Tan0002383 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0002383
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG02: 3296985 .. 3299142 (+)
RNA-Seq ExpressionTan0002383
SyntenyTan0002383
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAGTGTGGGAGTTTTAAAATGGGTTTTAATGGTGTTAAAAAAAGTACTCCCAAGAATTAATCTTTCTTTTTTAGCCCACACCGACGCACAGACAAAAAGCACACTCACACACACTGAATTACAGTTCTCTCTCTCTACTTTCACTGGTAGGACGACTGACGACAAACTCCGCGTGAATGCAGATCATTTCGGCGACCGATTCACAAGTTCCGAAACTCTAATCTGACATCGAAGGAGATCGTCTCGTTCCGAGATTTGTTTCATCATCGCGAACAATTCAGACGAGTTCTTCCGTGTAGATCTCTATTCGTCGAGAATCTTGCGCCCCTGATAGTTGAGGTAAAAGGAATTACAGATTGTTTCATCATCACGATTATGGTTGTCTCTATCATTTGCCGCCGCGCTCCTCCTGTTGCGGTTTGTCATTTCTCTGCGATGAGAAGCTATTTCTTCATTACTCCCACGTTGGTTGCTGCGCCGCGCATCGCCATCGCTGCCACCGCACCAGCTTCTGTTGCTCCTTCACCTAATCTCGTTGCCATGGTTGTCCCTCTCCACGACGGCGTTCCTCCTCTGTCGCGCGGTGCCGTTTCTCACCGCAGTGAAACTATTTCTTCCATTACTCCCACGGTGGTTCTTTCTTTATTCTGCGCGCGCACTCTCCTGCCGCTCCTTCACCTGATCTCGTTGCCATTGGCTCGCTTCTTACTCAGGTGGCTCCTGTTCTCGATGTTGTTCCTCCCACTCTCACACGGCTATGGTTTGTCTCTATCATTATCGCCGCTCCTCCCATTGCGGTATTATCGTTTTTATTGCAGTGCAGGCTATTTCTTCATTACTCACGTGCCAGGCCATTGGTCCGCTTCTTACTCAGGTGGCTCCTGTTCTCGATGTTGTTCCTCCCACTCTCACGGCTATGGCTGTCTCTATCGCTGTCGTCGCTCCTCCTGTTGCAGCTGTCGTTTTTATTGCAGCAGAAGCTATTTCTTCTGTTACTCCCACAGTGGTTGTTGTTGCTGCAGCCGCCATCGTTGCCACCGCACCAGCTTCTGCTGCTCCTTCACTTGATCTCGTTGCCATGGTTGTCCCTCTCGCTGAGGTTGCTTCTCCTGTTGAGTTGTCGTTTCTACTGCAGCAGAAGTTATTTCTTCTGTTACTCCCACGTTGGTTACCGCCGCCGCCGCAGTATCATCATCGTCGCCGCCGCACTGTGTTCTCACGCTCCTTCACCTGATCTCGTTGCCATTGGCCCACTTCTTGCTCAGGTGACTCCTACTCTCGATGCTGTTGCTCCCATTCTCACGGCCATGGTTGTCCCTCTCGCTGTCGTCGCTCCTTCTGTTGTAGCTGTCATTTCTACTGCAGCAGAAGTTATTTCTTCTGTTACTCCCATAGTGGTTGTTACTGCTGCAGCCGCCATCGTTGCCCCCGCACCAGCTTCGCTGCTTCTTCACCTGATCCCGTTGCCATTGGTCCACTTCTTGCTCCTGTTGCTCCCACTCTCACGCCCATGGTTGTCCCTCTCGCTGTCGTTGCTCCTCCTGTTGCAGCTGTCGTTTCTACTGCAGCAGAAGTTATTTCTTTTGTTACTCCCACAGTGGTTGTTGCTGCTGCAGCCGCCATCGCTTCCGCCGCACCAGTTTCTGCTGCTCCTTCACCTGATCTCGTTGTCATTGGTCCGCTTCTTGCTCAGGTGGCTCCTGCTCTCGATGTTGTTCCTCCAACTCTCACGGCTATGGTTGTCTCTATCGCTGTCGCCGCTCCTCCTGTTGCAGCTGTCGTTTCTACTGCAACAGAAGTTATTTCTTCTGTTACTCCCATAGTGGTTGCTGCTACTGCAGCTGCCATCGCTGCCACCTCACCAGCTTCTGCTGCTCCTTCACCTTATCTCGTTGCCATGGCTGTCCCTCTCGCTGACGTTGCTCCTCCCTTATTTGCATTTATCTTTTTTCGCAGCGCAGCAGGTTATTTCTTACATTACTTACACGTGGTTGGTTCTGGCTTCTTTGAAGCCGCCATCGCTGCCGTCGCACCAACTTTTGCTGCTCTTCACCTGATCTTATTGTCATTGGCCTGCTTCTTGCTCAGGTGGCTCCTGTTCTCGATGCTGTTGCTCCCACTCTCACGGCTATGGTTGTCTCTATCATTGTCGTAG

