Spg034657 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AACTCATTTATGTTTTGGGCCCTACTGAAATTAATTGAAAAACACTCTTATTTTCCACTTTAAAGTTTTATAAAGTTTCGTACTCATGCATGTAGTACCGACCCCTTTGTATGATTCCATTCCCTTTAGTCGGGTCGTTACATTTGAATTCCCATAAAGCCCTTTGAATCATCATCTCTCCCAGTACTGTTGGCTGAACAAAAAGGTGTTTCTTATCAATGTGGAGAATCCCATTTGCCTCGAATTTCATTTTCCTCTCTGTTTGAGTCTCAAGCTCCACTTCTTGGAGATTAGTAAAGTAAAACGAAGAAACCCCATCATTTTTGTTATTTGATTCTGAAGAAAAGTAGAGAAAATCCCAATTTTGTAATAGCTTTTCTCTGTTTTGTTCTTAGAAGAGCTTGACAGAGAACAAAGCTTGCAGAATGACAGATCAAGTGTCGGATAGTGTTTCCAGAGTTCTGAGTTTGTTTTTGTTTGTTGTTTTAGCTTCGATTCTGGCCAATGTAGCTTTTGTTAGCGCTAAATCAACTATAGAGCCGTGCTCGAACTCTGATTCTTGCAATGCTCTGCTCGGTTACACTCTCTATACCGACCTGAAGGTTTCTGAAGTTGCTTCGCTCTTTCAAGTCGACCCCATTTCGATTCTTACCGCCAACGCCATAGATGTTTCATACCCTGATGTTGAAAACCACATTCTGCCTTCACAGCTCTTCATTAAAATCCCCATTTCTTGTTCTTGCGTTGATGGGATTCGCAAATCGGTGTCCACTCGGTACAAGACTCGCCCATCTGACACTCTCTCGTCGATTGCTGATTCTATCTATGCTGGTTTGGTCTCGTCGGATCAAATTCGTGAGGCGAATTCCATTTCGGACCCCTCTGTTCTTGATGTTGGACAGACCCTTGTTGTGCCGCTTCCTTGTACTTGCTTTAATGGGACTGACAATTCGTTGCCTGCTATTTACTTGTCTTACGTTGTTCAACCTGAAGATACTTTAGCCGGGATTGCGTCTAGATATTCGACCACTATCACTGACTTGATGGATGTTAATGCTATGGGAAACCCGACCATTAAGGCTGGTGATATTTTGGCCGTCCCCTTGCCTGGTAAGTTTTGGAGAAATTTTGGATGTTGATGTTGTTAATCTTTATGTTCATGTTGCATCTTCTGTGGAAAATCTGTAGTTGATTTATGAGGTTGTAAGTTAAACTAATGATGTCTAATTGGGCTGTTAAGGGAAATGAATTGATGAATGTGCTACGTTTAGTCATAAGGCGACTCGTAACTAATTGTTTGTGAAGTTATGGGGGTGCTTATGTGCTTCTTTGTTACAGCCTGTGCGTCTAAGTTTCCGAGATATGCCTCCGACTTTGGCTTGATTGTCCCCAATGGAAGCTATGCGATAACCGCGAGTCATTGCGTGCAATGTAGCTGTGGACTAGGGAACCTCAAGTAATAATTGAATAGCGTTTTTCTTGAATTGATGTGGTGTTTTGTTTATTGATGGTTTTGATTTGCTTAATTGTGTGTTTTGAAACAGTATGTACTGCATGCCTGCTCCCTTTGCCGTTTCTTGTTCGAGTATGCAATGCAGAGGCAGCAATCTAATGCTTGGGAACTCCACTTCACAGCAGAGTAGTGCAGGTTGCAATGTTACATCTTGTAGTTATGGTGGTTTTGTAAATGGCACCATATTGACGACGTATGTCTATTTTCTTCTCATTTGGTTTCGAGCTTTATAATTAGGTTGAATATGTCATTCGAGTTTCATTCAAACAGCCTTTTTGATCAATCTTTATTCACATTTCACAGGTTGTCTTCGAATCTTCAGCCTCGATGCCCAGGTAATTGTTCTTTTTGTTTTGGTTCAACCTTTATGCCCAGAAAACTTCCCTCTTAGTTGTCTGGCTTGGTGGGTTCATCTAAATATTAAAGATTGTGGGTTTTACTGATTGATGGTCGCCTTCGAGCCCTTGTGCAGAGTGTTTAATCGACCATTTTTTGCATCTTTTGGTATTCAATTGCAAATTAGAACAATCACTTGAACTATATCATCCTTTTCTTCATGGTCATTTAAATTTACAGGGCCACAGCAATTCCCTCCTCTTAAAGCCCCGCCTACTACAGTAATCAGATATTCAAATTTTGCACCTGCACCTGCTCCTCAATTTGATGGCACTGGATCACCTGCACCTGGATTGGGATTGATCCCTTCAACAACTGGTTCTCTCCCCGGATTCCCGCCCGCCAGTGGCCCCGTTGGTAGTACTTCTGGTTTGAATTCTGCACCTTCTGCTGCTTCCTCATTGGTGTATCCATTAGCGAGTATCTCTGTTGCCTTTCTGTTATTTATCATCGCCAACTTCTTTACATCATTTTCATTGTAATTTTTCTAATGGGTTTTGTATTATTTGTGATTTATATGTTTTGAGATTTTTCTCCTGTATGTTGGCTGTATGTAACCCTTATTTATTCTTCCTGTTGAAACTGATGTATGAATGCGGCGAACTATAGGTTTTTTGAGACCCTTTCTTTGTTTCCTTGTAATATTGTACTCTTTCTGTCTTAGAAGATACTGCTTATCAGTGTTACTGGTTATGTAAGATTGATTCATCTGCTACTTGTTACATCCATTTCATACTTGCTTTTTTAAATCATTGATGAGTTGAAGATTTTGTTGGAAGAGATTTCCACTATGTTAATGTTTATTGCTTCAGATGCTAGCTAATAGAGAGCAGAGCACCACTAGACAATGTCCATTCAAATGATACATACATATGATCTTTGAACTCGGACTCCTAGTTACCGAGCCGAGCACACTGTGTGGGAACAAATGATACGACTTCCTTCTTGAGATCATGAAGAACCAACATATTCTGGTGTTGCATGCTATCGAAAATTGACAAAGCTCCTGCAGCTCCCATTGCCAAACACACCAACACCTGCTCCTCATTGGTGACCATATAGTTCTCGATTGGAAGCTTCAAGTCGAGCCCCTCGAAATGAAATACCAAATTAGGCACACCAAGTTTTCTTTTGTTGTGGGAAGGCATCTCAAAGTAGAGATCAAGACCAATGCCTGCTGAGTGTTTCACTGGGAGGTTTGTCTGGGCAATGAAAAATGGTTTCAGAACATCAAATGCATCCTCTGTTAAGTAGGTGATCGATGTGCCAGAATCAATAATCACGCCGCCGTTGCTATCGGTCTTTAGTCTAAACCACGAGGACGGGATGGGCAAGAACTTCTGGCCTACTGTGATTCCTTGTAGGGATAGATAGTAGAAAGATGGGTCAAATGGATTTTGTATCAGCGGTGTGACCTTGATGGCTCGATTCGTAGTGTTGTTGATACTTGTTGAAGGTTCTAAGTTCAGACTCCCAGTTCCATTTGGAGTTAAACAGTAAGAAAATTTGTGAATGTCGAGCTGTGAAATAAGCGACAATGGTCCTCGACTGAATCCCACCATGCCAGCACCCTGTTTCAGGCCCTTTACATGGTTCCTTAGCCCGCACCCGAAAGCTATGTCTGGTGCAGAAGCTTGCTGGTTTGCTTCTCCGAGCGTCAAAGTCTCGAAGGCTAAATAACCTTTGGTCAAAGACCCGTCTCCATAACAAAACGAATACTCACAACCACTGCTGGAACTAGAATTGGTCAAAGCTTTGCACAATGCAACAGAGGAAGTGGCATTGGCGAAGGAAGACGATCGTGTAGGATCATACACAGGGCTTGGCTGCTAAAAGCATTGCAAGCATGGCTTGCACTCGTCCAAATCAAGTCGCTGCCAGTATCGGCAATGGCAGAGAACGAAACTGGAGGCGTCCCGAGCGACAAGTTCGTAAGATAGCTTCCCTTTCTCTCAACAACAGGAATTTCAACATCGAAGTTACTTATGGTCGTCTTATTGAAATTTTGTATTCGGGTCTTGTCGCGCTCGATTCCTCGTCGGAGCATTTCAAATTTGGTGAAATTTTCCTCAGCGTCGAAGTGTGTAAGATCAACCCGGACCCCATGTTTCAGTGAGCATTCACTGAGAGCTGGCTCGGAAGAGAGAATTTGCAAGAGCAGTACCAAGAAAGAGGAAATCGAAGTTTGAAGAGGATACAAATTCGCCATTTTACTTTGTGGCATCTGAAACAGAGGATCTTGTTTAAAAACTTCTCAAATGAAGGTTTATTTTGGCAACCGTCCACGTAGTGGAAGGAAGCACTTTGAAGAACGTGTAGCTAACTATCAACCTATTAAATTAAATAGTTAAGACTTAAGGGTTGATTTAACTTTTGTAAGTGTTTAATTTTTTTAAAAAAATCATTTTAAAAAAGATTTTAGTGTTTGACAACCACTAAAAATGAATTGTTAAAAACTGAGATTGAAAAATAAACCATTTTGAGAGAAACACTTCAAAACAATTTTTTTAAAAAGAAGTTTTCAAGTATATAATAGAGAGTAAGGGGGTGGTACGGAGGATTAGTCCGTTTTGTAAAGCTGAGCTTTTCGGTTCGCTCCTCTAACCTTACCAGTTCGCCTCCTTTCTTTTGAAACATTTCCGATTGTTTTGGTAGACGGAGACGAAATTGTTAGAGTCGATGTTTCTTTTCGAAGAGCGGAATTGAAGTATAGTGTTGAATAGGAACTTGTGTATAAAAAACATTTGTAAGGAAATTTAACCAAACACATGAGAGTTTAAATCCTAAACAATTTGTATACAAAATGGTTAAAAGAAAATGCTTTTTTTAAAAAACACATAAATTAACTAAAATGAGCTTAGCTTAGCGGTAATTGACATGTAACTTCGACCAAGAGGTCAGATGTTCGAATCCCTCCACCCCAAATGTTGATCTACTAAAAATAAAAATAAAAATACAAATAAAAGGTATTTCGAACCAACCTTCAATTTAGGGGAAAGATCATTTACAAAGTGGGAGGATTCGAACCACAGACATCTTGGTCATTAATATAACTTTATGACAATTGAGCTAAGCTCTTATTGGC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ATGACAGATCAAGTGTCGGATAGTGTTTCCAGAGTTCTGAGTTTGTTTTTGTTTGTTGTTTTAGCTTCGATTCTGGCCAATGTGGCTTTTGTTAGCGCTAAATCAACTATAGAGCCGTGCTCGAACTCTGATTCTTGCAATGCTCTGCTCGGTTACACTCTCTATACCGACCTGAAGGTTTCTGAAGTTGCTTCGCTCTTTCAAGTCGACCCCATTTCGATTCTTACCGCCAACGCCATAGATGTTTCATACCCTGATGTTGAAAACCACATTCTGCCTTCGCAGCTCTTCATTAAAATCCCCATTTCTTGTTCTTGCGTTGATGGGATTCGCAAATCGGTGTCCACTCGGTACAAGACTCGCCCATCTGACACTCTCTCGTCGATTGCTGATTCTATCTATGCTGGTTTGGTCTCGTCGGATCAAATTCGTGAGGCGAATTCCATTTCGGACCCCTCTGTTCTTGATGTTGGACAGACCCTTGTTGTGCCGCTTCCTTGTACTTGCTTTAATGGGACTGACAATTCGTTGCCTGCTATTTACTTGTCTTACGTTGTTCAACCTGAAGATACTTTAGCCGGGATTGCGTCTAGATATTCGACCACTATCACTGACTTGATGGATGTTAATGCTATGGGAAACCCGGCCATTAAGGCTGGTGATATTTTGGCCGTCCCCTTGCCTGCCTGTGCGTCTAAGTTTCCGAGATATGCCTCCGACTTTGGCTTGATTGTCCCCAATGGAAGCTATGCGATAACCGCGAGTCATTGCGTGCAATGTAGCTGTGGACCAGGGAACCTCAATATGTACTGCATGCCTGCTCCCTTTGCCGTTTCTTGTTCGAGTATGCAATGCAGAGGCAGCAATCTAATGCTTGGGAACTCCACTGCACAGCAGAGTAGTGCAGGTTGCAATGTTACATCTTGTAGTTATGGTGGTTTTGTAAATGGCACCATATTGACGACGTTGTCTTCGAATCTTCAGCCTCGATGCCCAGGGCCACAACAATTCCCTCCTCTTAAAGCCCCGCCTACTACAGTAATCAGAGATTCAAATTTTGCACCTGCACCTGCTCCTCAATTTGATGGCACTGGATCACCTGCACCTGGATTGGGATTGATCCCTTCAACAACTGGTTCTCTCCCCGGATTCCCGCCCGCCAGTGGCCCCGTTGGTAGTACTTCTGGTTTGAATTCTGCACCTTCTGCTGCTTCCTCATTGGTGTATCCATTAGCGAGTATCTCTGTTGCCTTTCTGTTATTTATCATCGCCAACTTCTTTACATCATTTTCATTGTAA MTDQVSDSVSRVLSLFLFVVLASILANVAFVSAKSTIEPCSNSDSCNALLGYTLYTDLKVSEVASLFQVDPISILTANAIDVSYPDVENHILPSQLFIKIPISCSCVDGIRKSVSTRYKTRPSDTLSSIADSIYAGLVSSDQIREANSISDPSVLDVGQTLVVPLPCTCFNGTDNSLPAIYLSYVVQPEDTLAGIASRYSTTITDLMDVNAMGNPAIKAGDILAVPLPACASKFPRYASDFGLIVPNGSYAITASHCVQCSCGPGNLNMYCMPAPFAVSCSSMQCRGSNLMLGNSTAQQSSAGCNVTSCSYGGFVNGTILTTLSSNLQPRCPGPQQFPPLKAPPTTVIRDSNFAPAPAPQFDGTGSPAPGLGLIPSTTGSLPGFPPASGPVGSTSGLNSAPSAASSLVYPLASISVAFLLFIIANFFTSFSL Homology
BLAST of Spg034657 vs. NCBI nr
Match: XP_038886454.1 (lysM domain-containing GPI-anchored protein 1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 772.7 bits (1994), Expect = 1.7e-219 Identity = 402/432 (93.06%), Postives = 408/432 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. NCBI nr
Match: XP_008466706.1 (PREDICTED: lysM domain-containing GPI-anchored protein 1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 762.7 bits (1968), Expect = 1.7e-216 Identity = 392/432 (90.74%), Postives = 408/432 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. NCBI nr
