Tan0002769 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACTAGCGGTTATGATTCTCATGAGGTTGGTTTGCTTTCTGCGTGCAACATTCAAGGGGAAAATGCATTTAATGAGGTTCATTCTCTTTCTAAGGGCAACGATATTAAAGGCTCGTTTTCAAAACTGTTGAAGCCTTTTCCTAATTATTTTTATCGAAGGCCTGCGCGTCGTTGTTGGAGCTAGATTTGTTTAATTGGGATGTTATAGAAGAGGTTGTTTTGAATCTATTGGGTCCAAATTCTCTTTCAGTGGTGGATTCGGAGCTGGATAAAGGCGTTGCGACCAGGCTTGTTCGGTTTTTTTGTTGGCAAGGGGAAGATGCTGTATTTTTCTCTCAAAGCTTTGTAACTCCGGTAAAATCGAAGGTGCTGAACATCTAGGGTTTAATGAATTTGAATCTGAAGTAGATTCTAATTTCAGAATTAGCAGTGAGAAGGTGGAAGGGTTAAAGCTTTCAAATCAGTTGAGGGCTGGAGAGGTGAAGGAAACTCAGGGGTTTGATTTATCAGTTTTATTTCATGAGGAGGAGGTCACACTCACAGGTAATAGGTCTTCGGTGGTTATTCTAGACAAATTTGTGGATTTAGTCTCTGCCAATGGCCTTATTTGAAGGAAATTCCAGGTATTTGTCCAAGCATTTGGAAAGGTTAAAATACATGGCGGTATTTTGAGTATTTGACAATGAAGATTTTATCATGGAATACTAGAGGATTGGGTGATTTTTCCAAAAGAACTAGTCTGAAAATGTTTTTGATGACTTTGCACCCTGATGTAGTATCGATTTAGGAAACAAAAAGGGAGGATGGTTTGCCAAGAAGTTTCATTAAATCAATGTGGAGCTCCAACGATATTGAATGGTCTCATGAGGAATCCTTTAGAAAATTGGGAGGTATGCTTATTATGTGGGATGCTAGCAAAGTAAGGGTCAATGAGGTACTTAAAGGAGAATATACATTGTCTATTAAGGTTTCCTTCTTAATGACAACTTGTTGGATCTCTAATGTGTATGGCCGAACAAGTACTTTGAAAGAAAGCACTTGTGGAATGAATTAAGTTCTCTCTTTGCATATTGTGTTGAGCCTTGGTGCGTTGGAGGAGATTTTAATATCACACGTTGGGTGTATGAGAGGATGCCTCCAGGTAGACAAACTAGGGGTATGAGGCAATTTAATAAATTGATTGATGATTTGGGATTGATGGAAATTCCATTGTCTAATGGTAAATTTACTTGGTTTAAGGTGGGAGATGATAGTTTGCAATCCTTGATTGATAATTCTTTTATCTCAAAGGAGTGGGAAACCTTGTTTGATTCTTCTCTGGTGGTTTGAAAGCCAAGGATTTTTTTTTCAGATCATTTCCCTATTTTCTTGGAAGCTGGTAGTTTCAGTTAGGGATCTTGCCTTTTAGGTTTCTCAATTCGTGGTTGGAGTTGAAAGATTGTGTGGATTTAATTGAACAATTTTTGTTAAATGATCATTCATTTGGCTGGGCAGGCTTTGTTATTAACTCAAAATTTCGAAATTTGAGAGAAATTTTTAAGAGTTGGTTTGCTGCATTTGAGGTCAGTAGGAAACAACAAGAGAATTCTTTGATTTTGGTAATTTCAAACCTTGATGCATCCGATAGCAAATCTTTGTCAAGTCAAGAACCGAAACTCCGAGATCTAGCAGAACGAGATCTGTTTGCTTTATATTTGAAGGAAGAGAGAAATTAGATCCAAAATTGTAAGCTGAAATGGTTGAAGGAGGAGGATGAGAATACAAGGCTTTTTGAAAAAATGATCGTCCTTTCTCTCTCCCCCCCTCCCCGAACATGATCCTTGACTGCCCCCACACTCGCCGACCACCGAACTGGCCATGGCGGACAAACAAACTCTTTTCTCCTTCTCCATCGATAAAAATCTTTGTCTATTGATCTTGACCAGTACTCATGTGGCTCTCGAATCCGTCTCACGGAACATCAGAGAGATCGTTCTTTTTCTTTCGCAGCACCTGCCTCCATCATCCATTGGCTCCATGGAACCCTCAAGCTTCTCCTTAGCTCCCATCTTAACCAGAAATTCTTCAAGGAAGAATGCGTTGAAGGAGATGTATACTGGGTTGAAAAACACACCAACCGCAGAGGCCATTATGTTGAACTTGCTAAACTTGAGGCCAACGGAGCTTGTTCCAAGATCATCGTCCCTGCTGAAGTTAATAGAAAAGGATGGCATCTCCTTTTAGCGCGTTTGGCTAACTATCTTCCCAAACCGACTTCGAAACCCATTGTTGTAGGTCACCCAATCCCTCTCCCCGCGCCAAAGAAACCATCATTTAAAGATGCCCTCACAGCGACCCAACCACAAGCCCCTTCCCTTGTCACTGTTCCCACCACCAAAGCCCATAATCGACCAACCCCTGTCTACGACCTGGCTACCCTTAACCTCTCCTTCTTGATCATTGTCCATCGATACAATTTCCACGATGACTCGGTTTGCTATTAACTTGGCCTTGCAAAATGTGGTCAGTAAGCTTTGTGCTATTAGCCCGATACACCAAAACAAGGCTCTTCTTACCTGTGAATCTGCGGAACAAGCCAATGGCTTAGTGGGAGACGAAAGTTGGCAGCTTATTGGTGACTACTGTCTGAAGTTTGAAGCTTGGAGTAACACAACTTACGACAATGATCCTCAAATACCTTCATACAGGGGTTGGATTAAAGTGCGCAACCTACCCCTTGATAAATGGAGTTGGGAATCCTTCAAAGCCATTGGTGATGCTTGCGGAGGCCTGGTTGAGGTCTCCAAGAAGACTCTTTCCAGACTCGACAGGATGGTAGTTTGTCTGAAGGTGGCTGAGAATCAAAGAGGCTTCATTCCTGCATCTGTCCACATTCCATACACCTCCTCTTCATCCATCAAGGTGATAATTGACCCATTAAGATTTATGTATCAGTTTTATTGCAAGAATTCACGGCTGAAAGAAACCATTAGGGTCAACAGCTCCGACAAATATTTTGGTGGAAGTCTCGAGCCACATTAGCTGACCCTCACCATGCGCCATTCCCCATGACACGCGCCTGATGGCTACAATACCCTTTGAGATGGCCTTTAATCATTGGTCTACTCAGTCCACCTGCCCACCAAACCCACATGCCTCGACGACCCCGTTCTCTCCCACTTTCTAGTTCAAGTCCTCTCTTTTGGGCTCACCTATCACTAGCCCAGTCAACGACCCACATACCTTTCCTCTTTCTATTACCCTAAACCATCCCGAAACCATTAACCTTCACTTAAAGCCTCCATCCCCTCCGCATAAACCTTCACCTCTCGACAAAACTAAGATCATCATTGGCGGGAAACAAACCTTTCTCCTTAAGGGGAGAAAACACCATTCTAGTGTTTCCCATCATCCCTCCGACTCCGAAGACCTTATCTCCAGTCCCTGCCTTGGCACATTCTCTCCTCTACCCACCTTGCACCAATCCACGCCATGCTCCATCATTCCTCAGTATCTCTTTGTAGAAGTCACATTTGATGCTCCCCAATCTCTCAGCCATTACCCAGACCCTCCCCTGTTAATCTTGCCATCTGAGCCTCCCCTCCCCTTTTGCTCAATCCGGTTTATCAAAAGAAAGGTGAGACTAACATGGATGAACAACCCTCAGAGGTTAATGTGGACGATCTTTTTCTTAAAAAGCTTGCTCCTTGGCTCATTGAAAATGGGTTATGCATTTTTGCCATTCCGAACAAATCAAAGAAAGCCAAATTGACAGCGAAGAAAGCTGAACTAGTTTGAGAGGTTAAGGATTTGGCCTCATCCGTGAATTACGAGAAGATTACCTCAACTGTTGACAATGGTGGGCAAACAAATCCTTAATGATCGTCCTGTCATGGAATGTTCGACTCTCGTGGCGACTAGTCTGCAACTTCTGTAACAGAAGTCTCTCCCCCAGAGTAGTGACAACGGTGTCTATGCTCTGAAAATCATGTTGGACTGATGGATGCGGGGGCTCGACCATTTCCTCTTGGTGGGGCGCGTCCATTCCGTCCTGGTGATTGCCATCGGACTCTTGCTGATGATTGTCACCAACTCTTTCGACGTCCCATCCGTGAAGGCCCATTATGGAATTTCTGTCTTTGATAGCTCGAGGATGAATGAGCTCCTCGTTAGGGGTCCAGGTGACCCCTGCATCTTTGCACAAGGTTGTGGTCAAAGAAGCGTGGCCAAGCTCCCCAGTCGTGCTACCTCATCGTATGTGGCGGATGGAGCGGAAAATGACCTTCCCTATATCGTTCGATCCTTGGTCGCAATAGCAAATGAAAGAATGGCCTGCTCCTTAGTATTGTCATCCAGTTTGAGCCAGGTCGGGCAAGTTCAGAAATGATTTGAGTTGGATCGACTTGACTAGTGGCGTACTGGTTATATTCGTCCCTCTCAAAATTAGGTAGCTGGAAGTATCTATTTATAGTGGCATCATTGAAAGAGACTGTATGCCCTCTCACAAATGTCTAGGTCTCATCCGTCCTCATGTTGGCATAAATCTCTTTAACCACAAACACCACCCAGCCTCAGGTTGCTGAACCAAAAATTCCCATCCCCTTTGACGAATGACATGGTAGAGAATAGAGATGGCGGTGATGAGAGTCATCGGGCTCAATGCCACGTTTAGGGATTACGGATCGAGAGATCACGTAATTGTGGTGACGGCTAGCTGCCTCGTAATCTTGAAATCGATGTCCATCGAAATCTTGGCGCGCCGAAGAAAATGAAGAAGCTTGAGCTCGTTTTGAACTCATGATGATCATGCCTTTATTTCTTAATATTGCTCTATCTTTATGTTATTGTATTTTCTGTTTTTTTTTAACTTATGTATTTTGAGCATTAGTCTCTTTTCATCATTTCAATGAAAAGATTGTCGCTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAACTCATGATGAATACTACAAATATCCAAAGTCACTGAAGAGATATCTAAAAGGAAAGGGTTCAGCTTAA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ATGACTAGCGGTTATGATTCTCATGAGGTTGGTTTGCTTTCTGCGTGCAACATTCAAGGGGAAAATGCATTTAATGAGGCCTGCGCGTCGTTGTTGGAGCTAGATTTGTTTAATTGGGATGTTATAGAAGAGGTTGTTTTGAATCTATTGGGTCCAAATTCTCTTTCAGTGGTGGATTCGGAGCTGGATAAAGGCGTTGCGACCAGGCTTGTTCGAATTAGCAGTGAGAAGGTGGAAGGGTTAAAGCTTTCAAATCAGTTGAGGGCTGGAGAGGTGAAGGAAACTCAGGGGTTTGATTTATCAGTTTTATTTCATGAGGAGGAGGTCACACTCACAGTGGGTGTTCTCTCTTCAAGAAAGTGCTCCGTTCTCTATCGTCTGTTTCTCTTCCTCACGTCTCGTCCTTTCGTCTTCTCCGGTAGGCTCCCTTCGTTTTCGACCTCTCTCCGTTCTCTCCCTTCCATAATCCCTTCGGTCTCGGGTCCCGTTCCTTCGTCTTCTCCGGTTGGTTTCTGTCGATCTCTGGCCGCCGGCTTCTTCTCGTCGTTTTCTTCTCTGGTTGGGTTCCTTCAGCTTCTGGCCGCCGGCTTCTCCTCGCCAGATTCTCCTCGTTTGTCTCCTCCGTTCTCTTCAACCTGGTTTTCGTCTCTTCTTTCCTTTTTCCTTTCACAGTTGTCGAAGTCGCCCGTTTCCTTTCTTCTTCTTCGTTTTTCACTGTCGGTTTCGTCTAGAACAATGGAGGCTATATCAGATGCAGATTTGAAGTCTTTATTGGATAATTTGGATGGAAAGCTAAATGAGAATGAGAAATGGGAATGTGTTGTGGAAAAAAGTAATGATCTTCTTTCATATAGTGCTAAATGCTGCAAGCCCAAGGATGGTCCCTTGAAATATTCGAGCGTGACAATATTTGAAAATTGCTGTCCAAAATTGTTGAGGGACTTCTACATGGACAATGATTTTAGAAAACAGTGGGACAATACCCTGGTTATGTATGAGCAGCTACAAATGGATGGCACTAGCGGAATTGAAGTTGGTCGCACCTTAAAAAAATTTCCATTATTGACACCTAGAGAGTATATACTATCATGGAGATTATGGGAGGGGAAAGATGAAACCTTTTACTGCTATACCAAGGAATGTGAACATCCTATGGCACCACAACAGAAGAAGTATGTACGAGTGACGTTTTTCAGGTCAGGTTGGCGAATCAGGAGAGTATCCGGCAGAAATGCGTGTGAGATCTCTATGTTGCACCAAGAAGATGCTGGTTTGAATGTGGAGATGGCAAAACTTGGGTTTGCAAAGGGCATATGGAGCTTTGTCTGTAAAATGAATAAAGCACTACGCAAATACGCTCTAATCAACAACCCACCATCAAGTTCACTTGTCACTGCGATTACTCTGATTAAGAAGGTTCCAGATGGAGTTGAAGACATGAATGGTATGATCTCTAAAGCAAACACTGTAGGAACTGAGCCCTGCAGACAAATTTCTTCAGGGGAGAGAAAAAAATCGAGGGCATCAAAAAAACTGCTGGCCAATGGTTTGCTTGTTCTTGGTGGTGTGATCTGCCTGTCGCGGGGTCACTCTAGTCTTGGTGCCAAAGTTGTTCTGGCATATATTCTTACAAAGCTAAGCAAGCGAGCTGATACACCAGGAGGTCGGATAGAGAGCCGTAACTGTATAACGTAG MTSGYDSHEVGLLSACNIQGENAFNEACASLLELDLFNWDVIEEVVLNLLGPNSLSVVDSELDKGVATRLVRISSEKVEGLKLSNQLRAGEVKETQGFDLSVLFHEEEVTLTVGVLSSRKCSVLYRLFLFLTSRPFVFSGRLPSFSTSLRSLPSIIPSVSGPVPSSSPVGFCRSLAAGFFSSFSSLVGFLQLLAAGFSSPDSPRLSPPFSSTWFSSLLSFFLSQLSKSPVSFLLLRFSLSVSSRTMEAISDADLKSLLDNLDGKLNENEKWECVVEKSNDLLSYSAKCCKPKDGPLKYSSVTIFENCCPKLLRDFYMDNDFRKQWDNTLVMYEQLQMDGTSGIEVGRTLKKFPLLTPREYILSWRLWEGKDETFYCYTKECEHPMAPQQKKYVRVTFFRSGWRIRRVSGRNACEISMLHQEDAGLNVEMAKLGFAKGIWSFVCKMNKALRKYALINNPPSSSLVTAITLIKKVPDGVEDMNGMISKANTVGTEPCRQISSGERKKSRASKKLLANGLLVLGGVICLSRGHSSLGAKVVLAYILTKLSKRADTPGGRIESRNCIT Homology
