Spg027428 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg027428
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold7: 40963091 .. 40970255 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg027428
SyntenySpg027428
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGCGGTATCGCGACAGTGTCGCGACGCTGTCCATAGCGTCTCGACACTGTCGCCAGATTTTCTATAAATTCATCTTTTCATGCTACGGCAAGGGGAGTCCAATTGGTGAGATTTTAGCCCTAATTTCGACTAGAGACCTTTTGTGGGAGCTAAAGGCAAGGCCAAGGAGCGGGAATCAAGCGAGAAGATGTGGAGATCGTGACGGGGACGTGCGGTGTCGGCGGATTCGAGTTTTCCTTTCTCTTTCCCTTAACTCTTGTAGTTTTTATGGTTTTTCTTTCAATTAGTGTTTGTAGTTTAAAGACTATGAATTTCTAGTTGTTTGTCTTAGGGATTGATGTAGTTGTTTTAGGTTGTTGGATTGATTTGTGGTATGAATATGCATATATTTTACCTATGCAATTATGGTTAAATGCTTTCAATTACTTGATCACTAGTTGAATGATTTGAGTGTTGAATCTTGCTCGGGAGAGGGGATTTGGCCTAAGACTTACTTTATTTAATTGCATGACTAAAGTAGAAATTCTAAGTTTGTGACGGGATTTGGAATAACTTTAGAAGTTGCTTGAAGAACTAAACCCAAAGCCGTGCATGTTAATGAACTTAGATAGGGATATCAAGTTGGTTGCATGCATGAGAATAAATTATGCTCGGGAGAGATAGTTGTGATAAAGGTTCCTAGACTTGGTAGAATAATTGCATGCTAAATTCATCCTGTTAATTTATCCTCAATCTCAACAATGAAATCAATTCCCTAAGAGTCTTTCCATTTGAGTCTCCACCTTTATTTTATGCTTTTTGTCTTTACTTTTATCTTTATCTTTGAGTTTTGCTCCGTAAATAAAATTGAGCAAAAGTATCCACGGTACTTAATTTAATAGAAATCCAATCCAGAGGACGACACTCGTTTTACACGAAAACACTATATTATTACTTGACCCGTACACTTGCAGTTAGCAAATTGCGCATCAAGTTTTTGGCACCGTTGCCGGGGATTGGCATGTTTAGTTAAATTAATATTGTGGAAAAATTGTCCGGTCTTAGTTTAGGGTGTATTTTTTTTTTGTTATTTTTGTTAGTTTTGTTTTTAGGTATATTGCATTTTTTTTTTCCTTTGTTGGTTTGTTTTCCATATTTAGATTTTTCCATAGATAGAATTTTTCTTTTTAGTTTTTTCCTTTTTAGTATAGTTTTTCCTTATTTGCTAGTTTCCTTATTTGTTTTTGCCATATTTGTTTTTGCATTCTTTATTTTTATTTTGTAGATAGATTGCTTTTCTTTTTCCTTATTTGTTTTATTTCCATATTTGTTTTTCTCCTTTGGTTTTTGTTTCCATAGTTATAATTTTCCTATTTTAGTTCTTTCCTTATTTGTTTGATTTTTTCCTTAGTTGTTTTTTCTCCCTTAATTGTCTTTTCCTTATTTGTTCTTTTTCCTTTTTGATTTTTTTTCCTTATTTGTTTGAGTCTTAGTCCTTTGTTCTTGTTGGGTTATTATTTAATTGGAAGCCTAATATTCATTGTTGCTTTAATTGATTTGAATGGCTTTTTATTCAACTCCATATTCCAATTTTTCATCTTTAAGTTTTACCCCTTTAAAAGAAAATTCTTCCTTAGAAAGCATAGTTCAAAATTATAAAAGGACTTCATACCCCAAAGGAAGTTAGTGAGGAGGGATCCACTTCCATAGGATGTCTAGTGAGTCATGTGGCCGATGATTCATTGGCACCTATTCAGGAGCGTATTTCTTTCAATCTTGTTGAGGATGAGCATTTAGGGGTGAGTTGCATGAACAGTGGGGAAGAATTGGAGAGTTGTAGCACCTTTCAAGAACACGTTTGTGAGGAAGAAAAAGAAAATGAGCTTGCAGTGACAGAGGAAGTTCAGGAGGTAGAGTATGAGGTTGATCAACCTTCGTCTGTTTTATCTTCTTTATCCTTTGTTGAATATGATTGTTCTTTTTTCTATTCTCACGAGTCAGTTTTAGAGTCAGAGTCTATTTATTTTGATCTTTCTCCTTTGATCCTTATTTTAATCAAAAATTCCAAAAATAGATCTGTTTCAGGGGCCCATGAGAAGCTAGTAAGCTTGCTAGCGATCGTGTGTTTTATTGATTCAAGGAAGAAGGGCCTGAAGAAATACGAGAATTTTTATGTGCCTTGACAGATTACACGAGCACGTCGAGCTAAAGACGATAAACAAGCGCTTATGGGAGGCAACCCAAGTTATTTTATTTTATTTTTTTTTCTTTCTTTGTTTTTATGTTGTTGTTGTTTTTGTTTTGAAGGAGTTCCCGGGCTCTTGACTTTGCTAGCAATCATGAAAGGTCATCATTCCAGGGCAGTATCGTTCACCCCTTCCATTCTTTATTTGTTCTCATGCTTGACTATGCTTTATTGATTTATACATTGAGGACAATGCATGTTTTAAGTTTGGGGGTGGAATATCATGTTTGTGGAGCCCTTGAGCATCTGAGTTCGGGCTATAGTTTTGAGCTTTCTTTGAATTGAGCATATGGTTGTTTTCTGGATGCTATTTTTGCATGACTATGATTTCCTAGGATAGGCTTTCTTGTCAATTTTCAAGTTTTCGATGAGTTGTAAGCATGAGTGTCCAAAAAGGGAAACTTTTTAAACTTTTTCTAGGAGATGTCTTGCATGAGTAGAGTATTTGTCTTGGCTAGATTTGGATTTGAATGCTTAGGAGCGAATTATTAGGTTCATATGCTTGTTGTCACCTCGATAGGTGTAGGGAAGAGCTAAAGAGTTAATTTTTTGCAAATTAGCATGTTTGATCTTGCTTAGGAGGAAAGAAAAGAATATATGCTTATCATGCTCTTAAAGAAAAATCATTCTTGTTGTCACAATTTGAAAGAAAAAAAAAAGTCATGGCCTGTGCACAGTTTGCAATGAGTAATAAAGATTTAGGCAAAAAGAGCTACCCCTGTTGTGATCAGTTAGGCCAACCAGAGAAAACTCAGGTTAAGGGTCCCTGCAATAGGTGTGTGAAAGCTAGTGCCACATATAAATGCTTGATTAAATTTTCAATTATAAGCACCTAAGTATGGATGAAAACAAACTAATTTATTCTATTGACTCGTTAGTGAATCCTTAGTGCCAGTGTAGAGGGAAGATGAGTTGAGAGTTTAATAATCCAATCCCGGGCTAGTAGAGTCTGATCTAGTTGAGTTAGATCTCGCTTGTGCAAGTTAATTTTGGAAAACTTTTGATTTGTCTCCCTCATTGGTCTTTATGTGCATGTCTCTTGATTGCTTGACTATTGACTTTTGAGCCTTGAGGATTGAGTCATGTTTGTTGCATCCATTCTTCCACTGTATGCTTGATTTTTAGTTTGCTCGAGGACTAGCAAAAGCTTAAGTTTGGGGGTATTTGATAGCGAGCATAGCTAGCTATTTTTCTCTGATTAATTAAGCTAGCCTTTTACAATTATTTGCCCAAATTTATGCATTTTTATGTTTTATTTGTAGGAAGTATGTGTTTGAAGCTTAATTCAGCAATTGGAGTCAAATGGAGTCTTCAATCTAAAAAAAAAAAAAAAAATCATAGCGTCGCGACGCTATGACCAGCGTCGCGACGCTATAGGCAAATTTTCCAAAAATGCGGTATCGCGACAGTGTCGCGATGCTGTCCATAGCGTCTCGACACTGTCGCCAGATTTTCTATAAATTCATCTTTTCATGCTACGGCCAAGGGGAGTCCAATTGGTGAGATTTTAGCCCTAATTTCGACTAGAGACCTTTTGTGGGAGCTAAAGGCAAGGCCAAGGAGCGGGAATCAAGCGAGAAGACGTGGAGATCGTGACGGGGACGTGCGGTGTCGGCGAATTCGAGTTTTCCTTTCTCTTTCCCTTAACTCTTGTAGTTTTTATGGTTTTTCTTTCAATTAGTGTTTGTAGTTTAAAGACTATGAATTTCTAGTTGTTTGTCTTAGGGGTTGATGTAGTTGTTTTAGGTTGTTGGATTGATTTGTGGTATGAATATGCATATATTTTACCTATGCAATTATGGTTACATGCTTTCAATTACTTGATCACTAGTTGAATGATTTGAGTGTTGAATCTTGCTCGGGAGAGGGGATTTGGCCTAAGACTTACTTTATTTAATTGCATGACTAAAGTAGAAATTCTAAGTTTGTGACGGGATTTGGAATAACTTTAGAAGTTGCTTGAAGAACTAAACCCAAAGCCGTGCATGTTAATGAACTTAGATAGGGATATCAAGTTGGTTGCATGCATGAGAATCAATTATGCTCGGGAGAGATAGTTGTGATAAAAGGTTCCTAAACTTGGTAGAATAATTGCATGCTAAATTCATCCCATTAATTTATCCTCAATCTCAACAATGAAATCAATTCCCTAAGAGTCTTTCCATTTGAGTCTCCACCTTTATTTTATGCTTTTTGTCTTTACTTTTATCTTTATCTTTGAGTTTTGCTCCGTAAATAAAATTGAGCAAAAGTATCCACGGTACTTAATTTAATAGAAATCCAATCCAGGGGACGACACTCGTTTTACACGAAAACACTATATTATTACTTGACCCGTACACTTGCGGTTAGCAAATTGCGCATCAGAATTGCACAATATGACCCAAATCCAATAAACTAAGATCCAAGGTTGTTTACATGAGACTTGGACTAGTATGTGGGGACATACGGGGATCAGTGTTCAAGTAACAACCTAAAAGGTCTATAGTACAGGGATAAGGCTGGATACCTTATCCTGGTAACACTATGTGATATGACCCGCTTTGTATTCGATACAGACGTATTGATCCTAGGCGTCCATGTAGGAGACATGCAAGCGAGGGTATCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGACCGGACCACGAAATAGTAAACCACTAGATGTAACACCATTAACTAGTTAGGTTACTGTTTCAATAGGGTGACCTAGGTAACTCAATCTTAATCCTGAGTATGTCATGAACTCCTTCTCACGAGGGATTGTCCTTTGATTAGTACG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mRNA sequence

ATGCGGTATCGCGACAGTGTCGCGACGCTGTCCATAGCGTCTCGACACTGTCGCCAGATTTTCTATAAATTCATCTTTTCATGCTACGGCAAGGGGAGTCCAATTGGTGAGATTTTAGCCCTAATTTCGACTAGAGACCTTTTGTGGGAGCTAAAGGCAAGGCCAAGGAGCGGGAATCAAGCGAGAAGATGTGGAGATCGTGACGGGGACGAGCGTATTTCTTTCAATCTTGTTGAGGATGAGCATTTAGGGGTGAGTTGCATGAACAGTGGGGAAGAATTGGAGAGTTGTAGCACCTTTCAAGAACACGTTTGTGAGGAAGAAAAAGAAAATGAGCTTGCAGTGACAGAGGAAGTTCAGGAGGTAGAGTATGAGGTTGATCAACCTTCGTCTCGTCTCGACACTGTCGCCAGATTTTCTATAAATTCATCTTTTCATGCTACGGCCAAGGGGAGTCCAATTGGTGAGATTTTAGCCCTAATTTCGACTAGAGACCTTTTGTGGGAGCTAAAGGCAAGGCCAAGGAGCGGGAATCAAGCGAGAAGACGTGGAGATCGTGACGGGGACAGGAAGGACAAGGCATCCACTTCCCAGGCTACTCCTTCACCAAGGCCGCCACCTACTTCACCGTTGCCATCTACTCTTGTTTCAGGGTCTACAACATCATTAGGGGTTCTTGGGTTTGCTTTTAAGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCGGTATCGCGACAGTGTCGCGACGCTGTCCATAGCGTCTCGACACTGTCGCCAGATTTTCTATAAATTCATCTTTTCATGCTACGGCAAGGGGAGTCCAATTGGTGAGATTTTAGCCCTAATTTCGACTAGAGACCTTTTGTGGGAGCTAAAGGCAAGGCCAAGGAGCGGGAATCAAGCGAGAAGATGTGGAGATCGTGACGGGGACGAGCGTATTTCTTTCAATCTTGTTGAGGATGAGCATTTAGGGGTGAGTTGCATGAACAGTGGGGAAGAATTGGAGAGTTGTAGCACCTTTCAAGAACACGTTTGTGAGGAAGAAAAAGAAAATGAGCTTGCAGTGACAGAGGAAGTTCAGGAGGTAGAGTATGAGGTTGATCAACCTTCGTCTCGTCTCGACACTGTCGCCAGATTTTCTATAAATTCATCTTTTCATGCTACGGCCAAGGGGAGTCCAATTGGTGAGATTTTAGCCCTAATTTCGACTAGAGACCTTTTGTGGGAGCTAAAGGCAAGGCCAAGGAGCGGGAATCAAGCGAGAAGACGTGGAGATCGTGACGGGGACAGGAAGGACAAGGCATCCACTTCCCAGGCTACTCCTTCACCAAGGCCGCCACCTACTTCACCGTTGCCATCTACTCTTGTTTCAGGGTCTACAACATCATTAGGGGTTCTTGGGTTTGCTTTTAAGTAG

Protein sequence

MRYRDSVATLSIASRHCRQIFYKFIFSCYGKGSPIGEILALISTRDLLWELKARPRSGNQARRCGDRDGDERISFNLVEDEHLGVSCMNSGEELESCSTFQEHVCEEEKENELAVTEEVQEVEYEVDQPSSRLDTVARFSINSSFHATAKGSPIGEILALISTRDLLWELKARPRSGNQARRRGDRDGDRKDKASTSQATPSPRPPPTSPLPSTLVSGSTTSLGVLGFAFK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 173..194
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 173..220

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg027428.1Spg027428.1mRNA