Spg027076 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg027076
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionProtein FAR1-RELATED SEQUENCE 2-like
Locationscaffold8: 8691446 .. 8704110 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg027076
SyntenySpg027076
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCAAGTGCAACCATGGCAGAATCTTGGTTCAATAAGAGGTGAGGCCTTACTTTCTTAAAAGTTAATTCATTTTCTAACAAATTTCATGAAGGAAGCTTGAGCTAATTCTGATGTTAAGTTAATGGTTTTTGAAGAGGAAGACATAGCACAGAATTTTCATGCAAATCTGAAGGGTCTCTATTTTTCTCTGGTTTTTCGAACGTTCTGGGGTGTACACGTTGAATTAGAAGCTCAATTTGGTATGGTTGGAAAGCTTATTTAATTTCCTATGACTTTTATGAAGAATGCGTGAGCCAAAAATGACTGGAAGTAGGTTTAATTTCAGGAGAAAAGTAGAGGGTAGTAGAGAAGCACGAATTTGGAATAGCTGTGTTTGGGGGATTTCTGGACAAATCCATTAGGAATCTCTTTTTCATTACTTCTCGTACGTTGTAGAGGGTTCCAAAATGAAGAGTTTGATATGAAGTACATTAATTTTGGCCAAGTATTGAGGAAGTTATGAGTGTTTGAAGTTAGGGTATTGAATCTGGAAAATTCTGGGAAAAATGTGGAATGTGATTTTATTTCTAAAGTTTAGAATTCATGAGCGTAGAAAGACAAGACTATTTATGGTTCTGATGCTCGGTTTTGGTTTGTTTGACAGGCCAAGAGGAAATTGGTCGAGTCTACAGGCCAGGGAACTAGCCCAAGACTGTGAGTGACAAAACAAACTTCGAAAATGATTTCTAAACTGTTATTTATGATTAAATGTTTTATATGCTTGAATCTGAATTTATGAATGATACATGATTTCTATGAATGGTTTCAAGCATAAGTTTTGAGCTTAGATTTTCTAATGAAATTTATTTGTGAGCGCGTGATTATTGACTTTCTAAAAAGTAGTTGAAACGATATCATTTTAAGCAAAATATGTACTAGCGAGTATTGTTTAAAGATTTTCAGTTTTCCACGAGCAAGCTGAGTAAGCTTGAGTTTTACGAAAGATAAAGATAAGCAGGCATGTTTTAATGTTTTCATGTGATTTTCTGAGACTTATATTAACTACATGACTGAGATATTGAGCCCGAGGTTGTATGGTACCGTGTGCACACAGGTTATATTTCGTTGTTCACGTTGAGTGTACTCCGTGACAATGATGCTGTCGTGAGTGTTGGGCGGGCCCCACTACATCGTAGAGCTAGTAAACGTTGGTTGTACTGGGTGTGCCCTACACAACGTAGATTTGTCATGTTAGTTAAAATGTTTGATATACTTGATATGTCTTGCTAGATTTTAATGACGTACTTGCGAAGTATTTGAGAAAGCTTATCATTACACGTTTATGTTTAACGCATTGATTAAACAGATTTATATGTTTAAGGTTTATCATGTGTTCTGATTTGCGGATTAACAGTTTTAAATTTAGTCACTCACTGGGCTTCATAGCTCACTCTTTCAAAATGTTTTCCCACTTTCCAAGTAGAGATCGAGTTCCTGGTTCCTAATAAACTGCCAAAGTCTGCTAAAAGCTCCTAGATCAAGTTCCAATACGTGGGTGGAGTTGTACATTGAGTCTGTTTGTATTGTAAATGTCTTTGTAAGGATTGGATAGTTTACAGTTTGTGTAAGCTTTAGATGTTGTGGTTGTGTAAACCCTAGTTGGATATGTTTTTTGTTGTGATGTCTCTATGAGGTTTATTCCCTAGTTGGATATGTTCTTGGTTGTGATATCTCTATCAGGTTTATTTTCCAACTGAGTTAAGTCAAGGTTGCACTTCATGAATGTCTAAAGGTTTTCAAGGTTCCGCTGTGTTGTGTTGCATGTAAAGTATTTTATATCTAAGATTAGCAAGTTTATCAGGTTCAACGGTTCAGCAAGGTCAAGAGGTATCGTTAGAGGAGGACGATGTCCGTTGGCTTCACGCCATTGATAGGGGCAGAAATGTCGCTATTTTAGTCCTAATTTATTAAGCTTTTGAGCGCTTTAATTGTGTTTTTATTGAAGAAATCTAAAATAATTTGTTATTTTGTCTTTAGGAGCATTTTATGGATTTTTGGTGGAAAAAAGCCCAAAAGTGAGTTATCCAAGCCAAATATCCATCCATGGGTCAAAGGGGGAGCCCAAGAGTCAACCATGAAGAGAAGATCCAAAAAGAATTGAAGTTGGCCCAAGTTTCAAGCCCAATTCCGCGTCTGCTGGGTCTGGAAACCGCACAGCATCGCAACGCTGTCCCATTTCTTGGCAGACAAGTTGGATGACGTCACAGCATCTCGACGCTGTCCCTATTCCGGGCCTATATAAGGCCCCCCCTTGGTGCCCATTTTTCTCATCAATCAATTCTCCATCTTTTCCTTCCCTTCCTTCCTTGGCTCTTTTTTAGCATTCTCTCAAGGCTTTTTAGCCTTTTTGAGAGTTAGTAGTGGGAAAATTTTGGGGAGCTTTTGGGAGCACTCTAGGAGGCTCGGGGCGTGCTCGGAGGGACTCCAAGCACTAGCGATGGGGTCTTCAACGGTCATTTCCTTTTCTCTTATTTTGCTCCAATTTATGCTTTCTTTTGTATGTATTGTGGATATTATAGCCATGTATAGCTAAACCCCAATTTGGGTCTTGAAATGAAAATACATAGTTAAATGTTATTATAATTGCCTATCTCTTGCCCTTTTCACTAATTATTTGTATGGATGCTCGTAATGCTGTTTATAATCTGGCCAGTTATTTACTGATCCAATTCTTAATGGAAACTCGACGGAGAGAAATTAGGATAGATCTGAAGGATTGGAATTCCGTAATTCCATAAAGCGGAAGCGTGATTGGGACCGATTCGTAATTAATTTTGTTTAATCTAAAATACCAATACATTGGCAATAATATTAGAACTATTCTAAATATATATTAAGGCTAAGCATACAAAAATATTAGATCTAAATCTAATTTATAAAGTAATAAATTACTTACTCTCGTTGACGACTCAGATTAAATTCACCAACTGCTTGTGAATTAATCACGAACTAGTGCGAACACCACCACTATGGCTACACCGGTATGATTCTAAGACTTCTAGAGGCAGGAGACTGGTGGGAGTCTAGAGGAAGCCTTGAGGGGAATTCTCTGAGAGTAGGAGAATGAATGGGATGCCTTTCACTCCACCCCAGGGGTCTTATATATAGTAAAGGTCAAGACCTTTTTCCTAATTAGGAAAATGAACCTTTTCCTAATAGGAAAAGGTCTCTAATTTTAATAAATAATTAATTAATTCCTTAATTAATTAATTTCCCAATTAAATATCATATATTTAATCTTAGGGATTTTATTAAAATTAAAATTAATATGAATACAATTCATATTAAATTTATTTGAACTCTTTCAAATAGTTTTTTTTCCTAATAGGAAAAGGTCTCTAATTTTAATAAATAATTAATTAATTCCATAATTAATTAATTACCCAATTAAATATCATATATTTAATCTTAGGGATTTTATTAAAATTAATATGAATACAATTCATATTAAATTTATTTGAACTCTTTCAAATATTTTCTCTCAAGAATTAATTTTTTGAAATTAATTCAAAAATTATATTATAAAGTTTCATAAACTTTATATTATAATGCATTAATATACATTATACGATTCCCCAAATAAATTGAACACTTTCAATTTACAATTTATACTTAATTGCCTCAAGTCTCTTTACGAGCTACAAGTGGGACCTAATGGACCTACAGATCAGAAGCTCCAACGATACGAGACTAATTGGCCAAACTCATTAACCAAGTTAGTCAACATTCGTTAACTGTGGGTCACTCCACTAAAGACCCACAGCTGCACTCTTCCCACTGTAGAATATTTCTGTGTCCACGGATATTGACCAATGCAGTAAGTCAATCCTTCACGTGTGTTCATAACACCAGCTGGGTCAAATTACCATTTTACCCCTGGTTTACCTCTGGTTCCTTAAGTACCGTTGATCCCTCTAATGCACAAGTTGTTTAGGGTCCAACCACTAAACAGGAGTTCCTCTCGGGCCAGGAGAGGACGGCGCACCTTTGTTCAAGTCCCGAAATCAGCCCTTAAGGGAACACACATCTACTTACCCCAATAGGGGAAGGAGTGAATTCCATCTTGTACTGTTATGTTCCCAGCCCCCATTCGGTCTTGCCCCTGAAATGGTAGGCTTATTGAGTCGGCGAACTGGCCACTCTCACCCATACAAATCTAAGGACAATCCCTCCTGAAAGGGGTTCATAACAGACTCAGGATTGAGATTGAGTTACCTACGTCATCCTATTGAAATAGAAATATAAACTAGTTAACGGCGTTACATCTAGTGGTTACTATTTCGCGGTCCGGTCTTATGCAAACTCATTGCATAGGATACCCCCACCCGCATGTCTCCTACATGGATGCTTTGGATCATTGCATCTGTATCGAATACAAGGTGGGTCGTATCACATAGTGTCACCAGGATAAGGTACCCAGCCTTATCCTTATACTATAGACCTTTTAGGTTGTTACTTGGACATCGATCCCCGTATGTCCCCACATACTAGTCCAAGTTTCATTTAAACAACCTTGGATCTTAGTTTATTGGATTTAGGGTTTATTAATGCAAACTCGATTATTCAATAACCAAATTACTGAATTACTCAAATAACGCTTTATAGAGATCGATTAATTTGTTTCATTTACTATCTACGAGTTTTAGGGCATAAAACCCAACAAGATCATAATCCATGCAACTGGTTTAATTGCTCGTAGTGACAACGGGATTAGTTGATTAAACTTAGACTCCAATAATGAATCAGAACGTAGTAATTAACGAATTTTAATGGTGCTAAGGACACTTAGGTTGTTAAAATGAGTTAGTTATAATTAGGGGAAACCGATAGGAGAACCTATGTGATTAACGGAGATTCTAGGATTATAATTAGTTTGGCAATGAGATAGGATAATTGTAATAATTATTTAGCTATTAATTGATTTTCAAGACCCCGCTTCTCACTCAAAACTCTTTCTCCGTATTTTTCTCATCTCTTGATTGATCAAATTTTTAATCTTGAATTGCTTTAATTTTTAATTTATTTTTAGTTTCATGATTTGGTCCCAAAATATTATTTCTCCCAAGTACCATTAGTGTTCAAGGATTTATTGTTTTGCTTAATTATCGCTTCACCTCCCTGTGGATTCGATACTCGGAATATTTCTGTTTTATATTACTTGCGGCTCGTGCACTTTGCGGTCATCAACCATCTCCCAGACTAAGCTAGCAGGTAGTTCGGGAGGGGGTGTGACAATAGTGCACGCCCATCAGCAAGCGACTGCAAGCATTGCGTGCAAGTATGTGAAGATTATTATGAGGACCACTAACAGGATGCATTGCACACCTCGGGATATAATGGATTATGCTAAGAAAAACCATGGAATCAATATTAGTTATGACAAAGAATGGAGGGGAAGAGGGAATGCTCTAAATGAGTTAAAAAGATCCCCTGAAGAGTCATATGCGCGTATTACAGCATTTGCAGCTAGGTTGATCGAAAAAAATTCAGGTATTTACCTTCTGTTTTGACGAGTTTTAACATTGCATATTAGTATGTACTCATATTTACGAACTTTTTTTTCAAGAACATATATCGCTCAAGAAAAAAAAAAGGCAGTTACATAATAAGTGGGTTAATCGCATATTGACACAAAAAGATTTTGAATCCCAAAAAACAAAGGATTGTGTATAAAGTAGTTTCAAATCAAACAAAATCCAGCCGTTCTTTACATACCCTCGTGAAGGAATTGAATCCCGTAGCAGAAGTGGTTTTCACCGTTTGTGATTTAATTACGATTAAAAGAAAATCGATACGTTAGGCAAAACAAGAAACATTTTCTAAATAAGATTAAGCATGCATAAAAGAGATCTAAAACCTATTTAGATCTAGAAAATTTACATGAATTTGGAACAATTCTCGATCCCGGCAAGATCCTAGACACCACCAACAGCGAGCACCTGCTATCCTCTTGGATTACTGAGACTACCGGCTTGTGGGAACCATAAATGATGTCTTGGAAGGAAATTTTCAACTAGCTAGTTGCTGGTTTTTTAAAGAATTTTGAGAGAGTTCTCTCTACTGTGTCTAACGTGAGAATGGAGAAAATGGGGGTCAGTTGGGTAACCCCTCTCCACTTTACGATAAGTGAGGAGGGAGTTATTACCCTACTTGATCTCGATCGTTGGATCTAATCCAAACGATCTTGGTCGTCTATTAATTAAATAATAATTATTTAATTAATTAATTAATTAATTTAATTAAATCAATTATAATATAAGATTTTTAATTCAATGTAAATCATATTCAATTTGTTGGTTGGACCCTACCCTCTCTATGGCACGAGAGGGACTTCTGTTTGTTGGTTGAACCTCAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGGGACTTAAGGACGAAGATGTAACCCAGGGGAAAAACGGTAACTTGACCTAGCTGGGGTACGAACACACGTGAAGAGTGAAGTTGTTCATTAGAGGGGCTTGCCGTTATTGGTCGATATCCGTGGACATAGAAATATTCTGCAGTGAGAAGAGTGCAGTTGTGGGTCTTTAGTGGAGTGACCCACAGTTAACGAATGTTGACTAACTTGGTTAATGAGTTTAGTCAATTAGTCTCGTATCGTTGGAGCTTCTGATCTGTATAGGTCCATTAGGTCCCACTGGTAGCTCGTAAAGAGACTTAAGGCAACTAAGTATAAATTGTAAACTGAAAGTGTTCAATTTATTTAGGGGAATTATATAATTTATGTTGATGCATTATAATATAAAGTTTATGAAACTTTATAATATAATTTTTTAATTAATTTCAAAAATTAATTATTGAGAGAAAATATTTGAAAGAGTTCAAATAATTAATATGAATTGGATTCATATTAATATAAATAATTTAATAAAATCCCTAAGATTAAATATTTGATATTTAATTGGGTAATTAATTATTTATTTATTAAATTAAATATGAATAAGATAATAGATTTGATCTTATTCATGACATTTTCTTATTAGGAAAAGGTCTTGGCCTTTACCTATAAATAGGACCCCTGGGGTGGGGTGAAAGGCATCCCATTCAATCTACTTCTCTCAGAGATCTCTCCTAAAAGACTCCCACTAGTCTCTTGCCTCCAGTAGTCTCAGAGATATACCAGTGTAACCAATTGGTGGTGTTCGCACAAGAAGGTTGTTGCATTTTCGATCTCACAAGTTAGAAAAATGTGAATCGATCAAGGATCCCTACGAAAGTGAGTTTCCTTGAAAACCTTGATCACTAGGATCATCTAGATTAGATCTAGGCAATTATTAAGCATGTTTATAGTCGCTTTACAGCATGATAAATGTGTTTTTATTGTTGTATTCTTTTGCAAATTGTATTGGTATTTCAATTAGAATCAAAGACTCTGAGTAGGTTCTGTCCACGCTCCCATTCTTCCGCTACGCCGAGGGCTCTCATTCCCTTCACATGCCAGTGGGGGTATCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGATCGGACCGCGAAATAGTTAACCACTAGTTGTAACACCGTTACATAGTTAGGTTTCTATTTCACTAGGATGACCTAAGCAACTTGGTCTCAATCCTGAGTGGGTTATGGACTCCTGTTCACGAGGGATTGTCCTTTGATTTGTATGGGTGAGAGTGGCTTGCACGCCGACTCAATAAGCCTACCATTTTGGGGACAAGACCGAGTGGGGAGCTGGGAAGATAATCACACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCGACTCTAGGGTAAGTAGAGGTGTGTTCCCGTAAGTGGTGTCTCCGGGTCTTGAACAATGGGCCCTGCCCTCTCTATGGCACGAGAGGGACTTATGTTTGTTGGTTGGACCTCAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGGACTTAAGAATAAAGAGGTAACACAGGGGTAAAACGGTAATTTGACCTAGCTGGGGTACGAACACACATGCAGGACTGACTTGCTGTTATTGGTCATATCCGTGGACACATAAATATATCTGCAGTGAGAAGAGTGCAGCTGTGGTTCTTTAATAGAGTGGACCACAGTTAACAAATATTGATTAACTTGGTTAATGAGTTTAGCCAATTAATCTCATATCGTTGGAGCTTCTGATCTGTAGGTCCATTAGGTCCCACCGGTAGCTCACTTAGGGCGTTGAGGTAAATTTCTAAGGGAAAATTGTATATTCGAAGGGATTCGAATATTAAGTTTAAAATATGAATTTGATTCATATTAAAACTATAGGTTATAATTAATCTACATTGGATGCACATTAATACTATCGTTTATTTGAGAGAAATATAATTTGAAAGCGTTAATATCTAAAAAGCGGAAGCAATTTTGGATATTAGGCACATAATTTGTTCAATTTGATCAAACATTGTGATGCGCAATTTGCTTACCGCAAGTGTACGGGTCAAGTAATAATATAGTGTTTTCGTGTAAAACGAGTGTCGTCCTCTGGATTGGTGTTCTAGCAAATTAAGTACCGTGAATAATCTTGTCCAATTTTATTTAGGGAGCAAAACTCAATGATAAAAGATAAATCTAAAGACAAAAAGCATAAAATAAAGGTGGAGACTCAAATGGAAAGACTCTTAGGGAATTGATTTCGTTGATTAAGACTGAGGATTGATTAATAGGAATGAATTGACCGTGCAATTATTCTACAAGCCAAGGAAACTTTTATCACGATTACCTCTCCCGAGTATAATTGATTCTCATGCATATAAACTAACTTGATATCCCTATCTAAGTTCATTAACATGCAAGGCATTATTCGGTTCGGTCCTTGTTACGCTTCTAAAGATATTCCAAATCCCGTCACAAACTTAGAATTTCTACTCTAGTCATGCAATTAAACAAAGTAAGTCTTAGGCCAAATCCTCCCTCCCGAGTTAGATTCAACACTTAAATCATTCAATTAGTGATCAAGTAATTGAAAGCATTAAACAAAATTGCATGCATAAAATAAAAACACATTCATACCTAAAATCAATCCAAAAACTAAAACAATTACATCAATCCCTAAGACAAACAACTAGCAATTCATAGTCTTTAAACCATAAACACTAATTGAAAGAAAAGCCATAAAAACTACAAGAGGTAAGAGAAAGAGAAAGGAAAACTCGAATCCATCGAAACCGACACGTCCCCGTCACGATCTCCACGTCTTCTCGCTTGATTCCCGCTCCTTGGCCTTGCTTTAGCTCCCACCAAAGGTCTCTAGTCGAAATTAGGGCTAAAATCTAACCAATTGGACTCCAAAATCACGTTTTAGCTCCAATCATCAATTTCCTACAAAATAAACATTAAGTGCAATAAAATGGCCAATAAATCATAAAAGACTAGCTAAATTGATTAGGGAAAACTAGCTAGCTATGCTCGCTATCACATTGCATGCTGTCCATTTAAAGAAAAACAGAGTATGTTTACCAACCTTGAATCAATGGAGAAATTGGTTGGATTTCTTTGTCGTTTTTCTTCACCAACGAGTCACGAACCACCAAAGGGTCTTCCCTGCTATCCTCAAGCCTTTAGAACAGATTGTGGGATCCTCAAGTGATGGAATTTGAGAGAGAAAGTTTGAAGAACAAGCTTGCAAGATGGGTTTTGGTGAGTTTTCAATTTGGCAGCATTTCTTTATGTTTCAAGCTTAATTTCTTCAGCCATCTCCTTGCCTTTTATAGAGGGATCAGAGATGAAAGAAAGCTCCAGCAATTGACACTCAATCAACCAAAGATTAGTGGGAATTTGGGTGTCCAACATGAGGTGAGTGCATGGGTTTAGTCACCATTCACTCCACCTCCAAAAATTCAATCCTTTTTTATTTTAATTAAATCCATAATTATCCTAATTTAGTTAGATAATTATTTGAACTTTAATAATCTGAAAAATTAAAATCCAATTTCAATTTTTCAATTTTAAATTAATTCAAACTTAATTTAAAATAATTATTAAATAATTAATTAATTATTAATTTAATATTAAATATTAAATTAATATTTCCACCAATCCCGTACATTTCCTAAATGTTATTTTCAATCATGAATCTCTATTCATGTTATCGGTATTTAAATCATATTTAAATATTAAATACTCACCTACACGGTTTTCACAAAAACCCGACGTATCGACAATGCCTATCACCTCTACTCATATTTCTCAACATGAACTAAAAAAATTCATATTTTTTCCATCATATTGTTTTAAAGGTTATGTCTCGAGCTAGCAAGGGGACCTAATGGACCTACAGATCATGGGCTCCAACGGTACGAGGTTAAACTAGTCAAACTCTTTTAACCTAGCTAACCAACATCCGTTAACTATCGGGACACTCAACTATAGCCTAGTAGTTGAACTCCCCTCATTGTAGCTATATTTGTGTCCACTCGATGTAACCATGATTAGTAAGTCAATCCTTCACAAGTCGTTCGTTACTATAGATAGATCAAAAGTCCGTTTTACCCTTATAGCACATCTTAGTTCCTTAAGTCCACTGGTCCTCTAATAAACAATTTTGTTCATGGTCCAACCATTAAACAAGATCCCTCTCGGGCCAATGAGAGGGTGGGACCCCTTGTTCAAGCCTTGGATTCAGCACTTAAGGGAACAACCTCTCTACTATCCCTAAATAGGGTAGGAGTGAATTTTATATTGCATTACTATGTCCCCAGCCATCCATCTAGTGTTATCCCCAAAACGGGAGGTTTATTGAACAAAATTTTATGACCACTCTCACCTATGCAGATCAAAGGATAACCCTAAACAGACAGGAGTTCATACTAAGCTCAGGATTAAGATCGAGTTACCTAAGTCATTGATAAGTGCCAAAAATATACCTATTTTGCCCCTTATTCTTAGCTTATTTCTTGTGAAACTTGTATGTTTTTGGTCAAAATTACTATTCCCGAGCCTAAAAAGTGTAAAAGTTGGTAAGTTAGGTCTTTGAGAGTCATGTGTGTCAAATTATACATATTTGTGCTTAAAAGAACTCATTTTGGAGTGAATTTGACTTAGTTTTGGTGTTTTGCAGAAAACAGAGAAATGTTGTTGAAATGCTATTGAAATGCGACTGCATTTTGCCAAGGCAAATGAAACGCGACTGCATTTCTGCCAAGGTAAAATGATGAGACCGCATTTCTGGACAGAAACAGAAAAGTCTGAGTCCATCGCGGGTCGTTTTAAACGAGCTTTTCACGCAACTAACCGGCTGTTTTGACTCCAAAACTGATTGGGCTACCTACCAACACCATTTTTGTGACTCCTCAACCACTTCCCACACTATAAAAGGCCTCGATTCGAAGGGAAATTCAAGCAGAACTCATTTGGAAGAAGAGGGTGGTGACAGAACCCTAGTTGACGCCTATGAGTAGGGATGCCCGAGGTCCTTCTTAGATGACTAAATTCTAACCTTAGTTAGGCATCAAACCTTAGGGTTTGTAGGGATTTTCACCCATTCCCACTTGTAAAAGCGAGAGAGTGGAGTGTCTAAGCGAACTCTAGAAGGATTGGATAAATAGAAAACCCAAAATATTTGGCTACAGTCATTATTTCCAGCTTTTGATACTTTTCATTTATCTGTATTCTTTACATCTTATTTTCAATGGAAATGTATTCATTTTCACTTTATCTCACCATGAGTAGCTAAACTTAGTTGAGGGGTTCAATATGGTGAATTCCCTTATGGTTCAATAGCTTGAAAGTGTTTTATTTGCTTAAATATTGTTCAATGCATGTCATTCTTTATTGAATATCATTCTGATCTTGCTGAGTTTAACTTGATCACTTAGACTTTGCTTGCTATGTGAGTTTGATCTCGAAAGGGACAAACGATATCGGCTCTCATAAAGGTGATATAGGAGAAAAAGCTCAAAAGAGATTGTTCAGTGGTATAGGGCAAGCTGCCTAAGGCACCCTATATCAACTATAGGGTTATAGATTGCATTCGTGAATTATCTATGTCGAAGTCGAGTCACAGAAATGTGCATAGCGGTACTCGCTTAACCTTCTAACGGTTCTTGGGAGCAAGGCCAAATAGAAGTTAAATTTGACCCAATGCATTGAATAGGCTTAAGTTAAATAATCCATGATTAAGGTTATTGCCTTTGGGATGAATCCATGTTGAATACCTCGTTTTATTCATTATTGTTATTCTTTTATTTATTTGCTTGTTTTATCTATTTTTCTAAAAACCAATCATCAATCTTATTTCTTTGGTTACCTATTTTTAAGCAATCAAGTTGAGCAGTTTCTTCTTCAAATCTGAATTTCCAATTTAGTCCTCGTGGGATCGATACCCTTGGAATACTTCTAAGGTTTTTATTACTACGTGGGGTAGTGTATACTTGCACTAAGGTTGGCTGAATTTATCTTTATTATTATTTATCATCTTAACTCACATCCATCATTCAGCCTCTGCCGCACCAAGTTTTTGGCGTCGTTGCCAAGGACAAAAAGTGAAACCAGTTTTGTTTTTGAAATTGCGATCAGATTGCGACCGCATTTCTGTCTCTAAGGGAATTTGACTTTGATTTGCATTTGTTTTGCTTTTGCAGGTTGAAGTTAGTGCATGGACAAGGGGTGTCCACTCCTTGACATTGATCCTGAGATAG

