
Tan0001858 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTCAGTCCGATCCAATTCGTTTTTCTTCAGCTCAATTTGGTCCGGTTTATTTTTTGGCATTTATTCGGGCAGTACAACAGTGAAAATTGGTTTGGTATTGGTTTATTTTTCAGCTTCTTAATTGAGTTGTTTTTTACTAATGTCTAAATTGATTGTTGAAATGACTCAGAAATATAGCACAAGTGAGTATGGGTTGTTCGATAATACAACCATTACCTCAAGGCCATTTGGAAAAGAGCAAGTTGATCAATCTTTGAAACTGCTGCAAACCAATTTATCATCTGGTAATCTTTGTGTTTCTTTGGCACAAATAGGTAACTGTCCTCAAGCCTTTTCTTGTACTAATTCATCTCCATGGATTATTGATTCTGGAGCATCTGATCACATGACTAGTTCTTCTCAATTGTTTGATTCTTATTCTCTTTCCTATAAAAATGAAAAAATTAGAATTGCAGACGGTAGTTTCTCTTCTATTGCAGGAAAAGGAACCATTAAATTGAATGATAGCCTTTCCTACAAATCATCCTCCATGTTCCTAAACTAACATGTAACCTCTTATCTCATTAGTAAACTTTGTAGAGATTCTAACCGTCATGTCACTTTCTTTGAATCTCATTGTATTTTTCAGCATCAAGACTCAGGAAAGAAAATTGGGTGTGCAAGGATGCTTGATGGTCTCTACTACTTTGATGAAGGTCCTTTTAGTAATAAAGTAACTCAGGGTCTTAGTAGTATTAGTTCTCTCTCTATTCATGAGCAAGTCTTACTTTGGCATCGTAGGTTAGGACACCTCAATTTCTTCTATCTGAAACATTTATTTCCAAATTTATTCAAAAATGTTGATTGCTCTTCTTTTCATTGTGAAAGTTGTATCTTCGCAAAAAACCATCGATCCACATATTTACCAAAATCTTACAAAGCCTCTAAACCGTTTTACGTAATACATAGCGATGTTTGGGGTCCTTCTAAGATTATGACTCATAGTGGTAAGAAATGGTTTGTCACTTTCATTGATGACCACACACGTCTATCTTGGGTCTATTTAATGCAAAAAAAATATGAGGTGAAAGATCTTTTCATACACTTTTATAATATGATTGAAACTCAATTTCAAACTAAAATCGATATTTTACACTCGACAATGGACCAATATTTCAATGAATACCCGAATGATTTTTAAAGGATAAAGGCATTTTACACCAATCTACGTGTCGAGATACTCCTCAACAAAATGGAATTGCTTTGACGGAAAAATAGACATTTACTTGAAGTTGCACGTGCCATAATGTTTTCTATGCATGTCCCTAAGTATTTATGGGGAAGTCAGATTGTTTACGGCTACCTATTTGATAAATAAGATGCCTAGTAAAGTCTTGACTTTTAGAACCCCCTTGATTGCCTTAAAACTTTTTTTCAACTAATCATATACATTTTGATTTACCCATAAAGATATTTGGTTGCATTGCATACGTTCACATACCCAATGTTTTTCGATCAAAACTTGATCATAGGGCTATTAAATGCATTTTTTGGGCTATGCTTCAAACCAAAAGGGGTATAAATGTTTTGATCCTCGAGAAAAAAAGTTTTATGTGAGTATGGATGTTTCTTTTTAGAAAAACAACCATATTTTATCCAAAATTCTCTTCGTGGGGAGAAATCGAGTTAGAAGATAATTTTTGGGAAACATCCAATCCCTTCCTTGTGTCATCCATCGTGACTTATGTGCCACTAGCCCTTCGATGTCAAACATAGAAACTTCTCATTGTGGGGAGAAATACCACAAAATGACTCTACACGTCAAATTCCCGAGTTAAAGTTTTATACTAGAAGGGCGATCAATCAAAAGAACCAAGACCAAAGAGTTGACCCGACACAAATCCAATTTGAAGTTCGAAAATGATGCTGAAAATTCATCTCCTATTGTCAATGATGAAAGGTCTAGTAATCCCGCTCCTATCCCTAATTTGTCAAATGTTCAAAATACCTTACCTATCATTTCGATCTTGATGTTCCTATTGCTATTAGGAAAGGTACTTCGAACTTGTACTAAATATCCCATTGCAAACTATATCTCTTATGAGAAATTGTCAAATAGTCATAAAGTCTTTACCTCTAGGATAGACAACTTATTTGTTCCAAAGAACATACAAGAAGCCCTAGATGATCCAAATTGGAAATTAGCAAATCATGGAAGAGATGAATGCTCAAAAACAAAGTGGTACTTGGGAAATAAATGATTTGCCAAAAGATAAGAAAGACAAAGGGATGCAAATGGGTGTTTCTTCAAAAGTGTAATGCTGATGGTTCTGTTGAGAGATACAAGGCTAGATTAGTAGCAAAAGGTTTCACTCAAACCAATGGAATTGATTATCGTGAGACTTTTGCTCCAGATTGCAAAAATCAACTCTATCGTAATTCTTTTGACTCTTGCAGGCTAATTTAGATTGGTCACTTCATCAACTAGATGTTAAGAATGCTTTTCTCAATGGTGATTTAGAGGAGGAGGTATTCATGAGTCTACCACTGTGTTTTGAAATAGAACTTGGAAATAATAAAGTTTGTAGACCTGAAAAAATCTATATGGTCTCAAACAGTCTCCAAGAGCTTGGTTTGAACGGTTTGGAAAGGCAATCACTAGTTATGGATACCTTCAAAGTCAAGCAGACCATACCATTTTCTACAAACACGCTGAAAATAGTAAAATTGCTATTTTAATTGTTTATGTTGATGATATTATTCTCACAGGAAATGATGAAGAAGGCTTGACTGATCTTAAGGAAAAACTTGCAAGGGAGTTTCAGATCAAAGATTTGGGAGTCCTAAAGTATTTTTTGGGGATGAAATTCGCAAGATCCAAGAAAGGTATCTTTGTTAATAAAAGGAAATATGTTATTGACTTACTTCAAGAGACATGTTTACTTGGTTGTCAAACGGCAGAAACTCCTATCGAGCCAAATGTAAAGTTACAAGCTGCAAAAGCTGAAGAGGTAAAGGACAAAGACAGATATCAAAGACTTGTGGGTAGACTGATCTATTTATCTCACACACGTCCGAATATAGCATTTGCAGTAAGTATGGTAAGTCAATTTATGCACTCGCCTGGACCTACTCATTTCGAAGCTGTGTATAGAATCTTGAGATATTTAAAAGGAACTCCAGGTAAAGGTATATTGTTTCAAAAACATGACCATCTTCAAGTTGAAGTGTATACCGATGCCGATTGGGCTGTAAGTCCTATCGATAGAAGATCTACATCAGGTTACTGTTCATTTGTTGGAGGAAATTTAGTTACATGGCATAGTAAAAAACAAAATGTAGTAGCCAGAAGTAGTGCTGAAGCGGAATTTAGAGCCCTAGCACATGGAATTTGTGAAGGTATATGGATTGACAGGATACTCGACGAGCTGAAATTGTCTCAAAAGACACCTATAAGAGTATATTGTGATAACAAAGCTGCCATTGCTATATCTCGTAATCCAGTTCTACATGACAGAACAAAACATATAGAAGTTGACAAGCATTTTATAAAGGAGAAGATTGATGCAGGTGTGATATGCATATCGTACCTTCCAACGACAGAACAAACGGCTGATATGCTAACCAAAGGACTTTCAAAAGGACAATTCAATAAACTTATCAACAAGCTGACTATGGAAGATATCTACAAACCAGCTTGAGGGGGAGTGTTGGATTTTCTGTGTATCTTTAATAATGTGTATTATTTGTATCTTTATTATTTATACCTGTAATATTCTTTTTCCTTATTGATAGATATTTTCCTTATTAGTAGATATTAGTAGATGGTCTCTCTCCTATATAAGAAGACCTTGTATCTTGATTAAGCAAGAAGAAATACAACATATCTATTTCTCTTCTAAATTCAAGTGTTTCCTATCCAAAAAAGAATATGGGCAGCAGCTAGACTCTTAGGTGTGGTCATTACTCAATGAAATTCAAAAAGTTAGAATACCATCAAAGAGGAGCTTCTTGTGGTATTTGAAGATTTTTTTTTTAAAAGAAGTGTTTCCTTTCTTTGATAAGAAACCATGAAAGTATGTTGTCAACATGTTTATCAATGCAACTTACGTCGCTTGTGAAATGGTAAGCTTTGCATTACATATTTATCAATAAAGTTTGCCTTACTGAGGAGGACAGACAAAAGTTTATCACCATTTATGTAAGGCTAGTAAAAAAGTATCTGTATATGGATATTACCGAGATAACTATATACGTAGAGAGAAACTACTAAGGGAAAGTATATAAAGAGAAATTGGTGAGAGAGTGTGGATAACAAGAAGTTGGTGGGAGAAAATGTCTGTGAAGAGAGATTATTGAGAAAAGATATGCATAGAGAGAAGTTAGGGAGATAGATTTTTTTTTTGATAAAAGAAACGATTTCATTGATGAATGAAATAAGGAGATAAAACTCCAAGCACCTATTGGTGAATTACATGAAAACGCTCCAATTGGAAACTAAGAAAGATAAGCTATAATGACAGAGAGGCTGTAAATTTCTACACCAAGTAAAAGCAATAGGAAAAACATTCTCATTAAAACGATCAAAAGGAGAAGAAGAATCCCTGAAGTTCCGACTATTTCTCTCCAACCAAAAATTCCACAGAAAAGCACAGACAAAAGCAAGCTTGTCTATATACGATTAAACTAAATAAAGAGTTAGTGGTAGAAAATGTCTGTGAAGAGAGATTATGGAGAAAAGATCTGTAAAGAGAAGTTCGTGAGAGAAAATCTGTGAAGTTTGTATGAGGAGAATTTAATGAGAAAAGGTGTGTAAGAGAGACATTATTGATAAAAGATGCATAGAGAGAAGCTAGTGAGAAAAAGTGTGTAGAGAGAATTTAATGAGGGAAAGTTTGTGCATAGAGTAATTAGGAATTTAGGGAAAAAGCCATGAGAGGTTACGGTTGAGATTTTTAAGCCGAACAGTGAGTTCTTTAAAAGCATTTGAATACTTTTTGCTTTTTAGAAAAGTG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MKRKTDVGTVSQNDAKSVAQSYFQNLQVQSLGQHDRKLSFELLVCLLEHYPDVVVSLGDDLVYGICEAIDGEKDPHCLMLTFHIVELVAKLFPDPTGTVASSSSDLFEFLGCYFPIHFTHGKEEDVDVRRNDLSQALMIAFSSTPLFEPFAIPLLLEKLSSSLPLAKVDSLKYLSACTVKYGAERMEKHGEAIWSSVKEIIFTSIGQSSLSINLESLNSPSFQGNEISTEALRLLQKMVVESNGLFLRLIIDDEDIKDIFNILNIYTCYNDFPLQSRQRLNAVGHILYKSANASVASCDHVFESFLPRLLDIVGISVDQSHDNKISPSKDFNFGALYLCIELLAACRDLIASSDEHTCLVKEKSYSMLQTFSCSMVQLLNSIFPGIVKKDLHEAEFYCAVKGLQNLATFPAGSSPVSRVIFEDILLGLMSFITVDFKFASLWNHALKALQHIGSFVDKYHGSVELQSYMHVVVEKIASMFSVHDETLPLTIKLELASNIGRTGRSYMLKIVQGIEEAIFLHLSDVYVYGNSKSVEILLSLLDCYSTKILPWLDEVGDFEEVVLRLALNIWDQVEKCLVFSASMDRVLLDATMMALKLSVRSCSKESQDIIIQKAFNVLLTSSFSHLKVASSTTLPVQMEVLQLLQQKDSPLCRDEWILSLFASVIIALRPQTHVPDVRSVMHLLMLYITKGCMPAAQALGSMINKLSPKSDKVEVSSYVSFEEAIDIIFKTKFRCFHNDSTRDGSEMFLTDLCSSIEKSSFLQVHVVVGLSWIGKGLLLCGHEKVRDITMVFLECLLSKSRTDASPLQQVIPEKDCKTNLDFAVMKGGADAFHILMSDSEACLNRKFHAIVRPLYKQRFFSTMMPIFQSLVSKSNTPLSRYMLYEAFANVISDTPLTAIVSDAKKLIPMLLDGLLTLSVNIINKDVVYGLLLVLSGILMDRNGQEAVTENAHKIVDCLAGLTAFSHMMLVRETAIQCLVALSELPHARIYPMRKQVLNAISKTLDDPKRAVRQEAVRCRQAWSQSGDFAVTSGEILQ Homology
BLAST of Tan0001858 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WVF8 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MMS19 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 857.4 bits (2214), Expect = 1.6e-247 Identity = 481/1047 (45.94%), Postives = 677/1047 (64.66%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001858 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0V9L1 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=mms19 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 189.1 bits (479), Expect = 2.5e-46 Identity = 247/1049 (23.55%), Postives = 430/1049 (40.99%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001858 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6DCF2 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=mms19 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 186.4 bits (472), Expect = 1.6e-45 Identity = 246/1045 (23.54%), Postives = 424/1045 (40.57%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001858 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9D071 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Mms19 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 181.4 bits (459), Expect = 5.2e-44 Identity = 241/1042 (23.13%), Postives = 419/1042 (40.21%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001858 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: E1BP36 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog OS=Bos taurus OX=9913 GN=MMS19 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 173.3 bits (438), Expect = 1.4e-41 Identity = 237/1019 (23.26%), Postives = 415/1019 (40.73%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001858 vs. NCBI nr
Match: XP_022953370.1 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1746.5 bits (4522), Expect = 0.0e+00 Identity = 888/1023 (86.80%), Postives = 948/1023 (92.67%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001858 vs. NCBI nr
Match: XP_038898521.1 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1745.3 bits (4519), Expect = 0.0e+00 Identity = 892/1026 (86.94%), Postives = 954/1026 (92.98%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001858 vs. NCBI nr
