Spg027560 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg027560
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold11: 3506005 .. 3508167 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg027560
SyntenySpg027560
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCTGTCACGATTACAGCACGCGCTAGAAATTCGCAACAGGACGGTTCAAGGCTGTTGGGCGGTCCGATTCACGCGGTCTGGTTGGGCTGGGACCGATTTGGTCTGGTTCAGCTGGAATTTAGCTCGGTTCGTGGTTTTCATAGCTGGTTCGAAGTGGTTCGGGTCGGTTTGGGCGGTCTAGACCAGTATTTGGAGCTGTAGAAGGATTTTTAGGATAGAATTTAGCTATAATTATTGTAATTTATGCTTTATTTTATCCTAGGGGCCAAAATTAACCGATTCAATTGCTATTTATTTGCTTTATGGATGTCATATAGCTTAAATTCCCACCATAGGTTAAGCATGTTTCATGCATATTTATGTTATAAATGTTATAATATATGATAATTATGCAAGAATTTAAATTTCATGAGTTATTTAGTATAATTGTTATATTAAATATATGAAATTGGAAAAGCATGATGCATGACATTAATTAGATAAATATAATTGTTATATTTTATTAATGTAGCATGCATGCTTAGCATTATTTTCATGAGAATTAATATAATTAGTTATATTATGAATGAAAATAATAAATATAAATCAATGCTTGTTTTCATGTATGATTTAATATAAAATGTTATATTAATTAAATGAAAATGAAATAGCATTGAGCATGACATTAATTAGATTAATATAAGAGTTATATTATATTAATGTCAAATTTCATGTAATTTAATTTCATGGATGTTTCATTAATATAATCGATATTAATTAAATGAAATTGAAATTGCATGAAGCATGACACCACTTTAGATTAATATAATCGTTATATTATCGTTATCGGCGTCATAATAATATGGTGTTGAATAATTAGAATATGATTGTTATTTTCCAACACCATAGAAGCATGTTATAGGGCTAATCATTAAAATTTTATAATAAGTTATAAAATTGATTAGAAACCGTCAACCCTATAACAAAGAGTTGCATGCAAACATAGGACCTTAGGTTAAAATGAATTAATTTTAAAATGTTTAAAATTAATTAGACCTAAGCTCATTATAATTCTAATAGGATTAGAATTATTTTCTTACTTAGAATTAAAAATAGTTTTAATTGACTAAGTAGGAAAAACATTACTATGATTATAAGGGAACTCCACCGGTTAAGTTCTGTCTAAGGCTGGGGGTACTTAAGATGACGGTTTACGGAACACCTCCTACCTGGGAACTAACCCGGAATACCGGAGTTGAATTAATCATAGTTAAATGTTAGCATGCAATATCACTAGGTTTATTAAAAGAGTTTAATTCACCTAGATCTTTAGAGTAAAGAGTTTACTTTACTATGGTTATAAGGGAACTCTCCCGATGAAGTTCTGTCTAAGGCTGGAGGTACTTAAGATGACGGTTTACGGAACACCTGCTACCTGGGAACTGACTCGAAACTTGAGTTGAATTAACCATAGTTATGTTAGCATGCAATATCACTAGGTCAATTAAAAGAGTTTAATTCACCTAGATCTTTAGAGTAAAGATTTATCATAACTATTGGTTATAAGGGAACTCTACCGGTAAAGTTCTGTCTAAGGCTGGAGGTACTTAAGATGACGGTTTACGGAACACCTGCTACCTGGGAAATGAGCCGGAACTTGAGTTGAATTAACCATAGTTATATTAGCATGCAATGTCTCTAGGTAATTAAAAGTGTTTAATCCACCTAGACATTAGAGAAAAGACCTATATATATAAAAGTTATATATAGGCATAGACTTAGATAGATTCACTTAGCCGGAATTTACCTAAGTAATAAACCCTATAATTATAAAAATACTTAGTGGGAGGAAATATATCAAAACAAGATTTTAATAAATCAAGTTTTGCTCTCACGTCCTCAAACGTTCACAACGTGAGGTTCATGCTTGGCCTCGAGTCACCCTGGGAATGACCCCCTACGGATGGTGTTTGCATGAATCAATATCAAGGTGAATGAGGGAGTATTTTATAGTAAGTGGGAGCAGGAACGTGTCAACGTATCCTACGGTCTCCTCCATTAGGTTGCACCGTGAGATCCCAATGATCTGCCTGCGAGTCGCCCTGGGAGCGATCACCCTACGGAGGGCTTGATCATGGGAGTCGGAACAACGCAAACTCCAGAAATGGATACGGTTTCTTAG

mRNA sequence

ATGCTGTCACGATTACAGCACGCGCTAGAAATTCGCAACAGGACGGTTCAAGGCTGTTGGGCGGTCCGATTCACGCGGTCTGGTTGGGCTGGGACCGATTTGGTCTGGTTCAGCTGGAATTTAGCTCGGCTGGGGGTACTTAAGATGACGGTTTACGGAACACCTCCTACCTGGGAACTAACCCGGAATACCGGAGTTGAATTAATCATAGTTAAATGGAACTCTCCCGATGAAGTTCTGTCTAAGGCTGGAGATCCCAATGATCTGCCTGCGAGTCGCCCTGGGAGCGATCACCCTACGGAGGGCTTGATCATGGGAGTCGGAACAACGCAAACTCCAGAAATGGATACGGTTTCTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCTGTCACGATTACAGCACGCGCTAGAAATTCGCAACAGGACGGTTCAAGGCTGTTGGGCGGTCCGATTCACGCGGTCTGGTTGGGCTGGGACCGATTTGGTCTGGTTCAGCTGGAATTTAGCTCGGCTGGGGGTACTTAAGATGACGGTTTACGGAACACCTCCTACCTGGGAACTAACCCGGAATACCGGAGTTGAATTAATCATAGTTAAATGGAACTCTCCCGATGAAGTTCTGTCTAAGGCTGGAGATCCCAATGATCTGCCTGCGAGTCGCCCTGGGAGCGATCACCCTACGGAGGGCTTGATCATGGGAGTCGGAACAACGCAAACTCCAGAAATGGATACGGTTTCTTAG

Protein sequence

MLSRLQHALEIRNRTVQGCWAVRFTRSGWAGTDLVWFSWNLARLGVLKMTVYGTPPTWELTRNTGVELIIVKWNSPDEVLSKAGDPNDLPASRPGSDHPTEGLIMGVGTTQTPEMDTVS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 105..119
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 81..119

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg027560.1Spg027560.1mRNA