Spg034575 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg034575
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold4: 14332023 .. 14336184 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg034575
SyntenySpg034575
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCCACGGTATGCCAGAAATAGATTAGCTTCAGAATATCTAGAGAATGCCTTAATTTTTTTTCTTTAACACCTCTCTGATTTGTTCTATTTTCTGGTTCTCATTTGTTTTATTTTCTGGTGAAGGAGCTTCATTTTGAATTGTTTGGATGGTTAACAGGTAGCATTGGCAAAGCAGAGGGTTGATGAATATATTTATTCTCAGTTGATGCGACAAGCTGGTGTTCAACAGACAGCGTAGGTTTTCCTTGATAACTGTTCATACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAAAAAACTGTCCTGTGGTGAAGCCATAGTCTTCTAGGATTTTATCCCAAAAAAGAAAAAATAAAATTCAATTAGAAATTTGATTGAAATTGAAATGCCATGTTGGTAACAAAAAATTCAAAACCCTAAGTTGCTCAGTAATACTCTGTAACTTAGAGAGTAAAATGACTAATACTTAAAATTCCAATGGTACTTGAAAGAAAATGAACTGAATGGTAAGACTTGGTCAAGCCATATAACATTTAATATTTAGCTTTTAATCATGGACATTCAAGGAGAGTTTGTGATGATGTTTGAAAAAAGGTGGTGAAAAGTGCTTTTAGACCATTCAGATTCACAATCTTAGAGGAAATAGAAATGTCGTCCACACTAAAGCTAAAAGAACTTTCTCAAAACATCCTAATAAAAAACGTGGTTTGTGAAAATTCTAAAAACACCGAAAAAGAAACATTTAATAACTTTATATGCGCTTCTCTTAGAAGTGCAAACTTAAAAAACACTTTTTAAAAAGCTATCTTTATCTCTGGTGTAAACGAGAGAGAAATTCAATGTGGTAGCTTGATTTCTCATCTCGAGATGTCTATTTTAGCTATCGAACTCTGTACGGACAAGATGTAACGCCCCACGTTTCGAAATCGAGCCATTTTGGTATTAACTAGGCGTTCTTATTCTAATTTGGAAAATTAGAATTTAAGTTTGACCTTGGGTCGCTAAATTAAATTCCTATAATTTAGGAAAAAGAGATTTTTAATTAAATCTTTAAATTCCTAAAGTTTGGAGGTTTATTCGATATTTATTTTAAATATCAAAAGACTCAAATCGTTAGTCTATTGGGCTATTTTCGTTCCCAAAACTTTTAGGAGTTAAGTTTGGGATTTCAAATTAAATCCTAAATAAGAGATAACTCCTAATTTAAAATGGGATTTTCTTTTCTTAAGGTGTTTTTTTTAAAAGAAAAGAAAAAGATAATAAAAGCAAACCCTAGCTTCCCTTCATCTTTTTCTCCCCTCTCTTTGCCGTGAAAGCCTCCAGCCCCCCCCGCCCCTTGCGTTTTCCTCTTCAGCCGCCAGCCCCTTCTCCTTCAGCTTCTTCTTGCGCCGCCGTTCGTCTCCCTCAAGCTCGAGCCTTTCTCCTCGCGTGCAGCGGTGTGGCGTCTCCCTTTTTGCATTTCGTGTTCCTTTCCGTCGGCATCAAGACCCACACGCCGTCGAGCAGCCGCAGTCGTCCTCTCTCTCCTGTTTTCTCTTCTTCTCCGACAGGTGACTCACAGCCAGCGGCGTTTTAAGGTCGTCCCCCTTCCTTCGCACGCGTTTTCGTTGGTCTCAGTAGGTGGGTCGCGGATTTATCTCTCTGTTCGCGCGTAAGGCTTCCTTTTTCCCTCTATTTCATTCGAGTTTAGTGGGAAACACGTTAATCTCCTCTGTTTCCTCTTGTGTTCGGCTGGGCTAGTGAGTAGAAGCTGGGATCTTCGCTGTTCCTGTGTTTCGGGTGCGTTCGGGTTGATTTAAGGATCGTTTCGGCATGTTTAGGCTCTTTCGGTAAGCTCTCGATATTACCCATGAATTATTAAGCTCGAAATAAGTTTGCCCACTCTTGTTCGATGTTTAAATTGAGTTTCGTGGTTGATTCTCGTTTTTCCAGCGTTGTTCGGAGCCGTTTTGGGTTTGAAATCATCCCTGTCTTGTAACCCATCGTCCGTGGAGCCTTAAACTTGAACACCCAGTGCCTAGGGTCTCTAAGCAAGTGGTTTTTAAACCTCTTTGCTTGCTGGACAGCCCGTGTTCGAGGTCTTTTGGACACTGAACGGTAAATTCCAGCACCTTCCGTTTCCTTTATTAAGTAACTTAGGTGCTTTAAGTCGATTCCTAACCTTTTGAGAGCCTTTGCTTGTCCTTTAGGCTCAATTGGATACTTTCGATCAAGACCCAAGCCCTTAAAGTAAAGTTAAGGCGGTAAGAGTGTGTTTAGGCCCTTTTGAATTTAATTTAAGTAATTTAGAATGGGTCCTAATCCTTGGAGCACTTTTGCTGTAGGTTTGGGTTGGTATTAAAGTGTTGGAGCTGAGCTTTAAGATTTGGTTCCAGGTGAGAATTTCCTTCCCTTAGCATTCTTTAGCTTGAAATAGGTTCTTAGCTTTGAGTTATGTTCCTTAAGCGATTATTCTGTTATTTAGGAGCTCAGTTGGACTCTTTAGGATCGCTTGGGAGATCAGTAAGTAAGTAGTTCTTATCTGTTGAGTCTGTTTGATTGCATGATGCATGCTGTTTGTTTACTTGCTTTATAATTGTTCTTTTGCTTCTTGCTTCTCTTTGAATATATATGTATATTCTGGAATGTATGAGTTGTTGCTGTAATGTTTGATTGAAAACATGTCGGTTTGTTGTGAGTTCATGAGTTGTGCATGAAGTGAGTTTATGTTGTGGTATGTATGCTTGGTGGGCATAAAACGTAAATCTAGAAGCATGATGCAAGGCATATGTATTCTAGGTAGTTTGATGTGGTATGTATATGCTTGGTGGGCATAGTACATGAGTCTGTCGTTTATGCTTGGTGGGCATAGTTCATGAGTCTAGAAGCATATTGCAGGGCATATGCATTCTAGATAAGTGTGAGAAAAGAGGTCAGGGACCTAAAAAGTGAAAAAGGGCAAGATGGGTGAATGTCAGTGCATCTCGGGTACAAATGGTCGAGGGGTGACATGTCACCATGGGTTTAAAGAGGACTGGCATTGTGATTGAGATATCAGGGCCTCGGGTATAAATGGTCGAGCACTGATATTGTTTTCGAGGAAAGTAAAGTGATTATCAGGGCCACGGGTATAAATGGTCGGGGACTGATATATCACTATTGGATGTCGATGCCTCGGGTATAAATGGTCGAGGGTCGATATGCCAATGTTAGATAAAGAGGAGCATCGAGGCCTTGGGTGTAAATGGTCAAGGGTCGGTGTGATGAGTCTTGAGGCAAGTATTGAGGCCTTGGGTATAAATGGTCAAGGGTCAATACGTTGCTTAGTCATCGAGGCCTTGGGTGTAAATGGTCAAGGGTCGATGCACAGTTCGAGGCCTTGGGTATAAATGGTCAAGGGTTGAACGCCGAGCTCCGTAGAGAAGTGTTGAGGCCCTGGGTATAAATGGTCAGGGGTCGGTGCATCTCGAAGGATCAGTCTTGGAGAGTTTTGCAGAGCGTGACGCGAAAATCACGTGTGAAGTGCCATGTGAGGGCTGATCATGAGTGTTGAGTAAGCTTGTGGAGCTTGAGTGGTTGGTGATTTGCATAGAAAGATGCATGAGGTTATGGCTTAGGAGAGTCATTCGCTTTACTAGCTTTTGAGCATGTAGTTGTGTTTATCGCTTTAAGAAGCATGTTGTTTGCGCATGAAAAGCATGTTGTTTGCTTGTTTGTTGTTTGATGGCTTCTCAGGTAGGGGCTGCTTACCAGTACCTTAGTGTACTGACCCCCTCCCCTCTCTCTCCCCCCAACTACCAGATTTTGCAGGTATGGGGACTGCGTGGACCATGGTGATGCGGAGGAGGCATATGAGGAAGGACCTTAGCTAGTTGAGCTGTTTTTTCCTTTTACTTTCATGTTAGATAGCTCGTTGTTCAGCTTGGATAGGATAGTAATGTTTTATTGGTTGGGCAGTTGGATGTCCTAATTGTTTAGTTTCAAACTCATTCTTGTGAGACTCTAGGACTAGTTGTCCTTGTTTAAAAGAACTCCATCTATTCTTTTAGTTGTTAATCATTAAGTTTGTTTTGAATGAATTAACGTTTTAAGATTTTGTTAAAGATGTGTTTTGGTTTAGTTAGTAGTTGCTTATGTGAGGCCTGGCTGGCTGTTAGTTCTGTGGAGTTCTGCTGTGTTGTAG

