Tan0001619 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGTGGATCAAGTGACGATGAAGTGAACGTATCGATCCAAATGGAGGCTAGGCATACTAATCGACGTGGTCTCACTACGATGCGTGGTCTGGCACGCGTAAGGACTACAGGAGAACGCTTGGTCATCCAATACAACAATCAAGGCCAAAGTGTTGGTGATAATGCAAACCAAATGCAAAGTTATATAGGAGTTTGCGTTAGGCAACAAATTCCATTAAGTTACAAGACTTGGAAAGAAGTTCCCCAAGAATTGAAAGATAAAATTTTTGATTCTGTAGAGGTAAGAATAATAGTATTTTTCCCTAAAGGCTTCTTAATATATAGAGTTATTTAACCCTTTATTATGTGTTTCCTATGTAGATGTCATTTGTGGTAGACCCTCGGTCCAAGAATTGTATTCTTCAATCAGCGGCAAATAAATTTTGAACATTTCGATACACGTTGTATCAAAAGCACATACTTCCATTTAAGGATGAGCCGTTCTTGTTGAAACATCCTCCACAAAAGTATTTTCATATTGATAAAAAACAATGGGAAGCATTTGTGAATGCTAGATTATCGGAAGAATGAGAGGTAAATATATTATACTTATTGCTTTTAAAAGTTAGTAAAAAAAGTATTAAAATGATTTAAATTGATTCTAATATGTTATACAGGCACAAAGTCGTGTGCAAAAGGAAAGAAGAGAGAAATGTAAATATAATCATCACATCTCTCGCAAAGGATATGCAAACTTAGCTGAAGAACTAGTGAGTAACATTATTTCTTATAATTTTCCATACATGAGATTTAATAACTTGTATGTTTATATAGGAATTGGCGGAAGATCCTTCCACTCGTGCCACCTTATGGATACAAGGACGAAAAGGAAAAAATAATGAATACTTCGATGAAGACACCAAACAATGTGCTGGTCAAATCGTAAGTTAATATGTTTTATTTTAACATGATGTAAAAATGATTCTTAGTTTAAATATCTTATGGTTAGTTTCAATGTCAATCTAAATGGTTGTGACAGGATGAACTAGTTATGAAGAATAAAGGTAAAGACATATTGACCGAAGCATTAGGCACGCCAGAACACAGAGGGCGTGTTAGAGGAATAGGTTTGTCTGTTAATCCATCAACATACTTTAACATTCCTTGAGGGAAATCAAAATCAAGCAAAGAGTCTGGAAACAAAATGTCGACTGATTGCTCACCTTCCAAAAAGTCTACAAGCATAGGCACTAATCATCCAAAAGACAAGGAGGTCATTGACGAGGTGGAAGAAATTTTAGAGGTAATTAGAATTTTAAAATATTAAAAGTGTGATCTATGATAATTTATTTTGACATTCTTTTTTAATTTTTGAAGGGAACTCCATGCCATCTAGCAATAGGATCAAAGGATAATGTGGTTGCTGTAGGCATAATGTACACGTCTGACGCTCAATTTCTCACAGTCCATGGAGTTCCCTTAGGAGTTGAAAATATTAGAGTGGTAGTGGACATGATCGTAGGTGAAAATGCTCCATTACCAATTCCTATACGGGGAGAAGTAGAGTCTCTGAGTCAATCAATGAGAAATTTTGTGGCATGGCCTCGGGACCTTGTCATTTTTAATAAGGGGAAATAGGTATGAAATTCTTCAACTCAATGTTTAAAATTACTATATTCTTTGTTTACAAATTTAAATGTTGTTTTGTTGTGATAGGTGGCTTCTCCAGCAAAACATAAGTCGGATGTTTATGTACATGTGCCTACTTCACATTCTACAAAGTACACAAATGCTCATGTGACTATTAAGCTTCTGAATCGTTATGCAATGTTATCGATGCAAGAAGATGATACGACAAGTCAAGTTGAGCGAGCACATGTTCGGGGAGGAGAAGTTAATTTATTTACATCGCGATGATATCCTGCATTACTGTGGGATGGTGAAGATAGGGTACTCCTGCATAGTCGCATACATTGCGTAAGTATACAACATCTTTCATTTATATTGACTACGCTTTTGAATGTAGTATACAACATCTTTCGTTTTATAACTTTACTTTTGTTTAGGTATCTTTGGACTGTATGTGACTATGAAATAATCGCCAAGTTCTTGCTAGTTGATCAAATAATCATTTCTAATTTTATTAAAAGTCAAGAAACACTTTGTATAAATCTGGCTAACAGGTTAAAAATGATTTATTTGTACTTGGATCAACAAGTTTTCATCCCATATAATACTGGGTAAGTTTAAATTATTTCAACCTATTTATATGTTTTTTGTTCATAAAACAATGATATTAGAATATTCATTGTTTAATAGATATCATTGGATGTTGATCGTTATCCATCCGCGGGCGAACGCCGTTTATGTCTTAAACTCGTTGAGGAGTAAGATCGAAGAAAGTTTTCAAGGAACAATAAATATGTAAGTGTTTCAAACCTTTAGAATTAATTACTCAAACCTTTAGAATTAATTACTTTCTATTAATTTTTCTAATACTTCAAACTCTTTAGATCCTTGAGAATGTGGCAAACCAAGCACTCACTTCCACAATATTGCTCCGCCATCACTTGGAAACTTGTAAAGGTAAACATAATTGATATATTCGATTGTTTTGATCAACAGAACGAAATTTAACTCAAACATGCTATTTTTTAAATTATTTTGCATGTAGTGCCCCTGTCAACCGAGTTCTGTAGAGTGCGGGTACTATGTACAGAAGTATATACGAGAAATCGTATATAATTCTAGTATCCCTATAATGAACCTTGTAAGTACTCTTATTTTATCTTCTTAGTGATTCAAAATATAATTTAGTCTAATGTTATTATATATTATTTCTCTTTGTAGTTTAACACAAAAACTGCATATAAACAAGAAGAAATCGACGAGATTCGAGTACAATGGGCGGATTTGTTGGCAGATTTGTGTAAGCCATTTGTGGATTTCTGAATTTTGTGAAAAAGTACTAGATTTGTATGGAGTAAGGTAAGTTAATATGTTGGTTAGGTGTACAATATACTTGTTTATAATGTATATAGTAGAAGTGTATATAATATTTAGTAGTTTGTGGAGAGGTGGGTGGCCTCATTCTTCTGAATCTGGGATTGGAGTTTGTTGGATGTTGTCTATGAATGAATGTGTTTTTTGATGTATATACTTGTTTCTTGGATGTTGTCTATGGAGAGGCGGGTGACCTCATTCCCTACACCGTTTTTTTTTTGGATAGAAGTATTCTGCAGTGTTTCGGGTTATGGTTAGCTGATGTTCTGTAGAGGTCATGCCGAAATTTTTACTTATTGACTTGATTTCGTGTTAGTTTTAGAGTTTATTGTTTTTGTGATATAGGTGTTAAGGTTTGTGATATAGGAGTTTATGGTTTTAGAGTTATGGTTAAAGTTTGTGATATACTAGTTTATGGTTTTTGTGATATAGGCGATAAGGTTATGTAGAGATCGTCTCATGTGTATTCTTTATAATGAAGTGTTATGATTTTCTCGTAAAAGGAATCTTGTTGGATGTTTGTGGATGAATTAGTGATTTCATGTTTTTTTTTATATATAGAAGTGTTCTGCAATGTTTCAGGTTATGGTTAGCTGATGTTCTGTAGAGGTCATGCCGAAATTTTTACTTATTAACTTGATTTCGTGTTAGTTTTAGAGTTTATTGTTTTTGTGATATAGGTGTTAAGGTTTGTGATATAGGAGTTTATGGTTTTAGAGTTATGGTTAAGATTTGTGATATACGAGTTTATGGTTTTAGAGTTATATTTAAGGTTTAATTTGTGATATATGAGTTTATAGTTTTTGTGATACAGGCGTTAAAGTTTGTGATATAGGAGTTTATGGTTTGTAATATAGTAAGTTTATGGTTTTGGAGTTTTGGATATAAAAGTTTTCTATGTGCATTGTTTTGGTTAAAAAAGAATTTTGTTGGATGTTGTTATGGATTAGTGATTTCATGTATGTTTTGGATATAAAAGTGTTTTTGTTGCATGTTTGTAAATTTGTATAGTGATTTCATGTGTGGTTTCAATATAGAAGTTAATATATTTGCAATATTTCAGGTAATTAGTTATTAAATATTGTTGGTTAGCCATCGGGCTATCAACTTTTTTTTATTAAATTATGCTAAAAACGATGACGGACATTGTTTGTCATTAAATAAAAAATTATGAACTAAAATAATGACGAACAACATATAATGACGGGCAATGGGTTTTTAATTTTTTTTTCAAATATAAATGACGCGTAATGCCCGTGATAAAAAGTGACCCATTTTTTAATGACGGACAACACTTTTAATGACGGGCATTGCCCATCATCAAAACTCGACCGTCATTGTATGTTACAATGACGGGCGGTTTTTAATGACGGGCATATCAAAACCCTTTAATGACGGGCAATGCCCGTCATTAAAACCTTTTTTTCTTCTAGTGAACTAAAAATGAACAAAAGAATGTTAATAGCACATTCATGGTTTTTTTTTTAGTAAAAGAAGTTGGAGGATTTGAATCACAAATCTCGTAATCGTTAAAACGTTTGATATGTCAATTGAGTTATGCTCTCTTTGGCATAGCGTATTCACAGTTATTGTGTAGAGATGCTTTGAGATCTACAAAACTATTCTAAATACTAATATTTATGGGTAAGATATCTCAGCTTTGTACACAAATTTATTTTTCAGGCATGGAATCATTGATTACCTCCTCCATATTAGAGCATTTTTAAGTGGAAAATATAAAAAATGCTAAAACTTTCACTTTCAGAGTATTGTATCCCACAAATATTGATTTAATTCAATTAAGTATTGCGAATAATCTCATTTTACTTTATTTAAAGACAAGAAAAGAAGAGCAAATAGAGAAAATAAACTTCTAAATCTAGAAAGCAAGATAATGAGAGACGCAAATCAATTGGTAATTCTATGGATGTTGGCATTCTTTACCTTAATTTACTTAATTAAGCTAGCAATTAGGCAAAAACAAGTGTTCAAATCATAAATCTAGAAGCC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Match: XP_022136077.1 (uncharacterized protein LOC111007859 isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 322.8 bits (826), Expect = 4.3e-84 Identity = 217/584 (37.16%), Postives = 287/584 (49.14%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001619 vs. NCBI nr
Match: XP_022136080.1 (uncharacterized protein LOC111007859 isoform X4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 322.4 bits (825), Expect = 5.6e-84 Identity = 217/585 (37.09%), Postives = 287/585 (49.06%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001619 vs. NCBI nr
