Spg031087 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg031087
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold11: 10723386 .. 10732021 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg031087
SyntenySpg031087
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGTGGACTTTTCCTACCGCAAGCGCACGGGTCAACCTCAATCCTCTGTTTTCTCCTCTGTTTTACGGCTCCCAAAGCTATGCTCGCTATCAAGATGCTGAAGAAGAAGAGGTGCCAGTTACACCCGAAGCACCGAAGAAGAAAACGAAGAGGAGAAAAATACCCGAAGAGAGAGAGGCTAAAAGATTTAGAAGACAACAAGCTGAAGTAATAGAGGTTATTCAGAAAGTAATCGAGGATGTTCCTGAAGAAGAGGCTGAGAAAGAGCAGCCAAAAGGACCTGAAGAAGGGAAAAATTTAGAACAAGGAGATCAACCTGTCGAAACTCAACAGGAAAATCAAGATAAGAGAGTAGAGGATGTGCCGGAACAAGGGAATGGTCAAGAAACTCAAGAACAGCAGGTTCAGGGAGAGGTTGTACCGGAAGTACCGCATCGTCGCCGCCGCAAGCAGAAGGCGGGGCGAATCAAGAGGGAAGACAAGGGCAAAGGTGTTGCTGCCGCAGCAGCTGAGGCAGAGGAAGAAGAATCTGAGGAACCAAGATTGCCATACGAGCGCTTCACCAACAACATTGCCAGAGCAAAATATTTGGACATGCTGAAACGGGACTTCCTATTTGAGAGAGGATTTGGAGAAGACCTACCACATTTTCTTAGAGCAGGGATCACGAACCATGGATGGGAGCAATTTTGTGCGAAGCCAGAGTCCATAAATTCAAATGATTTCCCCCACGCCGATTCCAATGAGATGGTGGTAGCACCATCTAATGATCAACTGAATGCGGTTGTGCAAGAAGTTGGGATTGAAGGGGCTCAGTGGAGAGTGCTCCTGGTTTTTGCCATCCTGCGGTCCCTGAGTATTGATGTTGGTAAGACCAACTGGACTTATGCTAAGAGAAGGGATGCCACTCTAAGGAAGGCACTACAGTCAAATTTTTCAAAGTCGTATCAAGCCTTCCCAGTTTTCCCCGATGACTTGTTCAATCCCTGGATCCCACCGCCACCAGTTGAAAGAGAAGAAGAAGAGGATGATCAAGCATTTCTTCTAGCCTGGTCATCGTTGCGGCAAGAAGACTCTGAGGATGCTCAGGAAGGTGAGTTAGTATTGCTCGTGACGTGCAATAGTCCTCACCGGAGCTTTGGAAGCAATTCGGGTCTTAAACGAGCGAAACCGGAGCATAAAAAGACCATTCTGCCCTTGGAGCTGTCACAGCGGAAGCGTGATTGGGACCGATTCTGCGAACACCACCACTATGGCTACACCGGTATGACTCTGAGACTTCTAGAGGCAGGAGACTTGTGGGAGCCTTTGGGAGAATTCTCTGAGATGTCCAAGGATATCGACCAAGCAGTAAGTCAATCCTTCACGTGTGTTCGTAACACCAGCTGGGTCAAATTACCGTTTTACCCCTGGGTTACCTCTGGTTCCTTAAGTACCACTGATTCCTCTAATGAACAACCCCCATTCGGTCTTGCCCCTGAAATGGTAGGCTTATGGAGTCGGCGAACTGGCCACTCTCACCCATACAAATCTAAGGACAGTCCCTCCTGA

Protein sequence

MWTFPTASARVNLNPLFSPLFYGSQSYARYQDAEEEEVPVTPEAPKKKTKRRKIPEEREAKRFRRQQAEVIEVIQKVIEDVPEEEAEKEQPKGPEEGKNLEQGDQPVETQQENQDKRVEDVPEQGNGQETQEQQVQGEVVPEVPHRRRRKQKAGRIKREDKGKGVAAAAAEAEEEESEEPRLPYERFTNNIARAKYLDMLKRDFLFERGFGEDLPHFLRAGITNHGWEQFCAKPESINSNDFPHADSNEMVVAPSNDQLNAVVQEVGIEGAQWRVLLVFAILRSLSIDVGKTNWTYAKRRDATLRKALQSNFSKSYQAFPVFPDDLFNPWIPPPPVEREEEEDDQAFLLAWSSLRQEDSEDAQEGELVLLVTCNSPHRSFGSNSGLKRAKPEHKKTILPLELSQRKRDWDRFCEHHHYGYTGMTLRLLEAGDLWEPLGEFSEMSKDIDQAVSQSFTCVRNTSWVKLPFYPWVTSGSLSTTDSSNEQPPFGLAPEMVGLWSRRTGHSHPYKSKDSPS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
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InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
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NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 32..65

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg031087.1Spg031087.1mRNA