Spg029572 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg029572
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold2: 20126134 .. 20134012 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg029572
SyntenySpg029572
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGATAATTTTGATGATGATATAGAGTTGCCTGACATTGAGGATGAGCATGAAATGCATAAAAAAGATTACTTGGTAGATAATTTTGAGTCTGATCGTGATTACACTGAATCTATTGAGTCTGATCTTGACATTCCTGAATGCATGAACCCTGATAATGTTAATACCTTTGATTCGTGTCCTGATGATGTATATAGCATAGAAACTGACCCAGAGGAACTCGAATCTGTGCATAGTATAGAATCTGACCCTGAAGAGCTTGAATTCTTTAATTCTGATAGTGAGTCATGTGATAGCCTAGTTGAATCATTTTTTAATACTGAGTCTGAGGAATCTAAGGAGCATGTAAATGTTTTTTCTGATGAATGGTCTGGCATGATTAATAGGCCATCTTTAGATCCTAGACCGGTAGATATTATAACTCTTGATGACTCTGTTAACAATTGCTTTGTGAATAGAGACTTAGAAAAGAGATTTGATGCTGTTACATATTTTCTGCAATGTTATTATGATAATCTCTTTAGTGATGATGGGCCAGGGGAAAGTTTTTTTTCTCCCCTGTTTGCGGTATGCAACTCGGTGCGTGATTTTTTACAGGGCCCGGAGGATGATGAAAATTTTTATTTCGAGCCTCCGTAAGCGTGCCGAGCCTCGTCTAGCTAAAGACGTTAAAGAAAGCGCTGCTTGGGAGGCAACCCAAGGATTAAAGTTTAAATAGTTGTTTTTGCGGTAAATAATTTTTTTTGCTTCGAGATCCAATTTTGTTTTGCAGGATCACCTTAAGCAAATCCCAAAATTCCAAGAATCCCATTTTTCTGGATCGAAAGGAAGAGGATAAAGCGCTCCTAGCTCAGGGAAGTCTCAGTATCCCTCTATTTGCTTTACTGTCTTAAAAAACATTGGGGACAATGTTTAGTTTAAGTTTGGGGGGGAGGCTTCCGCTGTGTTGAGCATATTTGAATTCTTTTGGATGCATGAATAGATAGCCATGATAGCCAAGGATGTGATTTTAGAAATTTTGGGAGAAAATAGTTTATATGTTGTGGAATCTAGGAGCACGGCAGAAATTATGAAATTTTAAAATTTTTTGATACTTAGTTTTGATGTCTAAAGCATGCAATAGCCTTATCTAATGACGTCTTTGAAAATCTAGATTCTTACTATGATTTTTAAAGTTTGTTGTCACCCCGATAGGCTTAGTTTCTAATATTAGGAAGTTCATGCTTGATTGTTCTAAAGAGCTAGGTAGAAAAAAATGTTATGCCTGCTGAGAGAAAAGCAAAAGCAACAAAAGAAAATGAGAGAAAAGAAAAATCTGTTGAAAAAAGAAAATTTTTGCTTGCACAAAAGAAAAAGCCTAGGGGTAAAAAGAGCTACCTGCGGTGTGATCAGTTAGGCCAACCAGAGAATAAAATTCGGGTTAAGGGTCCCGGCACCGTAGTGTGAAAGCTAGTACCATTAGATATCAAAATGCAAGTTTGGGGGAGTAGCAAAAGAAAAAGCAAAAGAAAGAGAAAAATCAATTGTGAGTTTTGCTCCCCCATGAAAAAGAAAATGACAGGCACCCTAGTTTCTTTTTTTTTGCATGATAGAAGGACTCCGACCTATTAGGGGCTCTTAGCCAGTGTAGGGGGAAAACAAATGGAGAAAGCCATAAGACTAATCTAGGTTAGTAAAAGAATCAATAGATAAGTCTTGAGCATGCTATTCATTAATCTTAAGTTCAATCTAGTTTAAGATTTCTTCAAGAGTATGCGGTGCTTGCTTATTCCACTTGCATGTTTTCCATTCTATCTTAAGAATTCCAAAATCATTGAGGCTTGAGCAATTCTATTTCATGCATCTTTAGAATTTATTTTGCTCGGGACTAGCAAAAGCTTAAGTTTGGGGGTGTGATAGCGAGCAGAAATGTCGCTATTTTAGTCCCAATTTATTAGGATTTTCTATGCTTTAATCGTGTTTTTAATGAAAATATTTAATGAATTCCGTTATTTGGTCCTTAGGAGCAAAGTTGGTGATTTTGGGAGAAAAAGTGCAAAAAATGAAGCAAATGAAGCCCAAATCCAAGCATGGATCAAAAGGGGATCCAATGAAACCAATCATGATGAAAATGCCCAAACGAAGTGAAGAGAAGGCCCAAAAATCAGCCCAAAACCAAAGCTGGAAATTCTGAAAATTGGGGCAGCGTCGAGACGCTATGCAAGGCAGCGTCGCGACGCTACCCATTTCTTGGGCAACAAGACGCGTGCGTTGCAGCGTCGCGACGCTGTGCAATGTAGCGTCGCGACGCTACCCCCATTCCGGGCCTATAAAAAGGCACCCTTGGGTGCCTCATTTACCATCAATCAATTCATTCTTCAATCCATTCTTTCCTTCCTTTGGCTCCTTTGGAGCCTCTCTCAAGGCTTTCTAGCCTTTTTGAGAGAATTCTTTAGTGGGAAATATTTTGGGGAATTTTGGGAGCATCTTAGGAAGCTCAAAGGAGTGTTCGGCGGAGCTCTGAGCGCCAAGCGAAGGGGTTTTTCGACGGTCAATTCCTTTCCTTTTATGCTCTTAAATTATGCTTTCTATTGTAAATGTTGTGGATATTTTAGCTATGTATAGCTAAACCCCAATTTGGGGTCTTGAAATGAAATTATAGTTGAAATGTTGTTATAATTACCTGTCTCTTGCCCTTTGTCCTAATTATTTGTATGGATGTGCTTAATGCTTTATTCAATCTGGCCAATTGTGTAATGATTCGATTCTTAATGGAAACTCGACGGAGAGAAGTTAGGATGGATCATAATCCATGCAACTAGTTTAATTGCCCGTCGTGACACCGGGATTAGTTGATTAAACTTAGATTCCTAAAATGAATCAGAGCGTAATAATTAATGATTTTTAATGGCGCTAAGGACACTTAGGTTGTTAAAATGAATTAATTACAATTAGGGGAAACCGACAGGAGAACCTATGTGATTAACGGAGATTCTAGGAGTATAATTAGTTGGGCAATGAGATAGGATAATTATAACAATTGTTTAGCTCATAATTGATTTTCAAGACCCCTCTTCCCATTAAAAGAAATCTCTTTCTCCATATTTTTTTATTTGATTGATCAAATTATTTTCCTGCTTTAAATCTTAAATTTTTCTTATTTGCATGAGCTGCTCCCTAAATATTATTTTGCCTAAGTACTTTTAGTGCTCAAGAGATTTTATTTTTGCTTAATTTTCGCTTCGCTTCCCTGTGGATTCGATACTCGGTATTACTACCGTTTTATATTACTTGTGCGACCCGTGCGCTTGCGGTAGCAAACAGCAAACAAGAGACGCACCAACAGGCTACCAATAGGAAAGACAACTGTTGGTGATTACCCTTGAAGGAGCGAAGAACACTCGTGCAGAAACAATTGGCGATCTTAGGCACCGATTTTCATTAATTTAAAAGATTAAAGCATGCTGAAAATAAGAACAAAAACAGAGCAAACCGAGAGCTAACCTTTGTAGCTTCAATCCGTGAGATCTCTTGGATGTTTCTCCACACGATCGAGCCATGGACTACCGCTAGAGCCTTCCCCGCTATTCTCTGGCCTTCGAACGGGCTTGTGGGAACCCGAACATGATGAATTTGTAGAGGAAAGAATATGGGTTTGAGAGAGTTTTCATGGTTTTTCAAATACAGTTTTTGAGAGAGTTTTCATGGAGAAATTCAGCAACTTTTTATTCACCTTCAGCATCATTATATTCCACCTCTTCATGAAATTATAAAGAAGATATGATGCTTTGTGATTACCACAAATTGACAGCACATGTGTTAATGTCAAAATATGAAATTGGTGTCATTCCATGAGTTTTTCAATTCATGAATTTAAATGAATTACAATATTCATTTTGTTTAGTTTTCAACTGTAAATTAATCATATTAATTTAAATGAAAACTAATTTTAATACTTCAATTAAATAAATCTAATTTATTTAATAATTTCAATTTTAATTTCTTATATTAAAATTAATAATGCACCAATACCGTTCTCTCTCAAAACCGGTGAATGTGAATCACTATTCAAATTCAAAACCGAACATGTATCGAATACATTTTCCAATATTTAAATCATATTTAAATAATGTCAACTCTCCTATATAGTTTAATTCAAAGATTAAAAAAAATATGTTAAATTATATCGAATATAATTAACGATATCTCTCTAAATCGAATTTGAACGTTTTCAAATTCTTTCATCACTCTGTTCTAAGGTTTAATCCGTTTGAGCTAGCAGGGGGACCTAATGGACCTACAGATCATGGGCTCCAACGATCCAAGATTAACCGGTTGACCAATATTCGTTAACTAACGGGACATTCCACTATAGCCCGTAGCTGAACTCCCCTCACTGTAGATATATTTCTGTCCACCCGATATAACCGTGATCAGTAAGTCAATCCTTCACAGGTTGTTCATAACTATAGTCAGGTCAAAAGTCCGTTTTACCCCTATAGCACTTTTTGTTCCTTAAGTCTCCACTGAGTCCCTAATGAGCAATTGGTTTGTGGTCCCACCATTAAACCTAAAACCTCTCGAGCCAATGAGAGGGCGGCGCGCCTTTGTTCACGTCTCAGAGTCAACACTTAAGGGAACAACCTCTCTACTATCCCTAAAGACGGGTAGGAGTGAATTCCATCTTACAGGACTATGTCCCCAGCTATCTACCCGGTCTTATCCCCAAAGTGGTAGGTTTATTGAGTGGCATTAATGGACCACTCTCACCTTTTCAAATCAAAGGATAATCCCGAATAAACAGGAGTTCATAGTTAGCTCAGGATTAAGATCGAGTTACCTAGGTCATCGCTTGAAATAGTCAGTTTCACAGTAAACGACGTTATAAAGTGAAAGTGGCTTATTTCGCGGTCCAGTCTTATACAAACTCATTTGCATAGGACGCCCCCACTAGCATTTCTCTATATGAACGATACAGGATCACATCGTTTGTACTGAAACAAAGTGGGACGCGTCACATAGTTTTTCCAAGGATAAGGTACCCAGTCTTATCCTTATACTATAGATCGGTTTAGGCTATCACTCGAACTCGATCCATTTTTATGTCACTGCATATAGTTCCAGTGTTTCATATCATAGCCATGGATTCTAGTTTATTGGATTTGGGTTAATTAATACATAGATAAACTGATCTTTCGACAACCAGAAAATAAACTATTTCAATAATGTTTTATATATAACTTTGTTACATTTACTATCCACCAATTTTAGGACATAAACCCCAACCAAATTCCCACTTGGACTAAAACTCTAGTGGGCTATTTATAACTCGTAGACCTAGACCATCTAGATATCTGATAACTCTCCAAAAGGAAGTTATTTGTGCTAATTAGGATTGCTTTTAGAGGATTATTGCATGTTATAACCTATTTGGAAGAATGGATGCTTTGGAAGTTATTTTGTGTAGAATATATTGCTGAGCGACTTGAGGGAGAAAAATATGCGATCTAGCAAAACAGGGAGCAAAACTGTCACGTCACAACTCCTTATCCATTTTAATGAACTGAAGTTAGTTAAGCTGTTTTCAGATTTAAGGAGCAAGGAGAGCCATCCACGTGTCTAGGTCAACCTAATTTAAGCTTGTCTTCATTCTATAAAAGGGAAGAGCCGTTCAAGTCAAAGACATTCCACTCATGGGGAAGAGATCATTTCTCATTTCTATCATTGGGAGCCGAATAGAGGAGAAAGATTGGAGACTTCAAGAAGACCATCTCTACGAATTTGACTAAGGGAATTAGTATTTTCTTATAATTTCTTGTAGTTATGGATGCACATACTCAAATTGTAGCGTGTGTTGCTATGAGCTTTATGAACTAAATTCACTTAGGTGTTGGTTAGGAAGTATGTAATTGTCGTGTTTTATTCTCTATGCAATATATGTTGATTTGAGCATTTTGATTATTTGTTGTGCTTATTTATATTTTGTGCCCGCCTGGCCAGCCGGTATGAATACCACTTCCTAGTTTTAGGGATGATTTGGGAAGTGTGTGGCATTTAATCACACTAGATCATTGTGTATTGGTGAACGCTAGTGGCTGAGCTAGGGATAGCCAGTTGCCTAGTGCTTGATTGGTAGTGCGTCATTGGAGTCGAAACACATTCTAAAAAATCCAGAGTTCCGGGAGGATCCTGCTGATAAGACTGCAAGAGTTTTGCCTGATCAATAATATTGCTAAAGCATCGTTTAAAACAATTACTAAATCCTGACCAACGCCTGTTTCTAATCTGTCTGCTTTATTTGTTTACTTTCTGTTCTGTCATTTCTTTTGCTTCAGCATTATTCTAAAATCAATCATTTTAACCACTTTTGAAACCATTAAAGAGTTATACAAAATATATAAAGTGAGAGCTAATTCAGACCCTGGATTCGATTAATACTTATTACTTGCTGCGGATTGTGTATGCTTGCACAGTGTTCTAGAGTCTATTTTTACTTTGTTTTTACTCACTTTGGAAATTCAACATGTTTTTGGCGCCATTGCCGGGGAAACTAAAATCTAAATGGTCAGGACAATTTATTGTGATTGAAGTTTTTCCCCATGGAGCAATTACTTTGCAGGATGAAAAAGATGGGAGAGTGTTCAAAGTTAATGGACAACGTGTGAAACATTATTGGGGTGAGGAGTTCCAGTCGAAATATCCTTCCCTAAAGTTGGTTGATGAATGAGAAAGCATGAGTTTTGCGGGAGCATTTCACAAAGCAATATTTTGAACTCCCAGTAGTTGTTGTCATTTTATTCCTCGCTGATTTGATTTTAATTCGAGTTATTTTAGATTTGGTTTGTTTAAATTTTGTATGATTTATTTTAATTTGTTGTTGTTTTTAATTCCGTAGATTTTATCTTTGTCCAGTTTAGTTTATATTTAATTTATTCCGATTAGTTTTAGTTAGATTTTTGTTTAGTTTGTATTTTCGGTTATTTAAATTTCTGTTTAGATTTAGATTTTAATAAAGTTTTTTCTGATTTATTTGGCTTCGAGTAAAAATAAAAGAGATTTGATTTAAGCAGATAATTTAAAAAAAAAAAACTTCCTGATTTAATTTTTCTGGATTGATTTAAATTTAAAATCTTCTGTATCCAAGATTCTTCTAGAAGAAAATATTTGTTCAGAGGTTTGTTAGGGCAATTTTAGAGAGGAATCAAATATCTCGTCCGAATAGAAAGGGGTTTTGTTAGGGATTAATTATTTTTACCGTTTGGATTTGAATTTCCCGTGGGCAGGTAAAATGCATGAAGGATCTGATGCTGCCACGTGTCGCGCAGGGGAAATCCAATGGTTTAGCCGTTCGACAGCACACCAGCATTTACCATGGGTCGTTTGAACTTTAGATTTTACCGTTTGATGGATTTAATTTTTCCGATTGCATGAGATTTGAACGGTAATTTTATTTAATGAGGGGCAAAAATCTTTCGGTTATGATTCTATTTGTTGAATCCCTATTTATGCACAGCTTTCGGTAAGTTTTTTTTTCACTTCATCTTCTTGCTTTCTTCCCTTGCCATTTTTGCTTTTCCTTTTGCTTCTGTTTCCTGTAAAATCCTTTGAGTCCGCGATGGTGAAAACGAGAGGAAGAAGGGAAAGAAACAATGAGGAAGAAGAGGTACCAGTTACCCCTGAAGTATAAAAGACGAAAGCAAATAAAAAGAAAACGCCGGAGGAAAAGGAAGCTAAAAGAAGGAAGAGACAACAGAAGGCTGAAGTTGATGAGGTAGTACAAAAGGTAGTAGAAGATATTGGTGAGGTGGTTGTTGAAGAGAACCCGAAGGAACCTGCGGAACAGAACCTTGGACAGACTGAGCCGACAGTCGAGAATCCGCAAGAAGTTCAAGAAAAATAG

mRNA sequence

ATGGATAATTTTGATGATGATATAGAGTTGCCTGACATTGAGGATGAGCATGAAATGCATAAAAAAGATTACTTGGTAGATAATTTTGAGTCTGATCGTGATTACACTGAATCTATTGAGTCTGATCTTGACATTCCTGAATGCATGAACCCTGATAATGTTAATACCTTTGATTCGTGTCCTGATGATGTATATAGCATAGAAACTGACCCAGAGGAACTCGAATCTGTGCATAGTATAGAATCTGACCCTGAAGAGCTTGAATTCTTTAATTCTGATAGTGAGTCATGTGATAGCCTAGTTGAATCATTTTTTAATACTGAGTCTGAGGAATCTAAGGAGCATGTAAATGTTTTTTCTGATGAATGGTCTGGCATGATTAATAGGCCATCTTTAGATCCTAGACCGGTAGATATTATAACTCTTGATGACTCTGTTAACAATTGCTTTGTGAATAGAGACTTAGAAAAGAGATTTGATGCTGTTACATATTTTCTGCAATCGTCGAGACGCTATGCAAGGCAGCGTCGCGACGCTACCCATTTCTTGGGCAACAAGACGCGTGCGTTGCAGCGTCGCGACGCTGTGCAATGTAGCGTCGCGACGCTACCCCCATTCCGGGCCTATAAAAAGGCACCCTTGGGTGCCTCATTTACCATCAATCAATTCATTCTTCAATCCATTCTTTCCTTCCTTTGGCTCCTTTGGAGCCTCTCTCAAGGCTTTCTAGCCTTTTTGAGAGAATTCTTTAGTGGGAAATATTTTGGGGAATTTTGGGAGCATCTTAGGAAGCTCAAAGGAGTGTTCGGCGGAGCTCTGAGCGCCAAGCGAAGGGGTAAAATGCATGAAGGATCTGATGCTGCCACGTGTCGCGCAGGGGAAATCCAATGGTTTAGCCGTTCGACAGCACACCAGCATTTACCATGGACGAAAGCAAATAAAAAGAAAACGCCGGAGGAAAAGGAAGCTAAAAGAAGGAAGAGACAACAGAAGGCTGAAGTTGATGAGGTAGTACAAAAGGTAGTAGAAGATATTGGTGAGGTGGTTGTTGAAGAGAACCCGAAGGAACCTGCGGAACAGAACCTTGGACAGACTGAGCCGACAGTCGAGAATCCGCAAGAAGTTCAAGAAAAATAG

Coding sequence (CDS)

