Spg028930 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg028930
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold5: 17470434 .. 17475957 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg028930
SyntenySpg028930
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGGGTTTTGCGCCAAAAAGTGGAAGAAAATCGTGGGTAAGCTCTCTTATGCCTTCGTTCTTAGTCGTTTATGGCTGATCTAACTCCTTTCTCTCATTTCGGTCAGATTGGTGCGTGTCTAGCAGCGGGATTCCATTTTCCTCCCTTTTCATCTCTATCCAGCAAGTAATTTGGCCTTGGATCGCTTTGTTCGATAAGTTTAAGCCTTACCCAGTGTTGGATGGTGCTAGATTTAATTTACCCATTGCTTTATGTGATGAAATTTCTGTTCTGCAGCGTCGTCTAAGTGATCGATTGGGCTCGAATCGTTGTAAGCTTGAATGCCCACTGTCCAAGGATCATCCTAGTACGCTATTCGAGGTTAATATAAGTCGTCTAGCGTGAAATCGGGTTCGTTTGGGTAAGATCATTGTTGTTTTTAGTTTAATAGCTTAAGGGATTGATACCCGTTAGACGTGTTAGCCTTAAAAGCATGTTTAATCGGTACCCATGAGTTATTTAGGCTTTAAAAGCGTTGTCCAACTCTTGTAGGTCCTTAGAATGTAAAATAAATAGGTTTTGCTTGCTGGTCGTGGTTTAAAAAGCATGCTAAATTATCATCTATCTATTATCTAGGCCTTAGTTGTGTTGCCCAATCGCTAGGAGTCCTTAGAATGCTAATTACGTGTAGTCTACTTGTTGTCCAGCAGCTGAAAAGCCTTAAATATGGCAACGAATACCCATTGCCCGTTGTGTCTTAGACATGGTTGTCCATGGTCTAAAGGTTTTGAGTTTTTAATTTGGGAAATTTTGAGTGGTTGTCCAGCAAGGAAATAGGTTTTTTTCTCAGTTGAATTTGGCCTTCCAAGCATGTTTAAAGTGTTTTTAGGTTGGTTCTAAATTTAGTAGAAATTATCCTTATTATTTAGGAGCTTTCTCGGACTGCTTGGATTATTAAGGTTGCCTTAGGAGAGCCGTATGTAAGTAGTTTCTACTTGTTGGGTTTTGTTTGATTGCGTGATGTATGCTATATTATTGTTTTGCTCTTTTGTTCCCCATTAAGCATGACTTGTTGTGTTAAAGCTTGGATGTGTTTTTTGAGTTAAAGCATGACTTGTTGTGCCTATAGCATGTTGTGTTGCTTGTGATGAGCATGTGTTATGTTGTTAAAGCATGATAGGATGTTGTGTTAAGCATGGTTGGTTAGGCTAGCATGTTGTCACGGGATGTGTGGCATGGGTCTAGTGGTTGCGTTACATGGCTTGTAATTCATGTGTAGGTGCGCAGCGTGGCGCATAATCCATGTGTTTGGTTTTGCGTAGCATGATGCGTAATGCATGCGTTTGTTTTAGCGTAGCATGGCGAGCAATGCATGTGTTTATTGCGTAGCATGACACAGAAATCATGTGGGCTAGGTGCGCAGTGTGGCGCGTAATTCACGTGTTGGTTTGCGCAACATGGTGCGTAATTCATGCGTTAGGTGCGGAACATGACGCGTAAATCATGTGATGTCCAGTAGGGTGTGTGCATAGTGTGGGAAGCATATGCATGGTGGTTTTATTGCTTTCTAAGCATGTTGATTGTTTATGACTTTTTAAGCATGATGGTTGCGTGTGAGAAGCATGCTGATTGACATTGGTTGTTGTTTGTGACCTAACAAGTGTGAGCTACTTACCAGTATCACGGTTGTACTGATACCCCCTTCCCTATCTCCCCCCAACATTTTAGATGTTGCAAGTTTGAAGGATAAGCTAGACCATGGTGGTGAGGAAGAGGAGAACATCAAGGAAGAAACCTAGGATGTTTGAGCTTTTATTATGTTATGCTTTGGTTAGGTTAGTTCTGGTGTAGTTATTGTTTTGTCATGGTGAAAGATTTACCTAGATGACTTGATTTTCGGTTTTAAGATCTTGTGATTGACATTGTTGTTGGTTTTAGTAGGAAAATAAGGGCTCGTTTGGTAACGTTCTCGTTTCTCGTTTCTTGTTTCTAATTTTATTAAGAAATCTAAGCATTTAATAGCTACGTATGTTTCTTTTTTCTCATTTTTTAGAAACACTCCCAAAATATGTATAGAACTTTTGGGAACAACTAAAACTAGTTTCTCATTTTTTGTTCTTGTTTCCAATTTTTTCGAAACATAAATAAGAATATAGGTTTATTATTATTGAATGTATAGGTGTTAGGGTCATGAAATTCTATTTTTCTTTATTAAAAATGAAGAAACGAAAACAAGAAACGAGAACGTTACCAATCGGGCCCTAAAAGGCTTGAGATTTAGCTAGTGTTGTGGTCGTGATGAGTTAATAATGAACTAGTAGCAGGATTTGTTGCATGGTTTAGCTTTATGCTTTCATCTAGTTGTTGCTACGAGACCAGACTCGTATAGTGAAGTTAGGATATGAAGTCTACGTTGTAGTGTTGGTGGAGTTCAGTTGTGAATGTTTAGAAGTGGGGAAATTGACAAAAATGACCCCTTTAACTTTTTGGTTTGTAATTTTGACCCCCTCCCTAGGAAAAAAGTTTTTTTGGACCCCTTGATGATGAAGATGATGTAAGCATGCATGTTAAATTACTTTTATACCATCAATTCATTAAAAACCAATAAAATTAATTATTTCACCAATTTTTCACCCACTTTTCACCAACTTCCCATATCATATTTACCCTATTACTCTTAACCATCCATTAAACCCATTTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATCCTACAATCACCCAACCCCTCATCTTCTCTCTTGAATCCACAACAAGGTTCTCAACTAAAGTGCATTTGATCCACAACAAGTGTTCATTTTTTAACAAGGTACATTTGCTTGTCATTATTCTATCGTTTTTGTTTAAAAAAAATCCAATAGAATGTGGTTAAAATGATTTTTTTCGTCAAAACTGTGTTGAACCTGGTCCAATCTCGGCCGGACAGCTTGAAAATCTCGGCCGAACCATCAATTTTTTCGACTGGGATCCATCCATATTGAAGACCGGCAGAACCGGTTTTTTCCCGACCGAACCAATATTTTCCCGACCGAGCCGTCACTGAGATTGGACCAAGATGAGGGTTTTTTATTGTTTTTTTTTAAATGTGTATGAATTTCCTGTGGTTGCATACATTTGTTTATATATTCTTTTGTATTTGTGCAGATGCCTCGTGTTTGGGTATGTTTTGGTGGTGTGTGGAAAGAGAGTGAAAAGGAGTACGATGGTGGAGAGGTGAGGGGCTTAGACAAGGATGTTGGAATTTCTTATAACGAGTTCTTAGGTCGGGTGTATGAAATAAGTAGTATAAATCCGAATGATAACGACATTGTATTGAGGTGTTTGCTTCAACTGAGGTCTAAAGCTCCCGCTTTTGTGATTAGGAACGATATAGACCTACATAGTTTTTTGACGTGGGGGGAAGTGTCTGCAAGTCCCCTTTATGTATCCACTGTGTTGAAACCATCCCTGTCCAATAACCAAGGGTTTCGTCCATATCTTATTCCATATACTGTACCAAATACCCCATATATGGGAGTGCAGTACTTTTCATATATGGACCCACATCATCAACCATACCATTACACGTCTGTCCCACCATATATACCACATAACACGAGTCAAGAAATACCATCCCGAGCCACACCCTTTCCACACAATGAAGATCATCACAATCCCTCGACCTCCACATCCTTCCCGTTCAAAGAAGAGCAAGAGCAACACATCCCCTCCGTTTCCACACACATGCCATTTACACCCATTTATAACGAGCCAATGTCACTGAGTCCATTACATGACAATGAGGGGCATATAACATTGGGGATGATGTTGACTACGTTACCCCGCAGAATGATTTCTATGACTGGGGAGAGTATGGAGACGATGTTAACCCGGACAGTGATTTTCAGGATTGGGGAGAATACGAAAAAGAGGAGCAGGACACATATACAGATGGAGCACATGAGAGTGGGGAGGAAGATTTGTACGAAGTTGATGTAACTGCCCAGGAGATGGAGGAGAACATCGGGGTTCATCAGGAGGAACTTGAAACTGCACAAAATGTCGATCCTCCTGCTATGCCGGTTAATATCTCACCCGACCCTTCTACGACAACTCGTACATCTAATTCAACAGTCATGTCAGGTCAGTACTCTAATTACAAGGATATAGAAGTGGGAGATATATTCTTGTCTAAAAAGGACTTGCAGATGAGACTGTCTATTTTAAGGATGAGAGAGAACTTTGAATATAGGGTCAAGAAGTCTAACAAGAAAATATTCAAAGTTTGGTGTGTTGTTGAGGAATGTAAGTGGAGGGTCCAAGCTACGAAGCTGAAAGGCTGCGATGTCGTTACAGTTACCAAGTATTCTAAAGGACATCATAAGTGATATGTGGTAAAAGTTCGGTGTGAATCTGAGTTATGACAAGGCATGGGGGGCTAGAAAACATGCCTTGGTTCTTGCTAGAGGCTCGCCTGAAGAGTCCTACAAACAGTTACCACGGTTTGGAGAAGTGTTGAAAATTGAAAATCCTGGTTCATTTTTTTACTTGGAAGTGGACGAGGGTCATTACTTCAAGCATGTGTTCATGGCAATTGGGTCCACGATTAGAGGGTTCTTGAACTCTATTTGTTTGGTTTTGATAGTAGATGGGACCCACATGAGGGGAAAGTTCAGTGGAAAGCTCCTAATTGCAGTAGGCATCGATGGAAACAACCAAATATACCTCGTAGGGTTTGGCATTGGGAGTGGAGAAACTGATGAATCGTGGACCTACTTTTTCCTGCAAATCGAGCTTGCTATTGGTCAACTTAATCCCCTAGTGATTGTATCTGATAGACAAAAGAGCATATGCAAGGCAGTATGGACTGTGTTTCCTAATGCAGCCAACTGCTACTGTATCCACCATCTAGAAGAGAACTTGAAAACAAAGTTCAAGGATCACGACTTTATTCCACTCTACCTTAAAGCAGCGAAGGCATTTCGTGATACAGAGTTTCAAGAATATTGGAGCAAAATTCCAATA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mRNA sequence

ATGGGTTTTGCGCCAAAAAGTGGAAGAAAATCGTGGCGTCGTCTAAGTGATCGATTGGGCTCGAATCGTTGTAAGCTTGAATGCCCACTGTCCAAGGATCATCCTAGTACGCTATTCGAGGAGCTTTCTCGGACTGCTTGGATTATTAAGGTTGCCTTAGGAGAGCCGTATGTGCGCAGTGTGGCGCGTAATTCACGTGTTGGTTTGCGCAACATGATGCCTCGTGTTTGGGTATGTTTTGGTGGTGTGTGGAAAGAGAGTGAAAAGGAGTACGATGGTGGAGAGAATGATTTCTATGACTGGGGAGAGTATGGAGACGATGTTAACCCGGACAGTGATTTTCAGGATTGGGGAGAATACGAAAAAGAGGAGCAGGACACATATACAGATGGAGCACATGAGAGTGGGGAGGAAGATTTGTACGAAGTTGATGTAACTGCCCAGGAGATGGAGGAGAACATCGGGGTTCATCAGGAGGAACTTGAAACTGCACAAAATGTCGATCCTCCTGCTATGCCGGATAAGGTTGGGTACCTTATCCTGGTAACACTATGTGATACGGCCCGCTTTGTATTTGATACAGACGTATTGATCCAAAGCACCCATGTAGTAGACATGCGAGTAGGGGTATCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGATCGGACCGCGAAATAGTAACCGCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGTTTTGCGCCAAAAAGTGGAAGAAAATCGTGGCGTCGTCTAAGTGATCGATTGGGCTCGAATCGTTGTAAGCTTGAATGCCCACTGTCCAAGGATCATCCTAGTACGCTATTCGAGGAGCTTTCTCGGACTGCTTGGATTATTAAGGTTGCCTTAGGAGAGCCGTATGTGCGCAGTGTGGCGCGTAATTCACGTGTTGGTTTGCGCAACATGATGCCTCGTGTTTGGGTATGTTTTGGTGGTGTGTGGAAAGAGAGTGAAAAGGAGTACGATGGTGGAGAGAATGATTTCTATGACTGGGGAGAGTATGGAGACGATGTTAACCCGGACAGTGATTTTCAGGATTGGGGAGAATACGAAAAAGAGGAGCAGGACACATATACAGATGGAGCACATGAGAGTGGGGAGGAAGATTTGTACGAAGTTGATGTAACTGCCCAGGAGATGGAGGAGAACATCGGGGTTCATCAGGAGGAACTTGAAACTGCACAAAATGTCGATCCTCCTGCTATGCCGGATAAGGTTGGGTACCTTATCCTGGTAACACTATGTGATACGGCCCGCTTTGTATTTGATACAGACGTATTGATCCAAAGCACCCATGTAGTAGACATGCGAGTAGGGGTATCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGATCGGACCGCGAAATAGTAACCGCTAG

Protein sequence

MGFAPKSGRKSWRRLSDRLGSNRCKLECPLSKDHPSTLFEELSRTAWIIKVALGEPYVRSVARNSRVGLRNMMPRVWVCFGGVWKESEKEYDGGENDFYDWGEYGDDVNPDSDFQDWGEYEKEEQDTYTDGAHESGEEDLYEVDVTAQEMEENIGVHQEELETAQNVDPPAMPDKVGYLILVTLCDTARFVFDTDVLIQSTHVVDMRVGVSYAMSLHKIGPRNSNR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 147..167

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg028930.1Spg028930.1mRNA