Spg028758 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAATTGGCTTCTCCAGAAGAGACAGATCTGTCGCAGGCAATTGAAATTTGAAGCTCAGAACATGGTTGATATTTTTATACATAAAGAAATCCAAGAAATTTGGTACACAGGAACTGGAAGAACATGCTGCTCTGATCGGAGTGAGCCATGGGAGCGCCATTTCAATGGAGCTCATCTCTTCACGCTGCTCCGATCAAGCTCAAATCGCCCATTTTCCTACCCTCGCCATCCAATTTCATCTACTATTATTGTAAACGATCTCGTGTCAATGATTCGTCAACTCGTCGTGGCGCTGTTTGTGCTCAGAACTCCAATTTGCCGCGGCCTAAATCCACGAACTCCGATCCTCCGAGTTCGAAATTGGTCGTTCTCGGAGATTGCCAAGGGAACGAGGTTGTTCGAGTCTCTTCGACTCCGATTCGACGGCGTAAAAGTGTGATTCTCTCTATAGTGTCTTTGTTTGATAAACGTTCTCTTTGGCGAAGGATCTTTTTTGCCTCCAAGAAAGTTAGGAGTATCATTCTGCTCAATGTCGTCACGATTGTTTACGGTGAGCTTCTGTTTAACCCCCCTAATTTTCTATTAGGTCAGTTGTTGATGTTGTCGAGCAAATATGTAAGATATATCTATGCTGAAGCGAAATTCGTACACGGCTATTCTTGAATTCTTTTATTAAAACGATTCAGCTTTTTTCCTGATTCTCCGAGGAGACGAGACTTTGTACTACTTTTCATACTATTTCTGCTGTTTGCTTTGAATTTACCCATAGTAAGAAGAATTCACTAATTTAAGCTATTCCCGCGGAATGTTATCTCAGAGTTGGGATCCATTTTTCTTTGGCAATCAACTCTCTCATGTATTTGGACTGGAATTTTGTTGTGTGCTTTATTCTTGATAGTTGCAATGCAACCATGATATTCTCCTATCACCTATCATATTAGGTCCATGCTTTGTTGGCCAACATTGTCAACATGGCATCTCTGTAGAGTGTCGTGATGTATACTATTCTTATAAGTTTGTGAAATTCTTGTGAAATATTGATCTCTTAGGTAAATTGCTTTGTACTTTCAGTTATCTTAATGAAAGCTAGTTTCTTCTTAAAAGAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAAAGGAAAAAGAAAAAAAAAAACCGTGGGTAGAAACTTGGCCATAATATACAATTTTATTCCTACTAATAAAAAGGTTAGCTACAGAAGTCTTGAAGTTTCCTTCTTTTTCTATGATAAGAAATTCCTTAAGTTCTTTAACTAAAATACCATTCCATATTTTCAAATCTTGGCTGCTGTAGCTAGCAGTATTCCGGTTGTGAAAGAGGTTGAAGAATTAGTGGATCCAGCAACCTTCAATGCCGTGCGATTTGCCATGACTGCTATTCCATTTGTTCCACTTGTATTGTATGAATGGGATGATGTTGAGACCCGTAATGCTGGAATAGAGTTGGGTTTCTGGGTTAGTCTAGGGTACCTGATGCAGGCATTTGGACTTCTTACATCTGATGCTGGGCGTGCATCCTTCATATCAATGCTCACGGTGAGATTCTGAATTATATGTAGGTATACATGGTGTAGTAAATTTTTTTGCCATAATATTCTGTATTAAGGTACTTGTGTATCAATAATCAGGTACTTGTAGTTCCTTTTCTTGATGGACTTTTAGGGGCTGTAGTTCCTGCTCGTACCTGGTTTGGAGCTCTCATGTCTGTCATTGGAGTTGCAATGCTGGAATCCTGTGGATCCCCTCCATGTGTATGTTTAGTCTCAAAATTATTTGATTACCAAGTAATGAAACTTGTAATAATAGGCAGAATCTAATCAGACATTTTTAACAATTTCTGAATGCTCTAAAATTGAGATTTTGATATATGTATAGATAGCCATTCAACTAATTCGTATGATCTAATTCAGGTGGGAGATCTTTTGAATTTCTTGAGTGCAATATTTTTTGGTGTGCATATGCTTCGAACAGAGCATATTTCAAGACGTACAGACAAGGATAAATTCTTACCACTCCTTGCATTTGAGGTTAATATTTTCTCATATATAGTAGATACTGAGGGGCAGAAATGTTAGTTTTGGTGCACAGTTTGAATGGTTTTAATTACTTCTTCAGGTTTGCGTTGTTTCTATTCTATCGATGGTATGGTATTTTATTTGGAGATGGATTGATGGAACTGAAACAATTAGCGAGTCATGGAATTGGAAAACATATTTAGATTGGGTGTTCATGTTTCCTTGGGTACCTGCTTTGTACACAGGCTTGCTGTCCACTGGTTTTTGCCTGTGGCTAGAGGTATGCCTTCTCATTTTGTCTCTATATATAACATTTTTATTAGAGTTTTGCTTTTCCTTTGAGTTGCTATTCAATTTTACTGATCCTCTGTCTTGAGCGTTTTTGCTTTTCTTGTTGTATTCCTTTTGTAACTTAATTGAAATTTACTGTGCTGCAATTTTTAATGCTTATATAGACAAATAGAAGGAGAAAAGATATTATCAAAAAAAAAAAAAATAATTAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGAAAAATAGAATGAGATAAGCTAATTGTATTTAAGCATACATTTTTCCGTGAACTTCTTGCTCATGGCTGCACATATTTGTGAATAAAGTTTGATGTGAAAAGCCCTAGAGAATTATAATTAGCAATCCTTTGGGTATATGAGAACCCCTAATTCATAAACTCTAAAACCCCCAAATCAATTTGAGTTCATTCAATCCTAAATGTTGGATTAGAAACAGATTGCCTTAAGATCAAATGTTTGAGATAAAGAACCAAGTTCCCTAACTCAAGAGTCAAACACTCCACAAACTGGATGAAAAATCCTACTTGAAAGTTCTTGGCATGTAACTCAAGACCATAATTGCCATGTATGAAGAAGCTCTTAGTTATCTTGAAAGAAAAACTCTAGGCTACTAAATTTTATTAATCATCAAATTGTCAATAAAACATCCTAATGACACGACTATACATAGCTTCCCAACTGTATGTATATCCCTTACAGTGTAGGATTAGAGTTTCCTAATTCAAATACCTAATGATTGGCCCACATGGGCCAACAAAGTCTAAACTAAACTAAATAACACTGAGGTCCACAATGGCCCAAAGTTTATAAAATAAAGTACAATCCCTATTCGACGATCATAGTTAAAAGACGTTAATGCCCCTACCAAATACATCAAACTAGGGGTAAAATAGTAAATTGGAACGGGCGTGATAATTGTGTATCCAAACATCCTCCATGATAATTGGGATGCCTTTATTTTTCATTTGATTTTTTTTTTTTTAATTTTCTTTCTCTTCCTTGTGGAGTTTGTATCTTTTGAGCATTAATTTCTTTTCATTTCTTCAATGAAAAGTTTCGTTTTTTGTAAAAAAAAAATAAAAAATCCTCTATGATGTAATCAAATGGTGATAATTGATGGAATAGCCTTGATCTCTTGATCTCCCTAGAATCAAATGAAAAGTTGAATTTGGTGGGGCTTTCATTCTTCATGAATATGGTCCATCGCATCATTTGAAGATCTTTTGATCCTTTCTTGTTTGTTCCTCCTTATAGTGTCTCTTTTAAAGCAAGCTTCCTCTTGAAGCTTGAATGATCAAAGTAGGCCTCGTACTTGCTTCGATTTTCCTTTTGGACTTGAATCTTCTTCCTTGGTTGGAGTTGAATATCTTTTTTGTAGTTGTCCAAAATCCTGACAAGTCCCCTGGTGTGTGTATGAGAGGAAGTGGTTAAAGGGGATAAGGACGGAGAATGTAAAAATGAGAGAGCAGGGACCATGAGGTGTGTTATGGAGTTATTATAATGGATACAATCTGGGGAAATAGTTAATTTGAAGAATAGGAAGTTTTGTTTGGGGTTGAAATTGAAGGAAGAAGGTGGGCTAAGCAAATAGGCCTTATTTATTTATTTGCTGAGAAACTTTTTTATTTTTTTATTTTTTTATTTTTATAAAAAAAAGGATAAATTGAAACCAAGCAAACCATAAAAGAAAGAAAGCGAAGGAAAAAAGAGAGAGCCAAAAAGAAAAACAAACCTTTATGTTGGCAACTAACTACAAATAAAGTTTACTATAAAACGCTCTAGTTGTTGAGATTAAGATATAAAAGATAATCATGGAACTCCTTGATTACAGAAACCTAAAGAGTGACATTGAACCAGCCAAAACCCACAACTTTCCTTAAGGATGCTAAGTGTCTTGGGCATGATTGTCCAAGGCAAGTTGTGCCTATGGCCGCATGTCCAAACCATCCTCAACCACCATGTTTTTACATCATGTAATTAGTTTAGTTGTTTGCTTTTGTTTGTAACTAGTTTTGGGGTGTATGACTCTTCAAGATTTTGATGTTCATGCTTGCCAGGTTGAAAATGCTCAAAATGTACTATGGGGGGACCAAGTGGTCAAGAGACCTATCCCCGGTCAAGTGTTGGACTTCCTTACAATCAAGTTTTCTTGCATCTATTGTCTACCATACTTTCGTTAAAAATGTTTTCAAATGCCTTTTCTCTCTCATGTTTTGTAAAATTATTTTCTCTCAAAACGTGAGTGGAGACTAGACCCTACATTGAAGTTGTCCTCGATTTATGATTTTTACTTAACTGTCTTGCTTGCCGAGTTGGAAGCAAGTGTTGCACGATCACCTGTCCCTTGGTCGAAAGTTAGCGATTGTGACAAGTGGCTGTTAAACAATGCAAAAAGGAGGACACTATCTCCAAGAAATAAATGTTGGTTGTTGTTCATTGCTTCAAAGCCTGGATGCAATATTTGTTGAGATCATGTTTTGTAGTGAGACTAGACAACAAGGCTATCTGCCACTTCTTTAATAAGCCAAAGTTGACCTCAAAGCAAGCGCGGTGGCAAGAGTTCTTGGTAGAGTTTGATTTTAAGTTTGAGCACAAGACAAAAGAGTTATCATGCACATCCTGACCCTCTTCTTTGTTGGAAGG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Match: KAG6600804.1 (hypothetical protein SDJN03_06037, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 803.1 bits (2073), Expect = 1.2e-228 Identity = 402/458 (87.77%), Postives = 422/458 (92.14%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028758 vs. NCBI nr
