Spg030790 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg030790
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptioncalmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X3
Locationscaffold11: 29808089 .. 29820367 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg030790
SyntenySpg030790
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

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Protein sequence

MEYQILQHLSTLTNGENVKDNVKENVNVDETIQTADVVPSQLTEDELLSLKGSLAVVRQLFPKKIHSENGLNPLFKPVTNLETWPLTLTIALTFHLDALTHLSNFFNSFERLTVGFYALKLVDSESWVRVANTPTQYAFLFGDKTEWEAGDMTTQEGIHSFPLLGEVDECPLGPPASSTIKNHPLKYSESSTEDLDQIDRNWLSLLLAQSTLSSFNSREGSVYTALERLDAANVRNLLESLPLVDARPELVGIADLDARPELDGIADLVLGGAAGPPLEVRFQTHMSQVVRFQTYDAATRISFQSALVPK
Homology
[Close]
BLAST of Spg030790 vs. NCBI nr
Match: XP_022955592.1 (calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X4 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 1.0e-13
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           E  ++ HL +LT+GEN+KDNVKENVNVDETIQTADVV SQL EDELLSLKGSLA VR   
Sbjct: 681 EADLIAHLRSLTDGENLKDNVKENVNVDETIQTADVVSSQLAEDELLSLKGSLAAVR--- 740

Query: 62  PKKIHSENGLNPLFK 77
            K +H+   ++  F+
Sbjct: 741 -KSVHAAALIHAAFR 751

[Close]
BLAST of Spg030790 vs. NCBI nr
Match: KAG7018550.1 (Calmodulin-binding transcription activator 1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 1.0e-13
Identity = 48/75 (64.00%), Postives = 58/75 (77.33%), Query Frame = 0 

Query: 2   EYQILQHLSTLTNGENVKDNVKENVNVDETIQTADVVPSQLTEDELLSLKGSLAVVRQLF 61
           E  ++ HL +LT+GEN+KDNVKENVNVDETIQTADVV SQL EDELLSLKGSLA VR   
Sbjct: 709 EADLIAHLRSLTDGENLKDNVKENVNVDETIQTADVVSSQLAEDELLSLKGSLAAVR--- 768

Query: 62  PKKIHSENGLNPLFK 77
            K +H+   ++  F+
Sbjct: 769 -KSVHAAALIHAAFR 779

[Close]
BLAST of Spg030790 vs. NCBI nr
Match: KAG6582149.1 (Calmodulin-binding transcription activator 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 1.0e-13
Identity = 48/75 (64.00%), Postives = 58/75 (77.33%), Query Frame = 0 

Query: 2   EYQILQHLSTLTNGENVKDNVKENVNVDETIQTADVVPSQLTEDELLSLKGSLAVVRQLF 61
           E  ++ HL +LT+GEN+KDNVKENVNVDETIQTADVV SQL EDELLSLKGSLA VR   
Sbjct: 681 EADLIAHLRSLTDGENLKDNVKENVNVDETIQTADVVSSQLAEDELLSLKGSLAAVR--- 740

Query: 62  PKKIHSENGLNPLFK 77
            K +H+   ++  F+
Sbjct: 741 -KSVHAAALIHAAFR 751

[Close]
BLAST of Spg030790 vs. NCBI nr
Match: XP_022955588.1 (calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022955589.1 calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X1 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 1.0e-13
Identity = 48/75 (64.00%), Postives = 58/75 (77.33%), Query Frame = 0 

Query: 2   EYQILQHLSTLTNGENVKDNVKENVNVDETIQTADVVPSQLTEDELLSLKGSLAVVRQLF 61
           E  ++ HL +LT+GEN+KDNVKENVNVDETIQTADVV SQL EDELLSLKGSLA VR   
Sbjct: 700 EADLIAHLRSLTDGENLKDNVKENVNVDETIQTADVVSSQLAEDELLSLKGSLAAVR--- 759

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            K +H+   ++  F+
Sbjct: 760 -KSVHAAALIHAAFR 770

[Close]
BLAST of Spg030790 vs. NCBI nr
Match: XP_022955594.1 (calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X6 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 1.0e-13
Identity = 48/75 (64.00%), Postives = 58/75 (77.33%), Query Frame = 0 

Query: 2   EYQILQHLSTLTNGENVKDNVKENVNVDETIQTADVVPSQLTEDELLSLKGSLAVVRQLF 61
           E  ++ HL +LT+GEN+KDNVKENVNVDETIQTADVV SQL EDELLSLKGSLA VR   
Sbjct: 610 EADLIAHLRSLTDGENLKDNVKENVNVDETIQTADVVSSQLAEDELLSLKGSLAAVR--- 669

Query: 62  PKKIHSENGLNPLFK 77
            K +H+   ++  F+
Sbjct: 670 -KSVHAAALIHAAFR 680

[Close]
BLAST of Spg030790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GWP9 (calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457554 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 5.0e-14
Identity = 48/75 (64.00%), Postives = 58/75 (77.33%), Query Frame = 0 

