Spg028651 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg028651
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold7: 15515576 .. 15524683 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg028651
SyntenySpg028651
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGCGAGCCTATAGTGCCCACGCCTACATGCGAGCCTATAGTGCCCACGCCTTCATGCGAGCCTATAGTGCCCACGCCTACATGCGAGCCTATAGTGCCCACGCTTCACGCGAGCCTATAGTGCCCACGCCTACATGCGAGCCTATAGAGCCCACGCTTCATGCGAGCCTATAGTGCCCACGCCTACATGCGAGCCTATAGAGCCCACGCTTCATGCGAGCTTATAGTGCCCACGCTTCATGCGAGCCTATGGTGCCCACGCCCACATGCGAGCCTAGGCTTTTCAGCTTAGTGCCCACGCTTCTCATGCGAGTCTAGGCTTCCACGCTTAGAGCCCACGCTAATGCACCCGAGCCTGGGCTACCAAGTCTACCTCACCTCAGAGCTCAAACACTTGCTCAAGCACTTCATGTAAGTCAAGCTCACCTGGCGGAGGCCGAGACCAAGCACCTCTTGCCAAAGCCGAGCACCTCTTGCCGAGGCCGAGCACAAACTTTAAAGGTATTCTCCTATTTACTCAACTATACTTTATGTTTTAATGAAGTTTTACTTGAGATTGAGGGCTGCAAAGGGGATATGCACTCCCTATTAAACAATAAGCAAGTAACAGGGGATATGCACTCCCTATTAAACAAAAGGCACACTAGCTTAGCATGTCTAACCAATGGTTACATGTTCTGGCTTACTCTCCTATTATTTTCCTACAAAGACTAACATATGAATGCAGGGAGCTAAGTTTTGAGCTAAAAGGGGCATGAGGCCGAGGCCGAGCCTAGCCTCTTCCCTCATTCTTCTTTTTGCAGAGATTAACTTTTTGATGCAGGATCGTGAGATCTTCCTACATTTTACTTGTGGATAACCCCTGGATCCGGAATGATGCACTCCGAATGACCAAGTACGGGGGTCTCGCTAAGCAAAATTAGAAAAATGCTCGGCCTCTTCCCGAGGCCGAGGCCGAGCAGACAAGCTAAAAGGGGGATGACAGTGCTCGACCTCTTCTCGAGGCCGACCAGCACCACTTTTGTAATCCCTCACCTTTTCTCATTTCTATCTCACCTAACCCCTATTTAGGGAGTTTTGTTTTGTCTATTTCTATCCCATAATGCAGGATAGCAATGAATCCGCACGAAAGTCAGCACAGAGCAAGGATCATTACTCTTAAATCGGGCTTAAGGAGCTCAACCGATAGCACTAAGTCGCACCTGAATCCCAATTCAAGAGTGGGGGCTTAATGTTATAGGCAATTTTGGACCACCCGACGCACAAGGGGCTGACGAGGACGTCCGGGCGGAAATAGGGCTGGGAGACCGACCCAGAGGAAGAGTCGACCATTCGGCCCGCTTGTGCGTGCCGAGCTCGGTCACCTCCTCTCGGTCCCTCATGCCTCTAGCCGCCCCGGTTTCGCCTGGTTTGTCCCGAAACGCCTCCGAATTCCTAAAAACCCTAGGAGCACGAGCAGATATTTATACCCCTCTTCGCCACTGAAGAAGGGGACCCGAACTCAATTCTCGACTCTCTTCTCTTGCTCTCTAGCTCTCCCTTCCGTTTTCTGACTTAAGCATCGGAGGCGGTGTGGCTAGCACCACACCAGTGTGCAGGTTTTCTCTTTTGCAGGCTACGTCTTCCCCCTCATCTACAAATTTACCGTTGGTGGCACGCGAAGGTCAGGTGAGTTTCCTCTGACCAAAATCGACCATCAACAATCTATTTATTGTTCTTTTTTTCCAATCGATTGAGGACAGATTTTTGGCTATCTTTGGGCACTTTTAGAGAGTTTTCTTTGGAATTATTCCATTGAACTTTTTGTAAGATCGAATCAATGTCAAATTTTGGTTCTCGTCACGATGAACAACTAGATTCTACGTCTTTTATTCAAAGGTCCATTTGAGTCCAATTGTGTAAGACTGTGAGGCTTTAGGCTTGGTTGTAATTTTTTTTCTCTATTTAAGTATTCGTTATGTTTTTTTTCTTTTTTTACTTTATAAGCATTCGATATTGACTGAATTCACACCTGGATATTGATTGTTTGATTGCTAAGCATGAATTTGTGATCCGTAATTGTTATGAATGGGTGAATTAAATAGCAAAAAAGTTAGCTCATATGTGTGATTAAGGTTTTTCCTTGTTACATAGCTTGCATAATATGTTGGGGATATGCTGTATATAAAAACTGTGTTGCACACTAGCAAACAGATTACAATGCAACTAGCTACAAACAAATACAAAGTAAATATATCTACAAACACTGTACATAACAAAAATTACAGATATCATAATTAAACCATATCAGAAGATCAAAACCGCTCCGATGTTCGTAGATGATCCGATTGACAACAACAACCACAACAAGTGAATAGAACCTGTAAAACAGAAGAATGTGATAGTTGGTAGTCGAGGCACGCTTTCAAAGCGCTGTCCTGAATACAATTATTCGCTCTGCATGGGTTGCTAGCATACTATAGTGATTGTCTCAGCAGGATACAACGACTAACTCCGATAGAACAGCAACCTCGAACTACTCCGATCTGGCAGAACTCTTGGATACTTGGCTCTCAACTTGACTCAAGATCAAAGAAACAAAGAAAGAAAGAAGAATGCTCCAAATGGAATGAGATGATTCAAATGAAGAAACAAGTTGCTATTTATAGGCTAGCAACTTAGTAATTCCAAAGAACAAAATTAAATAAAATAGAAACGTATGTAAAATATAACTCAATTGAGTTATAACACCAAATTTAACTTCCATAGGTTAAATTCGTAATTGAAACATCAAGTTGAATTTGATGTTTCAATCCATCTTGAAACTATTGAAAAATTGAATTTAAACTTTCTTTCACATTCATTTCTAAAAATATCCAACATGATAAACTCTAGGAAACAAAGAAGCAAAATTAATTAGGGTGTAGCTGTCTCACCTAGTTAGTCTTGTCTTGATCATTCCCATTATTCTTAACGCTATTGTTCTGTTAATATGAAACAATACCATGTCCTGTTGATTATTTGACAAATTATTACTGATGCTTATGTGGCAGTGAGCTGGAATTCAAGCTGAAGTTGAAGAAGTTCCTGAGCTGGTTGGTGTTATCCTTGTCAACTTATTACAACTAGCTCTCCTTAGCTGTTAAGAGGTAGAGGCAAAGTGTGAGATTGAGTGCAAAAGAGAGTAAATTCTCTAGAGCTGTTGCACCTGAGTAGGTTCTATACTATTGATCATTGAAGCTTCATTGAGAGTGATTTCTGCTGTAATCATTGTTGAATAAAAGGGACTAGAGTGGATGTAGATAATCTATTTGGGGTCAAATGATAGCACCAATTTAGTGCTATCTAATTCCCGCTAATTCGTGCTAGTTATCGTGGATTTAATGCTTAATTTGTGTATTTTATAGGAAATCGAGCATAAGAGGCTCTTTGGAGTGATTTGGTGCATTTTGATGCTAAAAGGAAGAAATTGGCTCATTCTTAGCCAATTTGGAGTCAAACAGATGAAGAGAAGCTGAAATTTCAGAATGCACAACATCTAAACCCCATCTCGAGCATCAAAACGCTCCAAAATTGGAGAATTTGGAGTGCAGACCCGAGAAGGCACCGTTGAGACGCTGCTAGCGATCCATAGCGTTGATGGGTGGGTTAGCTCAACAATGAAGCGAAGATGATAGCGTGCAGAACAAGATATTTTTCCCGGTTATTTTAGTTAGCATTTGAGAATTATTTGGCCCATTTTAATGCACTTTAATGTTTGTTTTGTAGGAAATTGAAGTTTTGGATAAAATTGAGAATTTGGAGTTGATCGGGTGCTCGGGACCTAAAGAAGAGTAAAAGATCGAAAAAGAATCAAAGTTAAAGCTTAACAAAAGTGGCAAACCCGAGAGGTAGCGTCTCGACGCTAAAAAGTTTCCTAAACTGATTCTGGCGGTAAAGAGGACAGCGTCGAGACGCTATCGACGAATTTCCTATAAATAGATCCTTATCTTACACGGCCAAAGGGAGTTCAATTTGGGAGTTTTTAGACCTAAAATCGATTGGAGACCTTCTGTGGGAGCTGAAGCAAGGCCAAGGAGTGGGAATCACACAAGAACGTGTGGAGATCGTGATGGGGACGTGCGGGTTTCGACAGAATTGAGTTTTTCCTTATCTTTACCTTATCTCTAGTTAGTTTTTATGGCTTTTTCATATCTAGCTTATATTGTAATGCAATGTATGAGTAGCTAGACATGTTTCTTAGGGATTGATGTAGTATTTTATGATTATGGATTGATTATTTGGATGTTTTGTGCCTTTATTTTATTCATGTGATTATGGTTAAATGCTTTCAATTAATTGGCCACTAGTTGAATGATTTAGTGTTGAATCTTGCTCGAGAGAGAGGATTTAGCTTAGACTTTACTAATTGCATGACTAAGGTAGAATTCTAATATTGGGAGATTTAGAATAACTTTACAAGTTGTTAAAAGACTTTACTAATCACCTCGACATGCAGTGCTTGATTGCAGCAGAGAGTGCCTGACAAATTAGCAGATCCAGGGAGTTTTTCTATTCCTTGTAGCTTTGGTATTTACTCTTTTTGTGCATTGTGTGATTTAGGTGCTATCCTTAATATAACTCCTTTATCCTTATGCAAGAAATTAAACATAGGTGAGATAAAATCTACTTCTGTTAGGCTCCAGTTGGCTGACCAGTCTGTGGTTAGTCCATATGGAATTATAGAAATTTTTTTAATCAAAGTAGGTAGATTTTTCTTCCATATTGATTTGTTTGTTATGGATATTATGGAGCTCCTTCAGTACCTATTATTCTAAGGAGACCATTCCTCGCTATTGGGCGAGTTATTATTGACATTGAGTGCAAAGAGCTCACTGTTAGAGTCCAGCATAAAAAAAAAGTATTCAAAGCTTTTGTGAACTCTAAAGATCGTTCTGAGGCGCTCGTGATGGGCTACAAGAAAAGTGCAAGCAAGAACAAACTCTCCAAAAGGGAGTTATTTATACCTTATTCTACGATGA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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGCGAGCCTATAGTGCCCACGCCTACATGCGAGCCTATAGTGCCCACGCCTTCATGCGAGCCTATAGTGCCCACGCCTACATGCGAGCCTATAGTGCCCACGCTTCACGCGAGCCTATAGTGCCCACGCCTACATGCGAGCCTATAGAGCCCACGCTTCATGCGAGCCTATACACTTCATGTAAGTCAAGCTCACCTGGCGGAGGCCGAGACCAAGCACCTCTTGCCAAAGCCGAGCACCTCTTGCCGAGGCCGAGCACAAACTTTAAAGGCAATTTTGGACCACCCGACGCACAAGGGGCTGACGAGGACGTCCGGGCGGAAATAGGGCTGGGAGACCGACCCAGAGGAAGAGTCGACCATTCGGCCCGCTTGTGCGTGCCGAGCTCGGTCACCTCCTCTCGGTCCCTCATGCCTCTAGCCGCCCCGGTTTCGCCTGGCTACGTCTTCCCCCTCATCTACAAATTTACCGTTGGTGGCACGCGAAGGTCAGCATCAAAACGCTCCAAAATTGGAGAATTTGGAGTGCAGACCCGAGAAGGCACCGTTGAGACGCTGCTAGCGATCCATAGCGTTGATGGAGGACAGCGTCGAGACGCTATCGACGAATTTCCTATAAATAGATCCTTATCTTACACGGCCAAAGGGAGTTCAATTTGGGAGTTTTTAGACCTAAAATCGATTGGAGACCTTCTGTGGGAGCTGAAGCAAGGCCAAGGAGTGGGAATCACACAAGAACGTGTGGAGATCGTGATGGGGACAAAACAGAGAAAAACAGAGAAATGTTGTTCAAATGCTGTTCAAATGCGACCACATTTCTGCCAAGACAAAGTGAAATGCGACCGCATTTCTGGGCAGAAACAGAAACGTCCGAGGCCGTCGCGGGTCGTTTTAAACGAGCTTTTCACGCAACTAACTGGCTATTTTGACTCCGAAACTGACTGGGCTACCTACTGGCATGAATTTCGTGACTCCCCAACCACTTTTCACTCTATAAAAGGCCGCAAATCGAGAGGAAACACAAGCAGAACTCACTGGGAAGAAGAGGGTGGTGACAGAACCCTAGTAGACGCCCATGAGTAG

Protein sequence

MRAYSAHAYMRAYSAHAFMRAYSAHAYMRAYSAHASREPIVPTPTCEPIEPTLHASLYTSCKSSSPGGGRDQAPLAKAEHLLPRPSTNFKGNFGPPDAQGADEDVRAEIGLGDRPRGRVDHSARLCVPSSVTSSRSLMPLAAPVSPGYVFPLIYKFTVGGTRRSASKRSKIGEFGVQTREGTVETLLAIHSVDGGQRRDAIDEFPINRSLSYTAKGSSIWEFLDLKSIGDLLWELKQGQGVGITQERVEIVMGTKQRKTEKCCSNAVQMRPHFCQDKVKCDRISGQKQKRPRPSRVVLNELFTQLTGYFDSETDWATYWHEFRDSPTTFHSIKGRKSRGNTSRTHWEEEGGDRTLVDAHE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 340..360
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 332..360

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg028651.1Spg028651.1mRNA