Tan0001582 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0001582
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG01: 7451051 .. 7455385 (-)
RNA-Seq ExpressionTan0001582
SyntenyTan0001582
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGACTGAAGCGTCTGAATGGGCTGCCTCTAAGCTCAATGTAAGCACAAAAATAAAACGTTCTTTGATTATTTCCCTCTATATCAGGCTCAATAATGACGCTCTCCTTTCTTGTTCATCATCTTTTTGCCTTCATAAGTTGAATCGATAAATTACTTCCGTTAGATATTTATCACGATATTCAAATAAACTCCCTTTTGCTGGTTATGGCAGCGGAAGATGGATATATTGAGGTATAAATATCGTTGCAGGGAATCTTATTTAGATTTAATCCATAGGTATGCAATTCATTTGTGTTTCTCCTTCTCATTAATTGTATCTTCATCAGTAATGCATGTTTTTTTCTGTTTTACATGCTGAGGCCACCAATTCTATTTCTTGTGACACAGGCTTGGACAAGTAATCATTAAATTAGAGAAACAACGAACACCTATTGTTGAGATTCTCATCAGGTAAGCTAATTTTGTTTAACAATTTCATTATTCATATGACAGTGGTTAACTTTCTTAAGCTTTTGTCATGTATTGTAGACGAAGAGGCTGCATGCTTATTTTGTTGCTAATAGGCCTTGGGTAGAAATTCCATACATTGAAATATTGGTGGTGTATTTTCACATCGAGCGTCGTTATTCGTTTGGTCAAATTATTTCCTGCATTTGAGATAAAGTTCTCTAGTCAAATACTACTTTTTAAGTATATATATATATATATATATTGATAGCAAATGAGGTTGAACTGTTAGGTCGATATCTTCTCACAATTGCTTTTATAACACCAAGGTTGCAGTTTGTGTTGTTGCTTAACTAACTATATTGAGAAAGTGAATTTTTTAATTATTTGTGAACTTTTGAATAATTGATTTTGTTAATGCAATGTAAAAAAACTTATTATGTATACATAATTAGGAAACAAAACAAAGAATTAGGGACCTTGTTGTTTTATTATTAAAGCAGAAGTCTGACTTGTTTTCTTTCTTTTCAACATCAATATAAATTTGTATTTTTAAAACACAAGAAACTGACTGCTAGATTCTCTTTCTTTTTGAAGCTTTGACACGTTCAAATCGTGTCAAATACTGGATGTGTGTGTGAGTTCGAACTTACATAATAATAAAGCGTATCTTTGGCTGCCATATATGCAATACTATGGTTTTTTTTTTTGCATCTCCGGGCTCCTTATAGCCCATCCATTGGTGTTGTGACCCAAGATAGTTTGATGGGGATTGTTATTAGTTATTAACCATTCAATCCATTTTTAACCTCTCTCGCAAGTTTGGATTTAAATCTTTTTATTTTTATGTCCATGCTGATGTTTCGTTTTCACCCCTAGATTGCAAAACATTCTTCTAAAAGTTTGAAGGAGCTGCAAGAGTCTCAAAACTTCTACAACAGCCGTTGAAGGGGGAAAAGGGAAGAAAAAGTTGCAGAAGAGACGCCTCCTACAATGAAGCTGAAGAATATTGTGTTTTGATTTGTAATTTATCAAACAAATTTTTATGTCCAATGGTTTGTTTTGATGGTTTGGGAATTGATAGTGTTTATATTTTTTTGAGACTGGAATTATTAGTATTTTTGGTATATGATTTCTTATTCTTTTGAAGTCTATGAAGTGGAGCAGATTATATATGATTAGTCTTTGCCACAGGTTTTCCTTAGCGACATGAATTTCAGTGCTGGATTTGGGATCACTTCAAAGTTCAAAGTTATTCATACATATAGTGGTGGTGTTTATCAGGTCTGTTTGTCACCTGTTTATGGTAAAAATCACTTTATATTTTTTATGAATAAAAGTGTTGAAATCAATGAGTAAATCACTCTTTACGTGTCTAAAATCACATTTTTACTAAAAGTGTGATGTTTGACAATATTAAGTAAGTGATTTTGGAAGAATCCAAAATCATTTGAAGTAATTTCCTCTCAATCACTTGGGAGGTGATTCTCAAATGTTTTTTTGTTGAGTGATTGTAATTTAAAAGGATTATTATTTCATTTTTGGAAATAGTATATTTTTAATGACGGGTAAAAATCGTTATCTTTTGTCAAAATTCATAAATTTTCATAAAAAAATGAATTTTCTCAAAACCGTCTTATTAAGTTCGGTCGTCATTGTTAATAAAATGACAATTTTCTCTCTCTAAAATTTTTATAATATGTATCTTACTTTATTATATTTTTTGGTTTTAATTCATATTTTTCACTTTCTTTTTTCTCTAATGGTTTTAATTCTTTTTTATTATTTTTTTTATTTTGAATGTTTTTGTTTCTCCTATAATTTTCGTATCAATTTTTTCTCTCTGGCTCTACTTATTTCTAACTCTTAACTTTTTTCTAATCATTTTAGTTTTTCTTTCTAAAATTTTGATCATCTTGCCATTTTTTTTGTTTATCTCTCTATTTTGAGTTTTACTCTCTTTATTAAAAGTCTCTCTTTAAATTTTTTGTCTCTTCCTTTAAAATTTTTATCTCCATATTTCTAATTTTTATCCATCCAAATATTAAAATAATTTATAACTAAATACTTTTTAAATAGATTAATCATAATTAAATCACTTAGCTTAAAACACTATGTTAAAGTTGTTTTCCAAATATGCATTTTAAAAATCACTCAATTGTATAAAAATCACTATTAAAAGTGTAGAACTAAATATGAAAATGATTATATAGAAATTACTTTTAATAAATCAATTACACTAAAATAAATCGATATATTTGGTACCGACGAGTGAGTCATATATGAGAATAAGATAAGGAGGGAATTAAAAATTTTAACACGGGCCCATTCAAGCTCTTCTTCATTCTCATACTTACCCTATATTAAACAGAAACGACTCCTATGGATAACTAGTCCTAAATTGTCAGGCGACCTTATTCTTCATTTTTCGCCTGAGACGACACCTATGGATAATTAGCCCTAATTTGCCGTACTCAAGTGACCTTATTCTTCATTCTCTGCCTGAGACGACTCCTATGGATAATTAGCCCTAATTTGTCGTACTCAGGCAACCTTATTCTTCATTCTCCACCTGAGACGACTCCTATGGTGGTTAAATTGTTTTTGATTTCCTACGAAAAGAGAAATCTCGAAGTGAGATACATCAAGAAGATACTTAAATTGTTCAAATTCCTAAAATTTTAAAAACAGAGTATTGAAAACGTAGCCAACGGTCGCCACTCTTGGGGATTGTCTTGTTGCTTCGTGTCGATGTGAGAGGATTTTTATAATTAAATTCCAACAATCAACAAAAATTTGAAATTTTTAATGCTTCGGTAGTCAGGATACCGTTGCGATGAACATGGCACTTCTACCGTTGGGATTCGCCATACTCCCGACGGACCCGTCGGAGCCAACGACGGAGGAATTTTTTGTAACTAAGTGTCACATATGCTGCAAACCAGAGACAGTAGTGTGGACTAATGTCTGAATTTTTGTTACTAAGTGTCACATATGCTGCAAATTAGATCTTTTTAACTAAATTTGTGATAATTTTTTAGTTACAAAATTTCTTAAGTTACTTCTTTTATTAGTTAGTAAATTTCTGCTTTGTGTGTGGACTAATGTCTGAAGAATAATATGAGTTTGGTATAACAGGCTCTTGCAGATGCTTCTAGTAAAACCATGATTATGAAGCTATCAAATTGTTGGAATAAGCGTCACCGGTTATGTTCACCAAATCCTGGGCTTTTGTTATGTTCTGTTTTGTTCATATTGCAGGGACAGTGGTCAGCTTGACCAAGGTCAGCACCTTTTAAGTCTTATTGTTATCATATTTTTCTTATGGCAACTGGTTTTATAGTTCTTAATCTATAATTCCATCTAGGGAATCACCTTACACCTAGCATTATGGCGTGGAATCCAAGTGGTGAAAAAGCTTCCACGGATGTGCTTTTAGAGGAGGACAGAGTGTAAGTGACTTAAGTTCTAAACAAAACTATTTTTCAATTGCAATTGCAACCATTCATCTCTGGACTTAAATCTGTCATAACTTTTTCTATGGGGGTTCAGGAACTCTTCTATTGATGAGCTTGCACTAATTGAGAAGATTTGACGTCCTAAAGTCGTTCAACTTAGTGGTGCTGTGACTCAAAGTAGTTCGATGATGATTGTTAATGAATATATGCCAAAGGTATTTTCACCTCACTTGTTGACCACTCAATTCATTTTAAACCTCTCCAATAGTAGTTTTCTAAAAAATATAATAGAAAATACTTTCTCCAGTTGTTGGTCTTATTGAGAAACTTTAGTTGAAACCAATCTCCATTTTCCCCTGATTTCATTTAAATTTGAGTTGCAGGGAGGTCTTTGTCAACAGAGAAAAAGAGCATCAAGATCAATTGTAG

