Spg034278 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg034278
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionCCHC-type domain-containing protein
Locationscaffold10: 20852360 .. 20862704 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg034278
SyntenySpg034278
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTTGGCCTCGGCCTTGGGCCGAGGCTGACCATAATGCTCGCCCTCGGCCTAGGGCCGAGGCCGACCATATGGGTCGGGCCAAGTTGGCTCGGCCCTTTGGTCGGCTCTTCCTCTGGGTCGGTCTCCCAGCCCTATTTTCGCCCGGACGTCCTCGTCAGCTCCTTGTGCGTCGGGTGGTCCAAAATTGCCTATAACACGAGTGTTGAAGGGTCTTTGTGTAGGGACGGAGGTCTCGGCGCAGCGAAAGCGGTTCAGGAACAATTCACAGTTAATTTAGAATCATGAAATACCAATACACTAGCAACATACATACATTCATAATCTATTGTATATCTATATTGAGCATGTTGAAAACTATAGAATTTAATACTAATTTACATAGAGTAACAATTTACTTACTCTCGTTGACGACTCAGATTAATTTCACCAACAACTTGAGAAAAAATCACGAACAACTTAGAACACTATCACAGGGAAACACTGGTATTCTCTGGGGAATTTGAGGCCAAGACAATGGGAACCTTCTTCTTGATTTTAGGGAGAATTGAGTGAAGTGAGTGTGTTCAACTGGGAGGAATTCTATAGTTTATATAGAATGTCATATCCCTTTCCTATTCGTAATAGGTTAGGGATATATTTAATTAATTAATAATAATTAATTGCTCTTCCCAGTTGTAATAGGATTTGGATTTATTTATTTAATTAATAATAATTAATTAATTAACTCAAATTTAATTATTTCATTTAAATCATATTTAAATGAACATTTCCCACATAACCTATAGTTTTGACATGAATCCAATTCATGTTAAAATTAATATTTGAAATCATTCAAATATTTAATTAATTTTGAATCATATCAAAAATTAAATGTATCACCATACATTATATTATTTCCCTTATTGAATTTGAACACTTCAATTTACAATCAAGACTTAATTTCCTCAAGTACCCTTTACGAGCTACTAGTGGGACCTAATGGACCTACAGATCAGAAGCTCCAACGATATGAGATTAATTGGCTAAACTCATTAACCAAATTAATCAATATTCGTTAACTGTGGGTACACTCCACCATAGACCCACAACTGCACTCTTCTCACTGTAGAATATTTTTGTGTCCACAGATATAAACCAATAACAACAAGTTAGTTAATCTGCTATGCATGATAATTATTGTAAATTTTGTCCGTCGTATTGGTATTTTAATCTAGATTAAAACACAGTCAAAGGTCTTCTGATAAACCTTCCGCTGCGTTAGGGATTTCATTCCTACAATTGGTATCAGAGTCTCGTTGTCCCTTTTAATCAAGATTAAAATTTGCGACTGGTTCTAATAGGTGGGATTAAATGCATTATGAATGTTGGGATTGCGTTGAACTGTTTAGGTTTATTTGACCATAGATTTTGTTATTTTATGTGAATTGTGTTGGGTTTTATGCCCTAAAACTCGTAGATAGTGAATGTAAACAAATTGTATACTTGTTTCAATAAAGTGTTATTGAGTTTCCACAATAAAGTGTTATTGTTAAATATTGCAGAATTTGACCCAAATCCAATAAACTAAGATCCAAGGTTGTTTGCATGTAAGTTGAACTAGTATGTGTGGACATACAAGGATCGATGTTCAAGTAACAACCTAAAAGGTCTATGGTACAAGGATAAGGTTGGGTATCTTATCCTAGTAACACTATGAGATACGACCCGCTTTGTATTTGATACAGACGTATTGATCCAAAGCGTCCATGTAGTAGACATGCAAGCGGGGGTATCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGACCGGACCACGAAATAGTCAACCATTAGTTATAACACCGTTAACTAGTTAGGTTACTGTTTCAATAGGATGACCTACGTAACTCAGTCTTAATCCTGAGTGTGTCATGAACTCCTTCTCATGAGGGATTGTCCTTTGATTAGCATGGGTGAGAGTGGCCAATACGCCGACTCAATATGCCTTCCTTTTTGGGGACAAGGCCGAGTGGGAGGCTGGGGACATGACAACACAAGAAGGAATTCACTCCTTCCCGCTTCTAGGAGAAGTAGATGAGTGTTCCCTTAAGTAGTGACTCCGGGACTTGAACAAAGGGATCCCACCCTCTCACTGGCCCGAGAGGGACTTTCTGTTTAATGGTTGGACCATAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCGCTGGTACTTAAGGAGACAGATGTAACACAGGGGTAAAATGGTAATTTGACCCAGCTGTGATTACGGACACTCGTGAAAGATTGACTTACCGACATAGGTCTATATCTGTGGACACAGAAATGTTCTACAGTTAGAAGAGTTCAGCTGTGGGTCTTTAGTGGAATGACCCACAGTTAATGAATATTGGTTAACCTGATTAATGAGTTTAATCAGTTAACCTCATATCATTGGAGCTTCTGATCTGTAGGTCCATTAGGTCCCCCTGCTAGCTCGTAAAGAGTAATTAGGAACAAATATATCTTGAGAGAATTTGAATAGTTCAAATTCATATTTGGAATTAAGTTAATTGTATGAGATACAAATTAATATAATGTATAGTGATGCATTAAAATATAAAGTCCAATTTAAGATTAAACTTTATTATATCGAGAGATTGATATATTTGAAAGAGTTCAAATATATGTCTAATTAAATATATGGTATTTATTATTCAAAAAATATATATATATGGTATTTAATTAGAAGATGAATTAATTAATTATTCAATTTAGTTTAAATTAAATGAGATTTAATTAAACTATAGTCTATGAGGGAATTATTAGAATATGATTCCAATATGTAATTAATTGAATATGGGAGATATTTAATTAATTGTAAAATTAATTAATTATTGAAATTAATTAATTGATTAGTTTAATTGAATTAATTAAATGTGATTTAATTAAGTTTAATTAAAATATATTATGTGAGGAAATTACATTTAAATAAGATTTAAATGTGCATAAAATTAATTAATATGATTAGTTAATTAACATTTAATTAATTGATTGATCTTGATCTAACGGTCAAGATTGTTTCCTAACCTCACATTAGGGTTTCCTCCCTTATAAAAGGAAAGGTTATGAGAACCCTAGCCCTAAGGTCTCATTCTAGCCTCTCTCACATATTCTCTCAAGAACTCTAGAGAGAAATTTTCTCTCTAAGAGTTTTTCCCAATCAAGATTAGTAGTCCCACAACTACGTTCCTAATCTCAGAGAATAGCAGGGTAGTCTCGTGGTGGTGTCCGTTGAAGTATTCAGAGTCGTCAACGGAGGTATGTTTTTCAACGCTTAACTTTTTGCCAATGTATTGGTATTTTGTAGAACAAAATTAATTTACGAACGGTCCAATTGCTTCCGCTGTAACGGAATTGGGAATTCCAATCCTTTAAATTGTTCATGTAAAAGGCTCTGTGTTTTGGGCATAAATTGCAAATTCAGAGTTTGTAAGTCCAAGTCGAGCATACGGATGCCGATTGTTGAAATCGCAGACGAATTCGAGACGCATGGTGAAGGTGCAGCCTGGTGAGAATTGCTTCGGACTCAACGTTGTCGCAATTCCAGACGCGTGGTGAAGGTGCAGCGTCTCGACGCTATCACGTGGTGCGACAGGAATGAGGTTTTTTCATGCATGCATAAACCCTAATGTGCAGTTCAGTTGGTTGGGACCTTTTTGGTCCGTTCAACCCGGTTTTAGCTCAGTTCGTGGTTTTCGAAGCTGGTTCGAAGAAGTTCGGGTCGATTCGAGCGGTCTGATCCGGTTCTGGAGCTGCAGATTTTTGTAATAGGATAGAATTTAGCTTTATTAAGTATAATTTAGCTTTATTTTATCCTAGGGGCCAAATAAATCGGTTCAATTGCTATTTATATGTTTTATGGATGTCATATTAGAATTCCACCTTAGGTTATAAGCATGCACATGCATTTTATTATATTATAATTGTTACAATGTATGATTAAATGCATGGAGATTTTCATGAGTGATTTAATATAGGTGTATATTAAATATATGAAAATGAACTAAGTATGAAGCATGTCATTACTTAAATTAAATATAAAAAGTTATGTTTAAAGTGATGAATGCAACATGCTTGTGCGATTTTCTTGTTTGGCGATTATATAATTGTTATATTAATAATAATAAGAAAATGAACGATGCATGGAGCATGAAACATCCATAGTTATTAATATAATGGTTATATTTAAATTCATGCGATGCATATTATATGGTTTGATAATTTAATTTGAATTTGATTGTTAAATGTATTAAACCATTGAAGCATGATTATAGGTCTAATCATTAAAATTTTAAAATTAATGATTAGTAACCGTCAATCTATAATCAAGAATTGCATGCAAACATAGGATCATAAGGTTTAATTAATTAATTTTAAATTGGTTAAAATTAATTAGATCTAAGATCATGTTCTAATAGGATTAGAATTTATTCTTACTTAGTATTAAATCGTTTAATTGGACTAAGTAGGAAAAACATTGCTATGATTATAAAGGGAACTCTGCCGGTTAAGTTCTGTCTATGACTGGGGGGTACTTAAGATGATGGTTTACGGAACACCTTCTACCTAGGAACTGACACGAGTTGAATTAATCATAGTTTAATATTAGCATGCAATGTCACTAGGTCAATTAAAAGTGCTTAATTCACCTAGAACTTACAAATATAATGGTTATATTAAAATTCATGCAATGCATAATATGAAGGATTGAAATTCCCAATTTCGTTAAAGCGGAAGCGTAATTGGACCGTTCGTATTTAATTTCGTTCTACAAAATACCGTACATTGGCAAAAAAATTAGAGAATTCTAAATTCACTAGGCTAAGCAATGAGAAGCGTACCTTCGTTGATGACTCTGAATACTTCAACGGACACCACCACTTGGTTTCCTTGCTATCCTCTGAGTTTGGGAACGGAGTGGTGGGACTCTATGACCTCTTGATTTTGGGAAGTGAATTAGAGAATAAAGTATTTCTCTATTCTTGGCTTCAGAGAAAAATGAGAGAGACAGAGAGATCTCTTTCCTTTTCAGAATTGGAATGAACGCTTCTCTGAAGCGTGAGGGAAAGACCCCTATTACGTAGGATCTGATAATCACTCCCCTAATTGGAGAGTTGGTTATTTAATTAATTCATTATAATATAAAACATTATATTATAAATTAATTAATTAACTATATATAATTTTTTTTAAAAGAATTAACTATATATAATTAAACATCTCATATTTAATTATATATGTGCATTAAATCATATTAAATGCATAACCCTCACATAATATATAGTTTCAATTAAAATTAATTAAATCGAATTTAATAAAATTAATTAAACTACACAATTAATTAACTCTTTGACCAATTAAATAACACATATTTAATTAATCAACCATTTAAATCATATTTAAATGTGCATCTCTCTTATAACCTATAGTTTTAATATCAATCATATTCACACTAAAATTAATCTATAGATATTAATTTAATAAATCACATTTAACTAAATTAAATTGAACAATTAATTAATTCAAAATTAATTAATTTTATAATTAATTAAATATCAATCATATTTAATTAATTACATATTAGAATCATATTCTAATATATCTCTCATATATTATAGTTCAATTAAATCACATTTGATTCAACGAAATTGAATAATTAATTTATTCACTAATTAAATATCACATATTTAACTAGTCATATATCAATATAATAAAGTTTAATCACAAATTAAACTTTATATTATAATGTATCATTATACATTATATTAATTGTATCTCATACAATTAACTTGATTCCCAAGATGAATTTGAACTATTCAAATTCTTTCAAGATTAATTGTTCTCAATTACTCTTTACGAACTAGCAGGGGTGTCGCTACGGGTTTGCGACGTGGAGCGGCCGACTTTGTTCCCAAGAGGAGGAAAATGGAGTCGCCACCAGTCTTGATTTAGAGGGTGTGACTGGACACCCAAAATATGCTAAAATGGTCTGCAAATAAAAGATTTAAGGTTCGGGAGTCTTTTGTGTATGGGGAGGGTGTTAGCACCCCACAACACTCGTTCAAAGAAACAAAATTTTATTTTTCTTGTGTTATTTAAGGAAATTGGCTATTGTAAATACTAAAGAAGATTTTTTTTGTTGATTTTTAAATGTCCCACATTTTAATTCTCATTATTCCATAAATAAATAATGAGCAATAATTGTGGGTGGCATAAAGCCATTCAAAATTTGTATGAATTTAATTTGACATCCCAAATTTAAATTCATTATACCTCAAGAATATTAGGAAAGTCAATATCTTGATTTCTTCATTTCCGTCATAGGAAATTTTTTTTTTAAACGTTTGGTTTATTAATTTTGAAAATTGTGTGAGTAAAAAATATTTTTTTTTATGAAAACTCTGAATTAATTTTTATTTTTAAAGAAGTGACATTTTTACGGAAAATAATTTGAATGGATTTATTATTTTGAAAATAAGGTTTATGAAACAATTTTAGCAAAAGCTTTTAATACATTCCTTTTAAAGAAAATGACTTTTATGAAATACGTTTCTTTTGAAAAAAAGGTTTTAAAATGAAAATATGAATAATTTTTATTTATATTTTATAAGGGAAGAAATTTCAAAATCAAATCCTGGCATCCCAAGATTTTAATTTTTTTCCTCAAGAAACTCAAATATCGGCATCCTGAAGATTCAAGATTCCATCATTAGAAGAATTGTGTTTTGAAACTATTTGATTAAGAGAAAAAAAAATTATAAGAGAATTACGGATTAAATGTAATATCATAATTTAGAGAAATAAGAAAAAAAAATCAGCAACGTATAATTGAGAGAAAATGTTTAAAAGGGAAGAAAACTACCCTATACAAGAATTAAAAATTCATTAGATTCATTTGCTTTAAAGGAAACATTTTAAAATCAAATCTCGGCATTCCAAGATGTTGATTTTTTACCTCAAGAAACTCAAACATCGGCATCCCAAAAATTCGAGATTCCGTCATTGGAGTTTTTTTTTTTTAATATTTTTTATTTTTTATTTTTGAAGATGAATAACAAAGGAATCATGGTTTTAGAAAAGGTATTTACAAGAATCAATAGGATCGCATGACCGAATTCAAAGCAATAATAATGTAAGATTGAATGGTAAATAAAATTAGCAATCTATGATGAATAAACTATATTTTACAATTAATTTTAAACTTTGTAGTTAAATGATGGAAGAGATTGTCGAGGTCTCTTATCAAATAAATTTATAATCCTCAACCTCTAAAGCTAACTTGTAGCAGTAGCGGCCGGGGTCGATCGCAGGGAGTCTATGCAACAAATCTTAATTTCCTTATTTGCTTTAGGTAACCAAAAGGGGGGAATTTTGTATATGGAACGAAAGTAAATATGGAAAGAAAACTAATTAAGGAAAATGTTGTAAAAGGAAAGTAGAAAATTAAATTAAGGAAAGATAACAATACCTCAAAAATCATGCAACCGAGTTAGTCATGGTAAGTTCAATTCAATTAAATCATCAATTTCACTAATAAGTCAAAACAAGTTTAAGCTCGGCGTATTCCGACAACAAACCGAGAATCGTGATCCAACTATCACAAACATGCAAACACTAAGTTTGATTCTAGTTTAAACTAATTAATTGGCCGATTAATTAACCTAAACCGCAATGAGATCTAGCCGAGTTAATTCACATGTAACGGGCAACAAACCACAATTACAATTAATTAAATCATTTAGTTCTAGGGACGCATGCGTATAAACATAACGTTAACCTATTTGCTACTAAGATTTAGCAAGTAAATTTAGAGCGGGCGCGGTCAAGGTTGTCAATCTTTCCTACCACAAACTAAATTTATAGAAAAAGAACTAAAATCACATAAACATGCTTTGATAATTCAAACAAGAAATTTCATTAAACGAATATGAACTTACTCTTGACTTCCCGGTTACATGAATGAAGAGCTTAGCCTCTCATGGAATAAGAGCAAGCTTGCTTCTTCATGGAATACATCAAAGAAAGCAATAAAAACTAAAACTAAGAAGAATGGTGGAAAAGGGGGAGAGAGATGGTGTAAACCCGAGACTTTCCCTTAGATAATTTTCTCTTATCATCTACTGTGGCTTCATGGTTGAATCTAAGTTGTTGGAAATTATACACTTAAAAAGAAAGGAGATGGGAAAGAAGAAAAGAAAATAAATGGAAAAGGAAAAGGAAAAGGAAAGGGAAAAAAAAGAAAAAGAAATGAAGTGGGAATGGACAGCAAGAAAACCCACCACCGCCTAACTTATTTTCAGCCCATTTTCCCATCATTCCTCATCATTTTACATCCAAAATTTCAGAGCACTTGAGGGAGAGAGTGAAGGAAGAAGAATAAGAAGAATTTCGTAGTTTGAGGTTGAAGAAGATAAGAAAAGCTCATGCAAAGCCAGCCATAGCAGAATCTGAGTTCAACCTGTCAACCTCTGGTTTTTATTAGGTTTGAGCTACACAGAAGGAAATAAGAGGTGAGGTTTGATTTTCTTGAAAGTTAGTTCATTTTCTAACAAATTTCATGAAGGAAGCTTGACCTAAATCGTATGAGAAGTTAATGGTTTTTGGAATGGAAAACAGAGCACAGGATTTTCGAGCAAACCAGGAGGATCTCTGGTTTTCTCTGATGTTTTGAGCATTCTGGGGTGTACAAGTTGAATCAGAAGCTCTATTTTGTATGGTTGGAAAGCTTATTCAATTATCTACAACTTTCATGAAGAATTCGTGAGCCAAAAATGACTTGAAGTAGGTTTAATTGCAGGAGGAAGATGAAGGGTAAAGAGAAGCTCGAATCTGTGTTGTCTGATTTGGGGGCATTTCTGGACAAATTGGTTGGGAATCTCGTTTTCATTTCTTCGGGTAAGTTGTAGAGTGTTCGAAAATGAAGAGTTTGATGTGTATTTCATTAATTTTGGTTAAGTATTGAGGAAGTTATGGGTGTTGGAAGTTAGGGTATAGAATCTGGAAAATCTGGAAAGTAGAATTGTGAATGTGATTCTTAATCCAATTGTTTAAAAATTCATGAGCATGGAAAGACAAAGCTATCTATGTTTCTAATGCTCGGTTTTGGTTATTTGACAGGCCAAGAGGAAATAGGTCGAGTCTACAAACCGGGGAACTAGATAAGACAGTGAGTGACAAAATGAATTTCGAAAATGTTCTTAAACGATTGTTCATGATTATATGTTTTACATGCTTTCCTATGAATGATACATGGTTTTTATGAACGGTTTCAAGCATGAGTTTTGAGCTCAGATTTTCTAATGAGGTTTATATACGAGCACGTGTCTAATGACTTTATGAAAAGTAGCTGAAACGATATCTTTTAAAGCAAAGTATGGATTAGCAAGTACTTCTAAATGATTTTCGGTTTTCCACGAGCAAGCTGAGTAAGCTTAAGTTTTACGAAAGATAACGATAAGCAGGCATGTTTTAATGTTTTCATGTGATTTTCTGAGATTTCTATTGACTACATGACTGAGATATTGAGCCCGAGGCTATATGGTACCGTGTGCACACAGGTTATATTCCGTTGTCGACGTTGAGTGTACTCCGTGACAACGATGCTGTCGTGAGTGCTGGGCGGGCCCCACTGCGACAAAGACGATGGGAGTGATGGGCGGGCCCCACTACATCGTAGGACTAGTAAACGTTGGTTGTACTGGGCGTGCCCTACACAACGTAGATCGGTCATGTTAGTTAAAACGTTTGATATACTTGATATGCCTTGCTAGATTCTTAATGACGGACTTGCGAAATGTTTTAGAAAGCCTTTATCCTTACACGTTTATGTCAAACGCTTTGACTGAGCATATTTATACGTTTAAAGGTTTATCACGTGTTTTGACTTCCAGATTTAGAGTTTTAAAATTAGTCACTCATTGGGCTTCGTAGCTCATTCTTTCAAAATGTTTTTCCACTTTCAGGTAGAGATCGAGCTCCCGGTGCCTGATACACTGCCAACGTCTGCTGAAAGTTCTAGATCAAGCTCCAGTACGTGGTTGGAGTTGTATATTGAGTCCGTTCATATTGTAAATGTTTTGTAAGGATTGGATAATATAGTCCTAGAGGTCGTGGTTGTATAAACCCTCGTTGTATATGTTTTTGGTTGTGACATCTATATCAGGTTATTATCCGAACCAAGTTATGTCAGGGCGGCACCTCGTGTATGTTAAAAGTGTTTTCAGGGATTCTGCTGTGTTCTGTTTCGTGTAGAATGTTTTATATTTGTGATTACTATGTTTATCAGGTTCAACGTTTCCGTAGGGTCAACAGGGACCGTTAA

