Tan0000571 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATTTTGTTCTAGGATTGCCAAAGACTAGGAGACATCATGATAGCATTTTTGTGGTGGTTGATAGGTTTAGTAAAATGACACATTTTATTCCAGTAACAAAACAGATGATGCAACTAATATAGCTAACCTATTCTTTAGGGAAGTGGTTAGATTGCATGGCATTCCAAAAACCATTGTAAGTGATAGAGATGCCAAATTTTTAAGTCATTTTTGGAAAGTTTTGTAATCCCAAGATCTTTCTTTGGAACCTCCTTATTATCAAACAACAAAAGAAAGGAAGAAATGAGTGCTTAAAACTTGGGTTTCCTTGTTTTAAAAAGAAAAGTAATGAAGTGAAAGGCAAAAGGAAAACAAGGAAGGAAAAACATAAAACATTTTGGTTTGGATTGCTTTTAAGACAAAAGAAGAAAAGGAAATGAAACAAATGTTTAATATACTAAGTTTGTTTTGTCTTGCAAAGAAAAGATAAGAAAGGAAAAGATACAGAAAGGAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAGGGAAAGGAAAGGTGGACGGTGGGACCCCACATTTGTTTCTTTCTTTTTAAAAAGACTTCCCCCATCGATTTCTTCTCATTTTATGAAGTAAAGGCAAGGGTTTTCGTGAGAGAAGCTTAAAGGAAGAAGAAGAAGGTGGTTTTGGAGCTGGATTTGCAGAAGAGAGGGAGAGAACTGAAGCAATTAGTATAACAGCAAGGTAATCACTCTGCCATGTTCTGCTATTTTGTTCATCTCGAGCTCCACAGAGAGAGGTAAGAGTTGAAATTTTGTTTCGTGCAATTTAACTCATATTGGAACAAAATTCGTGAAGGATGCTCGAGCAAATTCGGATCTTAAGCTACTGATTTGTGAAGAGGAAGACAGAACACAGAATTTACTGTCAAATCCGAGAAGTCTCTGATGTTTTGGTTGTACTGACCTGTAGAGTTGGCATCAGAAGCTATATTAGGTATGGTTGGAAAGCTTATTGAATTTCCTACAACTTTCGTGAAGAAATCGTGAATAGAAAATGATTGGAAGATGTTGTAAATAGCAGGTCAAGTGTCGGGTTGCAGCAGAAAATCGAATCTGGAATAGCAGAAGTTAGTTCCTGGGAAAGAAGCTTCCGAGGTATTTCTGAACCAATCTATTGGGAATTTCAATTTCATGTCTTCATATGAGTTTTAGAGGATTCAAAAAGGAAGAGTTTGGTATAAATTTTACCCTGTTTGGCTAAGTAATGAAGAAGTTATGGCTGTCTGAATACAAGGCATAAAATTTGTTAAATGCTGGAATTTTTGTTGGAGTGTTTTCTTGTAGTTTTAAAGTTAAAACCATGAGCTCGAGGTTCTAAAACATGGTTTTGGTTTGTTTGACAGGCCAAGAGCGAATAGGTCGAGTGTACGGGTCAAGACTCTAGTTCTAACACTGTGAGTGACAAAACGAACTTCGAAAATGAGCTATATGCTTGAAAAATGCTTTAAGAAATGCAAGTTTTGCTAGAATGAATTGTTTCAAAGCTTTGTGTTTTATTTTTGAACACATGACTATGAGTATTCTTGTTTTCCTAGAAATGTTTCAAGTGTTCATTGTGACCCTAAAAGTCTTTATAAAGTTTATACATGAGCATATGTCCAATGGTTGCCAAAATTTATGGAAATGTTATGATTTCAAGCAAGCATGTACTAGCAAGTATGTTTTAAAGATTTTCAGTTTTATGAACAAGCTGAGTAAGCTTGAGTTTAATGAAAGAAAAGATAAGCAGGCATGTTGATATGAACCAAGGACCACCTATTGTCATGCCTGAAGGTCCAATTACAAGGTCGAGAGCCAAGAAGCTACAACAAGCTTTAATCACTCATATTCAAGCTATGGTGAGCTCAAAAGAGGAGGTTCTAGAAGATGTTGGAGTCTTTCCCTACATGTTGTGCAAAGTTGAACTTCAAGATGGAGACGCATTAAATGCATTCTAACTTGCACTTAATGAACTCATAGCTAAATTTATGGAACTTAAGTTTAACTTGGGTTTCACCTAAAAGAACTAAGTTGAACTAAAGTAACATTTAATATGGTGATGTTTGAACTGAAGTTGCATTCAATGAGGTGGAGATGGATTCAATGAAGTCAAGTATCATTACAAGCTTCATTCAAGACAAGCTAAGCTTCAATTATGGAACACAAGTTCAAACCATTTAAAGCTATGGATTAGTATTAAAATAATGGTTACAAGACAACACCTTTATTAGTTTTAAATGTAATTTCAGTTTTGTTTACCATTTAAGTTTGTTTTCAATATGGGAGTTGTGGTTAAATTGTAACTCATATAGGTTACTCTTTTCCCCCACTAACTAGCCCATAAAGTTAGTGTCTATTTGTCAATTAGGTTAAGGGTCTCAAAGGCTATATAAAGCCCTCTCTTCTTCCATTGTAGACAGAATTTTAAAGTGAATGAATTGAGTTTTCTTTTAGCTTTGTTGAGAGCTAAGTTTTCCTTATTGCAATTTCTTGTGTTTAGAATTTGCATGCTAGAGTCATTCAAGTGGTGTTGATCGTACCTCTTGTGGAGTGATTCGAATCACGAGTTTAGAAACGAGTTTTCTTTACTCTTGATCTTGATCATCAAGGTAATCCGTTCCAAACTTTTCCTTGGGTTGATTCCATGTCGTTTTGGGGTTTTTAAGTTTTAGATCTAAAGGTCTTGTTTTCTCAACAAGGTTGTTAGGTCTAATTCTTGGGAGTTACTTAACACATGTTCAATGTTTTCATGTGATTTTCTGAGATATTGAGCCCGAGGCTTTATGGTACCGTGTGCACACAGTGCTTTATTCGCTGTTGTCGACGTTGAGTGTACTCGTGACAACAATGCTACTGTCGTGAGTGTTGGGCGGGCCCCACTACGACAAAGACGATGGGAGTGCTGGGCGGGCCCCACTACATCGTAGAACAAAGTAGATTGTGACATGTTTTAATAAAGAGTTTATATCATTTACATACCTTACGAGATTTAAACGATATACTTGCTGGTTTTTCTGAAAAGCTATTATGATTACACGATTACTTTCAACACTTGATTACGGATGCATATGCTCATAGATGACCAGTGATATGATTTACGAGTTAGTAGTTTCCTTTAAACTCAAGTCACTCACTGAGCTTCATAGCTCATTCTTTCAGTGTTTTTCCACTTTTCAGGTAGAGATCGAGCTCCCGGTGCCTGATAACCTGCCTTAGTCTGCTGAAGCTTCACATGTTTGATACTTTGTACGTGGCTGGTGTTGTATAGCAAGTCCATATGTTTTGTAAATTATTTTGAGAGAGCTATGTAGTTATAGTCCTATGTGCTTTAGAGGTTGTGGTTGTTTAATTAGTGGTTTGGACTGTTTGTGGTTCTGATGTTCTTGCTCGTTTTAGTTTCCAAGAGAGACTTAAGAAGAGTTTCTCCTCATGTACGTCTTATAGATGTCCAGTTTCCGCTGTGTTAAGTTTAAAGTGTTCCTTATGCGAACATAGTTTCTTTTCAGGTAAAGTAGTGTCAGCAGGTATTGTTAAGAGGTAACAATGTCTGTTGGCTTCATGTCGTCTCCCGGGCTAAGTTAGCAAGTGTTTCGGGAGGGGGTGTGACAAGTTTTGTGGGGTAAATTGGGAACTAAGCTTTTGTTTTCTACAACTTGTCACCCCCAAACCGATGGACAAACCGAGGTGGTTAATAGAACTTTAGGGACATTACTTAGATCGTTAATTTCTAAGAATCTTAAGTCTTGGGAAGAGACTCTACCTTTTGTGGAGTTTGCATACAATAGAGCGATACATAGCACCACTCATTGTTCACCTTTTGAGGTTGTGTATGGATTTAATCCCTTAACTCCTCTAGATTTATCACCTTTACCACCTAATATGTTTTCTAGTGATGCAGCTGTTTCTAAAACCGAATACATAAAAAATCTGCACAAAGAAGTCAAGGAAAGAATTGAAAAGAAAAATCAGAAGCTAGTCACTCAAAAGAACCAAGGAAGAAAGAAATTGATTTTTAAGCCTGGGTGAATGGGTGCAGGTTCATCTACGAAAGGAAAGGTTTCCTGACCAAAGGAATTCTAAACTTCAACCAAGGGGAGATGGTCCATTTCAAGTATTAGAGCGGATCAATGACAATGCATACAAACTAGATCTCCGAGGTGAGTACAATGTGAGTTCTACTTTTAATGTGGCTGATTTGACTCCTTTTGATGTAGGAAATGAAGACGTTGATTTGAGGACAAATCCTTTTAAAGAAAGGGGGATGATGTGAATCAAACCATTGATCCATTGCATGTACCAAAGGAGCAATAACAAGGAGCAAGGCCAAGAAGATTCAAGAGGCTTTCACATTGCATCTCCAAAATCTCGTGAATGCACAAGGAGAGACCAAGATTTTTGAGCCCATAATTCTTTATAATGTTAGTACAACAAGTCAAGATGAGAATGGAGTGAAGATGGCACGAGAAAAGTTGTCTAGTTTGAAAGATGGCACGGAGGACAAAAAAAGTGTGCAGACAATGTGAACAGGTGGCTGTCTAGATTGCACCTCTTGGGATTTCGTGATGTCAAACCTCGTCAAACGAAATAGTCATGCATGGCGGATCCTACAGTTGATAATTAAGACCATTTAAAGCATTTCTATGTTTTTTGTTCCATATTTAGAGCTCTCAAACGTTGTGCAATCAAGTTTTAAACTCCTAGGTCAATTTTTTCTTCATTTCACATTTAATGCTTTTTAAAGACTTTTGGTCTTTGGTGCTTTGCACGACCATTTTGGCCTATTTAAAGGCTTGTATTGGCTTGGAAAAGGCAGAACCTTTATGAAAAAATCTTGTGTTTTGTTTAGCCCCATTTGGTGTTAACTTTCTTTCAAATCTTGCTTTAGGTTTGATGTTTAACCGATTCATTGGATTAGCCCCGATCAAGCTAATTCTGGAGTGAGTCGTCTTAGGATCTAGGAGTGACCATCCTTATTCTAA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ATGGATTTTGTTCTAGGATTGCCAAAGACTAGGAGACATCATGATAGCATTTTTGTGGTGGTTGATAGCTTCCGAGGTATTTCTGAACCAATCTATTGGGAATTTCAATTTCATGTTCTAAAACATGGTTTTGGTTTGTTTGACAGGCCAAGAGCGAATAGGTCGAGTGTACGGGTCAAGACTCTAGTAGAGATCGAGCTCCCGGTGCCTGATAACCTGCCTTATATGTTTATCAGTAGCGCAGGTCAACAGGTATTGTTAAGAGGTAACAATGTCTGTTGGCTTCATGCCGTCTTTCGGGCTAAGTTAGCAGGTTTCTCGGGAGGGGGTGTGACACAGCTTGTCTGA ATGGATTTTGTTCTAGGATTGCCAAAGACTAGGAGACATCATGATAGCATTTTTGTGGTGGTTGATAGCTTCCGAGGTATTTCTGAACCAATCTATTGGGAATTTCAATTTCATGTTCTAAAACATGGTTTTGGTTTGTTTGACAGGCCAAGAGCGAATAGGTCGAGTGTACGGGTCAAGACTCTAGTAGAGATCGAGCTCCCGGTGCCTGATAACCTGCCTTATATGTTTATCAGTAGCGCAGGTCAACAGGTATTGTTAAGAGGTAACAATGTCTGTTGGCTTCATGCCGTCTTTCGGGCTAAGTTAGCAGGTTTCTCGGGAGGGGGTGTGACACAGCTTGTCTGA MDFVLGLPKTRRHHDSIFVVVDSFRGISEPIYWEFQFHVLKHGFGLFDRPRANRSSVRVKTLVEIELPVPDNLPYMFISSAGQQVLLRGNNVCWLHAVFRAKLAGFSGGGVTQLV Homology
BLAST of Tan0000571 vs. NCBI nr