ATGGATAATTTTGATGATGATATAGAGTTGCCTGACATTGAGGATGAGCATGAAATGCATAAAAAAGATTACTTGGTAGATAATTTTGAGTCTGATCGTGATTACACTGAATCTATTGAGTCTGATCTTGACATTCCTGAATGCATGAACCCTGATAATGTTAATACCTTTGATTCGTGTCCTGATGATGTATATAGCATAGAAACTGACCCAGAGGAACTCGAATCTGTGCATAGTATAGAATCTGACCCTGAAGAGCTTGAATTCTTTAATTCTGATAGTGAGTCATGTGATAGCCTAGTTGAATCATTTTTTAATACTGAGTCTGAGGAATCTAAGGAGCATGTAAATGTTTTTTCTGATGAATGGTCTGGCATGATTAATAGGCCATCTTTAGATCCTAGACCGGTAGATATTATAACTCTTGATGACTCTGTTAACAATTGCTTTGTGAATAGAGACTTAGAAAAGAGATTTGATGCTGTTACATATTTTCTGCAATCGTCGAGACGCTATGCAAGGCAGCGTCGCGACGCTACCCATTTCTTGGGCAACAAGACGCGTGCGTTGCAGCGTCGCGACGCTGTGCAATGTAGCGTCGCGACGCTACCCCCATTCCGGGCCTATAAAAAGGCACCCTTGGGTGCCTCATTTACCATCAATCAATTCATTCTTCAATCCATTCTTTCCTTCCTTTGGCTCCTTTGGAGCCTCTCTCAAGGCTTTCTAGCCTTTTTGAGAGAATTCTTTAGTGGGAAATATTTTGGGGAATTTTGGGAGCATCTTAGGAAGCTCAAAGGAGTGTTCGGCGGAGCTCTGAGCGCCAAGCGAAGGGGTAAAATGCATGAAGGATCTGATGCTGCCACGTGTCGCGCAGGGGAAATCCAATGGTTTAGCCGTTCGACAGCACACCAGCATTTACCATGGACGAAAGCAAATAAAAAGAAAACGCCGGAGGAAAAGGAAGCTAAAAGAAGGAAGAGACAACAGAAGGCTGAAGTTGATGAGGTAGTACAAAAGGTAGTAGAAGATATTGGTGAGGTGGTTGTTGAAGAGAACCCGAAGGAACCTGCGGAACAGAACCTTGGACAGACTGAGCCGACAGTCGAGAATCCGCAAGAAGTTCAAGAAAAATAG

Protein sequence

MDNFDDDIELPDIEDEHEMHKKDYLVDNFESDRDYTESIESDLDIPECMNPDNVNTFDSCPDDVYSIETDPEELESVHSIESDPEELEFFNSDSESCDSLVESFFNTESEESKEHVNVFSDEWSGMINRPSLDPRPVDIITLDDSVNNCFVNRDLEKRFDAVTYFLQSSRRYARQRRDATHFLGNKTRALQRRDAVQCSVATLPPFRAYKKAPLGASFTINQFILQSILSFLWLLWSLSQGFLAFLREFFSGKYFGEFWEHLRKLKGVFGGALSAKRRGKMHEGSDAATCRAGEIQWFSRSTAHQHLPWTKANKKKTPEEKEAKRRKRQQKAEVDEVVQKVVEDIGEVVVEENPKEPAEQNLGQTEPTVENPQEVQEK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 320..340
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 308..335
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 348..378
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 312..335

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg029572.1Spg029572.1mRNA