mRNA sequence

ATGACAACACAAGAAGGAATTCACTCCTTCCCGCTTCTAGGAGAAGTAGATGAGTGTCCATTAGGTCCCCCTGCTAGCTCAGTTTGTAAGTCCAAGTCGAGCATACGGATGCCGATTGTTGAAATCGCAGACGAATTCGAGACGCATGGTGAAGGTGCAGCCTGTTCAGTTGGTTGGGACCTTTTTGGTCCGTTCAACCCGGTTTTAGCTCAGTTCGTGGTTTTCGAAGCTGGTTCGAAGAAGCTAAGCAATGAGAAGCGTACCTTCGTTGATGACTCTGAATACTTCAACGGACACCACCACTTGGTTTCCTTGCTATCCTCTGAGTTTGGGAACGGAGTGGTGGGACTCTATGACCTCTTGATTTTGGGAAGTGAATTAGAGAATAAAGGGTGTCGCTACGGGTTTGCGACGTGGAGCGGCCGACTTTGTTCCCAAGAGGAGGAAAATGGAGTCGCCACCAGTCTTGATTTAGAGGGTTTGAGCTACACAGAAGGAAATAAGAGGCCAAGAGGAAATAGGTCGAGTCTACAAACCGGGGAACTAGATAAGACAGTAGAGATCGAGCTCCCGGTGCCTGATACACTGCCAACGTCTGCTGAAAGTTCTAGATCAAGCTCCAGTACGTGGTTGGAGTTGTATATTGAGTCCGTTCAACGTTTCCGTAGGGTCAACAGGGACCGTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGACAACACAAGAAGGAATTCACTCCTTCCCGCTTCTAGGAGAAGTAGATGAGTGTCCATTAGGTCCCCCTGCTAGCTCAGTTTGTAAGTCCAAGTCGAGCATACGGATGCCGATTGTTGAAATCGCAGACGAATTCGAGACGCATGGTGAAGGTGCAGCCTGTTCAGTTGGTTGGGACCTTTTTGGTCCGTTCAACCCGGTTTTAGCTCAGTTCGTGGTTTTCGAAGCTGGTTCGAAGAAGCTAAGCAATGAGAAGCGTACCTTCGTTGATGACTCTGAATACTTCAACGGACACCACCACTTGGTTTCCTTGCTATCCTCTGAGTTTGGGAACGGAGTGGTGGGACTCTATGACCTCTTGATTTTGGGAAGTGAATTAGAGAATAAAGGGTGTCGCTACGGGTTTGCGACGTGGAGCGGCCGACTTTGTTCCCAAGAGGAGGAAAATGGAGTCGCCACCAGTCTTGATTTAGAGGGTTTGAGCTACACAGAAGGAAATAAGAGGCCAAGAGGAAATAGGTCGAGTCTACAAACCGGGGAACTAGATAAGACAGTAGAGATCGAGCTCCCGGTGCCTGATACACTGCCAACGTCTGCTGAAAGTTCTAGATCAAGCTCCAGTACGTGGTTGGAGTTGTATATTGAGTCCGTTCAACGTTTCCGTAGGGTCAACAGGGACCGTTAA

Protein sequence

MTTQEGIHSFPLLGEVDECPLGPPASSVCKSKSSIRMPIVEIADEFETHGEGAACSVGWDLFGPFNPVLAQFVVFEAGSKKLSNEKRTFVDDSEYFNGHHHLVSLLSSEFGNGVVGLYDLLILGSELENKGCRYGFATWSGRLCSQEEENGVATSLDLEGLSYTEGNKRPRGNRSSLQTGELDKTVEIELPVPDTLPTSAESSRSSSSTWLELYIESVQRFRRVNRDR
Homology
[Close]
BLAST of Spg034278 vs. NCBI nr
Match: KAA0040420.1 (NBS-LRR type resistance protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 96.3 bits (238), Expect = 3.7e-16
Identity = 49/61 (80.33%), Postives = 52/61 (85.25%), Query Frame = 0 