Match: XP_004146785.1 (lysM domain-containing GPI-anchored protein 1 [Cucumis sativus] >KGN47734.1 hypothetical protein Csa_004437 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 762.7 bits (1968), Expect = 1.7e-216 Identity = 393/432 (90.97%), Postives = 402/432 (93.06%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. NCBI nr
Match: KAA0059881.1 (lysM domain-containing GPI-anchored protein 1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK24831.1 lysM domain-containing GPI-anchored protein 1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 762.7 bits (1968), Expect = 1.7e-216 Identity = 392/432 (90.74%), Postives = 408/432 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. NCBI nr
Match: XP_022141633.1 (lysM domain-containing GPI-anchored protein 1-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 758.8 bits (1958), Expect = 2.5e-215 Identity = 391/432 (90.51%), Postives = 403/432 (93.29%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93ZH0 (LysM domain-containing GPI-anchored protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LYM1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 548.5 bits (1412), Expect = 6.7e-155 Identity = 293/423 (69.27%), Postives = 339/423 (80.14%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NPN4 (LysM domain-containing GPI-anchored protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LYM3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 498.8 bits (1283), Expect = 6.1e-140 Identity = 262/420 (62.38%), Postives = 327/420 (77.86%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q69T51 (LysM domain-containing GPI-anchored protein LYP6 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=LYP6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 438.7 bits (1127), Expect = 7.5e-122 Identity = 225/386 (58.29%), Postives = 280/386 (72.54%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q67UE8 (LysM domain-containing GPI-anchored protein LYP4 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=LYP4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 399.8 bits (1026), Expect = 3.9e-110 Identity = 200/379 (52.77%), Postives = 267/379 (70.45%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8H8C7 (Chitin elicitor-binding protein OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=CEBIP PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 124.0 bits (310), Expect = 4.1e-27 Identity = 93/327 (28.44%), Postives = 161/327 (49.24%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V2B0 (LysM