mRNA sequence

ATGAAATCATTTCGGCGACCGATTCACAAGTTCCGAAACTCTAATCTGACATCGAAGGAGATCGTCTCGTTCCGAGATTTGTTTCATCATCGCGAACAATTCAGACGAGTTCTTCCGTGTAGATCTCTATTCGTCGAGAATCTTGCGCCCCTGATAGTTGAGGTAAAAGGAATTACAGATTGTTTCATCATCACGATTATGGTTGTCTCTATCATTTGCCGCCGCGCTCCTCCTGTTGCGGTTTGTCATTTCTCTGCGATGAGAAGCTATTTCTTCATTACTCCCACGTTGGTTGCTGCGCCGCGCATCGCCATCGCTGCCACCGCACCAGCTTCTGTTGCTCCTTCACCTAATCTCGTTGCCATGGTTGTCCCTCTCCACGACGGCGTTCCTCCTCTGTCGCGCGGTGCCGTTTCTCACCGCAGTGAAACTATTTCTTCCATTACTCCCACGGTGGCTCCTGTTCTCGATGTTGTTCCTCCCACTCTCACGGCTATGGCTGTCTCTATCGCTGTCGTCGCTCCTCCTGTTGCAGCTGTCGTTTTTATTGCAGCAGAAGCTATTTCTTCTGTTACTCCCACAGTGGTTGTTGTTGCTGCAGCCGCCATCGTTGCCACCGCACCAGCTTCTGCTGCTCCTTCACTTGATCTCGTTGCCATGGTTGTCCCTCTCGCTGAGGTGGCTCCTGCTCTCGATGTTGTTCCTCCAACTCTCACGGCTATGGTTGTCTCTATCGCTGTCGCCGCTCCTCCTGTTGCAGCTGTCGTTTCTACTGCAACAGAAGTTATTTCTTCTGTTACTCCCATAGTGGTTGCTGCTACTGCAGCTGCCATCGCTGCCACCTCACCAGCTTCTGCTGCTCCTTCACCTTATCTCGTTGCCATGGCTGTCCCTCTCGCTGACGTTGCTCCTCCCTTATTTGCATTTATCTTTTTTCGCAGCGCAGCAGGTTATTTCTTACATTACTTACACGTGGTTGGTTCTGGCTTCTTTGAAGCCGCCATCGCTGCCGTCGCACCAACTTTTGCTGCTCTTCACCTGATCTTATTGTCATTGGCCTGCTTCTTGCTCAGGTGGCTCCTGTTCTCGATGCTGTTGCTCCCACTCTCACGGCTATGGTTGTCTCTATCATTGTCGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGAAATCATTTCGGCGACCGATTCACAAGTTCCGAAACTCTAATCTGACATCGAAGGAGATCGTCTCGTTCCGAGATTTGTTTCATCATCGCGAACAATTCAGACGAGTTCTTCCGTGTAGATCTCTATTCGTCGAGAATCTTGCGCCCCTGATAGTTGAGGTAAAAGGAATTACAGATTGTTTCATCATCACGATTATGGTTGTCTCTATCATTTGCCGCCGCGCTCCTCCTGTTGCGGTTTGTCATTTCTCTGCGATGAGAAGCTATTTCTTCATTACTCCCACGTTGGTTGCTGCGCCGCGCATCGCCATCGCTGCCACCGCACCAGCTTCTGTTGCTCCTTCACCTAATCTCGTTGCCATGGTTGTCCCTCTCCACGACGGCGTTCCTCCTCTGTCGCGCGGTGCCGTTTCTCACCGCAGTGAAACTATTTCTTCCATTACTCCCACGGTGGCTCCTGTTCTCGATGTTGTTCCTCCCACTCTCACGGCTATGGCTGTCTCTATCGCTGTCGTCGCTCCTCCTGTTGCAGCTGTCGTTTTTATTGCAGCAGAAGCTATTTCTTCTGTTACTCCCACAGTGGTTGTTGTTGCTGCAGCCGCCATCGTTGCCACCGCACCAGCTTCTGCTGCTCCTTCACTTGATCTCGTTGCCATGGTTGTCCCTCTCGCTGAGGTGGCTCCTGCTCTCGATGTTGTTCCTCCAACTCTCACGGCTATGGTTGTCTCTATCGCTGTCGCCGCTCCTCCTGTTGCAGCTGTCGTTTCTACTGCAACAGAAGTTATTTCTTCTGTTACTCCCATAGTGGTTGCTGCTACTGCAGCTGCCATCGCTGCCACCTCACCAGCTTCTGCTGCTCCTTCACCTTATCTCGTTGCCATGGCTGTCCCTCTCGCTGACGTTGCTCCTCCCTTATTTGCATTTATCTTTTTTCGCAGCGCAGCAGGTTATTTCTTACATTACTTACACGTGGTTGGTTCTGGCTTCTTTGAAGCCGCCATCGCTGCCGTCGCACCAACTTTTGCTGCTCTTCACCTGATCTTATTGTCATTGGCCTGCTTCTTGCTCAGGTGGCTCCTGTTCTCGATGCTGTTGCTCCCACTCTCACGGCTATGGTTGTCTCTATCATTGTCGTAG

Protein sequence

MKSFRRPIHKFRNSNLTSKEIVSFRDLFHHREQFRRVLPCRSLFVENLAPLIVEVKGITDCFIITIMVVSIICRRAPPVAVCHFSAMRSYFFITPTLVAAPRIAIAATAPASVAPSPNLVAMVVPLHDGVPPLSRGAVSHRSETISSITPTVAPVLDVVPPTLTAMAVSIAVVAPPVAAVVFIAAEAISSVTPTVVVVAAAAIVATAPASAAPSLDLVAMVVPLAEVAPALDVVPPTLTAMVVSIAVAAPPVAAVVSTATEVISSVTPIVVAATAAAIAATSPASAAPSPYLVAMAVPLADVAPPLFAFIFFRSAAGYFLHYLHVVGSGFFEAAIAAVAPTFAALHLILLSLACFLLRWLLFSMLLLPLSRLWLSLSLS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0002383.1Tan0002383.1mRNA