Query: 158 LEGLSYTEGNKRPRGNRSSLQTGELDKTVEIELPVPDTLPTSAESSRSSSSTWLELYIES 217
           L  LSY EG KRPRGNR SLQTG+LDKTVEIELP+PDTLPT AES  S+SSTWLELY ES
Sbjct: 19  LFSLSYPEGTKRPRGNRPSLQTGKLDKTVEIELPMPDTLPTFAESFGSNSSTWLELYFES 78

Query: 218 V 219
           V
Sbjct: 79  V 79

[Close]
BLAST of Spg034278 vs. NCBI nr
Match: KAA0025357.1 (hypothetical protein E6C27_scaffold1204G00410 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK23443.1 hypothetical protein E5676_scaffold605G00460 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 92.4 bits (228), Expect = 5.3e-15
Identity = 51/78 (65.38%), Postives = 55/78 (70.51%), Query Frame = 0 

Query: 158 LEGLSYTEGNKRPRGNRSSLQTGELDKT-----------------VEIELPVPDTLPTSA 217
           L GLSY EG KRP+GNR SLQTGELDKT                 VEIELPVPDTLPTSA
Sbjct: 19  LFGLSYPEGTKRPKGNRLSLQTGELDKTVIFLLSTLSVLRDNDVVVEIELPVPDTLPTSA 78

Query: 218 ESSRSSSSTWLELYIESV 219
           ES RS+S+TWLELY ES+
Sbjct: 79  ESFRSNSNTWLELYFESI 96

[Close]
BLAST of Spg034278 vs. NCBI nr
Match: KAA0051980.1 (DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK04577.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 7.7e-14
Identity = 51/78 (65.38%), Postives = 53/78 (67.95%), Query Frame = 0 

Query: 158 LEGLSYTEGNKRPRGNRSSLQTGELDKT-----------------VEIELPVPDTLPTSA 217
           L GL Y EG KRPRGNR+SLQTGELDKT                 VEIELPVPDTLPTSA
Sbjct: 19  LFGLGYPEGTKRPRGNRTSLQTGELDKTVIFSLSTLSVLRDNDAVVEIELPVPDTLPTSA 78

Query: 218 ESSRSSSSTWLELYIESV 219
           ESS S+SSTWLEL  E V
Sbjct: 79  ESSGSNSSTWLELNFEFV 96

[Close]
BLAST of Spg034278 vs. NCBI nr
Match: KAA0052218.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold207G00290 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK01785.1 uncharacterized protein E5676_scaffold113G00130 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 87.4 bits (215), Expect = 1.7e-13
Identity = 42/49 (85.71%), Postives = 46/49 (93.88%), Query Frame = 0 

Query: 170 PRGNRSSLQTGELDKTVEIELPVPDTLPTSAESSRSSSSTWLELYIESV 219
           PRGNR +L TG+LDKTVEIELPVPDTLPTSAESS+S+SSTWLELY ESV
Sbjct: 79  PRGNRPNLHTGKLDKTVEIELPVPDTLPTSAESSKSNSSTWLELYFESV 127

[Close]
BLAST of Spg034278 vs. NCBI nr
Match: TYJ96965.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold506G00070 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 2.9e-13
Identity = 43/49 (87.76%), Postives = 45/49 (91.84%), Query Frame = 0 

Query: 170 PRGNRSSLQTGELDKTVEIELPVPDTLPTSAESSRSSSSTWLELYIESV 219
           PRGNR S QTG+LDKTVEIELPVPDTLPTSAESS S+SSTWLELY ESV
Sbjct: 137 PRGNRPSRQTGKLDKTVEIELPVPDTLPTSAESSGSNSSTWLELYFESV 185

[Close]
BLAST of Spg034278 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TAS6 (NBS-LRR type resistance protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold35G00450 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 96.3 bits (238), Expect = 1.8e-16
Identity = 49/61 (80.33%), Postives = 52/61 (85.25%), Query Frame = 0 

Query: 158 LEGLSYTEGNKRPRGNRSSLQTGELDKTVEIELPVPDTLPTSAESSRSSSSTWLELYIES 217
           L  LSY EG KRPRGNR SLQTG+LDKTVEIELP+PDTLPT AES  S+SSTWLELY ES
Sbjct: 19  LFSLSYPEGTKRPRGNRPSLQTGKLDKTVEIELPMPDTLPTFAESFGSNSSTWLELYFES 78