mRNA sequence

ATGCAAGTGCAACCATGGCAGAATCTTGGTTCAATAAGAGAGGAAGACATAGCACAGAATTTTCATGCAAATCTGAAGGGTCTCTATTTTTCTCTGGTTTTTCGAACGTTCTGGGGTGTACACGTTGAATTAGAAGCTCAATTTGGCCAAGAGGAAATTGGTTATATTTCGTTGTTCACGTTGAGTGTACTCCGTGACAATGATGCTGTCGTGAGTGTTGGGCGGGCCCCACTACATCGTAGAGCTAGTAAACGTTGGTTGTACTGGGTGTGCCCTACACAACGTAGATTTGTCATGGGGAGCCCAAGAGTCAACCATGAAGAGAAGATCCAAAAAGAATTGAAGTTGGCCCAAGTTTCAAGCCCAATTCCGCGTCTGCTGGGTCTGGAAACCGCACAGCATCGCAACGCTGTCCCATTTCTTGGCAGACAATGCGAACACCACCACTATGGCTACACCGGTATGATTCTAAGACTTCTAGAGGCAGGAGACTGGTGGGAGTCTAGAGGAAGCCTTGAGGGGAATTCTCTGAGAAATATTTCTGTGTCCACGGATATTGACCAATGCAGAGTTCCTCTCGGGCCAGGAGAGGACGGCGCACCTTTGTTCAAGTCCCGAAATCAGCCCTTAAGGGAACACACATCTACTTACCCCAATAGGGGAAGGAGTGAATTCCATCTTGTACTGTTATGTTCCCAGCCCCCATTCGGTCTTGCCCCTGAAATGACTAAGCTAGCAGGTAGTTCGGGAGGGGGTGTGACAATAGTGCACGCCCATCAGCAAGCGACTGCAAGCATTGCGTGCAAGTATGTGAAGATTATTATGAGGACCACTAACAGGATGCATTGCACACCTCGGGATATAATGGATTATGCTAAGAAAAACCATGGAATCAATATTAGTTATGACAAAGAATGGAGGGGAAGAGGGAATGCTCTAAATGAGTTAAAAAGATCCCCTGAAGAGTCATATGCGCGTATTACAGCATTTGCAGCTAGGTTGATCGAAAAAAATTCAGGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGGGACTTAAGGACGAAGATGTAACCCAGGGGAAAAACGTGGGTTATGGACTCCTGTTCACGAGGGATTGTCCTTTGATTTGTATGGGTGAGAGTGGCTTGCACGCCGACTCAATAAGCCTACCATTTTGGGGACAAGACCGAGTGGGGAGCTGGGAAGATAATCACACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCGACTCTAGGGTAAGTAGAGGTCCATTAGGTCCCACCGGTAGCTCACTTAGGGCGTTGAGGTTATGTCTCGAGCTAGCAAGGGGACCTAATGGACCTACAGATCATGGGCTCCAACGAAAACAGAGAAATGTTGTTGAAATGCTATTGAAATGCGACTGCATTTTGCCAAGGCAAATGAAACGCGACTGCATTTCTGCCAAGGTTGAAGTTAGTGCATGGACAAGGGGTGTCCACTCCTTGACATTGATCCTGAGATAG

Coding sequence (CDS)

ATGCAAGTGCAACCATGGCAGAATCTTGGTTCAATAAGAGAGGAAGACATAGCACAGAATTTTCATGCAAATCTGAAGGGTCTCTATTTTTCTCTGGTTTTTCGAACGTTCTGGGGTGTACACGTTGAATTAGAAGCTCAATTTGGCCAAGAGGAAATTGGTTATATTTCGTTGTTCACGTTGAGTGTACTCCGTGACAATGATGCTGTCGTGAGTGTTGGGCGGGCCCCACTACATCGTAGAGCTAGTAAACGTTGGTTGTACTGGGTGTGCCCTACACAACGTAGATTTGTCATGGGGAGCCCAAGAGTCAACCATGAAGAGAAGATCCAAAAAGAATTGAAGTTGGCCCAAGTTTCAAGCCCAATTCCGCGTCTGCTGGGTCTGGAAACCGCACAGCATCGCAACGCTGTCCCATTTCTTGGCAGACAATGCGAACACCACCACTATGGCTACACCGGTATGATTCTAAGACTTCTAGAGGCAGGAGACTGGTGGGAGTCTAGAGGAAGCCTTGAGGGGAATTCTCTGAGAAATATTTCTGTGTCCACGGATATTGACCAATGCAGAGTTCCTCTCGGGCCAGGAGAGGACGGCGCACCTTTGTTCAAGTCCCGAAATCAGCCCTTAAGGGAACACACATCTACTTACCCCAATAGGGGAAGGAGTGAATTCCATCTTGTACTGTTATGTTCCCAGCCCCCATTCGGTCTTGCCCCTGAAATGACTAAGCTAGCAGGTAGTTCGGGAGGGGGTGTGACAATAGTGCACGCCCATCAGCAAGCGACTGCAAGCATTGCGTGCAAGTATGTGAAGATTATTATGAGGACCACTAACAGGATGCATTGCACACCTCGGGATATAATGGATTATGCTAAGAAAAACCATGGAATCAATATTAGTTATGACAAAGAATGGAGGGGAAGAGGGAATGCTCTAAATGAGTTAAAAAGATCCCCTGAAGAGTCATATGCGCGTATTACAGCATTTGCAGCTAGGTTGATCGAAAAAAATTCAGGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGGGACTTAAGGACGAAGATGTAACCCAGGGGAAAAACGTGGGTTATGGACTCCTGTTCACGAGGGATTGTCCTTTGATTTGTATGGGTGAGAGTGGCTTGCACGCCGACTCAATAAGCCTACCATTTTGGGGACAAGACCGAGTGGGGAGCTGGGAAGATAATCACACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCGACTCTAGGGTAAGTAGAGGTCCATTAGGTCCCACCGGTAGCTCACTTAGGGCGTTGAGGTTATGTCTCGAGCTAGCAAGGGGACCTAATGGACCTACAGATCATGGGCTCCAACGAAAACAGAGAAATGTTGTTGAAATGCTATTGAAATGCGACTGCATTTTGCCAAGGCAAATGAAACGCGACTGCATTTCTGCCAAGGTTGAAGTTAGTGCATGGACAAGGGGTGTCCACTCCTTGACATTGATCCTGAGATAG

