Spg035517 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview


Name	Spg035517
Type	gene
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Unknown protein
Location	scaffold3: 3411574 .. 3418327 (+)
RNA-Seq Expression	Spg035517
Synteny	Spg035517

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGATATTACTAGAAGTACTTAACCTGCAAAACCCTATACTTCATTTGCATGATCTCGATCCCAACGACGTTATCGTTGCAAGTGAGTTTGAGTTCAGGAACTCCGCAACTCGATGGACGATCATTACCCCAAAAAGGGAAGCCGATGCCAATGATCTCCCCACAGTTAAACATGGCAGAGCAATCTTTGTATGTGCAAAAAGATGGAGAGATATTGAAGGAGAAGACTATGAGAAGAAGATAGGAATTGGAGAAGAAAGTCAAGAAGTTGTTCTTCATCTTGTGACCTTTGTGTTGAAGGAGAAGTTTGAGGGTAATGATAATTGAAGAGGGAAGAATAATTATTGGAAAGTTGTTAGACTTTAAATGATAAGATTTCATTTTTAACATTATATATTAATGCTTCAACTGTTTTTTTCGTCTCTCAAATCAAAGAGAAATAGACAGATCATAAAATTCGTATATTTGACTTAATTTATTTATTTTGAATTGCCTCTCCTCGTGAGCTTTATGTTTGTTTTTGGTTAGTGGACAAAATGGATTACGTGGAATTGAGGTAGAGTTTGGATTCTATGTTAGTAGAATCAATTAACAACAGTCAAAGCATTATATGGGCGATTTATTTTCAATATCACATGGGTATCATCTAAGAATGATGTAACATTCAATAATTAAATAATTATTTATGAATGGACATTTATGGTGTAAATAGAGCGAGTAAGTACTACCGGAGTTGTCAACATGAGCATTAGTCCAACTAGAATAAAGTTTGTACTAATGACCCGAAAGGTGTCTAATTAAATTTTTTTTTTTCCAATATTTGAGTACTTCAAAAACTTTCATACCATTTAGCCTCTAAAATTTTCATAAAAGTTATTTTTAATTATTGTTATCAAGTCTTTTTACTAATAATTTGAGATAAATTTCTAACTGTCCATTTGAAACGTGGATATAACATGAATATTAAATATATGAGAGTTAAAAATCTAGGACTTAAACGTCGAGATAATAAATGTTTGTGTTTGGACATGCAAGATCATTAGTATTTGGAAGTTAAATGTGTGTTTGTTTTATGGGTTTTACTATGGAAAAAATAATTTAAATTAGGTTAAAAATAAATTTTCGTCCCTAAACTTTCATGAAGGTAACAATCTAGTCCCTGAACTTTGATCTATAACAATGTAGTCCATGTACTTTCAATTTTTGTAACAATTTAGTCCCTAAACTTTCATAAGTAACAATTTAGTCTCAACACTTTCAAATTTTTAACTTCTAAATATTAATTATCCTGCATATCCTTATCCTTGGATAATAATTACTTGAGTTTTAAAAATAAACAAACATGGGTTTCTTATGGCTCGTTTGATAACTGATCTTGTTTCTTGTTTCTAAATTTCTAAAAACGTTTCCAAAAAAGAGGCAAAATTTGAGAAACTACTATTGACATAAAAACTTTTCTTCAATTAATTGTCTAAGTGCGTGAAATTAAAATATGCTAATTACATGAAATTATAATTGAATTGGGTTCAATTTAAACCCGAGTTCATTAAGGTAATTGGGTCAGAAGCCCAAAATTTCAAGCCCAAGCCCATGAATGGGCCCAAATGCATTTCAAGCCCAAGCCCATGGATGAGCCAAAATACAATCTAGCCCAAGCCCACAAATGCCTTTTGAAAACTCTATAAATAGAAAGCCTTGACTCATTTGAGGGGAGGGTAGAAAGAAAGGAAGAAGAGAAAGCTCTCAGAAGACTCTAAAGATTGAAGCTCCTCCTGCAAAATTGAAGATCGAAGCTTAGATCCTTGTCAAATCCAGCTACAGAACTGAAGAACGAGGCTTCGATCATCTTCAAATCTCGCCGCAGAATAGAAGATCGAAGCTCATATCCTCTTCAAATCCCCCTGCAAAATTGATCCGTAGAACTCAAGATCGAAGCTCAGATCCTCTTCAACTTTTGCTACAGAATTGAAGATCGTAGCTCAGATCCTCTACAAACCCTCTTGCAAAATCGAAGACTGAAGCTCAGAACCTCCTACGTACCTAAAGACTGAAGTCCACCTCAATCCATCTAGAAGAACTCAAATCTTTATGAAGAAAACAAACCTTCAAGACTCTGAAAGACTAAAGCTTCTTGAAGACTTCCAGGAGATCAAAAGACTCCTACAAGTTGCAAAGCCCTTAAGACGACTCCAATCTCAAGAACAAGCTGCAAAGCCCTTGAGACGACTTCAAATTCGAGAACAAACGTTTCAGCCTTCGAGTGAAACACACACACACAAGAGAGAGAATCAGAGGATTATGTATTAAAGATTGTACACTCATACGCATACAACATCAATACAAATCAAATTTTATTCCACGCGTCTTATTCTTTGAAGTCTCGTGTGAACAAATTTGTCACGCCCAGTGGGACCATCTCTACCTCTCATCTTTTTCTCTTATCTCAAAACATAAGTGAAAACATGTCGTTCAAGACTTCTTCAATGACTGCCATCATGAGGAACTTTTACACAGGTTCTACTACCCATAGTTGCTCGAATGAACTCAAGTTGGAAGAAAATAAAACTCCTACCATCGTAATAAAAGAAACAATACTGCCAGAGGCATGTACTAATGACAAGTTTCTTGTAAAGTATATGTTGGGTTTTATGCCCTAAAACTCGTAGATAGTAAATGTACCTTTTGACCGAACATTAATAAAATGATGTATTATTCATTTCTCTGTGTTTGTATTAAGTAATCTTGTCTTATTAACCCTAATCCAATAAACTACACATCCTAGGCTGATAGTATGAGGCTTGAACTAGTATGTAGGGACATACGAGGATCAATGTTCAAGATTCAGCCTAAAGGGTCTATAGTATAGGGATAAGGCTGGGTACCTTATCCTGGTGACACTATGGATACGACCCACTTTGTATTTTGATACAAACGTATTGATCCAAAGCGTCCATGTAGTTGACATGCGAGTGGGGGTATCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGACCGGACCGCGAAATAGTTAACCACTAACTGTAACACCGTTAGTTATCTTGGTTTCTATTTCACTAGGATGACTTAGGCAACTTGGTCTTAATCCTGAGTGGATTATGGACTCCTGTCCGTGAGGGATTGTCCTTTGATTTGTACGGGTGAGAGTGGCCTGCACGCCGACTCAATAAGCCTACCATTTTGGGGACAAGACCGAGTGGGGAGCTGGGAACATAATCACACAAGATGGAATTCACTCATTCCCGACACTAGGGTAAGTAGAGGTGTGTTCCCTTAAGTGGTGTTTTCGAGTCTTGAACAATGGGCCCTGCCCTCTCTATGGCACGAGAGGGACTTCTGTTTGTTGGTTGGACCTCAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGAACTGGTACTTAAGGATAAAGAGGTAGCCTAGGGGTAAAATTATATTTTGACCTAGCTGGGGTATGAACACACGTGAAGGACTGAATTACTGTTGATGGTCGATATCCGTGGACACAAAAATCTATCTGCAGTGAGAAGAGTGCAGCTGTGGTTCTATAGTGCAGTGAACCACAGTAAACGAACATTGATTAACTTGGTTAATGAGTTTAACCAATTAATCTCATATCGTTGGAGCTTCTGATCTGTAGGTCCATCAGGTCGCACCGATGACTCAAATAAGGTATTGAGGTTATTTTCTAAGGAAGATTTGTAAATTCGAAGGTGTTCGAATATTAAGTTTAAAAATATGAATTTGGTTCATATTTAAACTATGGGTTATAATTAATGCGCATTAGATGTGAAGGGATAAAAGCCCTTTCGCAGCGGAAACGGTCAAAACCTTTTCTCAGATTTTAATTCAGATTAAAATACCAATACGTTGGAATAAAAAAAACACAGCAATAAACAAATTTAAAGCTGCTGTACAGCCTCTATAAAGCATGCAAAAACATGATAAATATCCTTTAGATCTAATCTAGATTGGATCCTATTGATCCTAGATCAAGAATTACCTACCGTAGATGAAGTTCTTCATCGATTCGCCTAATTCCCTTTGAATTGCAGAAAATTCCAACAGCAAAATGTCTCCTTTTTCGCCGCAAATCCCTTACGAACACCACCAAAAGGGTACACCAATGATCTTTAACGGATATGATGAGGGAGACGGTGGGATCTCTTTTTTTCTAAGGAATAATGTTGAGGGAATCAAGTAAGTGCTTAAGGTTTTTTTGGAGAGAGTTTTCTTTTCTGTAAACCAAAGAAAAAGAACTGCTTCCAAAAACCCCGTAACTTACTCCTTTGTAGGCGTGTGAGGGAGGAAAGATAGGTCAAAACCCACGTTCCTATAACTGATAAAAATATCAGTTGTTTTAATTTAAAATTCAATTTAATTAATTAGAAAATTAATTAAATTAAATCAAAATAAGTTATTAAATTCATAATTGAATAACTAATTCATTTAAACTATATTTAAATGATTATCCCTCACATAACCTATAGTTTTAATATAATTAAATCAAAATTTAATTAAATTAAAACAACAATGAATTAATTCTATAATTAATTAATATTATAATTAAACATCACATATTTAATCATAATTCCCTCATAGGAACTATAGTATTAACGCACATCTAATGCACATTAATTATAACCTATAGTTTAAATATGAATCAAATTCATATTTTATCTTTTTATTCGAACCTGTTCGAATATTTAATATTTCCTTAGAAATTAACCTCAACACCTTATTAGAGTCATCGGTGGGACCTAATGGACCTACAGATCAGAAGCTCCAACGATATGAGATTAATTGGCTAAACTCATTAACCAAGTAAATCAATGTTCGTTAACTGTAGTTCACTCCACTAAAGAACCACAACTGCACTCTTCTCACTGTAGATATATTTCTGTGTCCATGGATATCGACCATCAACAGCAAGTTAGCCCTTCACGTGTGTTCGTACCCTAGCTAAGTCAAATTACCGTTTTACCCCTAGGCTACCTCTTCATCCTTAAGTACCAGTGCTCCTCTAATGAACAACCTGTTTGAGGTCCAACCAACAAACAGAAGTCCCTCTCGTGCCATAGAGAGGGTAGGGCCCATTGTTCAAGACCCGGAGACACCACTTAAGGGAACACACCTCTACTTACCCTAAAGCTGGGAAGGAGTGAATTCCATCTTGTAAGACTATGTTCCCAGCTCCCCACTCGGTCTTGTCCCCAAAATGGTAGGCTTATTGAGTTGGCGTGCAGGCCACTCTCACCCGTACAAATCAAAGGACAATCCCTCATGGGCAGGAGTCCATAATCCACTCACGATTAAGGCCAAGTTCCCTAGGTCATCCTAGTGAAATAGAAACCGAGCTAACTAACGGTGTTACAGTTAGTGGTTAACTATTTTGCGGTCCGGTCTTTGTGCAATCTCATTGCACAGGATACCCCCACTCGCATGTCAACTACATGAACGCGTTGGATCATTACGTTTGTATCATTATACAAAGCGGGCCGTATCCATAGTGTCACCAGGATAAGGTACCCAGCTTTATCCCTATACTACAGACCCTTTGGGCTAAAACTTGAACATCGATCCCCGTATGTCCCTACATACTAGTTCAAGCATCATTCTATTAGCCTTGGATGCTTAGTTTATTGGATTAGGGTTAATAAGACAAGATATAATACAAACATAGACTAAATGAATAATTCATCACTTTTATTAATGTTCGGTCAAAAGTACATTTACTATCTACGAGTTTTAGGACATAAAACCCAACAAGATGTACATTAATACTATAGTTTTATTAGATAAATATGATTAAATTTATGATATTTAATTATATTAATTAATTATTGAATTAATTAATCATAAGTTTTAATTTAATTTAATTAAATTGAGGTTTAATTAAATTGCATTAAAACTATAGGTTATGTGAAGGATAATCATTTAAATATAGTTTAAATGAGTTGGTTATTTAATTATGAATTAATGAACCTTTTAATTTAATTTAATTAATTTGTTAATTAAATTATATTTTTAATTCATAACTGATATTTGATCAGTTATCAGATTGTGGCATTTGACCAGTTTTTTCTCACCTTCACGCCTAATGAGGAGGGTATCTCTGAGTTTTACGGTACGTTGGTTATTGTGGCTTTTGCACTCACGAAAAACTCCAGAGAAAAATCCCAGAAACTTTTGTTCTCTCAAAGTTCCCTTAGAGAAATCAGTGTTCCCACAAACCTACTCAATACAACCTTTAGAGATCAGTGGTGTAGCTTTGTGGTGGTGTTCGTGGAGATATTTACAGCAAAGGAAAGGCGTTTTTGCTGCTGTTTTTGGGGTTATTCCAACGAAGGAATTGGTGAAACGGTCTAGATCTTCTATCAAAGTAAGTCCCTTCGATACTTGATCGTTAGGATCAATTAGTATGTTGATCTAGGGTGTTTCTAATCTAGGTTTATGCATGCTTAATAACCTGTACAACATTTATAAATTTTATTTTCTGCTGTGAATGTTTTTGCCGTCGTATTGGTATCCCAATCGATGTTTAATTCATTGAGGTCCTCTGATCGTTTCCGTTGCACAAGGGCTTTAATCCCTGTAGCATAACCCTTTGTTTGAACTTCATTCTGACGTAGCGACTGTCATGATGACTAAGACAAGAACTATAGAAGAAAGAATGGCTGAGATGCAGGAGCACATCAACAACCTGATGAAGGCGATTGAAGAAAGAGATTCTCAAATCGCGCACCTAAAGAGCTAG

