Tan0002290 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0002290
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG07: 17826957 .. 17830350 (+)
RNA-Seq ExpressionTan0002290
SyntenyTan0002290
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AAAAAAGGTAAAAAAAGAATCGTGGGGTATACTTATCTCCTTCGCGTTTCATAGCCCTCAACCCTCAGCCCTCAGCCCTCAACCTCGCCGCCGATAGTTAGCTACTCTCCGTCACCGACCAGCCCAACCCAACCCCTCTTGCTTTCCACGAAGCCGACAACAGCAGTACGCCGACATCCAAATATCATTCCCTCCCTTCGTCTCATCAATGAATTACGATAAATTTAGTCTTTTGTTCATAATCTTAACAAGATTTTTCTTTTTTAGGCAGGAAGATTGCTCACAATGTGATGTCCATGGCGACTGGAGAAGTGCCAACGGAAGTGGCTGTAGGGGAGCTGGCGGAGCTGCCGTAAATTATAAAAAATTGGGTTTTTGCAGATTTAAGAGAACTATGTTGAAGGGGAGGAAGTGTCCAATGGGGTCGTCGTTGAAAGCAAATAGAAAGAAGTGCTCAAGGTTTGTAACTTGGTTGTTTCTGAGGAACATTTTTATTTTTTCTGTTGCTTCTCATCTGTTCGATTGTGTTGCTCAGGTTATTGTTACTGAGGTGTGTTAGGTGGTGGCAAGTTTTATGTCCAGACAATTGGGGATCAAAAAGCTACTTCTCTACAGCAACAACTTGCGGCTTTGAATCTTCAAGAAGACTCTTTAATTGGTGCTTTTAGTCCTAAGAAAGGTGATATTGTCCTTGCTCAATTCAGTGCAGATAACTCGTGGGGAACAGGGCAATGGTGAATGTTAGGAAGATGCCTTCTTTTAACATCCAATATGAACTTGCTTTACATTTATATTTTCTACGTAGTAGTCCTACGCAATGATAGCTATTTTGGGGTAAGTTTTATCAAGAGTTTCTAGGAATTATCCAAATTAAAGCTTCTGTAGATTGGTCCAAACTGAAACATATAACGTCGTCAATGGTAGTTATATACCAAAAAATGAAACGAAAGATGAAAATGAAGCAAAGGTATTCAATTTTGTAGTTTGCATTGATTTCAATTAGAACTTAGAGTTTAGTTGATTATCACTCTACTGAACAAGATTTCTATATTATTTTGAAGGATTCACCTTAAACTGAAATTGATTTTGTTGATTAGAATGTTCATCATCTCATTCATTTCACATCATTTATTATATAAACATATCATACTCTTTCTTTTTATCTCTCTTTTCATTAATTTTTACTACTTACACAATATTCACTTGGGGGAGCCAACTTCATGTTTAACTCTTGCTTGTGGTGTTTTAGTTTAAGTCTAACTGACTGAATCTGGTTGTTTTCTTATGCTTTGGTTCTAAAGAAAGAGAAAAAATAAGTCTTGACAGTCTGGGTGCATTTTAGAAGCTGCCATGGTGATGCCATCTCTTGATATTTTCTATTCTTCATTAAAGAAGGAAAAAAGGGTTAGCTAGCATGCGACTCTGTTTTACATGAAAGAATATCTTCACCCATATGAATGTTTTGTCATTCAGTTTACATTTGGAGATGAAAAGTATGAAGAGGTATGACATGAATCAATACTATCTACTTTTTTCTTCAAACATGGCCTAAGTTTTGGTTCACAATTAGGGAGATAATGAACTCTTGTTTCTTTTCTTAGTTTCAAATATGAGTTTTCATTTTGGCTAACTTTTATATTAGACTTGTTGTCTCTGGTGGCTTGAATGAAACGTATTATAAGGTCAAACAATTAATACCTCAACTAGCTAGTTTTACATGAAAGATGGTTAAAATTTCTCTTATTATTTAATTTTCTTTCTTCCACTAAAATGTTCTTATCTGTTATTCCTTGACATTTAGATGGCACTCCTCAAAAGAGAAATACCTTTTGTTGGTCGTTGTCCATCCAGATGCTGAGTTTTGATAACTTTAATTATTGTGTTATTTTGATGAGTATATTTATAGTTTTGATAAACTTAGTTTGGCGTTGAAACACAATTTTCAGGTTATTTGTCATCGAGATGCAATTTCCAACAAACTTTTTATTCCTTTAAGCGTCGAACTGTGAGGCTATGAAGTCCATTTGCCCCCCTTTAGTCTAGTTTAGCACTTGAGAGTTGTTGGAACTTTTCTGGTTTAAGTACACTTGTAGGATTACTTGTTCTGCTGAACTTTCTTGGCATGTTTTAAGTCATAAGTCGTGTTTTGAGCATTTATTAAATTAGTCTTGTTCTACTAAGAAATATTTGATTGTTGAACCCCAACTCTTGTGTATCTGAAGTTAGTTGGTGGCTAGGAAGAATGGTTTGTTTTTTAAGTGTTTCTGATGTTAAAACATGTCATTAAAATTTTGAAAAAGTCCTAGTAGCGTCGTTATGCTGCTGAAATTTCAGAGTGAACGACGTGCCTTAAGTTACGCCCAAGTTAGGTTTACCCCCAGAATTTAGGGTCGTTACACTTTGCATGTTTTAAATCTCTCTCAAATCAATTTCATTAATGTAGCATTGGTTATAACAAGTACAAACCTTTAGTTTGCAGTTTGAGTGTGATTCGGGCATCCTTCAATACACTTTCAGCAAAGCGTTTTGACTCTTTTAGCAAGATTAGTCCCTTTAAGCTCATTCAAACTAGATTAAATTATCCTACATTGGTTCTATTGCTCGAATACCTTTTAATTGTAGTTTTTAATACTTTCATCTTGGCCATAACACGAATAGGTTCATTTTGGTTAACCATAAGCCATGGAAGTCGATTTAGCAAAAGGAAGTTGATCTGAGCATCAATTAGCGAGGCTTTGAGCCATTTTGGTAAGTCTAAGTGTATTTTAATCTTTTTCGAACCCCTGCAAGTGTTGTAAGTATGTTAATCGTCTTAATCCTCCTTGGTCGACGTTTATCACATTAGGCTAGATCTCATTCCCTCCCTTTGAGCATGCTTCTTAGGATTAGCGTGAGGGTTTCTTTCCTTCATTATTCGGGATGTGAGGGATTGAATGGAGTAGGCAGATGGGTAGCCAGTATTCGAGATCGTTGTGTTTTCAGAGGGGTTGTCATGATTGAGTAAATTCACTCGTTGAATGTTTTAGAGTTTTGAATTATTACAACTAGGTTGCTTACTTAGTATGTTTATGCTCACTCTTGTTGCTTAATGTTGTGTTTTGCAGGTAATACTCAACTACTTAGCGGGTGACAAAGGTGTTGCAGAATTATGGTGACGTTTTCAAAGTTTTGGTCATAATGTTGTCAATAAGTTTCATGTTTAAGCCCTTTACAGTGTGTTAGGCTAGTAAATGTAAAGTTCTCTTGTTTGTAAACCTCCTTGAATGTTAGTTGAGTTTATGGCTTAGGATCGTTACAATAGTTCTTGTAATTTTTGAATTGTTTACATGAGGTTTGATAAGTGCTTGTAATTTTAGAATTGTTCATGAGCTTAATAGTTTGATATTGTTAAAGA