mRNA sequence

ATGACTGAAGCGTCTGAATGGGCTGCCTCTAAGCTCAATCGGAAGATGGATATATTGAGGCTTGGACAAGTAATCATTAAATTAGAGAAACAACGAACACCTATTGTTGAGATTCTCATCAGGGACAGTGGTCAGCTTGACCAAGGGAATCACCTTACACCTAGCATTATGGCGTGGAATCCAAGTGGTGAAAAAGCTTCCACGGATGTGCTTTTAGAGGAGGACAGAGTGGAGGTCTTTGTCAACAGAGAAAAAGAGCATCAAGATCAATTGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGACTGAAGCGTCTGAATGGGCTGCCTCTAAGCTCAATCGGAAGATGGATATATTGAGGCTTGGACAAGTAATCATTAAATTAGAGAAACAACGAACACCTATTGTTGAGATTCTCATCAGGGACAGTGGTCAGCTTGACCAAGGGAATCACCTTACACCTAGCATTATGGCGTGGAATCCAAGTGGTGAAAAAGCTTCCACGGATGTGCTTTTAGAGGAGGACAGAGTGGAGGTCTTTGTCAACAGAGAAAAAGAGCATCAAGATCAATTGTAG

Protein sequence

MTEASEWAASKLNRKMDILRLGQVIIKLEKQRTPIVEILIRDSGQLDQGNHLTPSIMAWNPSGEKASTDVLLEEDRVEVFVNREKEHQDQL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0001582.1Tan0001582.1mRNA