Tan0001821 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTCCCAGTTTTAAAAACTGTATGCTTTTTTGCTGCACTGCCAAGGTTTCGGTAAGATCAATAAACCCCTTCTTTTGTCACTGCATTATAATGTTCAATCACATTAGCAACTGATTATTTATTTTGTTTTAGACTTCAACCATTGTTAATTGGTTGGAATTTTTTAATTCATTGTCCATTTTTTTAGTTAGTTGTAAGTATCTATATGCAGTAAATTGAATCTCTAACTTCTTGGTCGGACCGTATATATGTTAACTAGTTAAGTTAGGTTGAGATTAGATTTAACACTTTCTATGCATCTATTAATATTCCATATGTTTTAACTTTTTTAGAATGTTGTTTTATGGGTTAAAATATCATTTTGGTTCTTGTATATTGAGACTTGTTTTATTTTGATCTTTATATACCTTGCTCCGTTTGATAACCATTTGGTTTTTGAAAATTATGCTTGTTTTTCCACAATTTCTTTTCATCTTTTCTATACAATGATTTCCATCTTTCTTGAGGTACCATTTAAGTTTTTAGACAAATTTTAAAAACAAAAACAAGTTTTTGAAAACTACTAGTTTTCAAAACTTAGCTTGGTTTTTAAAAACATAGGTAATAAGTAGATAAAAAAATATAGAAATCCATTGATAGAAGTAGTATTTTTAGGACTAATTTTCAAAAAGAAAAAAAACAAAAAAATCAAATGGTTGTGGGGCCTTAGTTTTCAAATTTTAGCTTGGTTTTTGAAAACATAGGTACAAAGTAGATAAAAAAAACATATAAATCTATTGGTAGAAGTAGTATTTTTAAACTTAATTTTCAAAAACCAAAAACCAAAAACCAAAAATGAAATGGTTATCAAAGAGGATCTTAAATATTCAAATTTAGTTTTCGCACTTCCAATAAATCTTAAAAATGGTTATTAATGTTGTTAGTTTATTGTTAACTCCTTTCTAAAAAGAAAATAGACTCCTTTTAGCCTCCCATCTATAAATTTTAAAGATATTTTACTTCTTTTTATAAATTTTGAGAAATAGGTTTAAAAGGTTCCGAGTTTTTTTTTCCTAATGTTTAAAGTTTTTATAATGCATTTTAAATTTAAAAAATAAAAAAATAAATGTATATTCTCTCTCACAACATTATTCTCTCCTCCCTCCTTATATTATAGATTAGTTTAATTTGTTTGTCTAAACACCAACAAACTCATCCCATTAATATACTTGGATGCCAATTTCCTCAGCTGTTGCAGTTTCACTAGTACTGTAATTTTAACCTTCCCCTCACCCCTTCATTAATGGTGAACAAAAATTCAACCACACTATCAAACAACAACACAACATTCTTAACCCCTCAATGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTTCTGGAAATTAATTCTCCACTTGACCCAATTGTTTAGGAAAGAATGGAGATAATAAAGACGACTAGAATTTACATTGTATATAAAATTACATTTCCAAGATACAAAACTTAAAAAGGTCCATTTATACCAAAGAGAATAATAACAAAAAAAACATAAAATCTAACTTAAAATCCCAAGTCAAATAAAGCTTAACTTAATTAAGATGCTTAAGTTTCATAGATTCTCATATCATATTAAATAAATATAGAATTCCTTAAGGATGTGAGCTCTTTCTCTTCTCGAAATTAATTGACAATTAAGTAGCCTATGTATCTTATAAATTGTGAGCTCTTTCTCTTCATCTTTCTAATGATGGATCCTCAACACAAATGACTTAAAGCTCTGATACTATGATAACTTTAGAAAATAATAAGAAGATACTATATAAAAGACGACTAAGGTTTACATTGTATATAGAATTGCATTATAAAAGAAATTTAAAATGCCTAAGATTTATACTAATGAGAATAATAAGAAAAAAACTAAAGGCATGTTTGAAAGTGATTTTAGAATGACCAAAATCACTTTTGACATGTCTAAAATCACTTTCCTTTCAAGTGATGTTTGGCAATATTGAGCAAGTAATTTTGGAAAAATCGAAAATCACTTGAAGTAATTTTCTATCAATCATTTGGGAGGTGATTCCTAAATGATTTTTATCAAGTGATTGTGATTTAAAGTGGCTATTATTTCATTTTTGAAAAAGCGACGGGTAAAAACCGTCATCTTTTGTAAAAATTCATAAATTTCCATCAAAAAATGAATTTTCTCAAAACCGTCGCCATTGAGTTTATTCGTCAGTTTTTACAAAATGACAAGTTTTCTCTTTCTAAAGTTTTTATAATGTGTATTTCTTACTTTATTATCTTTTTATATTTTCATTCATTTTTCTCTATAATGGTTTTAACTTTCTTTGAATTTTTTTATTTTTAAATTTGTTTTGTTTCTCCCTATCATTTTCGTATATTCTTAAATTTTTTCTCACTAATTTTTTTTATCTCTTGCTTTACCTTTTTTGTTCATGTACTTTTTTTTCCCTAACTCTTAACTTTTTTCTCTTCAATCCTCATTATAATTTTTTTTCCTAAAATTTTTATCTTCTTACCCAATTTTTTGTTTCTCTCTATCTTTATTTCTCTAATATTTTAATTATTCCATATCACTGACTTGATGATTATAAAATCACTTTTGAAAACAAACATTAATAATTTTTTGAAAAATATTTTTAATTGAATTTAAATTCACTTTTACAACGTTTGAATTAAATATTAAAATAATTTATAACTAAATATTGTTTAAAAATAATAATTATGATTAAATCATTAGCTTAAAACACTTATTTTAAAGTTATTCTCAAACATACCTTTTGAAAATCACTATTAAAAATGTAGAACCAAACATTAAAAATGATTATATGAAAATCACTTTTAATAAATTAATTGTATTAAAATCAATATTTCTAAAATCATTCCCAAACATACACTAATCTAGTCTTAGCAAATAAACTCAAATCAAATAAAACCTAATCTAATCTAACAATAGGAAAATTAAGCAAGGGAACACATTGGAAAATTTCAGACTTTGCCTTTTATTTTTTAGGTAGCAATTGGTTAAAATTAATTTAATAAATAAACAATTTTGGAGGTAGCCTTCACTGCACCAAAATATTACAAGCCCACTCCTATCCTACAATTTTTTTTTTTTTAGGAAAAAACAAAAACAAATAAATTTTGGTTGCACCCAAATTATGCTTAATAAATATTTGAACATGCTGTGGGTTGGCCTGTAAGTTGGTTTGTCGATAAGGGCCACAAATGTCTTGTCTTTTGATTGATTTGGCCAAAATTTTCCATTAATTTTTTGCAAATAAATTAATTAATTTTTAGGTGAGTGAATGTGGATAGCACAGAGAGAGAATGTGGTGAAAGAAAGAATTTTTTTAAAAAATTAAAATACATAAAAATAATTTTAAAAAATAGAAAAAAAAATAACTCAAACACCTTTTAAACCTATTTCTCAAAACTCGAAAACTAAAATGGTACATTTGGAAACTTGAAGAACCAAATGCGCCTATTCTTGAAAACTCAAGAAAAAAAGTAATTTTTTTAAAAATTATTATTATTATTATTCAATTAATTTCAATAAAAATTAATTTCAAATTAATAATAAGAACTAATTTTTAGATTTATTGGGAGTATAACAACTAAATTTAAACATTTAAAAATACATATATAGATGCAAAATACTAGAACTAAAATTATATTTAAACTTATTTTATTAAAAAATATTTGTCTTTTTTAATTTTATTCTATTTTAAAGTTTTGGGGAGGGCCGTAAAGGCTTGATTGTTGGTCCATAAATTGAGTTTTTTTTAAAAAAAAAAACAGTATTTAGATATTCGATCAATAAAGTTCTCTCTCTCTTTTGCCTAGTTGGTAACTTAGTTGGACTCTTTTGTTTTTAAGTTTTATTTTTGGATAAAGGTACAAGTGTTAGTTAAAGAAATATGTCTCATGCAAAAATTGATTAAACTTAGTTGTAAGACACTTTTATTTTTATTTTATTTTTTCTAAAAGTTGTGAGTTCTTCTCTCCCATTTGATCTAGTATTTTTAGAAGAAATATGTATATAAATACATAATTATATACATTTTACTTTGAAAAAAAAAATTGTATTTTCATTTTAAAAAAATCAAAAATTCTACACGTATCTCTTTTTAAAAATAATAGTTCCTTTAGTTATGGCAAAAATAGATCAACTAAAGAATATGAAAAGGAGCCTTGTAATTAAGATGAAATATTAGGCTCTACATTACTCATAACTTTGAATTCTTACATCTAACAGCTAATATAAAATTTTAAAAAAGAAATTAAAACACCTCTTAAAAAAAGGTAAAACTTAATAATTAGTATTTATAACCTACAACGAAAGTGCTGTCTCTTAATCATGGATAGTAATAATAATATAAACAATATTTTATGAACTTGCTCTATTATATAGATACAGATTAAGTGTATAGTTTTTAAGAAATATAATATAACTAATCTGATGAAGGGACACTTTTGAGATTCTCTGAATTGTTTTCTTACCAAAAAAAATAATAATAACTAAAAAACCACTCCATCATTGACGATTTTAATATATCAAGGATTAAATGTTAAAGATACAGTTTTAAAATGAAATTTAAATAATATAAAGGTTAAATTACGAGTTTAATATATCCTCAATTTTTAGATTTGTGTCTAACTTTTAATTTTAAAATGTGTTTAATAAATGGTCATTAAACTTTCAATTTTTTATCTAATAAGTCTTATTTTTTTTATTTTGTCTTTAATAGGTCTTTGACCTATTTAAAAACTTTTAAACTTCACATGCTTACTACACACAAAACTGAAATTTTAAGAATTTATTATACATCAAATTTAATTTAATACCTACATTAGTTTAGAGATTTATACACAAAATTAAAAGTGTATATATTAAATGGAAAGTTTTTTTTTTTTAACAAAGAAATACAACCAAAGAAATTCAAAATTACACATCAACCTTATCTCATAAATGAGAAAAAGAATGTTATTTGGAAAACTA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BLAST of Tan0001821 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Tan0001821 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P42737 (Beta carbonic anhydrase 2, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BCA2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 370.9 bits (951), Expect = 1.2e-101 Identity = 178/255 (69.80%), Postives = 214/255 (83.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94CE4 (Beta carbonic anhydrase 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BCA4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 368.6 bits (945), Expect = 6.1e-101 Identity = 183/280 (65.36%), Postives = 216/280 (77.14%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P27140 (Beta carbonic anhydrase 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=BCA1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 366.7 bits (940), Expect = 2.3e-100 Identity = 177/262 (67.56%), Postives = 214/262 (81.68%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P16016 (Carbonic anhydrase, chloroplastic OS=Spinacia oleracea OX=3562 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 355.1 bits (910), Expect = 7.0e-97 Identity = 173/265 (65.28%), Postives = 216/265 (81.51%), Query Frame = 0
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Match: XP_022151178.1 (carbonic anhydrase 2-like isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 522.7 bits (1345), Expect = 1.9e-144 Identity = 252/278 (90.65%), Postives = 269/278 (96.76%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. NCBI nr
Match: XP_004135244.2 (carbonic anhydrase 2 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 519.6 bits (1337), Expect = 1.6e-143 Identity = 249/278 (89.57%), Postives = 267/278 (96.04%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. NCBI nr
