Spg026947 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg026947
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold13: 24586851 .. 24592187 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg026947
SyntenySpg026947
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGGGTGAGAGTGGCCAGCTCGCCGACTCAATAATCCTACCATTTCAAGGGCAAGACCGAATGGGGGCTGGGAACATAACAGTACAAGATGGAATTCACTTCTTCCCCTATTGGGGTAAGTAGATGTGTGTTCCCTTAAGGGCTGATTTCGGAGCTTGAACAAAGGCGCTCGTCCTCTCCTGCCCCGAGAGGAACTCCGGTTTAGTGGTTGGACCCTAAACAACTTGTTCATTAGAGGGATCAGTGGTACTTAAGGAACCAGAGGTAACCCAGGGGTAAAATGGTAATTTGACCCAGCTGGTGTTACGAACACACGTGAAGGATTGACTTACTGCATTGGTCGATATCCATAGACACAAAAATATTCTACAGTGAGAAGAGTGCAGTTGTGGGTCTTTAGTGGAGTGATCCACAGTTAACGAATGTTGACTAACTTGGTTAATGAGTTTAGCCAATTAGTCTCGTATCGTTGGAGCTTCTGATCTGTAGGTCCATTAGGTCCCATTGGTAGCTCGCAAAGAGACTTGAGGCAATTAAGTATAAATTGTAAATTGAAAGTGTTCAATTTATTTAGGAGAATCATATAATGTATATTGATACATTATAATATAAAGTTTACGAAACTTTATAATATAATTTTGAATTAATTTCAAAATTAATTCTTGAGAGAAAATATTTAAAAGAGTTCAAATAATTAATATGAATTGGATTCATATTAATATAAATAATTTAATAAAATCCCTAAGATTAAATATATGATATTTAATTGGGTAATTAATTAATTATTAAATTAAATATGAATAAGATAATAGATTTGATTAGATCTTATTCATGACTTTTTCCTATAAGGAAAATGTCTTGGCCTTTTTCCTATAAATACGACCCTTGGGGTGGGGGTGAAAGGCATCACATTCATTCTCCTATTCTCAGAGAATTCCCCTGAAGGCTCCCTCTAGACTCCCACCAGTCTCCTGCCTCTAGAAGTCTCAGAGTCATACCGGTGTAGCCATAGTGGTGGTGTTCGCAGTAGTTCGTGATTATTTCGTAAGCAGTTGGTGAATTTAATCTGAGTCGTCAACGAGAGTAAGTAATTTGTTACTATATAAATTAGATTTAGATCTAATATTTTTGTATGCTTAGCCTTAATATAAATTTAGAATAGTTCTAAGATTATTGCTAATGTATTGGTATTTTAGATTAAACAAAATTAATTACGAATCGGTCTCAATCACGCTTCCGCTTTACGGAATTACGAAATTCCAATCCTTCAATGACAACACAAGAAGGAATTCACTCCTTCCCAATTCTAGGAAAAGTAGATGAGTGTTCCCTTAAGTGGTGACTCCGGGACTTGAACAAAGGGATCCCGCCCTCTCACTGGCCCACGAGGGACTTTCTGTTTATTGGTTGGACCATAAACAGGTTGTTCATTAAAGGAGCACTAGTACTTAAGGAGACAGATGTAACACAAGGGTAAAACGGTAATTTGACCCAGCTGTGATTACTGACACTTGTGAAGGATTGACTTACCGGTATAGGTCTATATCCGTGGACACAAAAATGTTCTATAGTGAGAAGAGTTCAGCTGTGAGTCTTTAGTGGAATGACCCACAGTTCTTTAGTGGAATGACCCACAGTTCTTTAGTGGAATGACCCACAGTTAATGAATATTGGTTAACCTGATTAATGAGTTTAATCAATTAACCTCATATCATTGGAGCTTCTGATCTGTAGGTCCATTAGGTCCCCCTACTAGCTCGTAAAGAGTAATTAGAAACAATTATATCTTGAGAGAATTTGAATAGTTCAAATTCATATTGGGAATTAAGTTGATCTTATGAGATACAAATTAATATAATGTATAGTGATACATTAAAATGTAAAGTCTAATTTGAAATTAAACTTTATTATTATGAGAGAAATAAATATTTGAAGAAGTTCAAATATTAATATGAATTTGATTCAGACTAAATTTATAGGATATAAGAGAATTTGAAGGAGTTCAAATTTTAATATAAATTTGATTCATATTATAGAATTAATTAATTGAAGGCCTGAAATTAAATATATGATATTTAATTGGGCAATTAACTAATTAACTAATAAAAGGTCTGAAATTAAATATATGATATTTAATTGGTGATTAATTAATTAAAGAATTAATTAATTGGAAATTAATCAATTATGGAAATGATTAATCACTTATGGAAGTAATTAATCATTTATGGAAATGATTTAATCACTTATGGAAGTGATCAATCATTTATGGAAAAGATTAATCAATTATAAAATTGATTGGTTATGGAATTTATTAATTATGGAAAAGATTAAATCAATTATGGAAATAATTGATTTTAAATGAATATTTTACTCATGGCCTTTCTCCTATAAATAGAACACTAAACCTAGGGTTTAGGTACTACAACATATTGCCACCATAAGGTCATTCTTGTCTCCCTCTCATATTCTCTCAACCCAAGAACTCTAGGGAGAATTTTCTCTCTAGAGTTTTTCCCATTCAAGATTAGGTAGTCCCACAACTATGTTCCTAATCTCAGAGTCATAGCGGGAAATATCAATTGGTGGTGTCCCAATTGTTGACGCTTGGTCCCTATGAAATCAAGAAAGACGTTCTTGATATTTCAGAGACGACAACGACGGTATGTACGCTTCTCCCATTTAGATTAGTTCTAAGGTTGTATGTTTCGCCTTAATAATTGATTTAGAATAGTTTTCTAAATTTTTGCCAATGTATTGGTATTTTGGTAGAAACAAAATTAACTACGAATCAATCCAATTACGCTTCCGCTTTACAGAATTACAGAATTCCAATCCTACACCTTTAACCTCCAAAACCTTTTCCATTGGTCTGAGTTCTTTGAGCTGTCTGAAGAGGATGTTTTTCCTTCATTTGCTAGGTTATGAGCTAGATGGTACGTGATAGCGAGCAGAGCTAGCTAGTTTTCCCTAATCTATTTAGCTAGTCTTTGATGATTTATTGGCCATTTTATTGCACTTAATTTTTTATTTTGTAGGAAAGTGTTGATTAGAGCTTAAGCGTGGAATTTGAGTCAATCGGGTGTTCGGAACGCGAAAAGATGCAAAAGAACCGAAGAGAATCAAAGGAGAAAAAGTCAACTCATGGTCAACCGCAGGCTAGCGTCGCGACGCCAGCCCTTGAGCGTCTCGACGCTAGCATTCCATATCTGATCAGGCGCTAAAAGGTCACAGCGTCGAGACGCTGCGACCTTAGCGTCTCGACGCTGTGTAATTTCCATTTCAGACGCGTGCGATAAGGCGACAGCGTCTCGACGCTATGACGAAAAATTCAGATTATAAATCAGTTGCGGCTAGGTCTGAAGGGGGGATCTTTTTGGGAACGTCTTGGAGCCGTAAAACAGAGCAAAACAGAGGCTTTTGGGGCTGAAGCAAAGGGAGCAAGGTGGAAATCAACCCATTGTTCGTGGGGATCGTGACGGGGACGCTCGGTCTCGGCCTACATTGAGTTTACTTCTTCTTTCCCTCAACTTAGTTAGTGTTTATGGCTGTTTTAGACTATTGCTATATCGTAACGTGTTGTATGAGTAGCTAGGCTTTAATTCTTAGGGATTGATGTAGCCGTTGGGCACCTTATGGATTGATTTACGGTTTTTATGCTATTGATGTCATTTATGCATATTTGTGTCCTTAATGCTTTCAATTTACCGGCCATAAATTGATTGATGTTTATGCTTGAATCTAACTCGGGAGAGAGGATTTAAATTAGAAATCAATATGCATAACTAGAATTTAGCTAGAAATCGGGAGATTATGGTTAATTCTAGAAATTGTTAAAAAGGTTATCCTTATTGCCTTGTATGTTTATTGGATTTAGATAGGGATATCGGGTTCAATTACATATGAGAGAATCATGTATGCTCGGGAGAGATATGTGTGATTTTAGTTTACCAAGATTTATGAGTCATAGCATGTGTTATTCCGTTAATTAATCCATAATTCCAATTGGTGAAATCAAATCCCTAAGACCATTACTTCCCATTAGATTGTCACTTTTTGCATTCGTTTTGTGTTTGATTTAATTAAATTCTCACTCAATTCGGTTCCCTAAATAAAATTGGCCAAGAGTATTTCCGGTAATTAAAATTGACTAGACACCAATCCAGAGGACGACATTCGAATTTCATATTCACTATATTATAACTTGACCCGTACACTTGCGGTTAGCAATTTGTGCATCAGTACGCACTCTTAACTGAGAATGTTCCTTTTTTTACCGGATTCCATATGATTACATCTTGTGCTTCATTGTTTCGTAGGGGGATATTTAGAATTGCTTCTGCATCCGCTGGAAGAAATTTCTCTTTAATCTCAGAGACTTTCCAATTTCCACTGTCGTTAATGAGCCTTGCAACACTATGCCCTTTTAGTTATTCACAGACCCATAGAGGTTTAGATAAACCTTCTCTAAGGGATCCATTGATCTTCGTCTATACTAATGAGCTTGCCATTTCCCACGCTCATCCTCATCCCTTTCTTAAATAACTTTCTTCCCCACAAGATGCTCCTCCATGTAAGGGAAGGATTTGATCCTAAGGAAGCTTCAAGAAATGAATTGTTAGATAAATATCTTCCTCTCAAGATCTTTGCAAGAAGGCTAGTCAGATTTTTAATTATGTGCCAACTCTGCTTAGCCAACATTGCTTGATTGAATAAGTTTATATCTTTGAACCTGATCCCTCCTTTTTTCTTACTAGCACAAAGTCGGCTCCAGCTCATCCAGTGGGCCTTATTCTTGTCTCTCGTCGATTCTGATAGCGAGCATAGCTAGCTAGTTTTTCCTAATTAATTTAGCTAGTCTTTTATAATTAAATGACCAAAATTATGCATTTTTGTGTTTATTTGTAGGAATTATGTTTTGGAGATAAATTCGGGAAATTGGAGCTAATTGGATGTTCGAGATGCAAAAAGAGGCAAAGGAACGAAGAGAATCGAAGTTGGAA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mRNA