Query: 2   EYQILQHLSTLTNGENVKDNVKENVNVDETIQTADVVPSQLTEDELLSLKGSLAVVRQLF 61
           E  ++ HL +LT+GEN+KDNVKENVNVDETIQTADVV SQL EDELLSLKGSLA VR   
Sbjct: 700 EADLIAHLRSLTDGENLKDNVKENVNVDETIQTADVVSSQLAEDELLSLKGSLAAVR--- 759

Query: 62  PKKIHSENGLNPLFK 77
            K +H+   ++  F+
Sbjct: 760 -KSVHAAALIHAAFR 770

[Close]
BLAST of Spg030790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GU72 (calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457554 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 5.0e-14
Identity = 48/75 (64.00%), Postives = 58/75 (77.33%), Query Frame = 0 

Query: 2   EYQILQHLSTLTNGENVKDNVKENVNVDETIQTADVVPSQLTEDELLSLKGSLAVVRQLF 61
           E  ++ HL +LT+GEN+KDNVKENVNVDETIQTADVV SQL EDELLSLKGSLA VR   
Sbjct: 696 EADLIAHLRSLTDGENLKDNVKENVNVDETIQTADVVSSQLAEDELLSLKGSLAAVR--- 755

Query: 62  PKKIHSENGLNPLFK 77
            K +H+   ++  F+
Sbjct: 756 -KSVHAAALIHAAFR 766

[Close]
BLAST of Spg030790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GWQ3 (calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X6 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457554 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 5.0e-14
Identity = 48/75 (64.00%), Postives = 58/75 (77.33%), Query Frame = 0 

Query: 2   EYQILQHLSTLTNGENVKDNVKENVNVDETIQTADVVPSQLTEDELLSLKGSLAVVRQLF 61
           E  ++ HL +LT+GEN+KDNVKENVNVDETIQTADVV SQL EDELLSLKGSLA VR   
Sbjct: 610 EADLIAHLRSLTDGENLKDNVKENVNVDETIQTADVVSSQLAEDELLSLKGSLAAVR--- 669

Query: 62  PKKIHSENGLNPLFK 77
            K +H+   ++  F+
Sbjct: 670 -KSVHAAALIHAAFR 680

[Close]
BLAST of Spg030790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GVI5 (calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X7 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457554 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 5.0e-14
Identity = 48/75 (64.00%), Postives = 58/75 (77.33%), Query Frame = 0 

Query: 2   EYQILQHLSTLTNGENVKDNVKENVNVDETIQTADVVPSQLTEDELLSLKGSLAVVRQLF 61
           E  ++ HL +LT+GEN+KDNVKENVNVDETIQTADVV SQL EDELLSLKGSLA VR   
Sbjct: 562 EADLIAHLRSLTDGENLKDNVKENVNVDETIQTADVVSSQLAEDELLSLKGSLAAVR--- 621

Query: 62  PKKIHSENGLNPLFK 77
            K +H+   ++  F+
Sbjct: 622 -KSVHAAALIHAAFR 632

[Close]
BLAST of Spg030790 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GVI0 (calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457554 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 5.0e-14
Identity = 48/75 (64.00%), Postives = 58/75 (77.33%), Query Frame = 0 

Query: 2   EYQILQHLSTLTNGENVKDNVKENVNVDETIQTADVVPSQLTEDELLSLKGSLAVVRQLF 61
           E  ++ HL +LT+GEN+KDNVKENVNVDETIQTADVV SQL EDELLSLKGSLA VR   
Sbjct: 700 EADLIAHLRSLTDGENLKDNVKENVNVDETIQTADVVSSQLAEDELLSLKGSLAAVR--- 759

Query: 62  PKKIHSENGLNPLFK 77
            K +H+   ++  F+
Sbjct: 760 -KSVHAAALIHAAFR 770

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spg030790 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_022955592.11.0e-1364.00calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X4 [Cucurbita moschata... [more]
KAG7018550.11.0e-1364.00Calmodulin-binding transcription activator 1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argy... [more]
KAG6582149.11.0e-1364.00Calmodulin-binding transcription activator 1, partial [Cucurbita argyrosperma su... [more]
XP_022955588.11.0e-1364.00calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X1 [Cucurbita moschata... [more]
XP_022955594.11.0e-1364.00calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X6 [Cucurbita moschata... [more]
BLAST of Spg030790 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Spg030790 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1GWP95.0e-1464.00calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X1 OS=Cucurbita moscha... [more]
A0A6J1GU725.0e-1464.00calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X3 OS=Cucurbita moscha... [more]
A0A6J1GWQ35.0e-1464.00calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X6 OS=Cucurbita moscha... [more]
A0A6J1GVI55.0e-1464.00calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X7 OS=Cucurbita moscha... [more]
A0A6J1GVI05.0e-1464.00calmodulin-binding transcription activator 3-like isoform X2 OS=Cucurbita moscha... [more]
BLAST of Spg030790 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg030790.1Spg030790.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0005488 binding