domain-containing GPI-anchored protein 1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold184G00850 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 762.7 bits (1968), Expect = 8.4e-217 Identity = 392/432 (90.74%), Postives = 408/432 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KFV3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G396650 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 762.7 bits (1968), Expect = 8.4e-217 Identity = 393/432 (90.97%), Postives = 402/432 (93.06%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CT55 (lysM domain-containing GPI-anchored protein 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504051 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 762.7 bits (1968), Expect = 8.4e-217 Identity = 392/432 (90.74%), Postives = 408/432 (94.44%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CL29 (lysM domain-containing GPI-anchored protein 1-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011941 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 758.8 bits (1958), Expect = 1.2e-215 Identity = 391/432 (90.51%), Postives = 403/432 (93.29%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FEW6 (lysM domain-containing GPI-anchored protein 1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444866 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 736.1 bits (1899), Expect = 8.4e-209 Identity = 384/432 (88.89%), Postives = 396/432 (91.67%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. TAIR 10
Match: AT1G21880.2 (lysm domain GPI-anchored protein 1 precursor ) HSP 1 Score: 548.5 bits (1412), Expect = 4.8e-156 Identity = 293/423 (69.27%), Postives = 339/423 (80.14%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. TAIR 10
Match: AT1G77630.1 (Peptidoglycan-binding LysM domain-containing protein ) HSP 1 Score: 498.8 bits (1283), Expect = 4.3e-141 Identity = 262/420 (62.38%), Postives = 327/420 (77.86%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. TAIR 10
Match: AT1G21880.1 (lysm domain GPI-anchored protein 1 precursor ) HSP 1 Score: 481.5 bits (1238), Expect = 7.2e-136 Identity = 239/310 (77.10%), Postives = 271/310 (87.42%), Query Frame = 0
BLAST of Spg034657 vs. TAIR 10
Match: AT2G17120.1 (lysm domain GPI-anchored protein 2 precursor ) HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 9.6e-32 Identity = 104/316 (32.91%), Postives = 165/316 (52.22%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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