTGGGGACAATATAGACGCGACCCACTTTGTAAAGTACAAATGATGTGATCCTAAATCGTTCATGTGGAGACATGTGAGTGGGGGCACCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGACTGGACCGAAATAGTCACTTAGACTTTATAACTCCGTCTACTGTCTTAACTGACTATATTCATACGATGACCTAGGTAACTCGATCTTAATCCTGAGCGTTCTATGGACTCCTGTTTATTCGGATTATCCTTAGATTTGCATGGGTGAGAGTGGCTCGAGTTGCGACTCAATAAGCCTCCCATTTCAGGGACAAAACCGGGTAGATAGCTGGGAACATAGTTCTGCAAGATGGAATTCACTCCTACCCGCTTTAGGGATAAGTAGAGAGATTGTTCCCTTAAGTGCTGACTCCCGGTCTTGAACAATGGGCCCACCCCTCTCATTGGCCTGAGAGGGATTCGGTTTGCTGGTTGGACCATAAACCAATTGTTCATTAGAGGATCAGTGGTACTTAAGGAACAAAAGGTAATTACAGGGGTAAAACGGTATTTTTGACCCAACTGTAATTACAAACGACTTGTGAAGGATCGACTTACTAATCATGGTTATATCGAGTGGACAGAAATATATCTACAGTGAGGAGAATGCAGCCACTAGGCTTTAGTGGAGTGTCCCGGTTGTTAACGAATGTTGATTAGCTAGGCTAGAGAGTTTGGCCGGTTATTCTCGTATCGTTGGAGCTCATGATCTGTAGGTCCATTAGGTCCTCCTTACTAGCTCAGACTTAGCCTTATAACATTTTGAGAGAAAAGAATTTGAATTGTTCAAATTCGAGTTTGAAAGAAAGCGTTAATTATATGTTATATATTTAACGAATCATAGCTTAATTATGAATTAAACTATGATTAATAAGAGGTGGATATATTTAAATATGATTTAAATATCAGATCGGTTTATAGCATGAATAAGGATTCATGTTCAGAAAAACAATCGAGATCGGGCAATTTATTTAATTTAATATTTGATATTAAATTAAATTAAAAATTAATTAATTAAATTAATTTTGAATTATTTAATTAATTATATTAATTTTAATTAAAAATCAATTTAATATTGATTTTCGAATTAAAATTAAATGAAAAATAAATAGATTTTCATGATTTTCATGAAAATCAACTTGACAAGTTGCCTAATCCTCATCATCTTCAAAATTGTCCACCTCCACCTCAAAGCATCCTCATCACCCTTGAGTTGTCACTCCATTGAAGCTTATTGAAGCTTTATATAATGGTGATTTGAGAGATGTTGTGAGAATCTTACAGAAAATTCAATATTCCCGAATTAGTGACCTTTGAGGTCTTTTCTTCCAAATTCTCTCAACCTAGGATCCCACAAACTGTTCTAAGGCCTGAGGATAGTAGGGAAGACTCTAACGGTTGTCCACGAAGTGTTCGTGTTGAAAACCATCCACCAGGTGAAGAGAATTTGATCTTCAAAGTTGAGTTTTCTATCCCTCTGTTTTTCCAGCTTTGAGCATGTTTTTTATTTTACAAAATTGATCAACTTAGAGTGTTCAAGATCCAAAATTGCTTCCGCTTTCTTAATCTATACTCTTTCACTAAGCGTGTTACGGACTCCTATCTGCGGGGGTCTGTCCTTTGACTAGTACGGGTGAGGGTGGTCACAGTTACTCGCCCAATATGTCTATCTTCTCAAGGACAGGACCACGTGGGGAGCTGGGAACTTGACTACGCGAGATGGAATTCACTCGTTCCCGACTTTAGGGAAACTAGAGGGGTTGTTCCCTTAAATGCGGCCTCCAGGGCTTGGACAACGGGCGCCCACCCTCTCCCTGGCCCGAGAGGGATGTTGTATATGGTTGGACAATTACAATGTTGTTTTTCATTAGAGGAGCAGTGGGGACTTAAGGAGCAAAAAGTACACACAGGGGTAAAACGGTAATTTGACCCAACAGTGTCTACGAACAACCTGTGAAGGGTCGACTCATCGGCATTGGTTATATCAGTGGACACAACTTGTCCTACAGTGACGGGAGTGCAACTACGGGCTTTAGTGGAGTGTTACCGTCGCTAATGAATGTTGATTAACCAGGTCAAAGAGTTTGACAGGTTAGTCTCGGATCATTGGAACTCGTCACCTTTAGGTCCTTAAGGTCCCTCGGTTGGCTCAAACTGGATAAATTGAGGGTTTACAGTTGGTGTAGATTTGAAGTGTTCAAATTCTATATAAGGGTATTTATGTCATTTATATGAGATATGATTGACATATTATATAGTTTAATGTGAATGAGATTCATAATAAACTATAGGTAGCCTAATTGCTTAATTAGGGCTAATTTGGAGAAATTGGATTGAGAGAAGTTAAATTGAATGTGATTAATTTAAAATCCACAATTATACAAATGTGATTTGTATAATAGCATATGAGATATCTTATTATATGTGGTTATGCAAATATGATTTGCATAACCTATGGTTGTGGTTAAATGGTAAATAGGTGGAGATTTCAACTCCACCTATCACCATTATTTAAACTCCTTTGCAAGAAGGATTTCATACTTGAAAGTTCATTTTTTGGATTTCTCACCAAAAGAACTCAAGAATTCTCTCTCAAATCTCTCCTCCCTTTCACCAAAAAGGAGTCCCACATACTCTCCTTCTACCTAAAAGAGAACAACCGAGAAGCCTATCGGAGGTGTCCGGCTCGTTGGTTTGTCCAAGGAGATCGAGTTCGTTGAGATCGTGTTCGCGAAGAGTTCATGATGGAGGAGGAAAACGTGAAGAACGGTTCTTCAACAAGTAAGTATTCTTTACTGTTTTTCCTTTCTAAAGCATGTTTAATTTAGTTTTTATGTGATAGAAACAATTTTAAGAAAACATTTTTCACAATGATACCACAGTGATTCAATCGCTTTTTCGCTGCGTAGGATTTTCATTCCTTCAATTGGTATCAGAATCGTTGGCTTTTCGTTGTGCAAATGTTTTTCTTAAAATTATGTGGGTATTGCTTCAATTCATGAGATGAAATTGTTGGTTTTGCATAATTGGATGTTTTCAGTTTTTGCACTAGTTTTAGGTTTATTTTCTGTTGATTAGATCAATGTAAAGACCCATGTTTTTGGGGCGTTTAGAAAATAAATCGAGTCTGTAAGTCCGGGTCTTTGTCGGCAAGAGTTGCTGTGAAGAAATCGGAGCAGCAAACGCGAAAAATCAAGAAAACAAAGAAAGGAGTTTGTTATTCAATAGATGGCATTGAGACCCTGTTCTTCGGCGTCTCAACGTCGTCCGCGCGGGCCAAGGCTGATCTCCAGAGCAGCGTTGCAACGCCGAG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ATGTTGACAACTGGTGGTTTAGAAGGGATTGAATACGTAGATGTTGAGGAAATGGTTGCAATGTTCTTACACATCCTAGCTCATGACGTCAAGAATCGAATAATTCGTACACAATTTGCAAGGTCTGGTGAGACAGTATCTAGGCACAATTCTGTACTTAGCGCAGTATTGCAACTCCATGAAATTCTACTGAAGACTCCAGAGCCAATCACAAATTCTTGTACTGATTCTAAAAAATTCAATATTCCCGAATCAGTGACCTTTGAGGTCTTTTCTTCCAAATTCTCTCAACCTAGGATCCCACAATCCGTTCTAAGGCCTGAGGATAGTAGGGAAGACTCTAACGACAATGGCACATTCAGACCCGAATACATATCGCATCTTCTCCGGCTGTTGCGAGAAAAAATACCAAACTGTAGTCTTCAATCAATAAGTACAATAGACTGCAAGGTTAGGAATCTTAAAAAGCAATACACAACAATTGTTGAGATGCTTGGATCTGAATGTAGTGGATTCGGATGGAATGAGGAGTTCAAGTGTGTGGATGTGGAGAGGAACATCTTTGACGAATGGGTCAAGAGTCATACTGGTGCCAAAGGACTCCGGAATAAGCCCTTCCCTCATTTTGATGAGTTAGCATTTGTATTTGGAAAAGATCGTGCGACGGAAGTAGCAGTAGAGACCCCTGGTGACATGGCATCAAATTATGATGTTGAAACACTGGGTGAAGACGTGGAGATTAGAGTATCCCAAGACCATTATGTACCTGAACCCCCGTTTGTCGATGGAACAAGTAATCTAGATGGGGAAGAAAATCCCGAGACACCGACTAGTAGGTTTCATATGTCAGCCACGACATCACGCGGAAGCAAGAGAAAGCGTTCATCTTATCAGTCTGAAATGCTAGATGTTGTGCGCGCAACAATGGACATGCAGGGTACTCAACTAGAGCGGATTGCGTCATGGCCTCAATCAAATGTTGATATAGATGATAGCCGACGCACAAAAGTGTCAAACATTTTAAAATAA ATGTTGACAACTGGTGGTTTAGAAGGGATTGAATACGTAGATGTTGAGGAAATGGTTGCAATGTTCTTACACATCCTAGCTCATGACGTCAAGAATCGAATAATTCGTACACAATTTGCAAGGTCTGGTGAGACAGTATCTAGGCACAATTCTGTACTTAGCGCAGTATTGCAACTCCATGAAATTCTACTGAAGACTCCAGAGCCAATCACAAATTCTTGTACTGATTCTAAAAAATTCAATATTCCCGAATCAGTGACCTTTGAGGTCTTTTCTTCCAAATTCTCTCAACCTAGGATCCCACAATCCGTTCTAAGGCCTGAGGATAGTAGGGAAGACTCTAACGACAATGGCACATTCAGACCCGAATACATATCGCATCTTCTCCGGCTGTTGCGAGAAAAAATACCAAACTGTAGTCTTCAATCAATAAGTACAATAGACTGCAAGGTTAGGAATCTTAAAAAGCAATACACAACAATTGTTGAGATGCTTGGATCTGAATGTAGTGGATTCGGATGGAATGAGGAGTTCAAGTGTGTGGATGTGGAGAGGAACATCTTTGACGAATGGGTCAAGAGTCATACTGGTGCCAAAGGACTCCGGAATAAGCCCTTCCCTCATTTTGATGAGTTAGCATTTGTATTTGGAAAAGATCGTGCGACGGAAGTAGCAGTAGAGACCCCTGGTGACATGGCATCAAATTATGATGTTGAAACACTGGGTGAAGACGTGGAGATTAGAGTATCCCAAGACCATTATGTACCTGAACCCCCGTTTGTCGATGGAACAAGTAATCTAGATGGGGAAGAAAATCCCGAGACACCGACTAGTAGGTTTCATATGTCAGCCACGACATCACGCGGAAGCAAGAGAAAGCGTTCATCTTATCAGTCTGAAATGCTAGATGTTGTGCGCGCAACAATGGACATGCAGGGTACTCAACTAGAGCGGATTGCGTCATGGCCTCAATCAAATGTTGATATAGATGATAGCCGACGCACAAAAGTGTCAAACATTTTAAAATAA MLTTGGLEGIEYVDVEEMVAMFLHILAHDVKNRIIRTQFARSGETVSRHNSVLSAVLQLHEILLKTPEPITNSCTDSKKFNIPESVTFEVFSSKFSQPRIPQSVLRPEDSREDSNDNGTFRPEYISHLLRLLREKIPNCSLQSISTIDCKVRNLKKQYTTIVEMLGSECSGFGWNEEFKCVDVERNIFDEWVKSHTGAKGLRNKPFPHFDELAFVFGKDRATEVAVETPGDMASNYDVETLGEDVEIRVSQDHYVPEPPFVDGTSNLDGEENPETPTSRFHMSATTSRGSKRKRSSYQSEMLDVVRATMDMQGTQLERIASWPQSNVDIDDSRRTKVSNILK Homology
BLAST of Tan0002976 vs. NCBI nr
Match: TYK26842.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold260G00340 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 250.4 bits (638), Expect = 2.3e-62 Identity = 146/329 (44.38%), Postives = 204/329 (62.01%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002976 vs. NCBI nr
Match: KAA0033487.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold261G00210 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 248.1 bits (632), Expect = 1.1e-61 Identity = 145/329 (44.07%), Postives = 203/329 (61.70%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002976 vs. NCBI nr
