Tan0001983 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAATGTAATTATCCTACTCATGATCTGGAGTTCGCAGCAGTTGTGTTAGCTTTAAAGATTTGGAGGCATTATCTGTTTGGTGAGAAGTGTTGTATTTACACAGATCATAAAAGTTTAAAATATATCTTCGAATAGAAAGAGTTGAATTTGAGACAGCGGCGGTGGCTTGAATTGATAAAAGATTATGACTGCACGATTGAATACCACCCAGGGAAGGCTAATGTTGTAGCTGATGCACTAAGTAGGAAGTCGAAGCAACATAGGGGTTCACTTAATTACATTAGAGTGGCTTCATTTGTGGAACTCAAGAGTTCTAATGCAAAAGTGTATGTTGGTGACAAAGGGAATTTGTTAGCTCATTTTCAGGTAAGACCTACCTTAATTAATGATGTTATCTCAAGTCAAGCTAAAGACCCTACCTCAAGAAATTGATAGAAGAGGTGAACTTGCAGAGAGAGCGATTACAAGTAAGGCATGATGGAGCATTGATGAAGTGTGGTAGATTTTGTGTATCTAAAGATGAAACTTTGAGAAATGCGATGCTAGAGGAAGCACATAGTTCAGCCTATGCGATGCATCCAGGAGGTACAAAGATGTATCGGACCTTAAAGAACCATTATTGATGGCCAGGAATGAAATGAGAGATAGCAGAGTATGTCTCTAAATGTTTAATTTGTCAGCAGGTGATATGAACCAAGGACCACCTATTGTCATGCCTGAAGGTCCAATTACAAGGTCGAGAGCCAAGAAGCTACAACAAGCTTTAATCACTCATATTCAAGCTATGGTGAGCTCAAAAGAGGAGGTTCTAGAAGATGTTGGAGTCTTTCCCTACATGTTGTGCAAAGTTGAACTTCAAGATGGAGACGCATTAAATGCATTCTAACTTGCACTTAATGAACTCATAGCTAAATTTATGGAACTTAAGTTTAACTTGGTTTCACCTAAAAGAACTAAGTTGAACTAAAGTAACATTTAATATGGTGATGTTTGAACTGAAGTTGCATTCAATGAGGTGGAGATGGATTCAATGAAGTCAAGTATCATTACAAGCTTCATTCAAGACAAGCTAAGCTTCAATTATGGAACACAAGTTCAAACCATTTACAGCTATGGATTAGTATTAAAATAATGGTTACAAGACAACACCTTTATTAGTTTTAAATGTAATTTCAGTTTTGTTTATCATTTAAGTTTGTTTTCAATATGGGAGTTGTGGTTAAATTGTAACTCATATAGGTTACTCTTTTCCCCACTAACTAGCCCATATAGTTAGTGTCTATTTGTCAATTAGGTTAAGGGTCTCAAAGGCTATATAAAGCCCTCTCTTCTTCCATTGTAGACAGAATTTTAAAGTGAATGAATTGAGTTTTCTTTTAGCTTTGTTGAGAGCTAAGTTTTCCTTATTGCAATTTCTTGTGTTTAGAATTTGCATGCTAGAGTCATTCAAGTGGTGTTGATCGTACCTCTTGTGGAGTGATTCGAATCACGAGTTTAGAAACGAGTTTTCTTTACTCTTGATCTTGATCATCAAGGTAATCCGTTCCAAACTTTTCCTTGGGTTGATTCCATGTCGTTTTGGGGTTTTTAAGTTTTAGATCTAAAGGTCTTGTTTTCTCAACAAGGTTGTTAGGTCTAATTCTTGGGAGTTACTTAACATTTGGTATCAGAGCATTAGGCTCTTTGATCGGACATATGTTTCCTTGCATTTATCTCTTTGAGTTCTTTTCTCTTTAGCTTCAGTTTTTGCAGATCCGAGCATGTTCTTATTCTGAATAAAAATACAAAACAATATCCTTTCCGTTCCGTATTTCATTATATCGTCTTCTACAAGATTTGAGATCTAGATCTGATCTACAATTTGTTATTCTTTGATATCTTCAAAATCGGATTTCTTCAGAGTGAAATATTCATATTTTGCAAATCTGTCAAAAGAAGACAGCATATCCGAGAGCAAATTTTCTGTTTTAATTTTTTTGTTCATTGTTTCAAGGTAACTTGAATTCAATTATTCCTTTGATAGTACTCTCTTGATGAATTGATATTTGATCATTTGTTCTAGGTCTATTTTTGTTTTCCCTCTTGAATTCCTTTCATTTTGTCATTTTTTCTTAAACTTGTTTCTTTTTGTTATTCGGATTGCTCCTTCAATACACTTGTTTGTATTCTTAGTGTGTTGTCTAATCACTTTGAATTGCACTTAGCTCTTTGACTTTGCTATACTCATACACCAATCTGTTTCTGAGTGCTTTGTGAGGTTGTGAGGTAAGGGAGTGATACATTAATTAGAGTGTTGAGTGTTAAACACGAGTGAACTTCATTAACGAGTGAAATACGTGAGGGAGTGCTTATGAGGTCCTTTTTTTTTTTTTTTCTTTCTTTACTTTACTTTACCGTATTTTGCAGCATGGCACAAGAAGGTGATCTTAACATTAACGGCCCAAGCCCGAATGAGGGAGGCACAACAAGGAACCATGGAGAGAATGATTCGTGGAATAGAAGAGTTATCGGAGCGTATACGGAGGTTGGAGGTTCAAAACCACGCTAGGAGGAGAATTCCACCCTCCACAACAACGTGAGGATGACCATGACAACGAATATGAGGGAGGAAGTTCTGATCAACTAGAAGATGACCAAGTTACATTAATAGCAGCACCACGAAGGGAAGAAAGACGTGTTGGTCGTGGCTTGAATAGGGGAAGAGGTCGTGGGCGAAGACATCAACATTTACAAAGGCGAGTTCCTTATGAAGAAGGAATTGACCAAACGTGGGAAGCATCAAATTGAAACTTCCAAGTTCTATGGCAAAACTGATCCGGAGGAGTACCTTCAATGGGAGAAAACAGTGGAGTCGGTGTTCAATTGCCATAATTTCAGTGAAGAAAAGAAGGTAATGCTTTGTGTTGCTCAATTTAAACAATATGCTCAAACGTGGTGGGATAAATTGATGTCAAGTAGGAGAAGGAATCTTGAAGCACCAATCGATTCATGGTACGAGTTCAAGGAGTCCATGAGGAAGCGTTTTGTTCCAAAACATTTCCAACGAGACATGGCTCAAAAGCTTCAAGCATTGAAACAAGGCAACAAGTCCGTGGAGGATTATTACAAGGAGATGGATACATTGATGGATCGACTTGATCTAGATGAGGATATGGAGAGTCTCATGGCACGGTTTCTTAATGGGCTAAACACGGAGATTGCAGACAAAGGTTGACCTACAACCTTACTCGACATTGAGGGGTTGTTGCATATTGCAATCAAGATCGAGAGGCAAATCCAACGAAACGTCTCGACGGTATTCTTCTAAACATTTTTCCAACTCTAGTTCTACATGGAAAAAGGATAGTAAGAAGATTGAATCTAAGCTTAGAAACCAAGAGATATATGAGAAACCTAAAGCAAATGTAGAGAAAGGGAGAGTTCTAAAAGGGGAAAGAGAAGATAGATGAATCTAATGTGCGAAATAGGGATTTGAAATGTTGGAAATGTCAAGGGTAGGTCACTATAGTAGAGATTGCCCTAATAGGAGAATTATGACCATTAGAGAGGAGAGATTGTGACTGATGATGAAGAGGAAGATGAGGTTAAGGAAGAAAATGATGAGAGTGAGAATGAGTTAAGCGAAGAGGATCCTGCAAACTTGTCCTTAGTTGCTAGGAGAGCTTTAAGCACCCAAATTAAGGAGGATAGTCTAGACCAAAGAGAGAACTTGTTTCACACTAGGTGCCTTATTCAATCTATGCCTTGTAGTGTGGTCATTGATAGTGGTAGTTGCACCAATGTTGTGAGTACAATTCTGGTCAAGAGGCTTAATTTAGAGACCAAACCACATCCTAGACCATATAAACTTCAATGGTTGAATGATTGTGCGCAAGTAAGGGTGAGTAAGCAAGCTCTTGTTTCTTTTACCATTGGAAAGTATAATGATGATGTTTTGTGTGATGTTGTATCCATGCATGCTGGAGATTTATTGTTGGGAGGCCTTGGCAATTTGATCGTCGGGTAGTATATGATGGGTATGCGAATCGTTACTCTTTTACTTATAATGGTAGAAAAACTACTCTTGTTCCATTGTCTCCAAAAGATGTATTTATTGATCAATGCAAACTTGAAAAAAAGGCAAGAGGCTGATGCAAAAGCAAAAAGTGAAAATGAAATAATAGAAAAGAATCGAGAGAAAAAAAAGAGTTTGAGTGAAAAGCAAGAGAGTAGCAATCGGCCTAGAGGAAAAAATGAGAGAAAAGCCAAAATAGTGAGTTTGTATGCTAGGTCAAGTGAGGCTAGGAATGTTTTGCTTTCTAATAGGACCATTCTTGTACTTATGTGCAAAGGGTCTTGTTTCTTTACTAACGAGCTTAACCCTTCTTTGCCTAGTGTTTTTGTTTTACTTTTGAAGGAGTTTGAAGATTTATTTCCAGAGGAGATGCCTAGTGGTTTGCCACCACTTAGAGGAATTGAGCATAAGATTGACTTCATTCCGGGAGCAACCATTCCAAACCGTCCAGCATATAGGACTAATCCAAAGGAGGCCGAAGAGATACAAAGGCAAGTGAGTGAACTCCTTGCTAAAGGGTATGTACGTGAGAGTTTGAGTCCATGTTCTATTCCAGTTATTCTTGTGCCTAAGAAAGATGGGTCATGGCGTATGTGTATTGATTGTAGGGCTATAAACAAGATAACTATTAAGTATAGACATCCAATTCCTAGATTAGATGATATGCTTGATGAGTTGCATGGATGTAGTCTCTTTACTAAGATTGATTTGAAATCAGGTTATCATCAAATTCGCATGCATATTGGTGATGAATGGAAAACTCGCTTTCAAAACTAAGTATGGCCTTTATGAATGGTTAGTTATGCCTTTTGGATTGACTAATGCACCTAGTACATTCATGAGGTTAATGAATCATGTCTTGCGAGAATACTTAGGGAAGTTTGTGGTTGTCTACTTTGATGATATTCTTGTTTATTCTAAATCCTTAGATGAGCATG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ATGAATGTAATTATCCTACTCATGATCTGGAGTTCGCAGCATCCTTTTGATGTAGGTGATGGTTATGATTCGAGGGCGAATCCTTCTCAAGAGGGGGAGGATGATATGAACCAAGGACCACCTATTGTCATGCCTGAAGGTCCAATTACAAGGTCGAGAGCCAAGAAGCTACAACAAGCTTTAATCACTCATATTCAAGCTATGAATTTGCATGCTAGAGTCATTCAAGTGGTGTTGATCGTACCTCTTGTGGACATGGCACAAGAAGGTGATCTTAACATTAACGAAGCCCGAATGAGGGAGGCACAACAAGGAACCATGGAGAGAATGATTCGTGGAATAGAAGAGTTATCGGAGCGTATACGGAGGTTGGAGGTTCAAAACCACGCTAGGAGGAGAATTCCACCCCCTCCACAACAACGTGAGGATGACCATGACAACGAATATGAGGGAGGAAGTTCTGATCAACTAGAAGATGACCAAGTTACATTAATAGCAAATTTGCATGCTAGAGTCATTCAAGTGGTGTTGATCGTACCTCTTGTGGAGTGA MNVIILLMIWSSQHPFDVGDGYDSRANPSQEGEDDMNQGPPIVMPEGPITRSRAKKLQQALITHIQAMNLHARVIQVVLIVPLVDMAQEGDLNINEARMREAQQGTMERMIRGIEELSERIRRLEVQNHARRRIPPPPQQREDDHDNEYEGGSSDQLEDDQVTLIANLHARVIQVVLIVPLVE Homology
BLAST of Tan0001983 vs. NCBI nr
Match: XP_022157414.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111024115 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 80.5 bits (197), Expect = 1.7e-11 Identity = 47/84 (55.95%), Postives = 59/84 (70.24%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001983 vs. NCBI nr
