Tan0000064 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTAAATTATTAATTAGGACTCAAATTTCTCCACTTTCTTCATCTCTTCTTTTTCTTCTCTCTCTCCTTCTCTCCCTCTCTCCCTCTCTGAAGGAAGTGAAGAATTAGTAAGGCCTCCATTGCAGTTGCAGGTACTTCCTCTTCTTCATCTCATATTTAATATTAAGAGCATCAAACATAGTATGAATATCTTTTCTTCTAATCTTCACTTCAGTTTTAGTTTTAGGTCTCATCTGCTTCTTCCCAACTTACAAACTATTTGTTACCAAAAAGTGGCCGATCCAAAATTTTATGTCTAGGAGTTTGATATATTTTAATGTTAGTTGGCTTTGTAGGTTAAAAAACACTCGTCCCTAAACTTACATGGACTTAACAATTTAGTCTTTGAACCATGGATCATAATAATCATTCGATTTTTAGTTTTTTATTTTTAAAAATTAAGCCTATAAATATTATTTTCATCCCTAGATTTTTCTTTTTTTTGTTCACTTTTTACCTATTTTTTAAAAAACAAACACAAATTTTGTTTTTTGTTTTCAACCTTTGGTTAAGAATTTAGATTTTTTTAAAAAATTATGAAAGTCATTGTAAAAGAATTATAAAAAAATGATGCGAAAACAAAAATATAATTATCAAACAGGGTCTTTCTTATTATACTTTTATAGTAATTTAGTACTTAAACTTTAGTATATAGCAATTTAACCATTGTAGTTTAAATTTTATAACAATTTTTACTTGAATTTCTTCAAAATTAAGTGTCAAGTTTTATTATATAGTGATTTAGTCTTTGTTATTTATGAACATATTTGGTTCCTAGTATCGATGGACATGAAATTTTGTTAAATCTTAACAATATTTTACAATAGAGACTAAATTCTTACAAAATTAAAAGTATATATAATAAATCATTACAAAAGGAAATTTGTGGACTAAATTGTTATTCAGAAACTTAGATGGTTTAAATCTTTTTTATATAAATAAATAAGAAAGAGAATCAAATTTAAAATAATAAAATAATATTTTACTGTATAATAGTTATAATAGATTTTAATCTTTTCTTTAAAAATATCAATATTCAGTTTCATTTATATTAAACCAAAAAAAAAAATTGATCATTTTATTAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAACGCTAAGGGGTTTCTTTTTAAAAAACAAAACATTATAAGACAAAAATCACCATAAAAGGAAAAAAACACTTAATGCATTTTCTTTAAAAAAAATATTAAAAAAAACACTAACGACAATTGAAAAATTAGCAAAATGAGTATAAATATTGCAAATATAGTACATTGCTAAAGTATTTGCATGTATGACAAATTTTGATTTAAATTACTAAAAAGTTCATGCACATGCCTTTAACCCAAATGAAAATTGTGATCTATCTTCCTTTATTTGTTCCTCAATTATCTTTGATTTTTTGTCATTTTTTTTGTGATTTCTTCTATCCAACATTTAGTCGTTCGACTAAAAGTCCTAGGTTCAATCGATGTCCAACATTCAAATTTTTCTATAATGATTGGAGTATACCACTAATAGACTTCAATCGTTGTCTTGTGATAGAAATCTATCAATGATATAAGTTTATCACTATCACTGATATACTTTTATATATATATGTTGTTTCTCTTTTTTTTTTTAATTGAAGTTTATTACTAATCAACTTCTATCGTAATCAATGGGAGTAGTGCGTGTTTGAAGTCTATCACTGATAGAAAAACATATATTTTAATTGATACAACTATCTGACTTTAGAATTTTGAATGTTGAAACAACTAGAATTAATATAAGTTAATTTTCATCCTTGAATGAGCTAGGGTGGGTGATTGGAGTTTATCACTAAAATGTTTATTTCATATATGATGATTGTGATAAGATTCTATCACTAATAGAAGTTTATCACTGATAGACTCATGACTATGATAAAAGTCTACTAGCATACACTGCAAGCCTTACTTCAGTTATACAGTCTATTAGAAACTATCAGTGATAGACTCATGATTATGATAAAAGTCTACTAGCATATTACTAGAAGCCTTACTTTAGTTTTACAACCTATTAGAAACTATCACTGATAGACTTCAAATTGTGATAATAGTCTATCAGTGATAGGATAACCTTGATAAAAATTTATTCGTCTACTTCATGTATTACATTCTTTCACAGTCTATCACTAGTAGACTTCTAATTGTGATAAGAGTTTATCAGTGATAAAAGTTTATCATTGATAAAATCTTAATTTTGAATAAGAGAGTCTATCAGTGATAGAAGTCTATCACCAATAGAATCCTAACCATGATAGTAGTCTATCGGCCTACTTCAAGCCTTACTTCAAAATTTCATTACACCACATTCAATCATTCTTAAATTTCTATTTGTGATAGGAACATATTAATGATAAAAGTTGATCATTAATAGACTCCTAACTGTTATAAGTATCTATTAGAATCACTTCAATTCTTCTGATAGAGTTCTAACTGTGATAAGAGTCTATTAGGGATAAAAGTCTATCACTGATAGATTCTGAACAATGATGAAAGTCTATCAGGAATAGAAGTCTATCACTAATAAGTTTTGAACAATGATAAAAGTCTATGAGGTTTCAATCAAAGGTAAAATGGAAATTATAAAACTTATTTAAAAAATTTTCTATATTTGATTTTAAAAAAAAAACTTGTTATATTTATAAATAAGAACTCATATTTTACTACCCATTACAATTTTCCTTTTTATTATTTAAAAGCATCACATTTAGGACAAAAGCCACAATAATTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAACCCTTATGCATGAGCAGGATTCAACTTGTACACTCACAATCAAGAGTCAGAGGGGCTGATCAAATATTCCATTATAAAACAAATATGTACTAATATAAATTTTTCATCAAGTTCAGGGGAAGTAGCCCCACCCATGGTTAGCGAGATCTTTGTTTTCACTCTCTCTAACTTTTACTTTCTTTAATTTTTTTTCTTTAAATTTTTGTCAATCTCCCCTATCTTTAATTTTGTCAAAAATTTTTATATCAACTATGTTTTTTCTCATCAAAACTTATCTTCTCTAAATCATTCTTAATTATCGCTTGGAACTTTGATGGGCTAGAAGTACTTTTTCATCTTCTTAAAAGAAAGGGAAAAAAAACTCAAAACATATATAAACTAGCAAAATTTTAAGACACGTTACCAAAATTGAAAATTTAAACATATTTTTATTTTTATTTTATGACTGCATTTGGAATGTAGCTTAGTTTCTTTGATTTTATTTATTTATTTTATTTTCGGTACTTGAGTAGAGTAACCAATGGAATTTTCAGACTGATTTTCTGGGTGTGAAATTAAGTACACGAGAAAACGAGGTTATGCTCTCTATATTGGTATTCACCTCTATCGTAGGGTATTGTATCTATACACCTCATACCCTTATTAGGGTTAGTAACAAAAAATCCGACAAGTCAAAGACAACAAAGTTCAACTAGCATATAGAATATATTAATGACGACGAGATATGTCGTTCGAATCTCCAAATCCTTATTGTACTAAAAAAAACTAAAAAAACTGGCGAGACAGTAAAAGAATATTTAAAGGACAAATGTCACAAAGATAATGAAGGAATGCTCAAATGACAAATCTCATCTTCCAATAGAAATTGTTTGCTCATAGCTTTGACTTGATGATTCACTATCTTTCTCCTCAATATCTCCCCTCAAATGAGAGGGTGATTCGATCCGCTCAAGTTTGGACCGCAAGTAGTAGAATTGAGAATGTGTAAGGGGTTTGGTGAGATAGTCCACCAATTTCTCGGTTGATGGAATATAGTCGTACCTTAAGGGAACAATTCAATACTTTGATCACGTATGAAATGAACATCAATTTCTATATGCTTCGTATGGGCATGAAAAACAATGATTGACAACCAGAGTCCTGCACTTAAGTTGTCACACCATAACACAGGAGGACAAGACAAGGGAAATCCTATTTCAGACCTGAGTTATTTTAACTAGATGATTTCATCTGAAGCATGAGCCAACATGCGGTACTCTGATTCAGTACTTGATTGAGCCACTATCTTCTATTTCTTCGAATACCAGGACACTAGAGTGTTACCAACAAACACACAATATACTGCAATCAATTTTCTATCATCAAAGTTTGATGCCCAATCAACATCGAAGTATGCATAAATGGATAGATCAATACTTGGTTGAATCAGCAGACCATAACTTTGTGTTCCACTAACATAACAAAGTAATCTCTTTATCGCCTACCAATGCTTATCTATGGGGTTGTTTAGGAATTGACTTAATTGATTGATGACAAAGCTAATATTTAGTTGAGTATTTGTTAAATATTGTAGAGCTCTAATCATACTTCGATAGATAGAATGGTTTGGAAGTGGATTACCATCTTTTAAAGATAATCTCTTCCCCAACACACATGGAGAAGGAGCAAGATTAAGATCAATAAGGTGTAGCTTATGCAACAAATCTTCTACATATTTTACTTGATTCAAGACAATCCCATATGGTGAATAATGTACTTGAACACCTAAGAAATAACTCAATTTACATATCTTTTAATTCAAACTTTGTATCAAGCTCCTCAACTAACCGATTAATTAACAACTCATTACTGCCCGCGACTATCGCATCATGCACGTATGGTAATAATAGAACAATAGATTTTTCTGGTCGAAAAAATAAATAGCGAGATATTTGACCTAGAGTTTTGAAATTCTCAAAATAGAAGTGCAACTCTGCGTGTGTTACACCAAGCACACGGAGCTTTTTTCGGCCATATATAGCCTTATTAAGTTTCCAAACATAATCAAGAAATTTAGAGTTCACGTATCCGAGTAGTTGACTCATGTAGAGATCTTCATATAGTGTGCCATTTACACCCTAAATACTACACAGATAGTCAACGCCTTGACAATAGGGCTAAAGGTCTCAAAAAATCAATTCAAGG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MDVIISIVAKIAEYGVAPIGRQVGYIFLYNRNIKDLKVRHQDLVDARKEVQHRVDEEKNRGCEIEPVVSTWFRRVDDTISKPPNIIIMSQENYESGFHNPSCFNLLQRYQISRNATKKGKEISELLATKDKFQSVGYPVPLSGIGNSNMPENYQFLESRTSMAKQIQDALSNPDFNRVGLFGMGGVGKTTLLDEVEKLVVLEDKLFNQVIKVTIGQTLSVEDIQAQMGDKLRLDLRMAETKQGRADLLRNKLQVGNKILIILDDLWNEFDFAEVGIPCGSKLSEKGSKILITSRKRKVLTNNMSIKVCFELNPLGKEDSWKFFSSIVGEFDDFAIEQVAKMVAEECGGLPLALDLVAKSLRGEKIEIWKDTLNRLKNPMATKIPDVTDLLYSSIKLSYDHIKSRETQLLFLLCSVFPDDYEIPIKNLQMYAMGMGLLNNINNWCEARNRVIMLVDNLLSCSLLVKSKNSRNQYVRMHDVVRDIAIHIAWSEEANMRGLTLGYTHIEWTEKDRRGSFRAIYGNITNFHYLPQNLEFHNLELLILRGSPPWNSPFETELQISNTFFQRMEKLKVLDLRMMHFQESRISLTHALMENLQIFCMDSCGAKDIDIIGELRNLQVLRISYCSITYLPSTMGKLVELKVLEASNCKDLDVIPPNIFYSMTKLEELDLSSGFRRWGEKVSYKNKLIKNVTVEELKDLPHLISLKLDILDERMLQDLLFLEKLKLENFCLRVGERDSFRMYLRQLQLSRTLVITIGPEVDIIDRVFGALWQNCECLSIKATSGALTNFRFKANEKGLPCLSLANPENDDPLFDDKVTFSELKILKIVGGNNSKMVWDDHGLIGNSFSKLQTIELSNFNSVRYILHSNVATALVSLNSLSIEACESVESIFEVEEPSFKQKENVKVMALKTLNLKGLLSLKCIWNKDGSAFFSFPNLQEIKVFDCPQLQSVFPATFITHVQKLEILNIQYCSKGVPLQLFSEDKTSKLVFPEIVFPSLTELRVGPMATTESVWFRSAWFPRLQNLILNYDNNEDIIEFPREINKIFYNCESVDVHYVCGLVQLFPNEEDSERSSCAKLKQLNLYSLHKLTHVWTDDSSGERLMLDNLEGLCIRECGELKCIAPPSITTTFLNLKYLQVSGCHKLSNLLIISSSTLAKTLVEIRIDDCREMTTMTRIFAEDKHEIVVFSKLEFLGIKNLPKLESFYPGKCKLVFPCLRELEVDECPIMKMFSHGTVSTTKLEQLRFNSRQVLSHTKHDINDIFQDIWWRSQIRSIRSYLSTQTE Homology