mRNA sequence

ATGCCACGCCCCCCCCGCCCCTTGCGTTTTCCTCTTCAGCCGCCAGCCCCTTCTCCTTCAGCTTCTTCTTGCGCCGCCGTTCGTCTCCCTCAAGCTCGAGCCTTTCTCCTCGCGTGCAGCGGTGTGGCGTCTCCCTTTTTGCATTTCGTGTTCCTTTCCGTCGGCATCAAGACCCACACGCCGTCGAGCAGCCGCAGTCGTCCTCTCTCTCCTGTTTTCTCTTCTTCTCCGACAGTGAGTAGAAGCTGGGATCTTCGCTGTTCCTGTGTTTCGGCCCGTGTTCGAGGTCTTTTGGACACTGAACGGCTCAATTGGATACTTTCGATCAAGACCCAAGCCCTTAAAGTAAAGTTAAGGCGGAGCTCAGTTGGACTCTTTAGGATCGCTTGGGAGATCAGTAAGGTCAATACGTTGCTTAGTCATCGAGGCCTTGGGTGTAAATGGTCAAGGGTCGATGCACAGTTCGAGGCCTTGGGTATAAATGGTCAAGGGTTGAACGCCGAGCTCCGTAGAGAAGTGTTGAGGCCCTGGGTAGGGGCTGCTTACCAGTACCTTAGTGTACTGACCCCCTCCCCTCTCTCTCCCCCCAACTACCAGATTTTGCAGTTAGTAGTTGCTTATGTGAGGCCTGGCTGGCTGTTAGTTCTGTGGAGTTCTGCTGTGTTGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCCACGCCCCCCCCGCCCCTTGCGTTTTCCTCTTCAGCCGCCAGCCCCTTCTCCTTCAGCTTCTTCTTGCGCCGCCGTTCGTCTCCCTCAAGCTCGAGCCTTTCTCCTCGCGTGCAGCGGTGTGGCGTCTCCCTTTTTGCATTTCGTGTTCCTTTCCGTCGGCATCAAGACCCACACGCCGTCGAGCAGCCGCAGTCGTCCTCTCTCTCCTGTTTTCTCTTCTTCTCCGACAGTGAGTAGAAGCTGGGATCTTCGCTGTTCCTGTGTTTCGGCCCGTGTTCGAGGTCTTTTGGACACTGAACGGCTCAATTGGATACTTTCGATCAAGACCCAAGCCCTTAAAGTAAAGTTAAGGCGGAGCTCAGTTGGACTCTTTAGGATCGCTTGGGAGATCAGTAAGGTCAATACGTTGCTTAGTCATCGAGGCCTTGGGTGTAAATGGTCAAGGGTCGATGCACAGTTCGAGGCCTTGGGTATAAATGGTCAAGGGTTGAACGCCGAGCTCCGTAGAGAAGTGTTGAGGCCCTGGGTAGGGGCTGCTTACCAGTACCTTAGTGTACTGACCCCCTCCCCTCTCTCTCCCCCCAACTACCAGATTTTGCAGTTAGTAGTTGCTTATGTGAGGCCTGGCTGGCTGTTAGTTCTGTGGAGTTCTGCTGTGTTGTAG

Protein sequence

MPRPPRPLRFPLQPPAPSPSASSCAAVRLPQARAFLLACSGVASPFLHFVFLSVGIKTHTPSSSRSRPLSPVFSSSPTVSRSWDLRCSCVSARVRGLLDTERLNWILSIKTQALKVKLRRSSVGLFRIAWEISKVNTLLSHRGLGCKWSRVDAQFEALGINGQGLNAELRREVLRPWVGAAYQYLSVLTPSPLSPPNYQILQLVVAYVRPGWLLVLWSSAVL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availablePROSITEPS51257PROKAR_LIPOPROTEINcoord: 1..24
score: 6.0

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg034575.1Spg034575.1mRNA