Spg030661 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg030661
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold11: 25946537 .. 25954953 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg030661
SyntenySpg030661
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGGATAATTTTGATGATGATATAGAATTGCCTGACATTGAGAATGAGCATGAAATGCATAAAAAAGATTACTTAGTAGATAATTTCGAGTCTGATCGTGATTACACTGAATCTATTGAGTCTGATCTTGACATTCCTGAATGCATGAACCCTGATAATGTTAACACCTTTGATTCGTGTCCTGATGATGTATATAGCATAGAAACTGACCCAGAGGAACTCGAATCTGTGCATAGTATAGAATCTGACCCTGAAGAGCTTGAATTCTTTAATTCTGATAGTGAGTCATGTGCTAGCCTAGTCGAATCATTTTTTAATACTGAGTCTGAGGAATCTGAGGAGCATGTAAATGTTTTTTCTGATGAATGGTCTGGCATGATTGATAGGCCATCTTTAGATCCTAGACCGGTAGATATTATAACGCTTGATGACTCTGTTAACAATTGCTTTGTGAATAGAGACTTAGAAAAGAGATTTGATGCTGTTACATATTTTCTGCAATGTTATTATGATAATCTCTTTAGTGATGATGGGCCAGGGGAAAGTTTTTTTTCTCCCCTGTTTGCGGTATGCAACTCGGTGCGTGATTTTTTGCAGGGCCCGGAGGATAATGAAAATTTTTATTTCGAGCCTCCGTAAGCGTGTCGAGCCTCGTCTAGCTAAAGACGTTAAAGGAAGCGCTGCTTGGGAGGCAACCCAAGGATTAAAGTTTAGATAGTTGTTTTTGCGGTAAATAATTTTCTTTGCTTCGTGATCCAATTTTGTTTTGCAGGATCACCTTAAGCAAATCCCAAAATTCCAAGAATCCCATTTTTCTGGATCGAAAGGAAGAGGATAAAGCGCTCCTAGCTCAGGGAAGTCTCAGTATCCCTCTATTTGCTTTACTGTTTTAAAAACATTGGGGACAATGTTTAGTTTAAGTTTGGGGGGGAGGCTTCCGCTGTGTTGAGCATATTTGAATTCTTTTGGATGCATGAATAGATAGCCATGATAGCCAGGGATGTGATTTTAGAAATTTTGGGAGAAAATAGTTTATATGTTGTGGAATCTGGGAGCACGGCAGAAATTGTGAAATTTTAAAATTTTTTGATACTTAGTTTTGATGTCTAAAGCATGCAATAGCCTTATCTAATGACGTCTTTGAAAATCTAGATTCTTATTATGATTTTTAAAGTTTGTTGTCACCCCGATAGGCTTAGTTTCTAATATTAGGAAGTTCATGCTTGATTGTTCTAAAGAGCTAGGTACAAAAAAAAAATGTTATGCCTGCTGAGAGAAAAGCAACAGCAAGAAAAGAAAATGAGAGAAAAGAAAAATCTGTTGAAAAAGAAAATTTTGCTTGCACAAAAGAAAAAGCCTAGGGGTAAAAAGAGCTACCTGCGGTGTGATCAGTTAGGCCAACCAGAGAATAAAATTCGGGTTAAGGGTCCCTGCACCGTAGTGTGAAAGCTAGTACCATTAGATATCAAAATGCATGTTTGGTGGAGCAGCAAAAGAAAAAGTAAAAGAAAGAGAAAAATCAATTGTGAGTTTTGCTCCCCCAGAGAAAAAAAAAAAAAAAAATGACAGGCACCCTAGTTTCTTTTTTGCATGATAGAAGGACTCCGACTTATTAGGGGCTCTTAGCCAGTGTAGGGGGAAAACAAATGGAGAAAGCCATAAGACTAATCTAGGTTAGTAAAAGAATCAATAGATAAGTCTTGAGCATGCTATTCATTAATCTTAAGTTCAATCTAGTTTAAGATTTCTTCAAGAGTATGCGGTGCTTGCTTATTCCACTTGCATGTTTTCCATTCTATCCTAGGAAGTCCAAAATCATTGAGGCTTGAGCGATTCTATTTCATGCATCTTTAGAATTTATTTTGCTCGGGACTAGCAAAAGCTTAAGTTTGGGGGTGTGATAGCGAGCAGAAATGTCGCTATTTTAGTCCCAACTTATTAGGCTTTTCTGTGCTTTAATCGTGTTTTTAATGAAAATATTTAATGAATTCCGTTATTTGGTCCTTAGGAGCGAAGTTGGTGATTTTGGGAGAAAAAGTGCAAAAAATGAAGCAAATGAAACCCAAATCCAAGCTTGATCAAATGGGGGCCCAAAGAAGACACTCATGATAAAATGCCCAAAAGAAATGAAGAAGAAGGCCCAAAAATCAGCCCAAAAAGAAGCTGAAAAATCTGGAATTTTAGGGCAGCGTCGAGACGCTATGTAAGCAGCGTCGCGACGCTACCCTTTTCGTGTTGCCCAAGCCGTGTGCGTTGCAGCGTCGCGACGCTGTGCAATGTAGCGTCGCGACGCTACCCCCAATCCGGGCCTATAAAAAGGCACCCTTGGGTGCCTCATTCACCATCAATCAATTCATTCCTCAATCCATTCTTTCCTTCCTTTGGCTCCTTTGGAGCCTCTCTCAAGGCTTTCTAGCCTTTTTGAGAGAATTCTTTAGTGGGAAATATTTGGGGAATTTTGGGGAGCATCTTAGGAAGCTCAAAGGAGTGTTCGGCAGAGCTCTGAGCGTCAGCGAAGGGGTTTTTCGACGGTCAATTCCTTTCCTTTTATGCTCTTAAATTATGCTTTCTTTTGTATATGTTGTGGATACTTTAGCTATGTATAGCTAAACCCCAATTTGGGGTCTTGAAATGAAATGTTGTTATAATTACCTGTCTCTTGCCCTTTTTCCTAATTATTTGTATGGATGTGCTTAATGCTTTATTCAATCTGGCCAATTGTGTAATGATTCGATTCTTAATGGAAACTCGACGGAGAGAAGTTAGGATAGATCATAATCCATGCAACTAGTTTAATTGCCCGTCGTGACACCGGGATTAGTTGATTAAACTTAGATTCCTAAAATGAATCAGAGCGTAATAATTAATGATTTTTAATGGCGTTAAGGACACTTAGGTTGTTAAAATGAATTAATTACAATTAGGGGAACCCGACAGGAGAACCTATGTGATTAACGGAGATTCTAGGAGTATAATTAGTTGGGCAATGAGATAGGATAATTATAACAATTGTTTAGCTCATAATTGATTTTCAAGACCCCTCTTCCCATTTAAAGAAAACTCTTTCTCCATATTTTTTTATTTGATTGATCAAATTATTTTCCTGCTTTGAATTTTAAATTTCTCTTATTTGTATGAGTTGTTCTCTAAATATTATTTCGCCTAAGTACTTTTAGTGCTCAAGAGATTTTATTTTTGCTTAATTTTCGCTTCGCTTCCCTGTGGATTCGATACTCGGTATTACTACCGTTTTATATTACTTGTGCGACCCGTGCGCTTGCGGTAGCGAACAGCAGCATAGAACAAGGCTTACAATTGAGGCAAACCCGAGAGCTAGCGTCGAGATGCTGCTTTCTTGGCGTCTCGACGCTAGTTAAATTCCATATATGAAATGGGTGGTAATCAGCACAGCGTCGAGACGCTATGTCCATAGCGTCTCAACACTATTGGTTTTTCCTTATACAATGGGCGCAAGGGACAGAGTCGCGACGCTGTCCATGGCGTCTCGATGGTGTCGATAGTTTTCTATAAATACAATATGATGTGCTACGGTTTTGTGGAGTTCATTTGGAGAGATTTTAGACCTAAAACCGATTGGAGACCTTCTGTGGGAGCTAAAGCAAGGACAAGCAGCAGGAATCACTGAAGAACGTGTGGAGATCGTGACGAGGACATGCGGTTTCGGCGGAATTGAGTTTTTTTTTATCTTTTCCTTACCTCTAGTTAGTTTTATGGCCTTTTCATATCTAGCTTATATAGTAACGCCATGTATGAGTAGCTAGACGTGTTTCTTAGGGATTAATGTAATCGTTTATGATCATGGATTGATTATTGGGGATGTTTTGTGCACTTTTTTATGTATGCAATTATGTTTAAATGCTTTCAATTAATTGGCCACTAGTTGAATGATCTAAGTGTTGAATCTTGCTCGGGAGAGGGGATTTAGCGTAGACTTTACTAAATTGCATGACTAAAGTAGAATTCTAAGATCAGGAGATTCAGAATAGCTTTAGAAGTTGTTAAAAGAACTAAAAGCCTTGCATGTTAATGAACTTAGATAGGGATGTCAAGTTAATTATATGCATGAGAATCAATTAAGCTCAGGAGAGATAGTTGTGATTTACGGTTCTTAGACTTATAAAATAATTGCACGTTACAATTCATTCCCTTCAATTAATCCTAATATAAATTGACGAAATCAATTCCCTAAGAATTCTTCCAATTGAATTTCCAACTTGTTAATTTGCATTACCTTTAATTCAAGATTTCATCTCTTTGTGATCCCTAAATAAAATTGAGCAAAAGTATTCATAATAATTAGCTTAGCTAGAAAACAAATCCAAAGGACGACATTCGATTTAATCAATCACTATATTATTACTTGACTCGTACACTTGCGGTAAGCATTTTGCGCATCACTAAATCTTTCATCTCAAAGCGTGAGGACAAGAATAACTTGGTATCATTAATTACGTCTAAATTCATATCGAAAATAAGCATATCATCAACATACAGACAAATAATCACATATTCAACACCAAACAATTTCGAGTGAACACGTGTCAGAAGAATTCACCCTAAACCCATTGTTTACTAAGGTATTATTAAATTTCTCATACCATTGTTTGGAGGCTTGTTTAAGACCATAAAGAGATCTTTTAAGTTGACATACCTTGTTTTCTTGACCAGAAATTACAAAGTCTTCAGGTTGTGTCATATATATCTCCTCTTCTAAATCTCCATTGAGAAATGTTGTTTTCACATCCATCTGATGTATTAACAGCCCACGAATAGCTGAAAGAGCGATCAGAGATCTAATAGTAGCTATTTTAGTTACAGAAGAATATGTGTCAAAGTAATCAATACCTTGTTTTTGCGTATAGCCTACAACCACTAATCTAGCCTTGAATTTTTCAATTGAGCCATATGACCTAATCTTCTTTTTAAAAATCCATTTGCACCTAATAGGTTTATTTCCCTTAGGTAAATCTACCAAGTTC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mRNA sequence

ATGGATAATTTTGATGATGATATAGAATTGCCTGACATTGAGAATGAGCATGAAATGCATAAAAAAGATTACTTAGTAGATAATTTCGAGTCTGATCGTGATTACACTGAATCTATTGAGTCTGATCTTGACATTCCTGAATGCATGAACCCTGATAATGTTAACACCTTTGATTCGTGTCCTGATGATGTATATAGCATAGAAACTGACCCAGAGGAACTCGAATCTGTGCATAGTATAGAATCTGACCCTGAAGAGCTTGAATTCTTTAATTCTGATAGTGAGTCATGTGCTAGCCTAGTCGAATCATTTTTTAATACTGAGTCTGAGGAATCTGAGGAGCATGTAAATGTTTTTTCTGATGAATGGTCTGGCATGATTGATAGGCCATCTTTAGATCCTAGACCGGTAGATATTATAACGCTTGATGACTCTGTTAACAATTGCTTTGTGAATAGAGACTTAGAAAAGAGATTTGATGCTGTTACATATTTTCTGCAATGTTATTATGATAATCTCTTTAGTGATGATGGGCCAGGGGAAAGTTTTTTTTCTCCCCTGTTTGCGGGCAGCGTCGAGACGCTATGTAAGCAGCGTCGCGACGCTACCCTTTTCGTGTTGCCCAAGCCGTGTGCGTTGCAGCGTCGCGACGCTGTGCAATGTAGCGTCGCGACGCTACCCCCAATCCGGGCCTATAAAAAGGCACCCTTGGGTGCCTCATTCACCATCAATCAATTCATTCCTCAATCCATTCTTTCCTTCCTTTGGCTCCTTTGGAGCCTCTCTCAAGGCTTTCTAGCCTTTTTGAGAGAATTCTTTAGTGGGAAATATTTGGGGAATTTTGGGGAGCATCTTAGGAAGCTCAAAGGAGTGTTCGGCAGAGCTCTGAGCGTCAGCGAAGGGGAAAATAGAGGAAGAGCTAGATTCTGCCCAAAAATGCGACCGTATTTCTGGGAAGGCAAAATGAAATGCGATCGCATTTCTAGAAAACCCGAGACGGTTCCGAGTCATCCGCGGGTCGTTGTTGACGAGTCTTCTTCGCACCTAACCGGCTCTGACGACACACCAAGGTCGGGTCCTCAAGTGTCCCAGACCCGATCGAGTCGAGGAATCCCCAGTTTGACCTGGTACAGGGGTCAAACTGGAGATAAAATTTGGGTCCCCAGTCAGGGATGGGCTGCAACTGTCAACATCTTATCTACTTCTTTGCTATTGTTTATGGGGCTTTCCTTTATGAAATTGACGCATGGCACTAGAACTGGAATGAAAGATGATTGCGGTAATGATGCTGTTATAGAGAAGGATTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGATAATTTTGATGATGATATAGAATTGCCTGACATTGAGAATGAGCATGAAATGCATAAAAAAGATTACTTAGTAGATAATTTCGAGTCTGATCGTGATTACACTGAATCTATTGAGTCTGATCTTGACATTCCTGAATGCATGAACCCTGATAATGTTAACACCTTTGATTCGTGTCCTGATGATGTATATAGCATAGAAACTGACCCAGAGGAACTCGAATCTGTGCATAGTATAGAATCTGACCCTGAAGAGCTTGAATTCTTTAATTCTGATAGTGAGTCATGTGCTAGCCTAGTCGAATCATTTTTTAATACTGAGTCTGAGGAATCTGAGGAGCATGTAAATGTTTTTTCTGATGAATGGTCTGGCATGATTGATAGGCCATCTTTAGATCCTAGACCGGTAGATATTATAACGCTTGATGACTCTGTTAACAATTGCTTTGTGAATAGAGACTTAGAAAAGAGATTTGATGCTGTTACATATTTTCTGCAATGTTATTATGATAATCTCTTTAGTGATGATGGGCCAGGGGAAAGTTTTTTTTCTCCCCTGTTTGCGGGCAGCGTCGAGACGCTATGTAAGCAGCGTCGCGACGCTACCCTTTTCGTGTTGCCCAAGCCGTGTGCGTTGCAGCGTCGCGACGCTGTGCAATGTAGCGTCGCGACGCTACCCCCAATCCGGGCCTATAAAAAGGCACCCTTGGGTGCCTCATTCACCATCAATCAATTCATTCCTCAATCCATTCTTTCCTTCCTTTGGCTCCTTTGGAGCCTCTCTCAAGGCTTTCTAGCCTTTTTGAGAGAATTCTTTAGTGGGAAATATTTGGGGAATTTTGGGGAGCATCTTAGGAAGCTCAAAGGAGTGTTCGGCAGAGCTCTGAGCGTCAGCGAAGGGGAAAATAGAGGAAGAGCTAGATTCTGCCCAAAAATGCGACCGTATTTCTGGGAAGGCAAAATGAAATGCGATCGCATTTCTAGAAAACCCGAGACGGTTCCGAGTCATCCGCGGGTCGTTGTTGACGAGTCTTCTTCGCACCTAACCGGCTCTGACGACACACCAAGGTCGGGTCCTCAAGTGTCCCAGACCCGATCGAGTCGAGGAATCCCCAGTTTGACCTGGTACAGGGGTCAAACTGGAGATAAAATTTGGGTCCCCAGTCAGGGATGGGCTGCAACTGTCAACATCTTATCTACTTCTTTGCTATTGTTTATGGGGCTTTCCTTTATGAAATTGACGCATGGCACTAGAACTGGAATGAAAGATGATTGCGGTAATGATGCTGTTATAGAGAAGGATTAA

Protein sequence

MDNFDDDIELPDIENEHEMHKKDYLVDNFESDRDYTESIESDLDIPECMNPDNVNTFDSCPDDVYSIETDPEELESVHSIESDPEELEFFNSDSESCASLVESFFNTESEESEEHVNVFSDEWSGMIDRPSLDPRPVDIITLDDSVNNCFVNRDLEKRFDAVTYFLQCYYDNLFSDDGPGESFFSPLFAGSVETLCKQRRDATLFVLPKPCALQRRDAVQCSVATLPPIRAYKKAPLGASFTINQFIPQSILSFLWLLWSLSQGFLAFLREFFSGKYLGNFGEHLRKLKGVFGRALSVSEGENRGRARFCPKMRPYFWEGKMKCDRISRKPETVPSHPRVVVDESSSHLTGSDDTPRSGPQVSQTRSSRGIPSLTWYRGQTGDKIWVPSQGWAATVNILSTSLLLFMGLSFMKLTHGTRTGMKDDCGNDAVIEKD
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
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Match NameE-valueIdentityDescription
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InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
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NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 343..370

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg030661.1Spg030661.1mRNA