BLAST of Tan0002769 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P53809 (Phosphatidylcholine transfer protein OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Pctp PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 55.5 bits (132), Expect = 2.3e-06 Identity = 48/209 (22.97%), Postives = 85/209 (40.67%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9UKL6 (Phosphatidylcholine transfer protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PCTP PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 4.0e-06 Identity = 46/189 (24.34%), Postives = 86/189 (45.50%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P53808 (Phosphatidylcholine transfer protein OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pctp PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 54.3 bits (129), Expect = 5.2e-06 Identity = 47/209 (22.49%), Postives = 85/209 (40.67%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. NCBI nr
Match: XP_004145626.1 (uncharacterized protein LOC101203824 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN57701.1 hypothetical protein Csa_011423 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 569.3 bits (1466), Expect = 3.7e-158 Identity = 275/317 (86.75%), Postives = 297/317 (93.69%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. NCBI nr
Match: XP_008461543.1 (PREDICTED: phosphatidylcholine transfer protein-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 569.3 bits (1466), Expect = 3.7e-158 Identity = 286/350 (81.71%), Postives = 306/350 (87.43%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. NCBI nr
Match: XP_038903674.1 (uncharacterized protein LOC120090201 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 568.5 bits (1464), Expect = 6.2e-158 Identity = 278/313 (88.82%), Postives = 297/313 (94.89%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. NCBI nr
Match: XP_008461544.1 (PREDICTED: phosphatidylcholine transfer protein-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 567.4 bits (1461), Expect = 1.4e-157 Identity = 275/314 (87.58%), Postives = 295/314 (93.95%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. NCBI nr
Match: XP_011651347.1 (phosphatidylcholine transfer protein isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 566.2 bits (1458), Expect = 3.1e-157 Identity = 273/314 (86.94%), Postives = 295/314 (93.95%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LCC1 (START domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G257060 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 569.3 bits (1466), Expect = 1.8e-158 Identity = 275/317 (86.75%), Postives = 297/317 (93.69%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CEV0 (phosphatidylcholine transfer protein-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500116 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 569.3 bits (1466), Expect = 1.8e-158 Identity = 286/350 (81.71%), Postives = 306/350 (87.43%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CFF3 (phosphatidylcholine transfer protein-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500116 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 567.4 bits (1461), Expect = 6.7e-158 Identity = 275/314 (87.58%), Postives = 295/314 (93.95%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D880 (phosphatidylcholine transfer protein-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017817 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 555.4 bits (1430), Expect = 2.6e-154 Identity = 288/360 (80.00%), Postives = 307/360 (85.28%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J7C0 (uncharacterized protein LOC111481908 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111481908 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 553.1 bits (1424), Expect = 1.3e-153 Identity = 268/323 (82.97%), Postives = 297/323 (91.95%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. TAIR 10
Match: AT3G13062.2 (Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein ) HSP 1 Score: 384.4 bits (986), Expect = 1.6e-106 Identity = 192/344 (55.81%), Postives = 250/344 (72.67%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. TAIR 10
Match: AT3G13062.1 (Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein ) HSP 1 Score: 384.4 bits (986), Expect = 1.6e-106 Identity = 192/344 (55.81%), Postives = 250/344 (72.67%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. TAIR 10
Match: AT3G13062.3 (Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein ) HSP 1 Score: 377.1 bits (967), Expect = 2.5e-104 Identity = 192/352 (54.55%), Postives = 250/352 (71.02%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. TAIR 10
Match: AT1G55960.1 (Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein ) HSP 1 Score: 372.1 bits (954), Expect = 8.0e-103 Identity = 189/349 (54.15%), Postives = 253/349 (72.49%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0002769 vs. TAIR 10
Match: AT4G14500.1 (Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein ) HSP 1 Score: 151.8 bits (382), Expect = 1.7e-36 Identity = 102/319 (31.97%), Postives = 161/319 (50.47%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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