Spg038055 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAGACCTCGACTCTGGTCTGGACTGAGTGATCTCATCGTCGTTTTCGCGCATTTCAAAAATTTCGAACATTCTTCATTGCCCTTCCTTCCCTTTCCAGATTTCCAGTAGCATCTCGTTCTTGTTTTCCAATACGTAGAAGGGTTTCTCTCTTGTACTCCAGCCATGGTTTCCGCTTCATCCATCAAAGAAATCCTTGGCGAACTCAACAAGGAATCCTTCGTCTCTTTACTCTCGAAGCTCATCGGCGAGGCCAAGTTCGTCCAGAACAACCCACCGGAAAACCTGATTCCTCAAGAGGACAAGATCGTCAATCACGTCCTTGATGTTCTCAACCCTTTCAGCACCGCCAATGGCGGACCCTTGCTAATCAACCATGTCAGCTACGCTCCTGGCCGCGGGAATTTGATTGTGGAGTATCCCGGGACTGTGTCTGGAAAAGTCGTCTCCTTCGTCGGCAGTCACATGGATGTCGTCCCTGCTGATCCCGATACTTGGGTATTGTTTTTCCAATCTCAAATCCCCTTTTGGTTTCTTTGATGGTCTTTCCTCTGCGTTTATACCGTTTCTTCAATTTCAGTGTCGTATTTTGTTTCCTATGCTGTGGGATGAAGTTTGTGCATAAGGGATTGATTGAGAATTTGATTTAGCACCAGCTGAAGTTGCCCCAGTTGCTATATTAACCATTGTTTTGCTATAGGGTGTTTCTGTTTTTGTAATTTAATCGCCAGGATTTAGGTTGATTCAAATAGAATTAAGGATTGCATTTTTATCTACTAGTGGATTTGCTATTCATATAAGAAAAATTATTATTGTATATGCAGAAATTTTGTCCTTTCTCATTGAGTGTTGATGGGGATCAACTTCGGGGTCGTGGGACTACTGATTGCCTTGGACATGTTGCCCTTTTAACTGAACTCCTGAAGAAGCTTGCACAAACGAAACTGAAGTTGAAGTCCTCTGTTGTTGTTATATTTATTGCCTCTGAAGAGAATAATTCAATCCCAGGAATTGGAGTCGAACAACTTGCTAAAGAGGGACACTTTCATAATTTAAAAGGAGGGCCTCTGTAAGTGATTGCATCTCCTTCCAAATAAGATCTCGATTTGCGCGAGTGCCTAGACCACAATACACACACGCCTTCACTAATCTTTCGGGCATCTGCCTATTGTTTTAATATTCTAGGTAGTTGGTTACCATGGGGTTCGAATCCATTCCCCTTAAGTCTCTTTACATTTTTCATATGCTTTGATGACCACGAGGTAAATCCATGATGGTTAGATGTTAATATGAGTTATTTTTCTAATTCTAATTTTTTGGCAACTTCTCCTATGGATTGTTAAGCTGTGTATATTTGGTTTCTTATACAGATATTGGATTGATACAGCAGATTCACAGCCTTGTATTGGTACTGGCGGTTCAATACCTTGGAAACTCGTAACAACTGGAAAACTTTTCCACAGTGGTTTGGCGCACCAGGTAAATTGATATATTGTCTTCTGTGTGCTGGTATGTGCGCACTTCATTGACTGAATGAGAGTCTTCTATTGCATTTTGAGGGTGAAATTTAGTGATTCAGAAGATTTTGGTTGTTGATTTGATAAAACTGAATGTTAGAATGTGAGAGTACATATCTAAGATCTTTCTACCCATGATATGGAAGCTTCACAATCTGAAGGATTATAGTTTTATACAAGTGCCCAAATCTTAAATGTGAAATCCCACCCTCGATATTATCTTGTCACTAATGATAAACTTGACCAGTAAATTTTTATTTGAATATAAACTGTAAGGATTACTGAAAAGCAAAGCTTTGCTAAATGTGTCTTGCATTTGAGATTATCTGGATAACATGTCCATTAATAATTCTGCAGAATTGAGCTAACAGAATTTGATTGATGTGAGTGCTGATCTCTAATACAATAAAACTTGAATATTCATGTGCATAACTTTATGCCAATTGATTAAATTTTGTTTTAGCACAAGATACATAAGTGCTTACTTCTCTTGTATGCAGGCTATTAACGCTATGGAGCTAGCTATGGAAGCTCTTAAAGTGATCCAATTGCGCTTTTATGAAGATTTTCCTCCCCATCCTAAGGAACAGGTATATGGATTTGCGACACCATCAACCATAAAACCAACCCAATGGATTTGTAAGTTCTAAACCTTCGATGATTAATTTTAGGTAGAGAAATATGTTTTGATCATGATCATTTCTTCATCTTAGATCCAGGAGGTGGCCTCAATCAAATTCCAGGAGAATGTACTATTTCAGGAGATGTCAGGTTAATTCAAGTCTCTGCTTTTCTACGATTTTAGCATAAAATTGACATATAATAAAATCTTCAGTTAGTGTCTTTCTCAATTTTACTTATATATTTCGTGTTGGATTCATTTGGCAGGTTAACTCCCTTCTACGAGTAAGTAGTTTACTTCCTTTCCCCTAATCAAGCAACGTTACTTCGCAACCAAACTGCATACTTATTACCATTGTTTTGAATAAGCTTTTCTATCCTTTTTCTTCATTTGCTGGTCCATATTAAAAATTTTAGACGCTTTATGGATTTAGTCTCTATCAATTTTTCTTCCAGTGTGAAGGATGTTATGACAAAACTCAAAGGCTATGTTGATTACATTAATGCAAACCTCGAGAAACTCGATACAAGGGGTCCGGTTTCAAAGTATGTCCTACCAGATGAAGGCCTCAGGGGACGGTAATAATTCACTTCACGAAACCCTCTCCCCAAGAGGAATGATGTTTTATTCAATCAAATTCTAATAAACTTTTTTCATTGAAAAATAAAATACCAATAGAGTAGGACGTAGAAAATCGTGTAAAAAATGCATTTTCCTTCAATAATAAATTGTTTTTGACTTATGTGCATCATCATTTATCTATATCCACCATTTATGGTCTTTGGAATACAAAATTTTTACATTATTTTTTTGTAGAGTTGAGATAACTTTCGGTGAGGCAATGTCGGGAGTTGCATGTGATCTTGATTCTCGAGGCTATAAAGTTTTATATAATGCAACAAAGGAAGTTATAGGGCATGTCAAACCTTACTCAATTACAGGGAGTTTGCCAGTTATTCGGGAGCTCAAGGTAAAACACATCTCCATCTCTCTTTTCTTCTGCTGGTGTTTATTGCATTCATTTGGTTTCTCATCTCTTTGTTATTACTACTTATAGGATGAAGGCTTTGATGTTCAGACTGCAGGCTATGGTATGATTTATGATTCTTTTACCCATTCATTTCTTAAAACATGGCAAGGTTTTGTTACACAAGACAGTTAAATTCCTCTTGATTTTACTTCTGAATGCTCTCCTAATATACATTCAGCTGCTGTTTGTGTTGGAAAATTTTCATTAATACAGCTTCATAATTGGAAAGTGTACAAGTCCTCAACTTGTCAAGTCCATTGCCTATAGATTGTTGATTGTGAAGATCTGATTTACTCTGTAATGCTTTTATTTGCAGGTTTATTGGATACATACCATGCCCAGAATGAGTATTGTCTTTTTAGTGATATGGGCAATGGCTACAAGATTTTTGCCAGTATCATCTCTCAATTAGAAGAAGTTTAATACTGAAAAACCAGATGGTACTACTTTGAGAGGGGAACTGTGATATTTTCACTCTCATTGTAAGTAACAAATAAAACTAATCTGCATGCTTTGGTACTACTGAGCACTTTCTTCCTTGATCTGTACATTTGTATTCAATAAAGGCAATAGTAGAGCTACATGTTTTAGGGTGCGTTTGAAATTGATTTTGCAGGGATGAAAAGTGATTAGGAAAGAGTTTTAACTGTTTAGGTGTTTGAGAAAACTGATTTCTTTTTTTATTAATTTAAACACGAATATTTTTTCAATTACTTTTATTTGCAAAATCTGGTAAATAGATGCTTTTGAAATTAGCTTCCCGAATAATCTGCCACCCCCCTGCAACAAATTTCACAAAATTAGTGTTGTATCCTTCCCTATGTGACCTATTTGCTGATATGTTTGCCAAATTATTGGCAACACTTTATTTATTTATTTTATGTTTTTGCTGCAAATACGGGAATGAGGTGTTTTATTTCTTATTATTTTCCAGTAATCAAATTTTATTCTTCAATCAGTAAGTTTTAAGAAGTTGGATGTTTGTAATTTAGACCCCGTTTGATAACCATTTCGTTTTTAGTTTTTGGTTTTTAAAAATTAAGCCTATAAATACTATTTTTACCTAATAGCTTCTTTGTTTTTTATCTACATCATTTTCTATGTTTTCAAAAATCAAGCCAAATTTTGAAAACAAAAAGAAGTTTTCAAAAACTTGTTTTTGTTTTTCGAATTTGGCTAGGAACTCAAATGTCCCCTTAACAAAAATGAAAGCCATTATAGGAAGATTGAAAGAAAACAAGCACAATTTTCAAAACAAAAAACAAAAAATGAAATGGTTATCAAACGGGACCTTGGGAAACAAGTTACATCGTTCATTTATTATTCTTTTTTTCTTTTATTTTGTTAAATAATTCAATAAAAATATTTTATGTTTTAGTCTATTAATTAATTCAACACTTTCTTTTATATAACAATATTTTTTCATAATATTTTATTAGAGTAATTTGAAATGATATAAAATTTCAAACAATTATTTAGATATTAAAATTTAATACAAGAATAATTGAAATAATATGTCCACTTCAATGGTTTAATTCTAACAAATTAGTATTAGTTTTCCAAACACTCTAAAGTCTAACATGCTTTTTCTTATTTGTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGCTTTTTCTTATCAACTGCGCATCTGGTGTAGTGGTATCATAGTACCCTCCCACGGTACTGACCGGGGTTCGATTCCCTGGATGCGCATTTTTTTTGTTTAAAAAAAGAAAAAAAGCTTTTTCCAAGTTTAAAGTTGAAATTTAGTAACTTCTTACAGATTTTTTTAAGTACAATTGACATTAATTATTTTAGATTTAAATCTCATTTTA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BLAST of Spg038055 vs. NCBI nr
Match: XP_022967171.1 (acetylornithine deacetylase isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 819.7 bits (2116), Expect = 1.2e-233 Identity = 396/437 (90.62%), Postives = 418/437 (95.65%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. NCBI nr
Match: XP_022967172.1 (acetylornithine deacetylase isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 818.5 bits (2113), Expect = 2.7e-233 Identity = 396/433 (91.45%), Postives = 416/433 (96.07%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. NCBI nr
Match: XP_022963824.1 (acetylornithine deacetylase isoform X2 [Cucurbita moschata] >KAG6571673.1 Acetylornithine deacetylase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 818.1 bits (2112), Expect = 3.5e-233 Identity = 395/433 (91.22%), Postives = 416/433 (96.07%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. NCBI nr
Match: XP_022963823.1 (acetylornithine deacetylase isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 818.1 bits (2112), Expect = 3.5e-233 Identity = 395/433 (91.22%), Postives = 416/433 (96.07%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. NCBI nr
Match: KAG7011398.1 (Acetylornithine deacetylase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 817.8 bits (2111), Expect = 4.5e-233 Identity = 395/433 (91.22%), Postives = 416/433 (96.07%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C5C4 (Acetylornithine deacetylase OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g17830 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 656.8 bits (1693), Expect = 1.8e-187 Identity = 313/438 (71.46%), Postives = 371/438 (84.70%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P54638 (Acetylornithine deacetylase OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=argE PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 