Query: 218 V 219
           V
Sbjct: 79  V 79

[Close]
BLAST of Spg034278 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DIM8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold605G00460 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 92.4 bits (228), Expect = 2.6e-15
Identity = 51/78 (65.38%), Postives = 55/78 (70.51%), Query Frame = 0 

Query: 158 LEGLSYTEGNKRPRGNRSSLQTGELDKT-----------------VEIELPVPDTLPTSA 217
           L GLSY EG KRP+GNR SLQTGELDKT                 VEIELPVPDTLPTSA
Sbjct: 19  LFGLSYPEGTKRPKGNRLSLQTGELDKTVIFLLSTLSVLRDNDVVVEIELPVPDTLPTSA 78

Query: 218 ESSRSSSSTWLELYIESV 219
           ES RS+S+TWLELY ES+
Sbjct: 79  ESFRSNSNTWLELYFESI 96

[Close]
BLAST of Spg034278 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U9X4 (DNA/RNA polymerases superfamily protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold409G002130 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 3.7e-14
Identity = 51/78 (65.38%), Postives = 53/78 (67.95%), Query Frame = 0 

Query: 158 LEGLSYTEGNKRPRGNRSSLQTGELDKT-----------------VEIELPVPDTLPTSA 217
           L GL Y EG KRPRGNR+SLQTGELDKT                 VEIELPVPDTLPTSA
Sbjct: 19  LFGLGYPEGTKRPRGNRTSLQTGELDKTVIFSLSTLSVLRDNDAVVEIELPVPDTLPTSA 78

Query: 218 ESSRSSSSTWLELYIESV 219
           ESS S+SSTWLEL  E V
Sbjct: 79  ESSGSNSSTWLELNFEFV 96

[Close]
BLAST of Spg034278 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UAH6 (CCHC-type domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold113G00130 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 87.4 bits (215), Expect = 8.3e-14
Identity = 42/49 (85.71%), Postives = 46/49 (93.88%), Query Frame = 0 

Query: 170 PRGNRSSLQTGELDKTVEIELPVPDTLPTSAESSRSSSSTWLELYIESV 219
           PRGNR +L TG+LDKTVEIELPVPDTLPTSAESS+S+SSTWLELY ESV
Sbjct: 79  PRGNRPNLHTGKLDKTVEIELPVPDTLPTSAESSKSNSSTWLELYFESV 127

[Close]
BLAST of Spg034278 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BET3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold506G00070 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 86.7 bits (213), Expect = 1.4e-13
Identity = 43/49 (87.76%), Postives = 45/49 (91.84%), Query Frame = 0 

Query: 170 PRGNRSSLQTGELDKTVEIELPVPDTLPTSAESSRSSSSTWLELYIESV 219
           PRGNR S QTG+LDKTVEIELPVPDTLPTSAESS S+SSTWLELY ESV
Sbjct: 137 PRGNRPSRQTGKLDKTVEIELPVPDTLPTSAESSGSNSSTWLELYFESV 185

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spg034278 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAA0040420.13.7e-1680.33NBS-LRR type resistance protein [Cucumis melo var. makuwa][more]
KAA0025357.15.3e-1565.38hypothetical protein E6C27_scaffold1204G00410 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK234... [more]
KAA0051980.17.7e-1465.38DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK04577.1 D... [more]
KAA0052218.11.7e-1385.71uncharacterized protein E6C27_scaffold207G00290 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK0... [more]
TYJ96965.12.9e-1387.76uncharacterized protein E5676_scaffold506G00070 [Cucumis melo var. makuwa][more]
BLAST of Spg034278 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Spg034278 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5A7TAS61.8e-1680.33NBS-LRR type resistance protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_... [more]
A0A5D3DIM82.6e-1565.38Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold... [more]
A0A5A7U9X43.7e-1465.38DNA/RNA polymerases superfamily protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 G... [more]
A0A5A7UAH68.3e-1485.71CCHC-type domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5... [more]
A0A5D3BET31.4e-1387.76Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold... [more]
BLAST of Spg034278 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 163..184
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 168..182

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg034278.1Spg034278.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0090304 nucleic acid metabolic process
molecular_function GO:0003676 nucleic acid binding
molecular_function GO:0016740 transferase activity
molecular_function GO:0008270 zinc ion binding