Protein sequence

MQVQPWQNLGSIREEDIAQNFHANLKGLYFSLVFRTFWGVHVELEAQFGQEEIGYISLFTLSVLRDNDAVVSVGRAPLHRRASKRWLYWVCPTQRRFVMGSPRVNHEEKIQKELKLAQVSSPIPRLLGLETAQHRNAVPFLGRQCEHHHYGYTGMILRLLEAGDWWESRGSLEGNSLRNISVSTDIDQCRVPLGPGEDGAPLFKSRNQPLREHTSTYPNRGRSEFHLVLLCSQPPFGLAPEMTKLAGSSGGGVTIVHAHQQATASIACKYVKIIMRTTNRMHCTPRDIMDYAKKNHGINISYDKEWRGRGNALNELKRSPEESYARITAFAARLIEKNSGCSLEEHWGLKDEDVTQGKNVGYGLLFTRDCPLICMGESGLHADSISLPFWGQDRVGSWEDNHTRWNSLLPDSRVSRGPLGPTGSSLRALRLCLELARGPNGPTDHGLQRKQRNVVEMLLKCDCILPRQMKRDCISAKVEVSAWTRGVHSLTLILR
Homology
[Close]
BLAST of Spg027076 vs. NCBI nr
Match: KAA0047666.1 (MuDR family transposase [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 89.7 bits (221), Expect = 7.5e-14
Identity = 39/82 (47.56%), Postives = 59/82 (71.95%), Query Frame = 0 

Query: 259 HQQATASIACKYVKIIMRTTNRMHCTPRDIMDYAKKNHGINISYDKEWRGRGNALNELKR 318
           H+QAT+SI  +  K+I +T ++  C P ++++Y K +HG+NISYDK WRGR  ALN ++ 
Sbjct: 142 HKQATSSIVSECTKLIFKTNDKASCRPSNVINYMKIHHGVNISYDKAWRGREIALNSIRD 201

Query: 319 SPEESYARITAFAARLIEKNSG 341
           +PE+SYA ++AF+  LI  N G
Sbjct: 202 TPEDSYAMLSAFSDALIRNNPG 223

[Close]
BLAST of Spg027076 vs. NCBI nr
Match: TYK29863.1 (MuDRA-like transposase [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 1.7e-13
Identity = 39/82 (47.56%), Postives = 58/82 (70.73%), Query Frame = 0 

Query: 259 HQQATASIACKYVKIIMRTTNRMHCTPRDIMDYAKKNHGINISYDKEWRGRGNALNELKR 318
           H+QAT+ I  +  K+I +T ++  C P D+++Y K +HG+NISYDK WRGR  ALN ++ 
Sbjct: 142 HKQATSWIVSECTKLIFKTNDKAPCRPSDVINYMKIHHGVNISYDKAWRGREIALNSIRG 201

Query: 319 SPEESYARITAFAARLIEKNSG 341
           +PE+SYA ++AF+  LI  N G
Sbjct: 202 TPEDSYAMLSAFSDALIRNNPG 223

[Close]
BLAST of Spg027076 vs. NCBI nr
Match: KAA0067552.1 (protein FAR1-RELATED SEQUENCE 2-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYJ97202.1 protein FAR1-RELATED SEQUENCE 2-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 1.7e-13
Identity = 40/82 (48.78%), Postives = 57/82 (69.51%), Query Frame = 0 

Query: 259 HQQATASIACKYVKIIMRTTNRMHCTPRDIMDYAKKNHGINISYDKEWRGRGNALNELKR 318
           H+QAT+ I  +  K+I +T ++  C P D+++Y K +HG+NISYDK WRGR  ALN +K 
Sbjct: 224 HKQATSWIVSECTKLIFKTNDKAPCRPSDVINYMKIHHGVNISYDKAWRGREIALNSIKG 283

Query: 319 SPEESYARITAFAARLIEKNSG 341
           +PE+SYA + AF+  LI  N G
Sbjct: 284 TPEDSYAMLFAFSDALIRNNPG 305

[Close]
BLAST of Spg027076 vs. NCBI nr
Match: KAA0061274.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold455G001170 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 86.3 bits (212), Expect = 8.2e-13
Identity = 38/82 (46.34%), Postives = 57/82 (69.51%), Query Frame = 0 

Query: 259 HQQATASIACKYVKIIMRTTNRMHCTPRDIMDYAKKNHGINISYDKEWRGRGNALNELKR 318
           H+QAT+ I  +  K+I +  ++  C P D+++Y K +HG+NISYDK WRGR  ALN ++ 
Sbjct: 194 HKQATSWIVSECTKLIFKMNDKAPCRPSDVINYMKIHHGVNISYDKAWRGREIALNSIRG 253

Query: 319 SPEESYARITAFAARLIEKNSG 341
           +PE+SYA ++AF+  LI  N G
Sbjct: 254 TPEDSYAMLSAFSDALIRNNPG 275

[Close]
BLAST of Spg027076 vs. NCBI nr
Match: XP_008455803.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495899 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 84.3 bits (207), Expect = 3.1e-12
Identity = 37/82 (45.12%), Postives = 57/82 (69.51%), Query Frame = 0 

Query: 259 HQQATASIACKYVKIIMRTTNRMHCTPRDIMDYAKKNHGINISYDKEWRGRGNALNELKR 318
           H+QAT+ I  +  K+I +T +++ C P D+++Y K +H +NISYDK W GR  ALN ++ 
Sbjct: 217 HKQATSWIVSECTKLIFKTNDKVPCRPSDVINYMKIHHSVNISYDKAWGGREIALNSIRG 276