429.5 bits (1103), Expect = 4.6e-119 Identity = 221/439 (50.34%), Postives = 285/439 (64.92%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9K4Z2 (Acetylornithine deacetylase OS=Moritella abyssi OX=111292 GN=argE PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 5.4e-11 Identity = 93/391 (23.79%), Postives = 146/391 (37.34%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0VQG3 (Succinyl-diaminopimelate desuccinylase OS=Alcanivorax borkumensis (strain ATCC 700651 / DSM 11573 / NCIMB 13689 / SK2) OX=393595 GN=dapE PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 3.3e-08 Identity = 59/207 (28.50%), Postives = 81/207 (39.13%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B2IDW3 (Succinyl-diaminopimelate desuccinylase OS=Beijerinckia indica subsp. indica (strain ATCC 9039 / DSM 1715 / NCIMB 8712) OX=395963 GN=dapE PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 3.3e-08 Identity = 54/179 (30.17%), Postives = 73/179 (40.78%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HRA1 (acetylornithine deacetylase isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466791 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 819.7 bits (2116), Expect = 5.8e-234 Identity = 396/437 (90.62%), Postives = 418/437 (95.65%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HQ35 (acetylornithine deacetylase isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466791 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 818.5 bits (2113), Expect = 1.3e-233 Identity = 396/433 (91.45%), Postives = 416/433 (96.07%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HJ13 (acetylornithine deacetylase isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111464009 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 818.1 bits (2112), Expect = 1.7e-233 Identity = 395/433 (91.22%), Postives = 416/433 (96.07%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HLB7 (acetylornithine deacetylase isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111464009 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 818.1 bits (2112), Expect = 1.7e-233 Identity = 395/433 (91.22%), Postives = 416/433 (96.07%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E5Q2 (acetylornithine deacetylase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503528 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 811.2 bits (2094), Expect = 2.1e-231 Identity = 391/433 (90.30%), Postives = 416/433 (96.07%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. TAIR 10
Match: AT4G17830.1 (Peptidase M20/M25/M40 family protein ) HSP 1 Score: 656.8 bits (1693), Expect = 1.2e-188 Identity = 313/438 (71.46%), Postives = 371/438 (84.70%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. TAIR 10
Match: AT4G17830.2 (Peptidase M20/M25/M40 family protein ) HSP 1 Score: 650.6 bits (1677), Expect = 8.9e-187 Identity = 313/443 (70.65%), Postives = 371/443 (83.75%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. TAIR 10
Match: AT1G44820.1 (Peptidase M20/M25/M40 family protein ) HSP 1 Score: 43.9 bits (102), Expect = 3.8e-04 Identity = 46/189 (24.34%), Postives = 83/189 (43.92%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038055 vs. TAIR 10
Match: AT1G44180.1 (Peptidase M20/M25/M40 family protein ) HSP 1 Score: 43.1 bits (100), Expect = 6.5e-04 Identity = 48/190 (25.26%), Postives = 82/190 (43.16%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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