Tan0000454 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0000454
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG01: 62664516 .. 62670238 (+)
RNA-Seq ExpressionTan0000454
SyntenyTan0000454
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGATGGATCATTCTTCCTGTACTTCATACGAATCGTGTCTTGAGGCTACAACAGTGACTTGTGTTCAATCTCTTGATATCGAGGTGATGGAGAATTTGCTCCCATTTTGATTAAGATTGTCTTTCTTCTTTGTTCTTTTGATATAACACTTTTTTAACACGGTAGAGTAAGATTTTCTTATAGGGAGAGAAGTTAGCAGTTATAAGTTATAATTTCCCTCATACTAGTTTAATTAAGAAGAGAGATAATGTACCTACAGAAGCAGTAAGAATGGAAAAGAGAAGCAGAAAGCTTGAAAACTTACCAGGAGTTAAATCTAAAGAATTCAAAGTAGTACAAATTAATAGATAGGGAATTGTGGTGAGTGTATTTTACTCGATTTGGTTCAACCAAGGAGTTAGAGATATTTAATTCCCCACTAGAAATTGAGGAGAAAAATTATTTACGGTCTCTCAACAACATTTCGATATGGAAATTTGTATACTCCTAATAACCATTGGATATAAATTTGAAATAATCTCTCTCATACATCCAACGATTTAAAACTACTAGCCATATTGTAGCGGTCTCTTGAATAACATCTCAATCAAATTGAGATGATTCCTCTAGACTGAGAATCAGTGATTCAACTTTCAACATTCTTTTCTCTTATCATTCTTATCTCTTATTACCTTTGATTAATAAGAGAAGTATGGTGAGTGTTTTAATTTCACACTTAAACTTTTAACGATAAAAATTAAACCCTTGAAGTTACATAATTGTAAAAATGGGCCACGTTAAATTAAATTGGTTGTTATTAACGAATTTTGATAGGTTAAGCCTCATCCATTATAAGTTAGCTTTAAGTTCATTTTCTCTAAATTTTCCAATAATTGGGGTTTGATTCACTTGCTCAACTGAGAAAGGTTAGTGAATCTAATCTAAGTTGAAATCAGTATGAGTTTTTCTTTATATAATCCTTCATCTTCTTCACATTTTTTTTTAATTGTAATTGGTTTAGAGATGTATTCTAAACTCTAATTACGCCTCCTCTTCGTCCATCCTCATCAAGTTTCAAACATGATTAACTAATGATTTAATCCCATTAAATTTCTTTAATAATAACATATGAACAAGGAACTGTGGTATGTTTGATTAGTTAAGTCAAGCCAATTTAGATGCTTATAATGTAGGAAAAATTAAATGGTCTTTTAATTCAGTTTTTCTTAGGAAAAATGCTAGAAATGACCAAAAACAATGAGAAATTGCCAAAGATAGGACAAAATTAGGGGCATAAAAGAGATTTAGGACCTTTTTTAGTTTGGTAGAGTTTTAGGACTTTTTAGGGTATGAAATTACCATCTTACCTTGAACAGCGGCAAAGCAACGACCACGAATGACAGAGAACGATAATTTTTCGTCCATGGAATACCCATTAGATTGTCAAAGCACTGTATTTCAATATCATTAGATTCTCAAAGCACGATATATTTAATTAAATTCAAACTATTACTTGATTATAGATAATGAAGTATTTAAATGTACTTTTGAAACTTATGTGGTTTGATATTCGAGAGGACTTCAGAAGACAAATAGCGCTCTGTAGTTGTTCTTGTTGTTACAGAAGAATAGGAGTAAAGTCAAAACTCCAAATTGCATTAATGATTTAGTGGTACTCAATGGGCTCTAAAGAGTAAAGACAATAGTAGATTTATAGAGCTCCTTAGGAAGGAAATAAGAAAAGACTCAACATGAAATTGGTAACTATTATGAACGTGAAGAAGTGTGTCATCCTAATGTTTAGAAGGACGAATGCTATTTGGAACTAACTTGTCTACCACCATATATTTATATATAATATATAGTTTTATGAGCCATTTCATGTAATTGGGTTTGTTGTGGATTTCTGACTGTTGTGCCCCAGCTCATGCATATTTGAAGTTTGGTGGGAGGCTGGGAGGATTGATTTGATTAAGGAGTGTTTTTTATAGACATGTTTGCAATTAGGTCCATAAAATTTTTTGTAAAGTCCTAGTAGCGTTTGTCATTGATTTTATTCTAGTCTAGCTACGAGAAAGTACTAGAAACTTTGAAATCTTGTTGTAAATGTGTGCTTATCTTAAATATGTATGTTTATTCAATGTATTATATTCTAGGTACGAGAAAGTAATAGAAAGTTTGAAGTCTTGATGAAAATGTGGTTATCTTAACTCCAAATGAATCCTTTTAGGTTGAGTAGATGTTGTTTAAGCATTTCTTATGATGTATAGGCAAATTTTGCATGATTTCTTAGGTGCAAGAAAGGTGTGAGAAATACTTTGCCTTTCATAGGTCCATTTAGGCATTCATAACTATGTTTTGATGTTGTTTATTCATTTTCTTCTTTTTTTTATCTAATGTATTAGGGCTTGTTTGGCCCACTGGTTATTATTAACCCGTGTTATAATAACTTGTGAAATACTCTGCACCTCAAATACATACTATTATAACTCTAAAATATACTACTCTGCATTTTAAATAATATTATATGTTTCACAGACTATAATAACCCACAGACTATTATAACCCAGTCAGTGCTCCAAACAACCCCTTATAGTATAGGCACGAGAAAGTAGTAGAAAGTTTGAAATCTTGATGAAAATGTGGTTATCTTAACTTCGTATGAGTCCTTTTAGGTTGTGTAAATGTTTTTTTTGGTATATTTGCTTCGCCCCTAGAATTTTTAGTTAGTTTTTTTGGTGCGAGAAATGTGCGAGAAAAAAAATATAATGCAAAAGTAGTTTCCTTTCGTCCATATGGGTCTTTTTAGGTTGAATAAATGTTGTTTGAGCATTTCTTATGATTTATAAGCAAATTTTGCATGATTTCTTAAGTGCGAGAAAGGTGCGAGAAAAAAAAAATGTTAAAGTAGTTTTCTTTCGTCCATATGAGCCTTTTTAGGTTGAATAGATGTTGTTTGGGCATTTCTTATGATTTATAGGCAAATTTTGCATGATTTCTTAGGTGCGAGAAAAGTGCGAGAAAAAAACATAATATAAAAGTAGTTTCCTTTCGTCCATATGAGTATTTTTAGGGATGTTGTTTGAACATTTCTGATGATTTATATGCAAATTTTGCATGATTTCTTAGGTGCGAGAAATGTGCGAGAAAAAAAACATAATGCTATTTGGCCATTTTTCTTTGATTTTTGCATTTCATAGGTCCATTTAGGCATTCATAACTATGTCTTGATGTTGTTTATTCATTTTCTACCTTTTTTTAATTCAATGTATTATGGTCTAGGTACGAGAAAGTAGTAGAAAGTTTGAAATCTTGATGAAAATGTGGTTATCTTAACTCCGTGTGAGTCCTTTTAGGTTGTGTAAATGTTTTTTTGGTATACAAGCTTCGCACCTAGAATTTTTAGTTAGTTTTTTTGTGCGAAAAAAAAAACATAATGCAAAATTAGTTTCCTTTCGTCCATATGGGTATTTTTAGGTTGAATAGATGTTGTTTGAGCATTTTTTATGATTTATAGGCAAATTTTGCATGATTTCTTAGGTGCGAGAAAAATGCGAGAAAAAAAACAGAATGCAATTTGACCATTTTTCTTTGATTCTTTGCATTTCATAGGTCCATTCAAGCATTCATAACTATGTTTTGATATTGTTTATTCATTTCCTACCTTTTTTTTATTCAATATATCATAGTGTAGGTACGAGAAAGTAGTAGAAAGTTTGAAATCTTGATGAAAATGTGGTTATCTTAACTCCGTATGAGTCATTTTATGTTGTGTAAATGTTTTTTTTTTGGTATATAGGATTTGCCCCTAGAATTTTTAGTTATTTTTTTTGTGTGAGAAAGATGCGAGAAAAAAAACAAAATGCAAAAGTAGTTTTCTTTCGTCCATATGGGTATTTTAAAATTGAATAGATTTGTTTGAGCATTTCTTATGATTTATAGACAAATTTTGCATGATTTCTTAAGTGCGAGAAATGTGCAAGAAAAAAAGAATGTAAAAGTACTTTCCTTTCGTCCATATGAGTCTTTTACGTTAAATAGATGTTGTTTTAGCATGTATTATGATTTATAGGCAAATTTTGCATGATTTCTTAGGTGCGAGAAAAAAAATATAATGTAAAAGTAGTTTCCTTTCGTCCATATGAGTGTTTTTAGGTTGAATAGATGTTGTTTGAGCATTTCTTATAATTTATAGGCAAATTTTGCATGATTTCTTAGGTGAGAGAAAGGTGCGAGAAAAAAAATAGAATGTCGTTTGACCATTTTTCTTTGATTTTTTGCATTTCATAGGTCCATTTAGGCATTCATAACTAATTGTTATATTGAATGTTGTTCCTTATATTCAATGTTGAATTGTTCTTCATTTTTAAATTCTTATATATTAATGGCGATAAACACCTCTTCCAAGTACTTGATAAAGTCATCAGCTCATTTACGAGCTCAAGTGACAACCAGATAAGTGATTGGGAAGACAATTGAGAGTATAAAATCGAAGCTCAACGCTGCCCAACAAGAAATGTTTAGAGCTACCCGCTTAGCCCATTTCTTAGATGTTGACCTTACATTCAATGAGTAATACATCCACTACCTTTTATTGAGAGGAGTGGGGGAAGAGAAGGTTAATTGCATTACCTTTAAGGTAGGAGGAGAGATTGTAACTTTTGGACGGAAAGAATTTAATATAGTTACAGGTTTGTGGCCTAGTTTTAGGATTTGTTCTCGACCACAAAAATTAAACAATAGAATTAGAAAAATATATTTTGGGGATAGAGCTATGGTATACTCTAATGAGTTGGATAACGTCTTCATGAATTATAAAGGTGACGACAATGATTGTGTTAAATTAACTTTAATATACCTCATAGAACTAGGGTTGTTGGGGAAGGAAAAGAAACTTAAAGCAAACACGACATTATGAGGATTTGTTGAAAAGAAACTTAAAGCTGAGACGACATTATGAGGATTTGTTGACTATTGGGATACCTTCAATAGTTATGACTGGGGTTCTCTCATTTTTGAA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mRNA sequence