Match: XP_038898520.1 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1745.3 bits (4519), Expect = 0.0e+00 Identity = 892/1026 (86.94%), Postives = 954/1026 (92.98%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001858 vs. NCBI nr
Match: XP_038898522.1 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1745.3 bits (4519), Expect = 0.0e+00 Identity = 892/1026 (86.94%), Postives = 954/1026 (92.98%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001858 vs. NCBI nr
Match: XP_023547398.1 (MMS19 nucleotide excision repair protein homolog isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1744.6 bits (4517), Expect = 0.0e+00 Identity = 889/1023 (86.90%), Postives = 945/1023 (92.38%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001858 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GPG0 (MMS19 nucleotide excision repair protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455939 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1746.5 bits (4522), Expect = 0.0e+00 Identity = 888/1023 (86.80%), Postives = 948/1023 (92.67%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001858 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JY03 (MMS19 nucleotide excision repair protein OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488523 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1743.4 bits (4514), Expect = 0.0e+00 Identity = 891/1023 (87.10%), Postives = 947/1023 (92.57%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001858 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GN60 (MMS19 nucleotide excision repair protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455939 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1740.7 bits (4507), Expect = 0.0e+00 Identity = 888/1027 (86.47%), Postives = 948/1027 (92.31%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001858 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JWJ7 (MMS19 nucleotide excision repair protein OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488523 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1737.6 bits (4499), Expect = 0.0e+00 Identity = 891/1027 (86.76%), Postives = 947/1027 (92.21%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001858 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JNP3 (MMS19 nucleotide excision repair protein OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488523 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1737.6 bits (4499), Expect = 0.0e+00 Identity = 891/1027 (86.76%), Postives = 947/1027 (92.21%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001858 vs. TAIR 10
Match: AT5G48120.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 857.4 bits (2214), Expect = 1.2e-248 Identity = 481/1047 (45.94%), Postives = 677/1047 (64.66%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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