Match: XP_022158199.1 (uncharacterized protein LOC111024737 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 80.1 bits (196), Expect = 2.2e-11 Identity = 37/48 (77.08%), Postives = 44/48 (91.67%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001983 vs. NCBI nr
Match: XP_023520282.1 (uncharacterized protein LOC111783592 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 1.3e-08 Identity = 40/72 (55.56%), Postives = 52/72 (72.22%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001983 vs. NCBI nr
Match: XP_023520835.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111784339 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 1.3e-08 Identity = 40/72 (55.56%), Postives = 52/72 (72.22%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001983 vs. NCBI nr
Match: XP_022971169.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111469948, partial [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 68.6 bits (166), Expect = 6.6e-08 Identity = 39/72 (54.17%), Postives = 52/72 (72.22%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001983 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DWE9 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111024115 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024115 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 80.5 bits (197), Expect = 8.1e-12 Identity = 47/84 (55.95%), Postives = 59/84 (70.24%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001983 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DYP6 (uncharacterized protein LOC111024737 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024737 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 80.1 bits (196), Expect = 1.1e-11 Identity = 37/48 (77.08%), Postives = 44/48 (91.67%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001983 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I7T3 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111469948 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111469948 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 68.6 bits (166), Expect = 3.2e-08 Identity = 39/72 (54.17%), Postives = 52/72 (72.22%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001983 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TK52 (Retrotrans_gag domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold320G001000 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 7.1e-08 Identity = 36/73 (49.32%), Postives = 52/73 (71.23%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001983 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DYV9 (uncharacterized protein LOC111025539 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025539 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 62.8 bits (151), Expect = 1.7e-06 Identity = 32/49 (65.31%), Postives = 38/49 (77.55%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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