Spg030652 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg030652
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold11: 25660350 .. 25662690 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg030652
SyntenySpg030652
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGGAGCCGGGAACATAATCGTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCGACTTTAGGGAAGCAGATGAGTGTTCCCTTAAGTGGTTACTCCGAGTCTTGAACAAAGGGCCCTACCCTCTCAATGGCACGAGAGGGTTTTCTGTTTGATGGTTGGACCACAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGAACTGGTACTTAAGGAAATAGAGGTAACCCAGGGGTAAAACGGTAATTTGACCCAGCTGGTGTTACGGACACTCGTGAAGGACTAACTAGTCGATATTGGTCTAGATCCGTGGACACAAAAAATATGTCTGCAGTGAGAAGAGTGCAACTGTGAGTCTATAGTGGAATGTACACACAGTTAACGAATATTGATTAATGTGGTTAATGAGTTTGACCAATTAATCTCACATCGTTGGAGCTTCTGATCTGCAGGTCCATTAGGTCCCACTGGTAGCTCATAAAGTAATTTGAGGCAACTAAGTAATAAATGTAAATTGAAAATGTTCAATTTACTAAGGGAAACAAATATAATATATATTGATATATTATTATGAGAGAAATTAATATTTGAAGAAATTCAAATATAAATTTATGGAAGTTTGAAAGAGTTCAAATAATGAATTAATTAATTTAAGGCCTAAAATCTATTTGGGCAAATTAATTAATTCAAGGTCGGAAATTAAATATGTGATATTTAATTGGTGGTTAATTAATTAAAGAATTCATTAACCGGGAATTAATCAATTATGGAAATAATTAATCACTTAAGGAAGTGATTAATCATTTATGGAAATGATCTAATCACTTATGGAAGTAATTAGTCATTTGTGGAAAAGATTAATCAATTATGGAATTGATTGATCATGATTGATTAAATCAGGAATAAGATTGAATCAATTTTGGAAAAGATTGATTTAATTGAATATTTTATTCATGGCCTCTCTTCTATAAATAGAACACTAGACCTAATTGGTCCAAGATTTTTGCTCTTGCTCTTAGACTCTCAAAGACAAGACCTAGAATTCCCTCTAGCCTCCCTCTTAGAGAAAGACTCCCACAAGTCTTTTGCCTCCTAGACCTAGAGTCATACCGGTGTAACCTTTGTGGTTATTGTGTCATTCAAGAAGAATTTTCCAGCGATCACAAGCAAAAGGAGGCTGCTGCGTTTTGTTCGTTGGAGCGTCGTTGGCGAAGAACAGTCAAGTCTACAACGGAGGTTTGTAACGGTTCTTCCACTTTTCTTTAGAAAAGCATGAAAATAAATATGGATTTATTTTTCAGCATGTTTAAACTGATTTCCAGCAACTTTAAAGTATGTTTAAAGTTTGATTGAGTTTTCGTAACGGTATTTTAATGTTAATTAATATACGGCATAAGGTCCAATCGATGCGCTTCCGCTGCGTGGGGACTTTTATTCCCTTCAATTCAAATGTACATCTCACTTATAACCTATAGTTTTAATATGAATCTAATTCACATTAAAATTAATCTATAGTTTTAATTTAATTAAATCACATTTAACTAAATTAAATTGTACAATCAATTAATTCAAAATTAATTAATTTTATAATTAATTAAATATCAACCATATTTAATTAATTACATATTAGAATCATATTCTAATATATCTCTCATATATTATAGTTTAATTAAATCACATTTAATTAGACTAATTGAATAATTAATTAATTCACAATTAATTAATTTATTCACTAATTAAATATCACATATTTAATTAGTTATAAATTTGAATTCTTTCAAATATATATAATTCTCTCAATTTAATAAAGTTTAATCACAAATTAAACTTTATATTATAATGTATCACCATACATTATATTAATTGTACTTCATACAATTAACTTGATTCCCAAATTGAATTTGAACAATTCAAATTCTTTTCAAGATAATTTGTTCCCAATTACTCTTTACGAGCTAGCAGGGGGACCTAACGGACCTACTGATCAGAAGCTCCAATGATATGAGGTTAACTGACTAAACTCATTAATCGAGTCAATCAATATTCATTAACTGTGGGTCACTCCACTAAAGACCCATAGTTGCACTCTTCTCACTGTAGAATATTTCTGTGTCCACGGATATTGACCAATAACGGTAAGTCAATCCTTCACGAGTGTTCGTAACTTCAGCTGGATCAAATTATCGTTTTACCCCTGAGTTACCTCTGGCTCCTTAAGTACCGGTGCTCCTCTAATGAACAACCTGTTTATGGTCCAACCAGTAAACAAAAAGTCCCTCTCGGGCCAGTGAGAGGGCGGGATCCCTTTGTTCAAGACCCGGAGTCACCACTTAAGGGAACACTCATCTACTTCTCCTAG

mRNA sequence

ATGGGGAGCCGGGAACATAATCGTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCGACTTTAGGGAAGCAGATGAGTCTGGTGTTACGGACACTCGTGAAGGACTAACTAGTCGATATTGGTCTAGATCCGTGGACACAAAAAATATGTCTGCAGTGAGAAGAGTGCAACTGTCCATTAGGTCCCACTGCGATCACAAGCAAAAGGAGGCTGCTGCGTTTTGTTCGTTGGAGCGTCGTTGGCGAAGAACAGTCAAGTCTACAACGGAGCTGGATCAAATTATCGTTTTACCCCTGAGTTACCTCTGGCTCCTTAAGTACCGGTGCTCCTCTAATGAACAACCTGTTTATGGTCCAACCAGTAAACAAAAAGTCCCTCTCGGGCCAGTGAGAGGGCGGGATCCCTTTGTTCAAGACCCGGAGTCACCACTTAAGGGAACACTCATCTACTTCTCCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGGAGCCGGGAACATAATCGTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCGACTTTAGGGAAGCAGATGAGTCTGGTGTTACGGACACTCGTGAAGGACTAACTAGTCGATATTGGTCTAGATCCGTGGACACAAAAAATATGTCTGCAGTGAGAAGAGTGCAACTGTCCATTAGGTCCCACTGCGATCACAAGCAAAAGGAGGCTGCTGCGTTTTGTTCGTTGGAGCGTCGTTGGCGAAGAACAGTCAAGTCTACAACGGAGCTGGATCAAATTATCGTTTTACCCCTGAGTTACCTCTGGCTCCTTAAGTACCGGTGCTCCTCTAATGAACAACCTGTTTATGGTCCAACCAGTAAACAAAAAGTCCCTCTCGGGCCAGTGAGAGGGCGGGATCCCTTTGTTCAAGACCCGGAGTCACCACTTAAGGGAACACTCATCTACTTCTCCTAG

Protein sequence

MGSREHNRTRWNSLLPDFREADESGVTDTREGLTSRYWSRSVDTKNMSAVRRVQLSIRSHCDHKQKEAAAFCSLERRWRRTVKSTTELDQIIVLPLSYLWLLKYRCSSNEQPVYGPTSKQKVPLGPVRGRDPFVQDPESPLKGTLIYFS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 112..137

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg030652.1Spg030652.1mRNA