sequence

ATGGGTGAGAGTGGCCAGCTCGCCGACTCAATAATCCTACCATTTCAAGGGCAAGACCGAATGGGGGCTGGGAACATAACAGTACAAGATGGAATTCACTTCTTCCCCTATTGGGGATTGACTTACCGGTATAGGTCTATATCCGTGGACACAAAAATGTTCTATAGTGAGAAGAGTTCAGCTAGTCATAGCGGGAAATATCAATTGGTGGTGTCCCAATTGTTGACGCTTGGTCCCTATGAAATCAAGAAAGACGTTCTTGATATTTCAGAGACGACAACGACGAATTCCAATCCTACACCTTTAACCTCCAAAACCTTTTCCATTGGTCTGAGTTCTTTGAGCTGTCTGAAGAGGATGTTTTTCCTTCATTTGCTAGGTTATGAGCTAGATGGCGCTAAAAGGTCACAGCGTCGAGACGCTGCGACCTTAGCGTCTCGACGCTGTGTAATTTCCATTTCAGACGCAGCAAAACAGAGGCTTTTGGGGCTGAAGCAAAGGGAGCAAGGTGGAAATCAACCCATTGTTCGTGGGGATCGTGACGGGGACGCTCGGTCTCGGCCTACATTGAGTCACAGCGTCTCGACGCTTGCGGATTTCCCTTTCCAAATTGGCGGTATCGCGACAGCGTCGCGACCCTGTGCCGAAATTTTTCCCTATTTAAAGATTGCGATTAGGTCAGTTTTGGGGACTTCTTTTGGTGCATTTGTGGCCGAAAACTCACAAAAAAATCCTCTTTGGAAGCTGAAGCAAGTGGTGGAGAGCGGGATTGAAGACTTTGTTCGTGGGGACGTGCGGTCTTGGCCTACTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGTGAGAGTGGCCAGCTCGCCGACTCAATAATCCTACCATTTCAAGGGCAAGACCGAATGGGGGCTGGGAACATAACAGTACAAGATGGAATTCACTTCTTCCCCTATTGGGGATTGACTTACCGGTATAGGTCTATATCCGTGGACACAAAAATGTTCTATAGTGAGAAGAGTTCAGCTAGTCATAGCGGGAAATATCAATTGGTGGTGTCCCAATTGTTGACGCTTGGTCCCTATGAAATCAAGAAAGACGTTCTTGATATTTCAGAGACGACAACGACGAATTCCAATCCTACACCTTTAACCTCCAAAACCTTTTCCATTGGTCTGAGTTCTTTGAGCTGTCTGAAGAGGATGTTTTTCCTTCATTTGCTAGGTTATGAGCTAGATGGCGCTAAAAGGTCACAGCGTCGAGACGCTGCGACCTTAGCGTCTCGACGCTGTGTAATTTCCATTTCAGACGCAGCAAAACAGAGGCTTTTGGGGCTGAAGCAAAGGGAGCAAGGTGGAAATCAACCCATTGTTCGTGGGGATCGTGACGGGGACGCTCGGTCTCGGCCTACATTGAGTCACAGCGTCTCGACGCTTGCGGATTTCCCTTTCCAAATTGGCGGTATCGCGACAGCGTCGCGACCCTGTGCCGAAATTTTTCCCTATTTAAAGATTGCGATTAGGTCAGTTTTGGGGACTTCTTTTGGTGCATTTGTGGCCGAAAACTCACAAAAAAATCCTCTTTGGAAGCTGAAGCAAGTGGTGGAGAGCGGGATTGAAGACTTTGTTCGTGGGGACGTGCGGTCTTGGCCTACTTAG

Protein sequence

MGESGQLADSIILPFQGQDRMGAGNITVQDGIHFFPYWGLTYRYRSISVDTKMFYSEKSSASHSGKYQLVVSQLLTLGPYEIKKDVLDISETTTTNSNPTPLTSKTFSIGLSSLSCLKRMFFLHLLGYELDGAKRSQRRDAATLASRRCVISISDAAKQRLLGLKQREQGGNQPIVRGDRDGDARSRPTLSHSVSTLADFPFQIGGIATASRPCAEIFPYLKIAIRSVLGTSFGAFVAENSQKNPLWKLKQVVESGIEDFVRGDVRSWPT
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 168..188

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg026947.1Spg026947.1mRNA