ATGATGGATCATTCTTCCTGTACTTCATACGAATCGTGTCTTGAGGCTACAACAGTGACTTGTGTTCAATCTCTTGATATCGAGGTATGGGCGTACGAGTCTATATCAACCTTAAATGGTGTTGTCCCGAAGAAAATAAGCGACGATGCTATCCCCGTATGTTACGTTGGTCTTGCTTGCAATTTCTCTCCTCCAATATCATACATAGTCAGATTAAAATTAAACGTTTCCTTGACGGTGGATGAAAAATTATTTGCCCAAGATGGACTACCTCTTCAACCTTGTCTACTATCTCCCAACGTTAAATCAATCCAAATATTGAACATTCCCATTGAGGATGTGATCGACGAAGGAGTACAAGCAAAAACAACAATTAACAACCTCAAAGAATCTACGAAAGACTGGAAGTCTAAACCCATGTCCTCCAAGGAATATAGGAAATTAAAAGTACAAGTGAGGAACTTAGAGCATGAGATGAAGATTGTGAAAGGCGACATGAAACTTATTAAGGGGATGTGGCAGAGATGA

Coding sequence (CDS)

ATGATGGATCATTCTTCCTGTACTTCATACGAATCGTGTCTTGAGGCTACAACAGTGACTTGTGTTCAATCTCTTGATATCGAGGTATGGGCGTACGAGTCTATATCAACCTTAAATGGTGTTGTCCCGAAGAAAATAAGCGACGATGCTATCCCCGTATGTTACGTTGGTCTTGCTTGCAATTTCTCTCCTCCAATATCATACATAGTCAGATTAAAATTAAACGTTTCCTTGACGGTGGATGAAAAATTATTTGCCCAAGATGGACTACCTCTTCAACCTTGTCTACTATCTCCCAACGTTAAATCAATCCAAATATTGAACATTCCCATTGAGGATGTGATCGACGAAGGAGTACAAGCAAAAACAACAATTAACAACCTCAAAGAATCTACGAAAGACTGGAAGTCTAAACCCATGTCCTCCAAGGAATATAGGAAATTAAAAGTACAAGTGAGGAACTTAGAGCATGAGATGAAGATTGTGAAAGGCGACATGAAACTTATTAAGGGGATGTGGCAGAGATGA

Protein sequence

MMDHSSCTSYESCLEATTVTCVQSLDIEVWAYESISTLNGVVPKKISDDAIPVCYVGLACNFSPPISYIVRLKLNVSLTVDEKLFAQDGLPLQPCLLSPNVKSIQILNIPIEDVIDEGVQAKTTINNLKESTKDWKSKPMSSKEYRKLKVQVRNLEHEMKIVKGDMKLIKGMWQR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 145..165

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0000454.1Tan0000454.1mRNA