mRNA sequence

AAAAAAGGTAAAAAAAGAATCGTGGGGTATACTTATCTCCTTCGCGTTTCATAGCCCTCAACCCTCAGCCCTCAGCCCTCAACCTCGCCGCCGATAGTTAGCTACTCTCCGTCACCGACCAGCCCAACCCAACCCCTCTTGCTTTCCACGAAGCCGACAACAGCAGTACGCCGACATCCAAATATCATTCCCTCCCTTCGTCTCATCAATGAATTACGATAAATTTAGTCTTTTGTTCATAATCTTAACAAGATTTTTCTTTTTTAGGCAGGAAGATTGCTCACAATGTGATGTCCATGGCGACTGGAGAAGTGCCAACGGAAGTGGCTGTAGGGGAGCTGGCGGAGCTGCCGTAAATTATAAAAAATTGGGTTTTTGCAGATTTAAGAGAACTATGTTGAAGGGGAGGAAGTGTCCAATGGGGTCGTCGTTGAAAGCAAATAGAAAGAAGTGCTCAAGGTTATTGTTACTGAGGTGTGTTAGGTGGTGGCAAGTTTTATGTCCAGACAATTGGGGATCAAAAAGCTACTTCTCTACAGCAACAACTTGCGGCTTTGAATCTTCAAGAAGACTCTTTAATTGGTGCTTTTAGTCCTAAGAAAGAAAGAGAAAAAATAAGTCTTGACAGTCTGGGTGCATTTTAGAAGCTGCCATGGTGATGCCATCTCTTGATATTTTCTATTCTTCATTAAAGAAGGAAAAAAGGGTTAGCTAGCATGCGACTCTGTTTTACATGAAAGAATATCTTCACCCATATGAATGTTTTGTCATTCAGTTTACATTTGGAGATGAAAAGTATGAAGAGGTTCATTTTGGTTAACCATAAGCCATGGAAGTCGATTTAGCAAAAGGAAGTTGATCTGAGCATCAATTAGCGAGGCTTTGAGCCATTTTGGTAATACTCAACTACTTAGCGGGTGACAAAGGTGTTGCAGAATTATGGTGACGTTTTCAAAGTTTTGGTCATAATGTTGTCAATAAGTTTCATGTTTAAGCCCTTTACAGTGTGTTAGGCTAGTAAATGTAAAGTTCTCTTGTTTGTAAACCTCCTTGAATGTTAGTTGAGTTTATGGCTTAGGATCGTTACAATAGTTCTTGTAATTTTTGAATTGTTTACATGAGGTTTGATAAGTGCTTGTAATTTTAGAATTGTTCATGAGCTTAATAGTTTGATATTGTTAAAGA

Coding sequence (CDS)

ATGAATTACGATAAATTTAGTCTTTTGTTCATAATCTTAACAAGATTTTTCTTTTTTAGGCAGGAAGATTGCTCACAATGTGATGTCCATGGCGACTGGAGAAGTGCCAACGGAAGTGGCTGTAGGGGAGCTGGCGGAGCTGCCGTAAATTATAAAAAATTGGGTTTTTGCAGATTTAAGAGAACTATGTTGAAGGGGAGGAAGTGTCCAATGGGGTCGTCGTTGAAAGCAAATAGAAAGAAGTGCTCAAGGTTATTGTTACTGAGGTGTGTTAGGTGGTGGCAAGTTTTATGTCCAGACAATTGGGGATCAAAAAGCTACTTCTCTACAGCAACAACTTGCGGCTTTGAATCTTCAAGAAGACTCTTTAATTGGTGCTTTTAG

Protein sequence

MNYDKFSLLFIILTRFFFFRQEDCSQCDVHGDWRSANGSGCRGAGGAAVNYKKLGFCRFKRTMLKGRKCPMGSSLKANRKKCSRLLLLRCVRWWQVLCPDNWGSKSYFSTATTCGFESSRRLFNWCF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0002290.1Tan0002290.1mRNA
Tan0002290.2Tan0002290.2mRNA
Tan0002290.3Tan0002290.3mRNA
Tan0002290.4Tan0002290.4mRNA
Tan0002290.5Tan0002290.5mRNA
Tan0002290.6Tan0002290.6mRNA