Match: XP_038877380.1 (uncharacterized protein LOC120069670 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 798.5 bits (2061), Expect = 3.0e-227 Identity = 402/460 (87.39%), Postives = 421/460 (91.52%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028758 vs. NCBI nr
Match: XP_022150064.1 (uncharacterized protein LOC111018331 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 790.0 bits (2039), Expect = 1.1e-224 Identity = 397/458 (86.68%), Postives = 420/458 (91.70%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028758 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O29470 (Uncharacterized transporter AF_0788 OS=Archaeoglobus fulgidus (strain ATCC 49558 / VC-16 / DSM 4304 / JCM 9628 / NBRC 100126) OX=224325 GN=AF_0788 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 6.3e-10 Identity = 75/293 (25.60%), Postives = 130/293 (44.37%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028758 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JFT3 (uncharacterized protein LOC111484651 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484651 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 808.9 bits (2088), Expect = 1.1e-230 Identity = 405/458 (88.43%), Postives = 426/458 (93.01%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028758 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D8X4 (uncharacterized protein LOC111018331 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018331 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 790.0 bits (2039), Expect = 5.2e-225 Identity = 397/458 (86.68%), Postives = 420/458 (91.70%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028758 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BNU1 (uncharacterized protein LOC103491903 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491903 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 768.1 bits (1982), Expect = 2.1e-218 Identity = 396/460 (86.09%), Postives = 415/460 (90.22%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028758 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JIE8 (uncharacterized protein LOC111484651 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484651 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 726.1 bits (1873), Expect = 9.2e-206 Identity = 362/402 (90.05%), Postives = 378/402 (94.03%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028758 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BNS3 (uncharacterized protein LOC103491903 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491903 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 693.0 bits (1787), Expect = 8.6e-196 Identity = 353/404 (87.38%), Postives = 369/404 (91.34%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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