BLAST of Tan0000064 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O81825 (Probable disease resistance protein At4g27220 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g27220 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 225.3 bits (573), Expect = 3.9e-57 Identity = 230/944 (24.36%), Postives = 432/944 (45.76%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T048 (Disease resistance protein At4g27190 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g27190 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 224.9 bits (572), Expect = 5.0e-57 Identity = 221/879 (25.14%), Postives = 398/879 (45.28%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C8K0 (Probable disease resistance protein At1g51480 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g51480 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 210.7 bits (535), Expect = 9.9e-53 Identity = 194/724 (26.80%), Postives = 338/724 (46.69%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FG91 (Probable disease resistance protein At5g43730 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g43730 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 201.4 bits (511), Expect = 6.0e-50 Identity = 195/719 (27.12%), Postives = 335/719 (46.59%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FG90 (Probable disease resistance protein At5g43740 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g43740 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 199.5 bits (506), Expect = 2.3e-49 Identity = 191/720 (26.53%), Postives = 330/720 (45.83%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. NCBI nr
Match: XP_038890209.1 (probable disease resistance protein At4g27220 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 991.1 bits (2561), Expect = 8.9e-285 Identity = 586/1349 (43.44%), Postives = 816/1349 (60.49%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. NCBI nr
Match: XP_022143564.1 (probable disease resistance protein At4g27220 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 949.9 bits (2454), Expect = 2.3e-272 Identity = 559/1245 (44.90%), Postives = 786/1245 (63.13%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. NCBI nr
Match: XP_038887230.1 (probable disease resistance protein At5g63020 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 828.6 bits (2139), Expect = 7.6e-236 Identity = 530/1315 (40.30%), Postives = 769/1315 (58.48%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. NCBI nr
Match: XP_038900638.1 (LOW QUALITY PROTEIN: probable disease resistance protein At4g27220 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 812.0 bits (2096), Expect = 7.4e-231 Identity = 517/1405 (36.80%), Postives = 762/1405 (54.23%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. NCBI nr
Match: XP_011650062.1 (probable disease resistance protein At5g63020 [Cucumis sativus] >KAE8652346.1 hypothetical protein Csa_022345 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 788.9 bits (2036), Expect = 6.7e-224 Identity = 506/1320 (38.33%), Postives = 737/1320 (55.83%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CPP4 (probable disease resistance protein At4g27220 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013433 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 949.9 bits (2454), Expect = 1.1e-272 Identity = 559/1245 (44.90%), Postives = 786/1245 (63.13%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LTN4 (NB-ARC domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G433370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 771.5 bits (1991), Expect = 5.3e-219 Identity = 498/1286 (38.72%), Postives = 732/1286 (56.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CHN4 (disease resistance protein At4g27190-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501064 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 766.1 bits (1977), Expect = 2.2e-217 Identity = 500/1306 (38.28%), Postives = 738/1306 (56.51%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K5R3 (NB-ARC domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G239020 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 745.7 bits (1924), Expect = 3.1e-211 Identity = 527/1402 (37.59%), Postives = 747/1402 (53.28%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FY21 (probable disease resistance protein At4g27220 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448887 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 706.1 bits (1821), Expect = 2.8e-199 Identity = 462/1287 (35.90%), Postives = 696/1287 (54.08%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. TAIR 10
Match: AT4G27220.1 (NB-ARC domain-containing disease resistance protein ) HSP 1 Score: 225.3 bits (573), Expect = 2.7e-58 Identity = 230/944 (24.36%), Postives = 432/944 (45.76%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. TAIR 10
Match: AT4G27190.1 (NB-ARC domain-containing disease resistance protein ) HSP 1 Score: 224.9 bits (572), Expect = 3.6e-58 Identity = 221/879 (25.14%), Postives = 398/879 (45.28%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. TAIR 10
Match: AT1G51480.1 (Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family ) HSP 1 Score: 210.7 bits (535), Expect = 7.0e-54 Identity = 194/724 (26.80%), Postives = 338/724 (46.69%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. TAIR 10
Match: AT5G43730.1 (Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family ) HSP 1 Score: 201.4 bits (511), Expect = 4.2e-51 Identity = 195/719 (27.12%), Postives = 335/719 (46.59%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000064 vs. TAIR 10
Match: AT5G43740.1 (Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family ) HSP 1 Score: 199.5 bits (506), Expect = 1.6e-50 Identity = 191/720 (26.53%), Postives = 330/720 (45.83%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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