Query: 319 SPEESYARITAFAARLIEKNSG 341
           +PE+SYA ++AF+  LI  N G
Sbjct: 277 TPEDSYAMLSAFSDALIRNNPG 298

[Close]
BLAST of Spg027076 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U0B5 (MuDR family transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold115G001610 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 89.7 bits (221), Expect = 3.6e-14
Identity = 39/82 (47.56%), Postives = 59/82 (71.95%), Query Frame = 0 

Query: 259 HQQATASIACKYVKIIMRTTNRMHCTPRDIMDYAKKNHGINISYDKEWRGRGNALNELKR 318
           H+QAT+SI  +  K+I +T ++  C P ++++Y K +HG+NISYDK WRGR  ALN ++ 
Sbjct: 142 HKQATSSIVSECTKLIFKTNDKASCRPSNVINYMKIHHGVNISYDKAWRGREIALNSIRD 201

Query: 319 SPEESYARITAFAARLIEKNSG 341
           +PE+SYA ++AF+  LI  N G
Sbjct: 202 TPEDSYAMLSAFSDALIRNNPG 223

[Close]
BLAST of Spg027076 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VGR4 (Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 2-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold174G00860 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 8.0e-14
Identity = 40/82 (48.78%), Postives = 57/82 (69.51%), Query Frame = 0 

Query: 259 HQQATASIACKYVKIIMRTTNRMHCTPRDIMDYAKKNHGINISYDKEWRGRGNALNELKR 318
           H+QAT+ I  +  K+I +T ++  C P D+++Y K +HG+NISYDK WRGR  ALN +K 
Sbjct: 224 HKQATSWIVSECTKLIFKTNDKAPCRPSDVINYMKIHHGVNISYDKAWRGREIALNSIKG 283

Query: 319 SPEESYARITAFAARLIEKNSG 341
           +PE+SYA + AF+  LI  N G
Sbjct: 284 TPEDSYAMLFAFSDALIRNNPG 305

[Close]
BLAST of Spg027076 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E198 (MuDRA-like transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold208G001100 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 8.0e-14
Identity = 39/82 (47.56%), Postives = 58/82 (70.73%), Query Frame = 0 

Query: 259 HQQATASIACKYVKIIMRTTNRMHCTPRDIMDYAKKNHGINISYDKEWRGRGNALNELKR 318
           H+QAT+ I  +  K+I +T ++  C P D+++Y K +HG+NISYDK WRGR  ALN ++ 
Sbjct: 142 HKQATSWIVSECTKLIFKTNDKAPCRPSDVINYMKIHHGVNISYDKAWRGREIALNSIRG 201

Query: 319 SPEESYARITAFAARLIEKNSG 341
           +PE+SYA ++AF+  LI  N G
Sbjct: 202 TPEDSYAMLSAFSDALIRNNPG 223

[Close]
BLAST of Spg027076 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V1Z6 (CCHC-type domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold455G001170 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 86.3 bits (212), Expect = 4.0e-13
Identity = 38/82 (46.34%), Postives = 57/82 (69.51%), Query Frame = 0 

Query: 259 HQQATASIACKYVKIIMRTTNRMHCTPRDIMDYAKKNHGINISYDKEWRGRGNALNELKR 318
           H+QAT+ I  +  K+I +  ++  C P D+++Y K +HG+NISYDK WRGR  ALN ++ 
Sbjct: 194 HKQATSWIVSECTKLIFKMNDKAPCRPSDVINYMKIHHGVNISYDKAWRGREIALNSIRG 253

Query: 319 SPEESYARITAFAARLIEKNSG 341
           +PE+SYA ++AF+  LI  N G
Sbjct: 254 TPEDSYAMLSAFSDALIRNNPG 275

[Close]
BLAST of Spg027076 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C3J6 (Gag/pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold98G002960 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 84.3 bits (207), Expect = 1.5e-12
Identity = 35/56 (62.50%), Postives = 41/56 (73.21%), Query Frame = 0 

Query: 358 KNVGYGLLFTRDCPLICMGESGLHADSISLPFWGQDRVGSWEDNHTRWNSLLPDSR 414
           +++G   ++ RDCPL C GESG   DSI L FWGQDRVGSWE NHTRWNS +P  R
Sbjct: 557 ESLGLRDMYIRDCPLTCTGESGQIVDSICLSFWGQDRVGSWEHNHTRWNSRIPTFR 612

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spg027076 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAA0047666.17.5e-1447.56MuDR family transposase [Cucumis melo var. makuwa][more]
TYK29863.11.7e-1347.56MuDRA-like transposase [Cucumis melo var. makuwa][more]
KAA0067552.11.7e-1348.78protein FAR1-RELATED SEQUENCE 2-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYJ97202.1 prot... [more]
KAA0061274.18.2e-1346.34uncharacterized protein E6C27_scaffold455G001170 [Cucumis melo var. makuwa][more]
XP_008455803.13.1e-1245.12PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495899 [Cucumis melo][more]
BLAST of Spg027076 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Spg027076 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5A7U0B53.6e-1447.56MuDR family transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold... [more]
A0A5A7VGR48.0e-1448.78Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 2-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E... [more]
A0A5D3E1988.0e-1447.56MuDRA-like transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold2... [more]
A0A5A7V1Z64.0e-1346.34CCHC-type domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6... [more]
A0A5D3C3J61.5e-1262.50Gag/pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold98G00296... [more]
BLAST of Spg027076 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg027076.1Spg027076.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0015074 DNA integration
molecular_function GO:0003676 nucleic acid binding
molecular_function GO:0008270 zinc ion binding