Match: XP_022136076.1 (uncharacterized protein LOC111007859 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 322.4 bits (825), Expect = 5.6e-84 Identity = 217/585 (37.09%), Postives = 287/585 (49.06%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001619 vs. NCBI nr
Match: XP_038895930.1 (uncharacterized protein LOC120084092 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 313.2 bits (801), Expect = 3.4e-81 Identity = 220/630 (34.92%), Postives = 285/630 (45.24%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001619 vs. NCBI nr
Match: XP_038895921.1 (uncharacterized protein LOC120084092 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038895924.1 uncharacterized protein LOC120084092 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038895927.1 uncharacterized protein LOC120084092 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 308.5 bits (789), Expect = 8.3e-80 Identity = 220/631 (34.87%), Postives = 285/631 (45.17%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001619 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C4J7 (uncharacterized protein LOC111007859 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111007859 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 322.8 bits (826), Expect = 2.1e-84 Identity = 217/584 (37.16%), Postives = 287/584 (49.14%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001619 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C2V2 (uncharacterized protein LOC111007859 isoform X4 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111007859 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 322.4 bits (825), Expect = 2.7e-84 Identity = 217/585 (37.09%), Postives = 287/585 (49.06%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001619 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C2H7 (uncharacterized protein LOC111007859 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111007859 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 322.4 bits (825), Expect = 2.7e-84 Identity = 217/585 (37.09%), Postives = 287/585 (49.06%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001619 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BRX5 (uncharacterized protein LOC103493028 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493028 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 298.9 bits (764), Expect = 3.2e-77 Identity = 221/634 (34.86%), Postives = 278/634 (43.85%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001619 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CYL9 (ULP_PROTEASE domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold21G002480 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 298.9 bits (764), Expect = 3.2e-77 Identity = 221/634 (34.86%), Postives = 278/634 (43.85%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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