Tan0001287 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0001287
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG09: 2794659 .. 2797085 (+)
RNA-Seq ExpressionTan0001287
SyntenyTan0001287
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGATGCAGCGACCAAGTGGCCCTTACCGGTAATGACGTTTATGCAACCGCCACGTGTCCATTACTCTGGACGTGGCTGTACTCTCAGCAATTCCGTGTGGAGAAATTATAGGCTACTTTCGAACTAATGTAGGTCCTTCCCTTTCTTGGTCGGTGGCACTATGACGGTGGTTAATCTGGACCGTACATTTTTATTCTAACTTCGATTAGATTAACACATTTTGGTCCTTTTACCTTTCTTTTTGGGGGAAAAAAATAGAAGTTGTATAAATTTAAACTTCAATTTAATAATTGATTTCATTTAAAACTAACTTAAAATTATGTAAACAAAACTATTTTTCTCTTAAATTTCCAACAAATTAGTAAAATAAAAAATTATCGTCTAATTCTTTCTAAATAAGTAGATAAAATAGAAAAAAAATGAAAAGTTAAAAAAACTACTTATATGAGTGACACAAACATTTCTCTCTAATATCGTATTAATCCCTACGTTTAAAGAAGTTTAGATTTAAAAATTATATATTAATAGCTTTAAAAAGAAAGGCTAATAAAAGGTCTAAATTAATTGTGAGGTTTTAAGTAATACAACTCCTAACTCCTAAATTTAAAGATATAAATTAATTTTCTCCTTTCTTTTTATTATTTATTTTACAAGAAATTTAAAAGAGAATTTGAACCTATGTATGTCTTATTCTCAGCCAACTTCATCGTAATTTAATTAAAAAATATATATTTTATGAAAATGTTGGAACAAACTTTGAACTTCCGTTAAACTAAAACCAAACAAACTTTTTCACTACAATTTTTTTTAAAAAAAGAAAAAAATTATCTTTTATGTAATTATAAAGTGAGTTGCATAGTGTATAAGTGTAGCTCAAGTTTTGTCTCTAAAATTTTTATTAAATTTTATTTTGGTTCTCAAGTTTTAAATATTAACTTTTAAGACCAATGCATGTATTAATTTATCAACGCAGGTACGTATTGAAATCATATAGATAAAAAAAAAAGCCGTGTGTAAGCAAATATTTTTTTTTAAGAGTGGACAGGTAAATATTAAATGATAACCTGAACAAAACTTAAGTGTTTTAATTTTCGTTCAACAAAATAACTTAGTGATTAAGAAATGTTTCTTGGTGAAAGTTAGGATGATTTAACGGTAACTGACATATACTATCGCTCTTAAAGTCAGAAGTTTGAAATCTCAATTTTATTTATACTAATTAAAACATATATTATAGACGAAAAAAGAGAATTCTCCTTTCACACACACATAGTTCAACAACATTTAGAACAAAAGAATTTAAGGGTTTGTTTGATATGTCATCCGAATTCTATTTTATGTTTTTGGATTCACTGAATTCAGTGAATATGTGTTTGACAGACGTGTTTTCGAAAACTGTTTTCGGATTCTAGGATTCAAATAGTAGAAATTCTAAAAACTAACATTTTTATGTTTTGATTGTATCCAGATTCTGAATTTAAAATTTTAAAATGCAGAATAATATTAAACAAAGATAAAATTCTTAATAAATACATTATTTCATGTTATAAACTTAATTTACTTTTGTTTTATTAAAATATTATAATATAATATATTATAAAATATAAAATATTATATTATAAAATGATAATTCTATAAAATTTATAAAACCATGTTCATAAATTAATTAATAATGATTTATATTCAATCTAATAATTAGTTTGTAATTACAACTAATTTCATGATCGATAAGTATGTTATAGAACACACTTTAAATAACTATTTAGAATGAAATCAAATTTATAAATCTACTACCAAACACATATTTGAAAACATGAAATATAACTTTGTTTTCATTGAATCCATTGTTTTTAAATTTATGTTTTCAGATTATTTACCAAACATACCCTAAACTTCAGGGCATTTTAATCGAAAGTATAGGTCAATTATTACTGAACTACTCCAAATCTCCTATGCATGTAGTTGAAAGAACAAAAAAACTTTTCAATAATTTCTTTGATATTTAATGAAATTTTTTGAGATTTCATTTAATCAATCTATTAAAAATTTTAAAAATTTGTCGGATCTCCTGAGAATGATGTGGAAGAATGCAACAAAAGTAGCTAGATTTCATTCTCATACAATTGTGTTGAAATATATTCCAAAGATACAACTGTATTTATAGAGTAATTAAAAGTATACCAAATCTAAATCAAATAAAAAAAAAACATAATTTAAAATAGAAATTTAAAGTCTTTATCGGACTAAAAAACAAGGTGAGAAATGAATGCATGGCAGTAAAGAAAGATAAAAAAAACACCCGTAATTGAATGCTTCGTTCGTGTAACAGGCGCAATCTCAGCCGTCGATTTTCACGAACATCAAAGATAACACTTACCCTCAGGTTTTGAAATTATTTACAATCAGACCACGAAACTCAGAGTAA

mRNA sequence

ATGGATGCAGCGACCAAGTGGCCCTTACCGGTAATGACGTTTATGCAACCGCCACGTGTCCATTACTCTGGACGTGGCTGTACTCTCAGCAATTCCGCGCAATCTCAGCCGTCGATTTTCACGAACATCAAAGATAACACTTACCCTCAGGTTTTGAAATTATTTACAATCAGACCACGAAACTCAGAGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGATGCAGCGACCAAGTGGCCCTTACCGGTAATGACGTTTATGCAACCGCCACGTGTCCATTACTCTGGACGTGGCTGTACTCTCAGCAATTCCGCGCAATCTCAGCCGTCGATTTTCACGAACATCAAAGATAACACTTACCCTCAGGTTTTGAAATTATTTACAATCAGACCACGAAACTCAGAGTAA

Protein sequence

MDAATKWPLPVMTFMQPPRVHYSGRGCTLSNSAQSQPSIFTNIKDNTYPQVLKLFTIRPRNSE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0001287.1Tan0001287.1mRNA