Match: KAA0060199.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold386G00120 [Cucumis melo var. makuwa] >TYJ95571.1 uncharacterized protein E5676_scaffold767G00770 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 1.2e-07 Identity = 40/87 (45.98%), Postives = 48/87 (55.17%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000571 vs. NCBI nr
Match: TYK14495.1 (putative polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 6.6e-06 Identity = 31/53 (58.49%), Postives = 37/53 (69.81%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000571 vs. NCBI nr
Match: TYK11725.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold304G00370 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 8.6e-06 Identity = 31/61 (50.82%), Postives = 39/61 (63.93%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000571 vs. NCBI nr
Match: KAA0066738.1 (DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK27886.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 1.1e-05 Identity = 32/61 (52.46%), Postives = 38/61 (62.30%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000571 vs. NCBI nr
Match: KAA0065516.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold638G00090 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 59.7 bits (143), Expect = 1.9e-05 Identity = 35/74 (47.30%), Postives = 41/74 (55.41%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000571 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BAD1 (Retrotrans_gag domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold767G00770 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 5.8e-08 Identity = 40/87 (45.98%), Postives = 48/87 (55.17%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000571 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CSJ5 (Putative polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold15G00060 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 3.2e-06 Identity = 31/53 (58.49%), Postives = 37/53 (69.81%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000571 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CJL4 (Retrotrans_gag domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold304G00370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 4.2e-06 Identity = 31/61 (50.82%), Postives = 39/61 (63.93%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000571 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DVW9 (DNA/RNA polymerases superfamily protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold384G00700 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 5.5e-06 Identity = 32/61 (52.46%), Postives = 38/61 (62.30%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000571 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VGQ5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold638G00090 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 59.7 bits (143), Expect = 9.3e-06 Identity = 35/74 (47.30%), Postives = 41/74 (55.41%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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