Match: TYK07921.1 (hypothetical protein E5676_scaffold265G00330 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 235.3 bits (599), Expect = 7.6e-58 Identity = 145/347 (41.79%), Postives = 202/347 (58.21%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002976 vs. NCBI nr
Match: KAA0034843.1 (retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 193.4 bits (490), Expect = 3.3e-45 Identity = 153/508 (30.12%), Postives = 206/508 (40.55%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002976 vs. NCBI nr
Match: ADN33754.1 (retrotransposon protein [Cucumis melo subsp. melo]) HSP 1 Score: 193.4 bits (490), Expect = 3.3e-45 Identity = 159/553 (28.75%), Postives = 217/553 (39.24%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002976 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DTL0 (Myb_DNA-bind_3 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold260G00340 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 250.4 bits (638), Expect = 1.1e-62 Identity = 146/329 (44.38%), Postives = 204/329 (62.01%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002976 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SW62 (Myb_DNA-bind_3 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold261G00210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 248.1 bits (632), Expect = 5.5e-62 Identity = 145/329 (44.07%), Postives = 203/329 (61.70%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002976 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C7T4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold265G00330 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 235.3 bits (599), Expect = 3.7e-58 Identity = 145/347 (41.79%), Postives = 202/347 (58.21%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002976 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SWD8 (Retrotransposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold515G00010 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 193.4 bits (490), Expect = 1.6e-45 Identity = 153/508 (30.12%), Postives = 206/508 (40.55%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002976 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TFA4 (Retrotransposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold93G00550 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 189.9 bits (481), Expect = 1.8e-44 Identity = 96/233 (41.20%), Postives = 139/233 (59.66%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002976 vs. TAIR 10
Match: AT4G02210.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT2G24960.2); Has 791 Blast hits to 465 proteins in 19 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 17; Plants - 748; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 26 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 5.9e-08 Identity = 25/110 (22.73%), Postives = 57/110 (51.82%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002976 vs. TAIR 10
Match: AT4G02210.2 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT2G24960.2). ) HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 5.9e-08 Identity = 25/110 (22.73%), Postives = 57/110 (51.82%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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