Match: XP_038893413.1 (carbonic anhydrase 2-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 518.1 bits (1333), Expect = 4.8e-143 Identity = 253/278 (91.01%), Postives = 267/278 (96.04%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. NCBI nr
Match: XP_022956457.1 (carbonic anhydrase 2-like isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 491.1 bits (1263), Expect = 6.2e-135 Identity = 236/278 (84.89%), Postives = 261/278 (93.88%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. NCBI nr
Match: XP_023543367.1 (carbonic anhydrase 2-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 490.0 bits (1260), Expect = 1.4e-134 Identity = 236/278 (84.89%), Postives = 260/278 (93.53%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DBH1 (Carbonic anhydrase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019165 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 522.7 bits (1345), Expect = 9.4e-145 Identity = 252/278 (90.65%), Postives = 269/278 (96.76%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GWD4 (Carbonic anhydrase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111458187 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 491.1 bits (1263), Expect = 3.0e-135 Identity = 236/278 (84.89%), Postives = 261/278 (93.88%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I9Y1 (Carbonic anhydrase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470569 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 490.0 bits (1260), Expect = 6.7e-135 Identity = 236/278 (84.89%), Postives = 260/278 (93.53%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DAH5 (Carbonic anhydrase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019165 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 484.2 bits (1245), Expect = 3.7e-133 Identity = 234/258 (90.70%), Postives = 251/258 (97.29%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KVM4 (Carbonic anhydrase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G601560 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 482.3 bits (1240), Expect = 1.4e-132 Identity = 232/258 (89.92%), Postives = 248/258 (96.12%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. TAIR 10
Match: AT5G14740.1 (carbonic anhydrase 2 ) HSP 1 Score: 370.9 bits (951), Expect = 8.8e-103 Identity = 178/255 (69.80%), Postives = 214/255 (83.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. TAIR 10
Match: AT5G14740.2 (carbonic anhydrase 2 ) HSP 1 Score: 370.9 bits (951), Expect = 8.8e-103 Identity = 178/255 (69.80%), Postives = 214/255 (83.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. TAIR 10
Match: AT1G70410.2 (beta carbonic anhydrase 4 ) HSP 1 Score: 368.6 bits (945), Expect = 4.4e-102 Identity = 183/280 (65.36%), Postives = 216/280 (77.14%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. TAIR 10
Match: AT3G01500.2 (carbonic anhydrase 1 ) HSP 1 Score: 366.7 bits (940), Expect = 1.7e-101 Identity = 177/262 (67.56%), Postives = 214/262 (81.68%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001821 vs. TAIR 10
Match: AT3G01500.3 (carbonic anhydrase 1 ) HSP 1 Score: 366.7 bits (940), Expect = 1.7e-101 Identity = 177/262 (67.56%), Postives = 214/262 (81.68%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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