mRNA sequence

ATGATATTACTAGAAGTACTTAACCTGCAAAACCCTATACTTCATTTGCATGATCTCGATCCCAACGACGTTATCGTTGCAAGTGAGTTTGAGTTCAGGAACTCCGCAACTCGATGGACGATCATTACCCCAAAAAGGGAAGCCGATGCCAATGATCTCCCCACAGTTAAACATGGCAGAGCAATCTTTGTATGTGCAAAAAGATGGAGAGATATTGAAGGAGAAGACTATGAGAAGAAGATAGGAATTGGAGAAGAAAGTCAAGAAGTTGTTCTTCATCTTGTGACCTTTGTGTTGAAGGAGAAGTTTGAGGGTCCATCAGGTCGCACCGATGACTCAAATAAGATTGTGGCATTTGACCAGTTTTTTCTCACCTTCACGCCTAATGAGGAGGGTATCTCTGAGTTTTACGGTACGTTGGTTATTGTGGCTTTTGCACTCACGAAAAACTCCAGAGAAAAATCCCAGAAACTTTTGTTCTCTCAAAGTTCCCTTAGAGAAATCAGTCAAAGGAAAGGCGTTTTTGCTGCTGTTTTTGGGGTTATTCCAACGAAGGAATTGGTGAAACGGTCTAGATCTTCTATCAAACATAACCCTTTGTTTGAACTTCATTCTGACGTAGCGACTGTCATGATGACTAAGACAAGAACTATAGAAGAAAGAATGGCTGAGATGCAGGAGCACATCAACAACCTGATGAAGGCGATTGAAGAAAGAGATTCTCAAATCGCGCACCTAAAGAGCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGATATTACTAGAAGTACTTAACCTGCAAAACCCTATACTTCATTTGCATGATCTCGATCCCAACGACGTTATCGTTGCAAGTGAGTTTGAGTTCAGGAACTCCGCAACTCGATGGACGATCATTACCCCAAAAAGGGAAGCCGATGCCAATGATCTCCCCACAGTTAAACATGGCAGAGCAATCTTTGTATGTGCAAAAAGATGGAGAGATATTGAAGGAGAAGACTATGAGAAGAAGATAGGAATTGGAGAAGAAAGTCAAGAAGTTGTTCTTCATCTTGTGACCTTTGTGTTGAAGGAGAAGTTTGAGGGTCCATCAGGTCGCACCGATGACTCAAATAAGATTGTGGCATTTGACCAGTTTTTTCTCACCTTCACGCCTAATGAGGAGGGTATCTCTGAGTTTTACGGTACGTTGGTTATTGTGGCTTTTGCACTCACGAAAAACTCCAGAGAAAAATCCCAGAAACTTTTGTTCTCTCAAAGTTCCCTTAGAGAAATCAGTCAAAGGAAAGGCGTTTTTGCTGCTGTTTTTGGGGTTATTCCAACGAAGGAATTGGTGAAACGGTCTAGATCTTCTATCAAACATAACCCTTTGTTTGAACTTCATTCTGACGTAGCGACTGTCATGATGACTAAGACAAGAACTATAGAAGAAAGAATGGCTGAGATGCAGGAGCACATCAACAACCTGATGAAGGCGATTGAAGAAAGAGATTCTCAAATCGCGCACCTAAAGAGCTAG

Protein sequence

MILLEVLNLQNPILHLHDLDPNDVIVASEFEFRNSATRWTIITPKREADANDLPTVKHGRAIFVCAKRWRDIEGEDYEKKIGIGEESQEVVLHLVTFVLKEKFEGPSGRTDDSNKIVAFDQFFLTFTPNEEGISEFYGTLVIVAFALTKNSREKSQKLLFSQSSLREISQRKGVFAAVFGVIPTKELVKRSRSSIKHNPLFELHSDVATVMMTKTRTIEERMAEMQEHINNLMKAIEERDSQIAHLKS

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Spg035517 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg035517 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg035517 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg035517 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 215..248

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Spg035517.1	Spg035517.1	mRNA